Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11582
- Subject:
- XM_017026220.1
- Aligned Length:
- 1947
- Identities:
- 1833
- Gaps:
- 90
Alignment
Query 1 ATGACGCCCGCCCTCACAGCCCTGCTCTGCCTTGGGCTGAGTCTGGGCCCCAGGACCCGCGTGCAGGCAGGGCC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1 ATGACGCCCGCCCTCACAGCCCTGCTCTGCCTT------------------------------------GGGCC 38
Query 75 CTTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCAGCTGGGGGAGCCCCGTGACCATCTGGTGTC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 39 CTTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCAGCTGGGGGAGCCCCGTGACCATCTGGTGTC 112
Query 149 AGGGGAGCCTGGAGGCCCAGGAGTACCGACTGGATAAAGAGGGAAGCCCAGAGCCCTTGGACAGAAATAACCCA 222
|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 113 AGGGGAGCCTGGAGGCCCAGGAGTACCAACTGGATAAAGAGGGAAGCCCAGAGCCCTGGGACAGAAATAACCCA 186
Query 223 CTGGAACCCAAGAACAAGGCCAGATTCTCCATCCCATCCATGACAGAGCACCATGCGGGGAGATACCGCTGCCA 296
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 187 CTGGAACCCAAGAACAAGGCCAGATTCTCCATCCCATCCATGACACAGCACCATGCAGGGAGATACCGCTGCCA 260
Query 297 CTATTACAGCTCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGCGACCCCCTGGAGCTGGTGATGACAGGATTCTACAACAAAC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 261 CTATTACAGCTCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGCGACCCCCTGGAGCTGGTGATGACAGGATTCTACAACAAAC 334
Query 371 CCACCCTCTCAGCCCTGCCCAGCCCTGTGGTGGCCTCAGGGGGGAATATGACCCTCCGATGTGGCTCACAGAAG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 335 CCACCCTCTCAGCCCTGCCCAGCCCTGTGGTGGCCTCAGGGGGGAATATGACCCTCCGATGTGGCTCACAGAAG 408
Query 445 GGATATCACCATTTTGTTCTGATGAAGGAAGGAGAACACCAGCTCCCCCGGACCCTGGACTCACAGCAGCTCCA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 409 GGATATCACCATTTTGTTCTGATGAAGGAAGGAGAACACCAGCTCCCCCGGACCCTGGACTCACAGCAGCTCCA 482
Query 519 CAGTGGGGGGTTCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGCCCCGTGAACCCCAGCCACAGGTGGAGGTTCACATGCTATT 592
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 483 CAGTGGGGGGTTCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGCCCCGTGACCCCCAGCCACAGGTGGAGGTTCACATGCTATT 556
Query 593 ACTATTATATGAACACCCCCCAGGTGTGGTCCCACCCCAGTGACCCCCTGGAGATTCTGCCCTCAGGCGTGTCT 666
|||||||||..|||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 557 ACTATTATACAAACACCCCCTGGGTGTGGTCCCACCCCAGTGACCCCCTGGAGATTCTGCCCTCAGGCGTGTCT 630
Query 667 AGGAAGCCCTCCCTCCTGACCCTGCAGGGCCCTGTCCTGGCCCCTGGGCAGAGCCTGACCCTCCAGTGTGGCTC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 631 AGGAAGCCCTCCCTCCTGACCCTGCAGGGCCCTGTCCTGGCCCCTGGGCAGAGCCTGACCCTCCAGTGTGGCTC 704
Query 741 TGATGTCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGGGAACGTGACTTCCTCCAGCGCCCTGGCCAGCAGC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 705 TGATGTCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGGGAACGTGACTTCCTCCAGCGCCCTGGCCAGCAGC 778
Query 815 CCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCCACGGGGGCCAGTACAGGTGC 888
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 779 CCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGGTGC 852
Query 889 TATGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGAACATCCTGATGGCAGGACAGAT 962
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||..||||||||||
Sbjct 853 TATGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGTGACCCCCTGGACATCCTGATCACAGGACAGAT 926
Query 963 CTATGACACCGTCTCCCTGTCAGCACAGCCGGGCCCCACAGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 927 CTATGACACCGTCTCCCTGTCAGCACAGCCGGGCCCCACAGTGGCCTCAGGAGAGAACATGACCCTGCTGTGTC 1000
Query 1037 AGTCATGGTGGCAGTTTGACACTTTCCTTCTGACCAAAGAAGGGGCAGCCCATCCCCCACTGCGTCTGAGATCA 1110
|||||.||.||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1001 AGTCACGGGGGTATTTTGACACTTTCCTTCTGACCAAAGAAGGGGCAGCCCATCCCCCACTGCGTCTGAGATCA 1074
Query 1111 ATGTACGGAGCTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCATGAGTCCTGTGACCTCAGCCCACGCGGGGACCTACAG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1075 ATGTACGGAGCTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCATGAGTCCTGTGACCTCAGCCCACGCGGGGACCTACAG 1148
Query 1185 GTGCTACGGCTCATACAGCTCCAACCCCCACCTGCTGTCTTTCCCCAGTGAGCCCCTGGAACTCATGGTCTCAG 1258
|||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1149 GTGCTACGGCTCACGCAGCTCCAACCCCCACCTGCTGTCTTTCCCCAGTGAGCCCCTGGAACTCATGGTCTCAG 1222
Query 1259 GACACTCTGGAGGCTCCAGCCTCCCACCCACAGGGCCGCCCTCCACACC------------------------- 1307
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1223 GACACTCTGGAGGCTCCAGCCTCCCACCCACAGGGCCGCCCTCCACACCTGGAGGTCCTGAGGACCAGCCCCTT 1296
Query 1308 --------------------------TGGTCTGGGAAGATACCTGGAGGTTTTGATTGGGGTCTCGGTGGCCTT 1355
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1297 AACCCCCCAGGGTCAGGCCCTCAGAATGGTCTGGGAAGATACCTGGAGGTTTTGATTGGGGTCTCGGTGGCCTT 1370
Query 1356 CGTCCTGCTGCTCTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCGACGTCAGCGTCACAGCAAACACAGGACATCTGACC 1429
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1371 CGTCCTGCTGCTCTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCTCCGTCAGCGTCACAGCAAACACAGGACATCTGACC 1444
Query 1430 AGAGAAAGACTGATTTCCAGCGTCCTGCAGGGGCTGCGGAGACAGAGCCCAAGGACAGGGGCCTGCTGAGGAGG 1503
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1445 AGAGAAAGACTGATTTCCAGCGTCCTGCAGGGGCTGCGGAGACAGAGCCCAAGGACAGGGGCCTGCTGAGGAGG 1518
Query 1504 TCCAGCCCAGCTGCTGACGTCCAGGAAGAAAACCTCT---ATGCTGCCGTGAAGGACACACAGTCTGAGGACAG 1574
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1519 TCCAGCCCAGCTGCTGACGTCCAGGAAGAAAACCTCTCAGATGCTGCTGTGAAGGACACACAGTCTGAGGACAG 1592
Query 1575 GGTGGAGCTGGACAGTCAGAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGACGTATGCCCCGGTGAAACACTCCA 1648
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1593 GGTGGAGCTGGACAGTCAGAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGACGTATGCCCCGGTGAAACACTCCA 1666
Query 1649 GTCCTAGGAGAGAAATGGCCTCTCCTCCCTCCTCACTGTCTGGGGAATTCCTGGACACAAAGGACAGACAGGTG 1722
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1667 GTCCTAGGAGAGAAATGGCCTCTCCTCCCTCCTCACTGTCTGGGGAATTCCTGGACACAAAGGACAGACAGGTG 1740
Query 1723 GAAGAGGACAGGCAGATGGACACTGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCTCCCAGGATGTGACCTACGCCCAGCTGCA 1796
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1741 GAAGAGGACAGGCAGATGGACACTGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCTCCCAGGATGTGACCTACGCCCAGCTGCA 1814
Query 1797 CAGCTTGACCCTTAGACGGAAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAGGGGAACCTCCAGCTGAGCCCAGCA 1870
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1815 CAGCTTGACCCTTAGACGGAAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAGGGGAACCTCCAGCTGAGCCCAGCA 1888
Query 1871 TCTACGCCACTCTGGCCATCCAC 1893
|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1889 TCTACGCCACTCTGGCCATCCAC 1911