Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11582
- Subject:
- XM_017026222.1
- Aligned Length:
- 1896
- Identities:
- 1833
- Gaps:
- 39
Alignment
Query 1 ATGACGCCCGCCCTCACAGCCCTGCTCTGCCTTGGGCTGAGTCTGGGCCCCAGGACCCGCGTGCAGGCAGGGCC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1 ATGACGCCCGCCCTCACAGCCCTGCTCTGCCTT------------------------------------GGGCC 38
Query 75 CTTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCAGCTGGGGGAGCCCCGTGACCATCTGGTGTC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 39 CTTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCAGCTGGGGGAGCCCCGTGACCATCTGGTGTC 112
Query 149 AGGGGAGCCTGGAGGCCCAGGAGTACCGACTGGATAAAGAGGGAAGCCCAGAGCCCTTGGACAGAAATAACCCA 222
|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 113 AGGGGAGCCTGGAGGCCCAGGAGTACCAACTGGATAAAGAGGGAAGCCCAGAGCCCTGGGACAGAAATAACCCA 186
Query 223 CTGGAACCCAAGAACAAGGCCAGATTCTCCATCCCATCCATGACAGAGCACCATGCGGGGAGATACCGCTGCCA 296
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 187 CTGGAACCCAAGAACAAGGCCAGATTCTCCATCCCATCCATGACACAGCACCATGCAGGGAGATACCGCTGCCA 260
Query 297 CTATTACAGCTCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGCGACCCCCTGGAGCTGGTGATGACAGGATTCTACAACAAAC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 261 CTATTACAGCTCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGCGACCCCCTGGAGCTGGTGATGACAGGATTCTACAACAAAC 334
Query 371 CCACCCTCTCAGCCCTGCCCAGCCCTGTGGTGGCCTCAGGGGGGAATATGACCCTCCGATGTGGCTCACAGAAG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 335 CCACCCTCTCAGCCCTGCCCAGCCCTGTGGTGGCCTCAGGGGGGAATATGACCCTCCGATGTGGCTCACAGAAG 408
Query 445 GGATATCACCATTTTGTTCTGATGAAGGAAGGAGAACACCAGCTCCCCCGGACCCTGGACTCACAGCAGCTCCA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 409 GGATATCACCATTTTGTTCTGATGAAGGAAGGAGAACACCAGCTCCCCCGGACCCTGGACTCACAGCAGCTCCA 482
Query 519 CAGTGGGGGGTTCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGCCCCGTGAACCCCAGCCACAGGTGGAGGTTCACATGCTATT 592
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 483 CAGTGGGGGGTTCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGCCCCGTGACCCCCAGCCACAGGTGGAGGTTCACATGCTATT 556
Query 593 ACTATTATATGAACACCCCCCAGGTGTGGTCCCACCCCAGTGACCCCCTGGAGATTCTGCCCTCAGGCGTGTCT 666
|||||||||..|||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 557 ACTATTATACAAACACCCCCTGGGTGTGGTCCCACCCCAGTGACCCCCTGGAGATTCTGCCCTCAGGCGTGTCT 630
Query 667 AGGAAGCCCTCCCTCCTGACCCTGCAGGGCCCTGTCCTGGCCCCTGGGCAGAGCCTGACCCTCCAGTGTGGCTC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 631 AGGAAGCCCTCCCTCCTGACCCTGCAGGGCCCTGTCCTGGCCCCTGGGCAGAGCCTGACCCTCCAGTGTGGCTC 704
Query 741 TGATGTCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGGGAACGTGACTTCCTCCAGCGCCCTGGCCAGCAGC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 705 TGATGTCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGGGAACGTGACTTCCTCCAGCGCCCTGGCCAGCAGC 778
Query 815 CCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCCACGGGGGCCAGTACAGGTGC 888
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 779 CCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGGTGC 852
Query 889 TATGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGAACATCCTGATGGCAGGACAGAT 962
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||..||||||||||
Sbjct 853 TATGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGTGACCCCCTGGACATCCTGATCACAGGACAGAT 926
Query 963 CTATGACACCGTCTCCCTGTCAGCACAGCCGGGCCCCACAGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 927 CTATGACACCGTCTCCCTGTCAGCACAGCCGGGCCCCACAGTGGCCTCAGGAGAGAACATGACCCTGCTGTGTC 1000
Query 1037 AGTCATGGTGGCAGTTTGACACTTTCCTTCTGACCAAAGAAGGGGCAGCCCATCCCCCACTGCGTCTGAGATCA 1110
|||||.||.||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1001 AGTCACGGGGGTATTTTGACACTTTCCTTCTGACCAAAGAAGGGGCAGCCCATCCCCCACTGCGTCTGAGATCA 1074
Query 1111 ATGTACGGAGCTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCATGAGTCCTGTGACCTCAGCCCACGCGGGGACCTACAG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1075 ATGTACGGAGCTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCATGAGTCCTGTGACCTCAGCCCACGCGGGGACCTACAG 1148
Query 1185 GTGCTACGGCTCATACAGCTCCAACCCCCACCTGCTGTCTTTCCCCAGTGAGCCCCTGGAACTCATGGTCTCAG 1258
|||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1149 GTGCTACGGCTCACGCAGCTCCAACCCCCACCTGCTGTCTTTCCCCAGTGAGCCCCTGGAACTCATGGTCTCAG 1222
Query 1259 GACACTCTGGAGGCTCCAGCCTCCCACCCACAGGGCCGCCCTCCACACCTGGTCTGGGAAGATACCTGGAGGTT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1223 GACACTCTGGAGGCTCCAGCCTCCCACCCACAGGGCCGCCCTCCACACCTGGTCTGGGAAGATACCTGGAGGTT 1296
Query 1333 TTGATTGGGGTCTCGGTGGCCTTCGTCCTGCTGCTCTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCGACGTCAGCGTCA 1406
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||
Sbjct 1297 TTGATTGGGGTCTCGGTGGCCTTCGTCCTGCTGCTCTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCTCCGTCAGCGTCA 1370
Query 1407 CAGCAAACACAGGACATCTGACCAGAGAAAGACTGATTTCCAGCGTCCTGCAGGGGCTGCGGAGACAGAGCCCA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1371 CAGCAAACACAGGACATCTGACCAGAGAAAGACTGATTTCCAGCGTCCTGCAGGGGCTGCGGAGACAGAGCCCA 1444
Query 1481 AGGACAGGGGCCTGCTGAGGAGGTCCAGCCCAGCTGCTGACGTCCAGGAAGAAAACCTCTATGCTGCCGTGAAG 1554
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1445 AGGACAGGGGCCTGCTGAGGAGGTCCAGCCCAGCTGCTGACGTCCAGGAAGAAAACCTCTATGCTGCTGTGAAG 1518
Query 1555 GACACACAGTCTGAGGACAGGGTGGAGCTGGACAGT---CAGAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGAC 1625
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1519 GACACACAGTCTGAGGACAGGGTGGAGCTGGACAGTCAGCAGAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGAC 1592
Query 1626 GTATGCCCCGGTGAAACACTCCAGTCCTAGGAGAGAAATGGCCTCTCCTCCCTCCTCACTGTCTGGGGAATTCC 1699
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1593 GTATGCCCCGGTGAAACACTCCAGTCCTAGGAGAGAAATGGCCTCTCCTCCCTCCTCACTGTCTGGGGAATTCC 1666
Query 1700 TGGACACAAAGGACAGACAGGTGGAAGAGGACAGGCAGATGGACACTGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCTCCCAG 1773
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1667 TGGACACAAAGGACAGACAGGTGGAAGAGGACAGGCAGATGGACACTGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCTCCCAG 1740
Query 1774 GATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTTAGACGGAAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAGG 1847
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1741 GATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTTAGACGGAAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAGG 1814
Query 1848 GGAACCTCCAGCTGAGCCCAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCAC 1893
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1815 GGAACCTCCAGCTGAGCCCAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCAC 1860