Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11582
• Subject: XM_017030296.1
• Aligned Length: 1896
• Identities: 1871
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGACGCCCGCCCTCACAGCCCTGCTCTGCCTTGGGCTGAGTCTGGGCCCCAGGACCCGCGTGCAGGCAGGGCC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACGCCCGCCCTCACAGCCCTGCTCTGCCTTGGGCTGAGTCTGGGCCCCAGGACCCGCGTGCAGGCAGGGCC  74

Query   75  CTTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCAGCTGGGGGAGCCCCGTGACCATCTGGTGTC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCAGCTGGGGGAGCCCCGTGACCATCTGGTGTC  148

Query  149  AGGGGAGCCTGGAGGCCCAGGAGTACCGACTGGATAAAGAGGGAAGCCCAGAGCCCTTGGACAGAAATAACCCA  222
            |||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGGGAGCCAGGAGGCCCAGGAGTACCGACTGCATAAAGAGGGAAGCCCAGAGCCCTTGGACAGAAATAACCCA  222

Query  223  CTGGAACCCAAGAACAAGGCCAGATTCTCCATCCCATCCATGACAGAGCACCATGCGGGGAGATACCGCTGCCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  223  CTGGAACCCAAGAACAAGGCCAGATTCTCCATCCCATCCATGACAGAGCACCATGCAGGGAGATACCGCTGCCA  296

Query  297  CTATTACAGCTCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGCGACCCCCTGGAGCTGGTGATGACAGGATTCTACAACAAAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||..|||||.|||||
Sbjct  297  CTATTACAGCTCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGCGACCCCCTGGAGATGGTGATGACAGGAGCCTACAGCAAAC  370

Query  371  CCACCCTCTCAGCCCTGCCCAGCCCTGTGGTGGCCTCAGGGGGGAATATGACCCTCCGATGTGGCTCACAGAAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCACCCTCTCAGCCCTGCCCAGCCCTGTGGTGGCCTCAGGGGGGAATATGACCCTCCGATGTGGCTCACAGAAG  444

Query  445  GGATATCACCATTTTGTTCTGATGAAGGAAGGAGAACACCAGCTCCCCCGGACCCTGGACTCACAGCAGCTCCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGATATCACCATTTTGTTCTGATGAAGGAAGGAGAACACCAGCTCCCCCGGACCCTGGACTCACAGCAGCTCCA  518

Query  519  CAGTGGGGGGTTCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGCCCCGTGAACCCCAGCCACAGGTGGAGGTTCACATGCTATT  592
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAGTCGGGGGTTCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGCCCCGTGACCCCCAGCCACAGGTGGAGGTTCACATGCTATT  592

Query  593  ACTATTATATGAACACCCCCCAGGTGTGGTCCCACCCCAGTGACCCCCTGGAGATTCTGCCCTCAGGCGTGTCT  666
            |||||||||..|||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACTATTATACAAACACCCCCTGGGTGTGGTCCCACCCCAGTGACCCCCTGGAGATTCTGCCCTCAGGCGTGTCT  666

Query  667  AGGAAGCCCTCCCTCCTGACCCTGCAGGGCCCTGTCCTGGCCCCTGGGCAGAGCCTGACCCTCCAGTGTGGCTC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGGAAGCCCTCCCTCCTGACCCTGCAGGGCCCTGTCCTGGCCCCTGGGCAGAGCCTGACCCTCCAGTGTGGCTC  740

Query  741  TGATGTCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGGGAACGTGACTTCCTCCAGCGCCCTGGCCAGCAGC  814
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGATGTCGGCTACAACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGGGAACGTGACTTCCTCCAGCGCCCTGGCCAGCAGC  814

Query  815  CCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCCACGGGGGCCAGTACAGGTGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|.||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCCCTCCAATGGGGGCCAGTACAGGTGC  888

Query  889  TATGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGAACATCCTGATGGCAGGACAGAT  962
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TACGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGAACATCCTGATGGCAGGACAGAT  962

Query  963  CTATGACACCGTCTCCCTGTCAGCACAGCCGGGCCCCACAGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTATGACACCGTCTCCCTGTCAGCACAGCCGGGCCCCACAGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTC  1036

Query 1037  AGTCATGGTGGCAGTTTGACACTTTCCTTCTGACCAAAGAAGGGGCAGCCCATCCCCCACTGCGTCTGAGATCA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGTCATGGTGGCAGTTTGACACTTTCCTTCTGACCAAAGAAGGGGCAGCCCATCCCCCACTGCGTCTGAGATCA  1110

Query 1111  ATGTACGGAGCTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCATGAGTCCTGTGACCTCAGCCCACGCGGGGACCTACAG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATGTACGGAGCTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCATGAGTCCTGTGACCTCAGCCCACGCGGGGACCTACAG  1184

Query 1185  GTGCTACGGCTCATACAGCTCCAACCCCCACCTGCTGTCTTTCCCCAGTGAGCCCCTGGAACTCATGGTCTCAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||.|||.|||||||||
Sbjct 1185  GTGCTACGGCTCATACAGCTCCAACCCCCACCTGCTGTCTCACCCCAGTGAGCCCCTGGAGCTCGTGGTCTCAG  1258

Query 1259  GACACTCTGGAGGCTCCAGCCTCCCACCCACAGGGCCGCCCTCCACACCTGGTCTGGGAAGATACCTGGAGGTT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GACACTCTGGAGGCTCCAGCCTCCCACCCACAGGGCCGCCCTCCACACCTGGTCTGGGAAGATACCTGGAGGTT  1332

Query 1333  TTGATTGGGGTCTCGGTGGCCTTCGTCCTGCTGCTCTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCGACGTCAGCGTCA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TTGATTGGGGTCTCGGTGGCCTTCGTCCTGCTGCTCTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCGACGTCAGCGTCA  1406

Query 1407  CAGCAAACACAGGACATCTGACCAGAGAAAGACTGATTTCCAGCGTCCTGCAGGGGCTGCGGAGACAGAGCCCA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CAGCAAACACAGGACATCTGACCAGAGAAAGACTGATTTCCAGCGTCCTGCAGGGGCTGCGGAGACAGAGCCCA  1480

Query 1481  AGGACAGGGGCCTGCTGAGGAGGTCCAGCCCAGCTGCTGACGTCCAGGAAGAAAACCTCTATGCTGCCGTGAAG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGGACAGGGGCCTGCTGAGGAGGTCCAGCCCAGCTGCTGACGTCCAGGAAGAAAACCTCTATGCTGCCGTGAAG  1554

Query 1555  GACACACAGTCTGAGGACAGGGTGGAGCTGGACAGT---CAGAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGAC  1625
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GACACACAGTCTGAGGACAGGGTGGAGCTGGACAGTCAGCAGAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGAC  1628

Query 1626  GTATGCCCCGGTGAAACACTCCAGTCCTAGGAGAGAAATGGCCTCTCCTCCCTCCTCACTGTCTGGGGAATTCC  1699
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GTATGCCCCGGTGAAACACTCCAGTCCTAGGAGAGAAATGGCCTCTCCTCCCTCCTCACTGTCTGGGGAATTCC  1702

Query 1700  TGGACACAAAGGACAGACAGGTGGAAGAGGACAGGCAGATGGACACTGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCTCCCAG  1773
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TGGACACAAAGGACAGACAGGTGGAAGAGGACAGGCAGATGGACACTGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCTCCCAG  1776

Query 1774  GATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTTAGACGGAAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAGG  1847
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTTAGACGGAAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAGG  1850

Query 1848  GGAACCTCCAGCTGAGCCCAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCAC  1893
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GGAACCTCCAGCTGAGCCCAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCAC  1896