Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11582
- Subject:
- XR_001753596.1
- Aligned Length:
- 1987
- Identities:
- 1481
- Gaps:
- 483
Alignment
Query 1 ---------------ATGACGCCCGCCCTCACAGCCCTGCTCTGCCTTGGGCTGAGTCTGGGCCCCAGGACCCG 59
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CCGGGAGGAGACGCCATGACGCCCGCCCTCACAGCCCTGCTCTGCCTT-------------------------- 48
Query 60 CGTGCAGGCAGGGCCCTTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCAGCTGGGGGAGCCCCG 133
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 49 ----------GGGCCCTTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCAGCTGGGGGAGCCCCG 112
Query 134 TGACCATCTGGTGTCAGGGGAGCCTGGAGGCCCAGGAGTACCGACTGGATAAAGAGGGAAGCCCAGAGCCCTTG 207
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 113 TGACCATCTGGTGTCAGGGGAGCCTGGAGGCCCAGGAGTACCAACTGGATAAAGAGGGAAGCCCAGAGCCCTGG 186
Query 208 GACAGAAATAACCCACTGGAACCCAAGAACAAGGCCAGATTCTCCATCCCATCCATGACAGAGCACCATGCGGG 281
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||
Sbjct 187 GACAGAAATAACCCACTGGAACCCAAGAACAAGGCCAGATTCTCCATCCCATCCATGACACAGCACCATGCAGG 260
Query 282 GAGATACCGCTGCCACTATTACAGCTCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGCGACCCCCTGGAGCTGGTGATGACAG 355
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 261 GAGATACCGCTGCCACTATTACAGCTCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGCGACCCCCTGGAGCTGGTGATGACAG 334
Query 356 GATTCTACAACAAACCCACCCTCTCAGCCCTGCCCAGCCCTGTGGTGGCCTCAGGGGGGAATATGACCCTCCGA 429
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 335 GATTCTACAACAAACCCACCCTCTCAGCCCTGCCCAGCCCTGTGGTGGCCTCAGGGGGGAATATGACCCTCCGA 408
Query 430 TGTGGCTCACAGAAGGGATATCACCATTTTGTTCTGATGAAGGAAGGAGAACACCAGCTCCCCCGGACCCTGGA 503
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 409 TGTGGCTCACAGAAGGGATATCACCATTTTGTTCTGATGAAGGAAGGAGAACACCAGCTCCCCCGGACCCTGGA 482
Query 504 CTCACAGCAGCTCCACAGTGGGGGGTTCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGCCCCGTGAACCCCAGCCACAGGTGGA 577
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 483 CTCACAGCAGCTCCACAGTGGGGGGTTCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGCCCCGTGACCCCCAGCCACAGGTGGA 556
Query 578 GGTTCACATGCTATTACTATTATATGAACACCCCCCAGGTGTGGTCCCACCCCAGTGACCCCCTGGAGATTCTG 651
||||||||||||||||||||||||..|||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 557 GGTTCACATGCTATTACTATTATACAAACACCCCCTGGGTGTGGTCCCACCCCAGTGACCCCCTGGAGATTCTG 630
Query 652 CCCTCAGGCGTGTCTAGGAAGCCCTCCCTCCTGACCCTGCAGGGCCCTGTCCTGGCCCCTGGGCAGAGCCTGAC 725
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 631 CCCTCAGGCGTGTCTAGGAAGCCCTCCCTCCTGACCCTGCAGGGCCCTGTCCTGGCCCCTGGGCAGAGCCTGAC 704
Query 726 CCTCCAGTGTGGCTCTGATGTCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGGGAACGTGACTTCCTCCAGC 799
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 705 CCTCCAGTGTGGCTCTGATGTCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGGGAACGTGACTTCCTCCAGC 778
Query 800 GCCCTGGCCAGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCCACGGG 873
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 779 GCCCTGGCCAGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGG 852
Query 874 GGCCAGTACAGGTGCTATGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGAACATCCT 947
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||
Sbjct 853 GGCCAGTACAGGTGCTATGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGTGACCCCCTGGACATCCT 926
Query 948 GATGGCAGGACAGATCTATGACACCGTCTCCCTGTCAGCACAGCCGGGCCCCACAGTGGCCTCAGGAGAGAACG 1021
|||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 927 GATCACAGGACAGATCTATGACACCGTCTCCCTGTCAGCACAGCCGGGCCCCACAGTGGCCTCAGGAGAGAACA 1000
Query 1022 TGACCCTGCTGTGTCAGTCATGGTGGCAGTTTGACACTTTCCTTCTGACCAAAGAAGGGGCAGCCCATCCCCCA 1095
||||||||||||||||||||.||.||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1001 TGACCCTGCTGTGTCAGTCACGGGGGTATTTTGACACTTTCCTTCTGACCAAAGAAGGGGCAGCCCATCCCCCA 1074
Query 1096 CTGCGTCTGAGATCAATGTACGGAGCTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCATGAGTCCTGTGACCTCAGCCCA 1169
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1075 CTGCGTCTGAGATCAATGTACGGAGCTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCATGAGTCCTGTGACCTCAGCCCA 1148
Query 1170 CGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCATACAGCTCCAACCCCCACCTGCTGTCTTTCCCCAGTGAGCCCCTGG 1243
||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1149 CGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCACGCAGCTCCAACCCCCACCTGCTGTCTTTCCCCAGTGAGCCCCTGG 1222
Query 1244 AACTCATGGTCTCAGGACACTCTGGAGGCTCCAGCCTCCCACCCACAGGGCCGCCCTCCACACC---------- 1307
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1223 AACTCATGGTCTCAGGACACTCTGGAGGCTCCAGCCTCCCACCCACAGGGCCGCCCTCCACACCTGGAGGTCCT 1296
Query 1308 -----------------------------------------TGGTCTGGGAAGATACCTGGAGGTTTTGATTGG 1340
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1297 GAGGACCAGCCCCTTAACCCCCCAGGGTCAGGCCCTCAGAATGGTCTGGGAAGATACCTGGAGGTTTTGATTGG 1370
Query 1341 GGTCTCGGTGGCCTTCGTCCTGCTGCTCTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCGACGTCAGCGTCACAGCAAAC 1414
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||
Sbjct 1371 GGTCTCGGTGGCCTTCGTCCTGCTGCTCTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCTCCGTCAGCGTCACAGCAAAC 1444
Query 1415 ACAGGACATCT----------------------------GACCAGAGAAAGACTGATTTCCAGCGTCCTGCAGG 1460
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1445 ACAGGACATCTGGGCTGAGACTCTGTCCATCTTCACCCAGACCAGAGAAAGACTGATTTCCAGCGTCCTGCAGG 1518
Query 1461 GGCTGCGGAGACAGAGCCCAAGGACAGGGGCCTGCTGAGGAGGTCCAGCCCAGCTGCTGACGTCCAGGAAGAAA 1534
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1519 GGCTGCGGAGACAGAGCCCAAGGACAGGGGCCTGCTGAGGAGGTCCAGCCCAGCTGCTGACGTCCAGGAAGAAA 1592
Query 1535 ACCTCTATGCTGCCGTGAAGGACACACAGTCTGAGGACAGGGTGGAGCTGGACAGTCAGAGCCCACACGATGAA 1608
||||||
Sbjct 1593 ACCTCT-------------------------------------------------------------------- 1598
Query 1609 GACCCCCAGGCAGTGACGTATGCCCCGGTGAAACACTCCAGTCCTAGGAGAGAAATGGCCTCTCCTCCCTCCTC 1682
Sbjct 1599 -------------------------------------------------------------------------- 1598
Query 1683 ACTGTCTGGGGAATTCCTGGACACAAAGGACAGACAGGTGGAAGAGGACAGGCAGATGGACACTGAGGCTGCTG 1756
Sbjct 1599 -------------------------------------------------------------------------- 1598
Query 1757 CATCTGAAGCCTCCCAGGATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTTAGACGGAAGGCAACTGAGCCT 1830
Sbjct 1599 -------------------------------------------------------------------------- 1598
Query 1831 CCTCCATCCCAGGAAGGGGAACCTCCAGCTGAGCCCAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCAC 1893
Sbjct 1599 --------------------------------------------------------------- 1598