Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11582
- Subject:
- XR_001756804.1
- Aligned Length:
- 2263
- Identities:
- 1871
- Gaps:
- 370
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGACAAGAAGGACCCAGCCTCCGAGCGGCCACACCCTGTGTGTCTCTCTGTCCTGCCAGCACTGAGGGCTCAT 74
Query 1 -------------------------------------ATGACGCCCGCCCTCACAGCCCTGCTCTGCCTTGGGC 37
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCCTCTGCAGAGCGCGGGGTCACCGGGAGGAGACGCCATGACGCCCGCCCTCACAGCCCTGCTCTGCCTTGGGC 148
Query 38 TGAGTCTGGGCCCCAGGACCCGCGTGCAGGCAGGGCCCTTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCT 111
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGAGTCTGGGCCCCAGGACCCGCGTGCAGGCAGGGCCCTTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCT 222
Query 112 GTGATCAGCTGGGGGAGCCCCGTGACCATCTGGTGTCAGGGGAGCCTGGAGGCCCAGGAGTACCGACTGGATAA 185
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 223 GTGATCAGCTGGGGGAGCCCCGTGACCATCTGGTGTCAGGGGAGCCAGGAGGCCCAGGAGTACCGACTGCATAA 296
Query 186 AGAGGGAAGCCCAGAGCCCTTGGACAGAAATAACCCACTGGAACCCAAGAACAAGGCCAGATTCTCCATCCCAT 259
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGAGGGAAGCCCAGAGCCCTTGGACAGAAATAACCCACTGGAACCCAAGAACAAGGCCAGATTCTCCATCCCAT 370
Query 260 CCATGACAGAGCACCATGCGGGGAGATACCGCTGCCACTATTACAGCTCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGCGAC 333
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CCATGACAGAGCACCATGCAGGGAGATACCGCTGCCACTATTACAGCTCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGCGAC 444
Query 334 CCCCTGGAGCTGGTGATGACAGGATTCTACAACAAACCCACCCTCTCAGCCCTGCCCAGCCCTGTGGTGGCCTC 407
|||||||||.||||||||||||||..|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CCCCTGGAGATGGTGATGACAGGAGCCTACAGCAAACCCACCCTCTCAGCCCTGCCCAGCCCTGTGGTGGCCTC 518
Query 408 AGGGGGGAATATGACCCTCCGATGTGGCTCACAGAAGGGATATCACCATTTTGTTCTGATGAAGGAAGGAGAAC 481
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGGGGGGAATATGACCCTCCGATGTGGCTCACAGAAGGGATATCACCATTTTGTTCTGATGAAGGAAGGAGAAC 592
Query 482 ACCAGCTCCCCCGGACCCTGGACTCACAGCAGCTCCACAGTGGGGGGTTCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGCCCC 555
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACCAGCTCCCCCGGACCCTGGACTCACAGCAGCTCCACAGTCGGGGGTTCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGCCCC 666
Query 556 GTGAACCCCAGCCACAGGTGGAGGTTCACATGCTATTACTATTATATGAACACCCCCCAGGTGTGGTCCCACCC 629
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||..|||||||||||||||
Sbjct 667 GTGACCCCCAGCCACAGGTGGAGGTTCACATGCTATTACTATTATACAAACACCCCCTGGGTGTGGTCCCACCC 740
Query 630 CAGTGACCCCCTGGAGATTCTGCCCTCAGGCGTGTCTAGGAAGCCCTCCCTCCTGACCCTGCAGGGCCCTGTCC 703
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CAGTGACCCCCTGGAGATTCTGCCCTCAGGCGTGTCTAGGAAGCCCTCCCTCCTGACCCTGCAGGGCCCTGTCC 814
Query 704 TGGCCCCTGGGCAGAGCCTGACCCTCCAGTGTGGCTCTGATGTCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAG 777
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGGCCCCTGGGCAGAGCCTGACCCTCCAGTGTGGCTCTGATGTCGGCTACAACAGATTTGTTCTGTATAAGGAG 888
Query 778 GGGGAACGTGACTTCCTCCAGCGCCCTGGCCAGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGG 851
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GGGGAACGTGACTTCCTCCAGCGCCCTGGCCAGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGG 962
Query 852 CCCTGTGAGCCGCTCCCACGGGGGCCAGTACAGGTGCTATGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCC 925
|||||||||||.||||.|.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CCCTGTGAGCCCCTCCAATGGGGGCCAGTACAGGTGCTACGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCC 1036
Query 926 CCAGCGACCCCCTGAACATCCTGATGGCAGGACAGATCTATGACACCGTCTCCCTGTCAGCACAGCCGGGCCCC 999
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CCAGCGACCCCCTGAACATCCTGATGGCAGGACAGATCTATGACACCGTCTCCCTGTCAGCACAGCCGGGCCCC 1110
Query 1000 ACAGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCATGGTGGCAGTTTGACACTTTCCTTCTGACCAA 1073
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ACAGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCATGGTGGCAGTTTGACACTTTCCTTCTGACCAA 1184
Query 1074 AGAAGGGGCAGCCCATCCCCCACTGCGTCTGAGATCAATGTACGGAGCTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCA 1147
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AGAAGGGGCAGCCCATCCCCCACTGCGTCTGAGATCAATGTACGGAGCTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCA 1258
Query 1148 TGAGTCCTGTGACCTCAGCCCACGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCATACAGCTCCAACCCCCACCTGCTG 1221
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TGAGTCCTGTGACCTCAGCCCACGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCATACAGCTCCAACCCCCACCTGCTG 1332
Query 1222 TCTTTCCCCAGTGAGCCCCTGGAACTCATGGTCTCAGGACACTCTGGAGGCTCCAGCCTCCCACCCACAGGGCC 1295
|||..||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TCTCACCCCAGTGAGCCCCTGGAGCTCGTGGTCTCAGGACACTCTGGAGGCTCCAGCCTCCCACCCACAGGGCC 1406
Query 1296 GCCCTCCACACCTGGTCTGGGAAGATACCTGGAGGTTTTGATTGGGGTCTCGGTGGCCTTCGTCCTGCTGCTCT 1369
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GCCCTCCACACCTGGTCTGGGAAGATACCTGGAGGTTTTGATTGGGGTCTCGGTGGCCTTCGTCCTGCTGCTCT 1480
Query 1370 TCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCGACGTCAGCGTCACAGCAAACACAGGACATCT------------------ 1425
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCGACGTCAGCGTCACAGCAAACACAGGACATCTGGGCTGAGACTCTGTCCA 1554
Query 1426 ----------GACCAGAGAAAGACTGATTTCCAGCGTCCTGCAGGGGCTGCGGAGACAGAGCCCAAGGACAGGG 1489
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 TCTTCACCCAGACCAGAGAAAGACTGATTTCCAGCGTCCTGCAGGGGCTGCGGAGACAGAGCCCAAGGACAGGG 1628
Query 1490 GCCTGCTGAGGAGGTCCAGCCCAGCTGCTGACGTCCAGGAAGAAAACCTCTATGCTGCCGTGAAGGACACACAG 1563
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GCCTGCTGAGGAGGTCCAGCCCAGCTGCTGACGTCCAGGAAGAAAACCTCTATGCTGCCGTGAAGGACACACAG 1702
Query 1564 TCTGAGGACAGGGTGGAGCTGGACAGTCAGAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGACGTATGCCCCGGT 1637
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TCTGAGGACAGGGTGGAGCTGGACAGTCAGAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGACGTATGCCCCGGT 1776
Query 1638 GAAACACTCCAGTCCTAGGAGAGAAATGGCCTCTCCTCCCTCCTCACTGTCTGGGGAATTCCTGGACACAAAGG 1711
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GAAACACTCCAGTCCTAGGAGAGAAATGGCCTCTCCTCCCTCCTCACTGTCTGGGGAATTCCTGGACACAAAGG 1850
Query 1712 ACAGACAGGTGGAAGAGGACAGGCAGATGGACACTGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCTCCCAGGATGTGACCTAC 1785
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 ACAGACAGGTGGAAGAGGACAGGCAGATGGACACTGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCTCCCAGGATGTGACCTAC 1924
Query 1786 GCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTTAGACGGAAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAGGGGAACCTCCAGC 1859
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 GCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTTAGACGGAAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAGGGGAACCTCCAGC 1998
Query 1860 TGAGCCCAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCAC---------------------------------------- 1893
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 TGAGCCCAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCACTAGCCCGGGGGGTACGCAGACCCCACACTCAGCAGAAGGA 2072
Query 1894 -------------------------------------------------------------------------- 1893
Sbjct 2073 GACTCAGGACTGCTGAAGGCACGGGAGCTGCCCCCAGTGGACACCAGTGAACCCCAGTCAGCCTGGACCCCTAA 2146
Query 1894 -------------------------------------------------------------------------- 1893
Sbjct 2147 CACAGACCATGAGGAGACGCTGGGAACTTGTGGGACTCACCTGACTCAAAGATGACTAATATCGTCCCATTTTG 2220
Query 1894 ------------------------------------------- 1893
Sbjct 2221 GAAATAAAGCAACAGACTTCTCAACAATCAATGAGTTAATAAC 2263