Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11611
- Subject:
- XM_006502325.2
- Aligned Length:
- 1398
- Identities:
- 1313
- Gaps:
- 6
Alignment
Query 1 ATGAAGGAGCCGGATGCCATCAAGCTGTTTGTGGGGCAGATCCCGAGGCACCTGGAGGAGAAGGACCTGAAGCC 74
|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAAGGAGCCAGATGCCATCAAGCTGTTTGTGGGGCAGATCCCGAGGCATCTGGAGGAAAAGGACCTGAAGCC 74
Query 75 CATCTTCGAACAGTTTGGTCGGATCTTTGAGCTGACTGTCATCAAGGACAAGTACACCGGGCTGCACAAGGGAT 148
|||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CATCTTCGAGCAGTTTGGTCGGATCTTCGAGCTGACTGTCATCAAGGACAAGTACACCGGGCTGCACAAGGGAT 148
Query 149 GTGCCTTCCTGACATACTGTGCCCGGGATTCAGCCCTGAAGGCCCAGAGCGCCCTGCACGAACAGAAGACGCTT 222
||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 149 GTGCTTTCCTGACGTACTGTGCTCGCGATTCAGCCCTGAAGGCCCAGAGTGCCCTGCACGAACAGAAGACTCTC 222
Query 223 CCAGGGATGAACAGGCCGATCCAGGTCAAGCCAGCCGACAGCGAGAGCCGAGGAGAAGACCGGAAGCTCTTTGT 296
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CCAGGGATGAACAGGCCGATCCAGGTCAAGCCAGCCGACAGCGAGAGTCGAGGAGAAGACCGGAAGCTCTTTGT 296
Query 297 GGGGATGCTAGGGAAGCAGCAGACAGATGAGGACGTCCGGAAGATGTTTGAGCCCTTCGGGACCATCGACGAGT 370
|||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||||||
Sbjct 297 GGGCATGCTAGGAAAGCAGCAGACAGATGAGGATGTCCGGAAGATGTTTGAACCATTTGGGACTATAGACGAGT 370
Query 371 GCACTGTGCTCCGGGGGCCAGATGGCACCAGCAAAGGCTGCGCCTTCGTGAAGTTCCAGACCCACGCTGAGGCC 444
||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 371 GCACTGTGCTCCGGGGGCCAGACGGTACCAGCAAAGGCTGTGCCTTTGTGAAGTTCCAGACTCACGCTGAGGCC 444
Query 445 AAGGCGGCCATCAACACCCTTCACAGCAGCCGGACCCTGCCAGGTGCCTCGTCCAGCCTGGTGGTGAAGTTTGC 518
.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 445 CAGGCAGCCATCAACACCCTTCACAGCAGCCGGACCCTACCGGGTGCCTCATCCAGCCTGGTGGTAAAGTTTGC 518
Query 519 TGACACTGAGAAGGAGCGAGGTCTCCGCCGCATGCAGCAGGTGGCCACCCAGTTGGGCATGTTCAGCCCCATCA 592
||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||.|||.
Sbjct 519 TGACACGGAGAAGGAGCGAGGTCTCCGTCGAATGCAGCAGGTGGCTACCCAGCTGGGCATGTTCAGCCCGATCG 592
Query 593 CCCTCCAGTTTGGAGCCTACAGCGCCTACACCCAGGCCCTGATGCAGCAGCAGGCGGCCCTGGTAGCGGCTCAC 666
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 593 CCCTCCAGTTTGGAGCCTACAGCGCCTACACCCAGGCCCTGATGCAGCAGCAGGCGGCCCTGGTAGCAGCTCAC 666
Query 667 AGTGCCTACCTCAGCCCCATGGCCACCATGGCTGCCGTGCAGATGCAGCACATGGCTGCCATCAATGCCAATGG 740
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 667 AGTGCCTACCTCAGCCCTATGGCCACCATGGCTGCCGTGCAGATGCAGCACATGGCTGCCATCAGTGCCAATGG 740
Query 741 CCTCATCGCCACCCCCATCACCCCATCCTCAGGAACCAGCACCCCTCCTGCCATCGCTGCCACGCCTGTCTCTG 814
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 741 CCTCATCGCCACCCCCATCACTCCATCCTCAGGAACCAGCACCCCTCCTGCCATTGCTGCCACGCCCGTCTCTG 814
Query 815 CCATTCCGGCTGCCCTGGGCGTCAACGGCTACAGCCAGGTGCCCACCCAGCCCACTGGGCAGCCTGCCCCTGAT 888
||||.||.||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct 815 CCATCCCTGCTGCCTTGGGCGTCAACGGCTACAGCCCGGTGCCCACCCAGCCTACAGGGCAGCCTGCCCCGGAT 888
Query 889 GCTCTGTATCCCAACGGGGTTCACCCCTACCCAGCCCAGAGCCCCGCGGCCCCCGTGGACCCCCTGCAGCAGGC 962
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct 889 GCTCTGTATCCCAACGGGGTTCACCCTTACCCAGCCCAGAGCCCGGCAGCCCCCGTGGACCCTCTCCAGCAGGC 962
Query 963 CTACGCGGGGATGCAGCACTACA---CAGCCTACCCAGCAGCCTACAGCCTGGTTGCACCTGCGTTCCCGCAGC 1033
|||.||.||.||||||||||||| ||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CTATGCAGGAATGCAGCACTACACAGCAGCGTACCCCGCAGCCTACAGCCTGGTTGCACCTGCGTTCCCGCAGC 1036
Query 1034 CTCCAGCCCTGGTCGCCCAGCAGCCCCCACCACCACCTCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAG--- 1104
|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CTCCAGCCCTGGTTGCCCAGCAGCCCCCACCACCACCTCAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAA 1110
Query 1105 CAGCAGCAGCAAAGAGAAGGCCCTGATGGCTGCAACATCTTCATCTACCACCTGCCCCAGGAGTTCACTGACTC 1178
||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1111 CAGCAGCAGCAACGGGAAGGCCCTGATGGCTGCAACATCTTCATCTACCACCTGCCCCAGGAGTTCACAGACTC 1184
Query 1179 AGAGATCCTCCAGATGTTTGTCCCCTTTGGCCACGTCATCTCAGCCAAAGTCTTTGTTGACCGAGCCACCAATC 1252
||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1185 AGAGATCCTCCAGATGTTTGTCCCTTTTGGTCATGTCATCTCAGCCAAAGTCTTTGTTGACCGGGCCACCAATC 1258
Query 1253 AAAGCAAATGTTTTGGCTTTGTGAGTTTCGACAATCCGGCCAGTGCCCAGGCTGCCATCCAGGCCATGAATGGC 1326
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.
Sbjct 1259 AGAGCAAATGTTTTGGCTTTGTGAGTTTCGACAATCCGGCCAGTGCCCAGGCTGCCATCCAGGCTATGAACGGT 1332
Query 1327 TTCCAGATCGGCATGAAGCGCCTCAAAGTCCAGCTAAAGCGGCCTAAGGATGCCAACCGGCCCTAC 1392
||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||
Sbjct 1333 TTCCAGATTGGCATGAAGCGCCTCAAAGTCCAGCTAAAGCGGCCTAAGGATGCAAACAGGCCCTAC 1398