Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11611
• Subject: XM_006502330.2
• Aligned Length: 1482
• Identities: 1097
• Gaps: 318

Alignment

Query    1  ATGAAGGAGCCGGATGCCATCAAGCTGTTTGTGGGGCAGATCCCGAGGCACCTGGAGGAGAAGGACCTGAAGCC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CATCTTCGAACAGTTTGGTCGGATCTTTGAGCTGACTGTCATCAAGGACAAGTACACCGGGCTGCACAAGGGAT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GTGCCTTCCTGACATACTGTGCCCGGGATTCAGCCCTGAAGGCCCAGAGCGCCCTGCACGAACAGAAGACGCTT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CCAGGGATGAACAGGCCGATCCAGGTCAAGCCAGCCGACAGCGAGAGCCGAGGAGAAGACCGGAAGCTCTTTGT  296
                  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ------ATGAACAGGCCGATCCAGGTCAAGCCAGCCGACAGCGAGAGTCGAGGAGAAGACCGGAAGCTCTTTGT  68

Query  297  GGGGATGCTAGGGAAGCAGCAGACAGATGAGGACGTCCGGAAGATGTTTGAGCCCTTCGGGACCATCGACGAGT  370
            |||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||||||
Sbjct   69  GGGCATGCTAGGAAAGCAGCAGACAGATGAGGATGTCCGGAAGATGTTTGAACCATTTGGGACTATAGACGAGT  142

Query  371  GCACTGTGCTCCGGGGGCCAGATGGCACCAGCAAAGGCTGCGCCTTCGTGAAGTTCCAGACCCACGCTGAGGCC  444
            ||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  143  GCACTGTGCTCCGGGGGCCAGACGGTACCAGCAAAGGCTGTGCCTTTGTGAAGTTCCAGACTCACGCTGAGGCC  216

Query  445  AAGGCGGCCATCAACACCCTTCACAGCAGCCGGACCCTGCCAGGTGCCTCGTCCAGCCTGGTGGTGAAGTTTGC  518
            .||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct  217  CAGGCAGCCATCAACACCCTTCACAGCAGCCGGACCCTACCGGGTGCCTCATCCAGCCTGGTGGTAAAGTTTGC  290

Query  519  TGACACTGAGAAGGAGCGAGGTCTCCGCCGCATGCAGCAGGTGGCCACCCAGTTGGGCATGTTCAGCCCCATCA  592
            ||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||.|||.
Sbjct  291  TGACACGGAGAAGGAGCGAGGTCTCCGTCGAATGCAGCAGGTGGCTACCCAGCTGGGCATGTTCAGCCCGATCG  364

Query  593  CCCTCCAGTTTGGAGCCTACAGCGCCTACACCCAGGCCCTGATGCAGCAGCAGGCGGCCCTGGTAGCGGCTCAC  666
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  365  CCCTCCAGTTTGGAGCCTACAGCGCCTACACCCAGGCCCTGATGCAGCAGCAGGCGGCCCTGGTAGCAGCTCAC  438

Query  667  AGTGCCTACCTCAGCCCCATGGCCACCATGGCTGCCGTGCAGATGCAGCACATGGCTGCCATCAATGCCAATGG  740
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  439  AGTGCCTACCTCAGCCCTATGGCCACCATGGCTGCCGTGCAGATGCAGCACATGGCTGCCATCAGTGCCAATGG  512

Query  741  CCTCATCGCCACCCCCATCACCCCATCCTCAGGAACCAGCACCCCTCCTGCCATCGCTGCCACGCCTGTCTCTG  814
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct  513  CCTCATCGCCACCCCCATCACTCCATCCTCAGGAACCAGCACCCCTCCTGCCATTGCTGCCACGCCCGTCTCTG  586

Query  815  CCATTCCGGCTGCCCTGGGCGTCAACGGCTACAGCCAGGTGCCCACCCAGCCCACTGGGCAGCCTGCCCCTGAT  888
            ||||.||.||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct  587  CCATCCCTGCTGCCTTGGGCGTCAACGGCTACAGCCCGGTGCCCACCCAGCCTACAGGGCAGCCTGCCCCGGAT  660

Query  889  GCTCTGTATCCCAACGGGGTTCACCCCTACC-------------------------------------------  919
            ||||||||||||||||||||||||||.||||                                           
Sbjct  661  GCTCTGTATCCCAACGGGGTTCACCCTTACCCAGATGAGGCTCTGTCTGCTGAGAGAAGTGCTGGCGGGGTTCC  734

Query  920  -----------------------------------------CAGCCCAGAGCCCCGCGGCCCCCGTGGACCCCC  952
                                                     |||||||||||||.||.||||||||||||||.|
Sbjct  735  CATAATGTCCCAGGCCCACTCATGGCTTGTGATGCTCTCTGCAGCCCAGAGCCCGGCAGCCCCCGTGGACCCTC  808

Query  953  TGCAGCAGGCCTACGCGGGGATGCAGCACTACA---CAGCCTACCCAGCAGCCTACAGCCTGGTTGCACCTGCG  1023
            |.|||||||||||.||.||.|||||||||||||   ||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  809  TCCAGCAGGCCTATGCAGGAATGCAGCACTACACAGCAGCGTACCCCGCAGCCTACAGCCTGGTTGCACCTGCG  882

Query 1024  TTCCCGCAGCCTCCAGCCCTGGTCGCCCAGCAGCCCCCACCACCACCTCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCA  1097
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct  883  TTCCCGCAGCCTCCAGCCCTGGTTGCCCAGCAGCCCCCACCACCACCTCAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCA  956

Query 1098  GCAACAG---CAGCAGCAGCAAAGAGAAGGCCCTGATGGCTGCAACATCTTCATCTACCACCTGCCCCAGGAGT  1168
            |||||||   ||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  957  GCAACAGCAACAGCAGCAGCAACGGGAAGGCCCTGATGGCTGCAACATCTTCATCTACCACCTGCCCCAGGAGT  1030

Query 1169  TCACTGACTCAGAGATCCTCCAGATGTTTGTCCCCTTTGGCCACGTCATCTCAGCCAAAGTCTTTGTTGACCGA  1242
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1031  TCACAGACTCAGAGATCCTCCAGATGTTTGTCCCTTTTGGTCATGTCATCTCAGCCAAAGTCTTTGTTGACCGG  1104

Query 1243  GCCACCAATCAAAGCAAATGTTTTGGCTTTGTGAGTTTCGACAATCCGGCCAGTGCCCAGGCTGCCATCCAGGC  1316
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1105  GCCACCAATCAGAGCAAATGTTTTGGCTTTGTGAGTTTCGACAATCCGGCCAGTGCCCAGGCTGCCATCCAGGC  1178

Query 1317  CATGAATGGCTTCCAGATCGGCATGAAGCGCCTCAAAGTCCAGCTAAAGCGGCCTAAGGATGCCAACCGGCCCT  1390
            .|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||
Sbjct 1179  TATGAACGGTTTCCAGATTGGCATGAAGCGCCTCAAAGTCCAGCTAAAGCGGCCTAAGGATGCAAACAGGCCCT  1252

Query 1391  AC  1392
            ||
Sbjct 1253  AC  1254