Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11611
• Subject: XM_011240284.1
• Aligned Length: 1410
• Identities: 1226
• Gaps: 90

Alignment

Query    1  ATGAAGGAGCCGGATGCCATCAAGCTGTTTGTGGGGCAGATCCCGAGGCACCTGGAGGAGAAGGACCTGAAGCC  74
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAGGAGCCAGATGCCATCAAGCTGTTTGTGGGGCAGATCCCGAGGCATCTGGAGGAAAAGGACCTGAAGCC  74

Query   75  CATCTTCGAACAGTTTGGTCGGATCTTTGAGCTGACTGTCATCAAGGACAAGTACACCGGGCTGCACAAGGGAT  148
            |||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CATCTTCGAGCAGTTTGGTCGGATCTTCGAGCTGACTGTCATCAAGGACAAGTACACCGGGCTGCACAAGGGAT  148

Query  149  GTGCCTTCCTGACATACTGTGCCCGGGATTCAGCCCTGAAGGCCCAGAGCGCCCTGCACGAACAGAAGACGCTT  222
            ||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.
Sbjct  149  GTGCTTTCCTGACGTACTGTGCTCGCGATTCAGCCCTGAAGGCCCAGAGTGCCCTGCACGAACAGAAGACTCTC  222

Query  223  CCAGGGATGAACAGGCCGATCCAGGTCAAGCCAGCCGACAGCGAGAGCCGAGGAGAAGACCGGAAGCTCTTTGT  296
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||   ||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCAGGGATGAACAGGCCGATCCAGGTCAAGCCAGCCGACAGCGAGAGTCGAGG---AGACCGGAAGCTCTTTGT  293

Query  297  GGGGATGCTAGGGAAGCAGCAGACAGATGAGGACGTCCGGAAGATGTTTGAGCCCTTCGGGACCATCGACGAGT  370
            |||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||||||
Sbjct  294  GGGCATGCTAGGAAAGCAGCAGACAGATGAGGATGTCCGGAAGATGTTTGAACCATTTGGGACTATAGACGAGT  367

Query  371  GCACTGTGCTCCGGGGGCCAGATGGCACCAGCAAAGGCTGCGCCTTCGTGAAGTTCCAGACCCACGCTGAGGCC  444
            ||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  368  GCACTGTGCTCCGGGGGCCAGACGGTACCAGCAAAGGCTGTGCCTTTGTGAAGTTCCAGACTCACGCTGAGGCC  441

Query  445  AAGGCGGCCATCAACACCCTTCACAGCAGCCGGACCCTGCCAGGTGCCTCGTCCAGCCTGGTGGTGAAGTTTGC  518
            .||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct  442  CAGGCAGCCATCAACACCCTTCACAGCAGCCGGACCCTACCGGGTGCCTCATCCAGCCTGGTGGTAAAGTTTGC  515

Query  519  TGACACTGAGAAGGAGCGAGGTCTCCGCCGCATGCAGCAGGTGGCCACCCAGTTGGGCATGTTCAGCCCCATCA  592
            ||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||.|||.
Sbjct  516  TGACACGGAGAAGGAGCGAGGTCTCCGTCGAATGCAGCAGGTGGCTACCCAGCTGGGCATGTTCAGCCCGATCG  589

Query  593  CCCTCCAGTTTGGAGCCTACAGCGCCTACACCCAGGCCCTGATGCAGCAGCAGGCGGCCCTGGTAGCGGCTCAC  666
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  590  CCCTCCAGTTTGGAGCCTACAGCGCCTACACCCAGGCCCTGATGCAGCAGCAGGCGGCCCTGGTAGCAGCTCAC  663

Query  667  AGTGCCTACCTCAGCCCCATGGCCACCATGGCTGCCGTGCAGATGCAGCACATGGCTGCCATCAATGCCAATGG  740
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  664  AGTGCCTACCTCAGCCCTATGGCCACCATGGCTGCCGTGCAGATGCAGCACATGGCTGCCATCAGTGCCAATGG  737

Query  741  CCTCATCGCCACCCCCATCACCCCATCCTCAGGAACCAGCACCCCTCCTGCCATCGCTGCCACGCCTGTCTCTG  814
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct  738  CCTCATCGCCACCCCCATCACTCCATCCTCAGGAACCAGCACCCCTCCTGCCATTGCTGCCACGCCCGTCTCTG  811

Query  815  CCATTCCGGCTGCCCTGGGCGTCAACGGCTACAGCCAGGTGCCCACCCAGCCCACTGGGCAGCCTGCCCCTGAT  888
            ||||.||.||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct  812  CCATCCCTGCTGCCTTGGGCGTCAACGGCTACAGCCCGGTGCCCACCCAGCCTACAGGGCAGCCTGCCCCGGAT  885

Query  889  GCTCTGTATCCCAACGGGGTTCACCCCTACCCAGCCCA-GAGCCCCGCGGCCCCCGTGGACCCCCTGC----AG  957
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||   | |||.|.|          ||     .||||    ||
Sbjct  886  GCTCTGTATCCCAACGGGGTTCACCCTTACCCAG---ATGAGGCTC----------TG-----TCTGCTGAGAG  941

Query  958  CAGGCCTACGCGGGGATGCAGCACTACACAGCCTA----CCCAGCAGCCTACAGCCTGGTTGCACCTGCGTTCC  1027
            .||..|| .||||||.|.|            |.||    |||||  |||.|| .|.|||     |.||.|.|  
Sbjct  942  AAGTGCT-GGCGGGGTTCC------------CATAATGTCCCAG--GCCCAC-TCATGG-----CTTGTGAT--  992

Query 1028  CGCAGCCTCCAGCCCTGGTCGCCCAGCAGCCCCC----ACCACCACCTCAACAGCAGCAGC---AGCAGCA--G  1092
             ||...||.||||||.|  .||||.|||||||||    ||     ||||..||||||  ||   .||||.|  |
Sbjct  993  -GCTCTCTGCAGCCCAG--AGCCCGGCAGCCCCCGTGGAC-----CCTCTCCAGCAG--GCCTATGCAGGAATG  1056

Query 1093  CAGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAAAGAGAAGGCCCTGATGGCTGCAACATCTTCATCTACCACCTGCCCCAGGA  1166
            ||||| |.|||                 .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1057  CAGCA-CTACA-----------------CAGGCCCTGATGGCTGCAACATCTTCATCTACCACCTGCCCCAGGA  1112

Query 1167  GTTCACTGACTCAGAGATCCTCCAGATGTTTGTCCCCTTTGGCCACGTCATCTCAGCCAAAGTCTTTGTTGACC  1240
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1113  GTTCACAGACTCAGAGATCCTCCAGATGTTTGTCCCTTTTGGTCATGTCATCTCAGCCAAAGTCTTTGTTGACC  1186

Query 1241  GAGCCACCAATCAAAGCAAATGTTTTGGCTTTGTGAGTTTCGACAATCCGGCCAGTGCCCAGGCTGCCATCCAG  1314
            |.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1187  GGGCCACCAATCAGAGCAAATGTTTTGGCTTTGTGAGTTTCGACAATCCGGCCAGTGCCCAGGCTGCCATCCAG  1260

Query 1315  GCCATGAATGGCTTCCAGATCGGCATGAAGCGCCTCAAAGTCCAGCTAAAGCGGCCTAAGGATGCCAACCGGCC  1388
            ||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||
Sbjct 1261  GCTATGAACGGTTTCCAGATTGGCATGAAGCGCCTCAAAGTCCAGCTAAAGCGGCCTAAGGATGCAAACAGGCC  1334

Query 1389  CTAC  1392
            ||||
Sbjct 1335  CTAC  1338