Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11627
• Subject: XM_006499451.2
• Aligned Length: 1683
• Identities: 1421
• Gaps: 105

Alignment

Query    1  ATGATCATGTTAGCAGTTGGTGAAGTTGAGGATAGCATTTTTAAAAAGAGAAAGGATGATGAGGACAGTTTTAG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AAGACGACAGAAAGAAAAAAGAAAGAGAATGAAGAGAGATCAACCAGCTTTCACTCCTAGTGGAATATTAACTC  148
                                        |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct    1  ----------------------------ATGAAGAGAGATCAACCAGCTTTTACTCCTAGTGGAATATTAACAC  46

Query  149  CTCATGCCTTGGGTTCAAGAAATTCACCAGGTTCTCAAGTAGCCAGTAATCCGAGACAAGCAGCCTATGAAATG  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct   47  CTCATGCCTTGGGTTCAAGAAATTCACCAGGTTGTCAAGTAGCCAGTAATCCAAGACAAGCAGCCTATGAAATG  120

Query  223  AGGATGCAGAATAACTCTAGTCCTTCGATATCTCCTAATACGAGTTTCACATCTGATGGCTCCCCGTCTCCATT  296
            ||||||||||..||||||||||||||.||||||||||||||.|||||..||||||||||||||||.||||||.|
Sbjct  121  AGGATGCAGAGAAACTCTAGTCCTTCAATATCTCCTAATACAAGTTTTGCATCTGATGGCTCCCCATCTCCACT  194

Query  297  AGGAGGAATTAAGCGAAAAGCAGAAGACAGTGACAGTGAACCTGAGCCAGAGGATAATGTCAGGTTATGGGAAG  370
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  195  AGGAGGAATTAAGAGAAAAGCAGAAGACAGTGACAGTGAGCCAGAGCCAGAGGATAACGTCAGGTTATGGGAAG  268

Query  371  CTGGCTGGAAGCAGCGGTACTACAAGAACAAATTTGATGTGGATGCAGCTGATGAGAAATTCCGTCGGAAAGTT  444
            ||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct  269  CTGGTTGGAAGCAACGATACTACAAGAACAAATTTGATGTAGATGCAGCTGATGAGAAATTCCGACGTAAGGTT  342

Query  445  GTGCAGTCGTACGTTGAAGGACTTTGCTGGGTTCTTAGATATTATTACCAGGGCTGTGCTTCCTGGAAGTGGTA  518
            ||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  343  GTTCAGTCCTACGTTGAAGGACTGTGCTGGGTTCTTCGCTATTATTACCAGGGCTGTGCTTCCTGGAAGTGGTA  416

Query  519  TTATCCATTTCATTATGCACCATTTGCTTCAGACTTTGAAGGCATTGCAGACATGCCATCTGATTTTGAGAAGG  592
            |||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||.|.|||||.|||||.||||
Sbjct  417  TTATCCATTCCATTATGCACCATTTGCCTCAGACTTTGAAGGTATTGCAGACATGTCCTCTGAATTTGAAAAGG  490

Query  593  GTACGAAACCGTTTAAACCACTAGAACAACTTATGGGGGTATTTCCAGCTGCAAGTGGTAATTTTCTACCTCCA  666
            |.||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  491  GCACAAAACCGTTTAAGCCACTGGAACAACTAATGGGGGTTTTCCCAGCTGCAAGTGGTAACTTTCTACCTCCA  564

Query  667  TCATGGCGGAAGCTCATGAGTGATCCTGATTCTAGTATAATTGACTTCTATCCTGAAGATTTTGCTATTGATTT  740
            .||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  565  ACATGGCGGAAGCTCATGAGTGACCCTGATTCCAGTATAATTGACTTCTATCCTGAAGATTTTGCTATTGATTT  638

Query  741  GAATGGGAAGAAATATGCATGGCAAGGTGTTGCTCTCTTGCCATTCGTGGATGAGCGAAGGCTACGAGCTGCCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct  639  GAATGGGAAGAAATATGCATGGCAAGGTGTTGCTCTATTGCCATTTGTGGATGAGCGAAGGCTGCGAGCGGCTC  712

Query  815  TAGAAGAGGTATACCCAGACCTCACTCCAGAAGAGACCAGAAGAAACAGCCTTGGAGGTGATGTCTTATTTGTG  888
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||.|||||.||.||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  713  TAGAAGAGGTGTACCCAGACCTCACTCCAGAAGAGAACAGGAGAAATAGTCTTGGAGGTGATGTTTTGTTTGTG  786

Query  889  GGGAAACATCACCCACTCCATGACTTCATTTTAGAGCTGTACCAGACAGGTTCCACAGAGCCAGTGGAGGTACC  962
            ||.||||.|||.|||||.|..||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct  787  GGAAAACTTCATCCACTACGCGACTTCATTTTAGAGCTGTATCAGACGGGTTCCACAGAGCCAGTTGATGTGCC  860

Query  963  CCCTGAACTATGTCATGGGATTCAAGGAAAGTTTTCTTTGGATGAAGAAGCCATTCTTCCAGATCAAATAGTAT  1036
            .||||||.|.|||||.|||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||
Sbjct  861  ACCTGAATTGTGTCACGGGATTCAAGGGACGTTTTCTTTGGATGAAGAAGCCATTCTTCCAGACCAAACAGTAT  934

Query 1037  GTTCTCCTGTTCCTATGTTAAGGGATCTGACACAGAACACTGTAGTCAGTATTAATTTTAAAGACCCACAGTTT  1110
            ||||.|||||.||.|||||..||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  935  GTTCCCCTGTGCCCATGTTGCGGGACCTGACACAGAACACTGCAGTCAGTATTAATTTTAAAGATCCACAGTTT  1008

Query 1111  GCTGAAGATTACATTTTTAAAGCTGTAATGCTTCCAGGAGCAAGAAAGCCAGCAGCAGTACTGAAACCTAGTGA  1184
            |||||||||||..||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||.||||
Sbjct 1009  GCTGAAGATTATGTTTTTAAAGCTGCAATGCTTCCAGGAGCAAGAAAGCCAGCAACAGTTCTGAAACCTGGTGA  1082

Query 1185  CTGGGAAAAATCCAGCAATGGACGGCAGTGGAAGCCTCAGCTTGGCTTTAACCGTGACCGGAGGCCTGTGCACC  1258
            |||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||.|||||||.||||
Sbjct 1083  CTGGGAAAAATCCAGCAATGGGCGGCAATGGAAACCTCAGCTTGGCTTTAACCGGGACCGGCGGCCTGTTCACC  1156

Query 1259  TGGATCAGGCAGCCTTCAGGACTTTGGGCCATGTGATGCCAAGAGGCTCAGGAACTGGCATTTACAGCAATGCT  1332
            ||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.|..|||||||||||.||.||..|..||||.|..||..||
Sbjct 1157  TGGACCAGGCAGCCTTTAGAACTTTAGGCCATGTTACACCAAGAGGCTCGGGGACGAGTGTTTATACGAACACT  1230

Query 1333  GCACCACCACCTGTGACTTACCAGGGAAACTTATACAGGCCGCTTTTGAGAGGACAAGCCCAGATTCCAAAACT  1406
            ||||.||||||||..|.|||||||||.|||...||||||||.||..|||||||.|||||.|||||.||||||||
Sbjct 1231  GCACTACCACCTGCCAATTACCAGGGGAACAATTACAGGCCACTGCTGAGAGGTCAAGCTCAGATCCCAAAACT  1304

Query 1407  TATGTCAAATATGAGGCCCCAGGATTCCTGGCGAGGTCCTCCTCCCCTTTTCCAGCAGCAAAGGTTTGACAGAG  1480
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||.
Sbjct 1305  TATGTCAAATATGAGGCCCCAAGATTCCTGGCGAGGCCCTCCTCCTCTTTTCCAGCAGCATAGATTTGAGAGAA  1378

Query 1481  GCGTTGGGGCTGAACCTCTGCTCCCATGGAACCGGATGCTGCAAACCCAGAATGCAGCCTTCCAGCCAAACCAG  1554
            |.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||.|.||||.|||.|||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1379  GTGTTGGAGCTGAACCTCTACTGCCATGGAACCGGATGATCCAAAACCAAAATGCAGCCTTTCAGCCAAATCAG  1452

Query 1555  TACCAGATGCTAGCTGGGCCTGGTGGGTATCCACCCAGACGAGATGAT---CGTGGAGGGAGACAGGGATATCC  1625
            |||||||||||||..||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||   ||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1453  TACCAGATGCTAGGAGGACCTGGAGGCTATCCACCCAGACGTGACGATCACCGAGGAGGGAGACAGGGATATCC  1526

Query 1626  CAGAGAAGGAAGGAAATACCCTTTGCCACCACCCTCAGGAAGATACAATTGGAAT  1680
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||
Sbjct 1527  CAGAGAAGGACGGAAATACCCTTTGCCACCACCCTCGGGAAGATACAGTTGGAAT  1581