Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11660
• Subject: NM_015014.4
• Aligned Length: 1290
• Identities: 1275
• Gaps: 15

Alignment

Query    1  ---------------ATGAGCAAACGGAAGAGAAAGAGAAGTGTCCAGGAGGGAGAGAATCCTGACGACGGCGT  59
                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCTTGGAAGGGATGAGCAAACGGAAGAGAAAGAGAAGTGTCCAGGAGGGAGAGAATCCTGACGACGGCGT  74

Query   60  TCGCGGGAGTCCGCCGGAAGACTACAGGCTTGGACAGGTCGCCAGTAGCTTATTTCGCGGCGAACACCATTCCA  133
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCGCGGGAGTCCGCCGGAAGACTACAGGCTTGGACAGGTCGCCAGTAGCTTATTTCGCGGCGAACACCATTCCA  148

Query  134  GAGGTGGCACCGGTCGGCTGGCGTCCCTCTTCAGTTCTCTGGAGCCCCAGATTCAACCCGTGTACGTGCCTGTG  207
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GAGGTGGCACCGGTCGGCTGGCGTCCCTCTTCAGTTCTCTGGAGCCCCAGATTCAACCCGTGTACGTGCCTGTG  222

Query  208  CCTAAACAAACCATCAAAAAAACGAAACGGAATGAGGAGGAAGAAAGTACATCCCAGATTGAAAGACCACTTTC  281
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCTAAACAAACCATCAAAAAAACGAAACGGAATGAGGAGGAAGAAAGTACATCCCAGATTGAAAGACCACTTTC  296

Query  282  GCAAGAACCTGCCAAAAAAGTGAAAGCGAAGAAGAAACACACTAACGCAGAAAAAAAGTTGGCAGACAGGGAAA  355
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCAAGAACCTGCCAAAAAAGTGAAAGCGAAGAAGAAACACACTAACGCAGAAAAAAAGTTGGCAGACAGGGAAA  370

Query  356  GCGCTCTAGCGAGTGCTGATTTAGAAGAAGAAATTCACCAGAAACAAGGGCAGAAAAGGAAAAATTCTCAACCT  429
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCGCTCTAGCGAGTGCTGATTTAGAAGAAGAAATTCACCAGAAACAAGGGCAGAAAAGGAAAAATTCTCAACCT  444

Query  430  GGTGTTAAAGTAGCAGATAGAAAAATACTTGATGACACAGAAGACACAGTTGTCAGTCAAAGAAAGAAAATTCA  503
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGTGTTAAAGTAGCAGATAGAAAAATACTTGATGACACAGAAGACACAGTTGTCAGTCAAAGAAAGAAAATTCA  518

Query  504  AATCAACCAAGAAGAAGAGAGATTAAAGAATGAGAGAACTGTGTTTGTTGGGAATTTGCCTGTTACATGTAATA  577
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AATCAACCAAGAAGAAGAGAGATTAAAGAATGAGAGAACTGTGTTTGTTGGGAATTTGCCTGTTACATGTAATA  592

Query  578  AGAAGAAGCTGAAGTCGTTTTTTAAAGAGTATGGACAAATAGAATCTGTACGATTTCGTTCTCTGATTCCAGCA  651
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGAAGAAGCTGAAGTCGTTTTTTAAAGAGTATGGACAAATAGAATCTGTACGATTTCGTTCTCTGATTCCAGCA  666

Query  652  GAGGGAACGCTATCCAAAAAGTTGGCAGCAATAAAACGTAAAATTCATCCTGATCAGAAAAATATTAATGCCTA  725
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGGGAACGCTATCCAAAAAGTTGGCAGCAATAAAACGTAAAATTCATCCTGATCAGAAAAATATTAATGCCTA  740

Query  726  TGTTGTGTTTAAGGAGGAGAGTGCTGCCACGCAAGCATTGAAAAGAAATGGGGCCCAGATTGCAGATGGATTTC  799
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGTTGTGTTTAAGGAGGAGAGTGCTGCCACGCAAGCATTGAAAAGAAATGGGGCCCAGATTGCAGATGGATTTC  814

Query  800  GTATTAGAGTTGATCTCGCATCTGAGACCTCATCTAGAGACAAGAGATCGGTTTTTGTGGGGAATCTCCCTTAT  873
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTATTAGAGTTGATCTCGCATCTGAGACCTCATCTAGAGACAAGAGATCGGTTTTTGTGGGGAATCTCCCTTAT  888

Query  874  AAAGTTGAAGAATCTGCCATTGAGAAGCACTTTCTGGACTGTGGAAGTATCATGGCCGTGAGGATTGTGAGAGA  947
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAAGTTGAAGAATCTGCCATTGAGAAGCACTTTCTGGACTGTGGAAGTATCATGGCCGTGAGGATTGTGAGAGA  962

Query  948  CAAAATGACAGGCATCGGCAAAGGGTTTGGCTATGTGCTCTTTGAGAATACAGATTCTGTTCATCTTGCTCTGA  1021
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAAAATGACAGGCATCGGCAAAGGGTTTGGCTATGTGCTCTTTGAGAATACAGATTCTGTTCATCTTGCTCTGA  1036

Query 1022  AATTAAATAATTCTGAACTCATGGGGAGAAAACTCAGAGTCATGCGTTCTGTTAATAAAGAAAAATTTAAACAA  1095
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AATTAAATAATTCTGAACTCATGGGGAGAAAACTCAGAGTCATGCGTTCTGTTAATAAAGAAAAATTTAAACAA  1110

Query 1096  CAAAATTCAAATCCACGATTGAAGAATGTCAGTAAACCTAAGCAGGGACTTAATTTTACTTCCAAAACTGCAGA  1169
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CAAAATTCAAATCCACGATTGAAGAATGTCAGTAAACCTAAGCAGGGACTTAATTTTACTTCCAAAACTGCAGA  1184

Query 1170  AGGACATCCTAAAAGCTTATTTATTGGAGAAAAAGCTGTTCTCCTTAAAACGAAGAAGAAAGGACAGAAGAAAA  1243
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGGACATCCTAAAAGCTTATTTATTGGAGAAAAAGCTGTTCTCCTTAAAACGAAGAAGAAAGGACAGAAGAAAA  1258

Query 1244  GTGGACGCCCTAAGAAACAGAGAAAACAGAAA  1275
            ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GTGGACGCCCTAAGAAACAGAGAAAACAGAAA  1290