Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_11710
Subject:
NM_001318326.2
Aligned Length:
1209
Identities:
821
Gaps:
386

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  MCETQKARKEREVEEKRHWDSSWEYEDYGSVRKRNLTVLDGLYRENDLDPRYWAKGQHQPYRKRDCGYWDFEQS  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  EPSYMDCGEAHESGKGCVYHGGHDGYRSPENVDYESLSPGTKDNSPTRSPDVTSKAGGYGEANGYSDCKNLNYN  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  PEDSKKAEQLTDCRGLDDSSANLGQPQLWYIDHENVNHNLEDCWATNFYCREHSNLYHVPGSYPDGQPVSFSDS  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  NGVNEDKEFIKYHEGDRNVHQNDNMYPKAKTHIMDQGDFDTENKGYDALFANCAYKSRNSRGTDSLHQMENLEY  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  NGTDIPRTKAHGGSRILLDGLQTQCTRGEQGGHHLGIPQSSSLEKNIWHLEEEKKLNGPETWRRNSCLRRTAPS  370

Query    1  ----------------MTLLSSQSSSLVAPSGSVSAENPEQRMLEKRAKVIEELLQTERDYIRDLEMCIERIMV  58
                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TLRRSEFVQNSKKTQEMTLLSSQSSSLVAPSGSVSAENPEQRMLEKRAKVIEELLQTERDYIRDLEMCIERIMV  444

Query   59  PMQQAQVPNIDFEGLFGNTQMVIKVSKQLLAALEISDAVGPVFLGHRDELEGTYKIYCQNHDEAIALLEIYEKD  132
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  PMQQAQVPNIDFEGLFGNMQMVIKVSKQLLAALEISDAVGPVFLGHRDELEGTYKIYCQNHDEAIALLEIYEKD  518

Query  133  EKIQKHLQDSLADLKSLYNEWGCTNYINLGSFLIKPVQRVMRYPLLLMELLNSTPESHPDKVPLTNAVLAVKEI  206
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  EKIQKHLQDSLADLKSLYNEWGCTNYINLGSFLIKPVQRVMRYPLLLMELLNSTPESHPDKVPLTNAVLAVKEI  592

Query  207  NVNINEYKRRKDLVLKYRKGDEDSLMEKISKLNIHSIIKKSNRVSSHLKHLTGFAPQIKDEVFEETEKNFRMQE  280
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  NVNINEYKRRKDLVLKYRKGDEDSLMEKISKLNIHSIIKKSNRVSSHLKHLTGFAPQIKDEVFEETEKNFRMQE  666

Query  281  RLIKSFIRDLSLYLQHIRESACVKVVAAVSMWDVCMERGHRDLEQFERVHRYISDQLFTNFKERTERLVISPLN  354
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  RLIKSFIRDLSLYLQHIRESACVKVVAAVSMWDVCMERGHRDLEQFERVHRYISDQLFTNFKERTERLVISPLN  740

Query  355  QLLSMFTGPHKLVQKRFDKLLDFYNCTERAEKLKDKKTLEELQSARNNYEALNAQLLDELPKFHQYAQGLFTNC  428
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  QLLSMFTGPHKLVQKRFDKLLDFYNCTERAEKLKDKKTLEELQSARNNYEALNAQLLDELPKFHQYAQGLFTNC  814

Query  429  VHGYAEAHCDFVHQALEQLKPLLSLLKVAGREGNLIAIFHEEHSRVLQQLQVFTFFPESLPATKKPFERKTIDR  502
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  VHGYAEAHCDFVHQALEQLKPLLSLLKVAGREGNLIAIFHEEHSRVLQQLQVFTFFPESLPATKKPFERKTIDR  888

Query  503  QSARKPLLGLPSYMLQSEELRASLLARYPPEKLFQAERNFNAAQDLDVSLLEGDLVGVIKKKDPMGSQNRWLID  576
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  QSARKPLLGLPSYMLQSEELRASLLARYPPEKLFQAERNFNAAQDLDVSLLEGDLVGVIKKKDPMGSQNRWLID  962

Query  577  NGVTKGFVYSSFLKPYNPRRSHSDASVGSHSSTESEHGSSSPRFPRQNSGSTLTFNPSSMAVSFTSGSCQKQPQ  650
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  NGVTKGFVYSSFLKPYNPRRSHSDASVGSHSSTESEHGSSSPRFPRQNSGSTLTFNPSSMAVSFTSGSCQKQPQ  1036

Query  651  DASPPPKEWDQGTLSASLNPSNSESSPSRCPSDPDSTSQPRSGDSADVARDVKQPTATPRSYRNFRHPEIVGYS  724
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  DASPPPKECDQGTLSASLNPSNSESSPSRCPSDPDSTSQPRSGDSADVARDVKQPTATPRSYRNFRHPEIVGYS  1110

Query  725  VPGRNGQSQDLVKGCARTAQAPEDRSTEPDGSEAEGNQVYFAVYTFKARNPNELSVSANQKLKILEFKDVTGNT  798
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  VPGRNGQSQDLVKGCARTAQAPEDRSTEPDGSEAEGNQVYFAVYTFKARNPNELSVSANQKLKILEFKDVTGNT  1184

Query  799  EWWLAEVNGKKGYVPSNYIRKTEYT  823
            |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  EWWLAEVNGKKGYVPSNYIRKTEYT  1209