Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11718
- Subject:
- NM_015264.1
- Aligned Length:
- 1227
- Identities:
- 1110
- Gaps:
- 117
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGGCTCTCAGGCTGCTGCTGAGTGGAGGAACTGGGCCTCCTGGGAGGTGTCCTCCAGCCTCTCTGGATGCTC 74
Query 1 -------------------------------------------ATGTTCTCCACCTACTTCATGGAGAAATGGG 31
|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CATGGGGTGCTTCAAGGATGACCGCATCGTCTTCTGGACTTGGATGTTCTCCACCTACTTCATGGAGAAATGGG 148
Query 32 CTCCCCGGCAGGACGACATGCTTTTCTATGTGCGCCGGAAGCTGGCGTACTCCGGCAGCGAAAGCGGTGCAGAC 105
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CTCCCCGGCAGGACGACATGCTTTTCTATGTGCGCCGGAAGCTGGCGTACTCCGGCAGCGAAAGCGGTGCAGAC 222
Query 106 GGGAGGAAGGCAGCTGAGCCTGAGGTGGAGGTGGAGGTGTACCGGCGGGACTCCAAGAAGCTGCCAGGCCTGGG 179
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GGGAGGAAGGCAGCTGAGCCTGAGGTGGAGGTGGAGGTGTACCGGCGGGACTCCAAGAAGCTGCCAGGCCTGGG 296
Query 180 AGACCCTGACATCGACTGGGAGGAGAGCGTCTGCCTGAATCTCATCCTGCAGAAGCTGGACTACATGGTGACCT 253
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGACCCTGACATCGACTGGGAGGAGAGCGTCTGCCTGAATCTCATCCTGCAGAAGCTGGACTACATGGTGACCT 370
Query 254 GTGCGGTGTGCACACGTGCTGACGGCGGGGACATTCACATCCATAAGAAGAAATCTCAGCAAGTGTTCGCGTCC 327
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GTGCGGTGTGCACACGTGCTGACGGCGGGGACATTCACATCCATAAGAAGAAATCTCAGCAAGTGTTCGCGTCC 444
Query 328 CCCAGTAAACACCCCATGGACAGCAAGGGGGAGGAGTCCAAGATCAGCTACCCCAACATCTTCTTCATGATTGA 401
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CCCAGTAAACACCCCATGGACAGCAAGGGGGAGGAGTCCAAGATCAGCTACCCCAACATCTTCTTCATGATTGA 518
Query 402 CAGCTTCGAGGAGGTGTTCAGCGACATGACCGTAGGGGAAGGAGAGATGGTCTGTGTGGAGCTGGTGGCTAGTG 475
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CAGCTTCGAGGAGGTGTTCAGCGACATGACCGTAGGGGAAGGAGAGATGGTCTGTGTGGAGCTGGTGGCTAGTG 592
Query 476 ACAAAACCAACACGTTCCAGGGGGTCATCTTTCAGGGCTCCATCCGCTACGAGGCGCTCAAGAAGGTGTATGAC 549
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACAAAACCAACACGTTCCAGGGGGTCATCTTTCAGGGCTCCATCCGCTACGAGGCGCTCAAGAAGGTGTATGAC 666
Query 550 AACCGGGTGAGCGTGGCCGCCCGCATGGCACAGAAGATGTCGTTTGGCTTCTACAAGTACAGCAACATGGAGTT 623
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AACCGGGTGAGCGTGGCCGCCCGCATGGCACAGAAGATGTCGTTTGGCTTCTACAAGTACAGCAACATGGAGTT 740
Query 624 TGTGCGCATGAAGGGCCCCCAGGGCAAGGGCCACGCCGAGATGGCGGTCAGCCGAGTGTCTACAGGTGACACAT 697
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGTGCGCATGAAGGGCCCCCAGGGCAAGGGCCACGCCGAGATGGCGGTCAGCCGAGTGTCTACAGGTGACACAT 814
Query 698 CCCCCTGTGGGACTGAAGAGGACTCCAGCCCAGCTTCGCCCATGCACGAGCGGGTGACCTCCTTCAGCACACCC 771
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CCCCCTGTGGGACTGAAGAGGACTCCAGCCCAGCTTCGCCCATGCACGAGCGGGTGACCTCCTTCAGCACACCC 888
Query 772 CCCACCCCAGAACGGAACAACCGGCCTGCCTTCTTCTCCCCATCCCTCAAGAGGAAGGTGCCCCGGAACCGGAT 845
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CCCACCCCAGAACGGAACAACCGGCCTGCCTTCTTCTCCCCATCCCTCAAGAGGAAGGTGCCCCGGAACCGGAT 962
Query 846 CGCTGAGATGAAGAAGTCGCACTCGGCCAACGACAGCGAGGAGTTCTTCCGGGAGGACGACGGTGGAGCCGATC 919
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CGCTGAGATGAAGAAGTCGCACTCGGCCAACGACAGCGAGGAGTTCTTCCGGGAGGACGACGGTGGAGCCGATC 1036
Query 920 TGCACAATGCAACCAACCTGCGGTCTCGGTCCCTGTCGGGCACAGGACGGTCCCTGGTCGGGTCCTGGCTGAAG 993
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TGCACAATGCAACCAACCTGCGGTCTCGGTCCCTGTCGGGCACAGGACGGTCCCTGGTCGGGTCCTGGCTGAAG 1110
Query 994 CTGAACAGAGCAGATGGAAACTTCCTTCTCTATGCACACTTAACCTACGTCACGTTGCCGCTGCATCGGATTTT 1067
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CTGAACAGAGCAGATGGAAACTTCCTTCTCTATGCACACTTAACCTACGTCACGTTGCCGCTGCATCGGATTTT 1184
Query 1068 AACAGACATCCTGGAAGTTCGGCAGAAGCCCATCCTGATGACC 1110
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AACAGACATCCTGGAAGTTCGGCAGAAGCCCATCCTGATGACC 1227