Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11746
• Subject: NM_012276.5
• Aligned Length: 1497
• Identities: 1296
• Gaps: 198

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGACCCTCATTCTCACAAGCCTGCTCTTCTTTGGGCTGAGCCTGGGCCCCAGGACCCGGGTGCAGGCAGAAAA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CCTACTCAAACCCATCCTGTGGGCCGAGCCAGGTCCCGTGATCACCTGGCATAACCCCGTGACCATCTGGTGTC  148

Query    1  --------------------------------------------------ATGTCGAGGCACATATTAAAAACA  24
                                                              ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGGCACCCTGGAGGCCCAGGGGTACCGTCTGGATAAAGAGGGAAACTCAATGTCGAGGCACATATTAAAAACA  222

Query   25  CTGGAGTCTGAAAACAAGGTCAAACTCTCCATCCCATCCATGATGTGGGAACATGCAGGGCGATATCACTGTTA  98
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTGGAGTCTGAAAACAAGGTCAAACTCTCCATCCCATCCATGATGTGGGAACATGCAGGGCGATATCACTGTTA  296

Query   99  CTATCAGAGCCCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGCGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGCCTACAGCAGACCCA  172
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTATCAGAGCCCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGCGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGCCTACAGCAGACCCA  370

Query  173  CCCTGTCCGCCCTGCCAAGCCCTGTGGTAACCTCAGGAGTGAACGTGACCCTCCGGTGTGCCTCACGGCTGGGA  246
            ||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCCTGTCCGCACTGCCAAGCCCTGTGGTGACCTCAGGAGTGAACGTGACCCTCCGGTGTGCCTCACGGCTGGGA  444

Query  247  CTGGGCAGGTTCACTCTGATTGAGGAAGGAGACCACAGGCTCTCCTGGACCCTGAACTCACACCAACACAACCA  320
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGGGCAGGTTCACTCTGATTGAGGAAGGAGACCACAGGCTCTCCTGGACCCTGAACTCACACCAACACAACCA  518

Query  321  TGGAAAGTTCCAGGCCCTGTTCCCCATGGGCCCCCTGACCTTCAGCAACAGGGGTACATTCAGATGCTACGGCT  394
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGGAAAGTTCCAGGCCCTGTTCCCCATGGGCCCCCTGACCTTCAGCAACAGGGGTACATTCAGATGCTACGGCT  592

Query  395  ATGAAAACAACACCCCATACGTGTGGTCGGAACCCAGTGACCCCCTGCAGCTACTGGTGTCAGGCGTGTCTAGG  468
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGAAAACAACACCCCATACGTGTGGTCGGAACCCAGTGACCCCCTGCAGCTACTGGTGTCAGGCGTGTCTAGG  666

Query  469  AAGCCCTCCCTCCTGACCCTGCAGGGCCCTGTCGTGACCCCCGGAGAGAATCTGACCCTCCAGTGTGGCTCTGA  542
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGCCCTCCCTCCTGACCCTGCAGGGCCCTGTCGTGACCCCCGGAGAGAATCTGACCCTCCAGTGTGGCTCTGA  740

Query  543  TGTCGGCTACATCAGATACACTCTGTACAAGGAGGGGGCCGATGGCCTCCCCCAGCGCCCTGGCCGGCAGCCCC  616
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGTCGGCTACATCAGATACACTCTGTACAAGGAGGGGGCCGATGGCCTCCCCCAGCGCCCTGGCCGGCAGCCCC  814

Query  617  AGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGAGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGATGCTAC  690
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGAGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGATGCTAC  888

Query  691  GGCGCACACAACGTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGTGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAGGACAGATCTC  764
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGCGCACACAACGTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGTGACCCCCTGGATATCCTGATCGCAGGACAGATCTC  962

Query  765  TGACAGACCCTCCCTCTCAGTGCAGCCGGGCCCCACGGTGACCTCAGGAGAGAAGGTGACCCTGCTGTGTCAGT  838
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGACAGACCCTCCCTCTCAGTGCAGCCGGGCCCCACGGTGACCTCAGGAGAGAAGGTGACCCTGCTGTGTCAGT  1036

Query  839  CATGGGACCCGATGTTCACTTTCCTTCTGACCAAGGAGGGGGCAGCCCATCCCCCGTTGCGTCTGAGATCAATG  912
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CATGGGACCCGATGTTCACTTTCCTTCTGACCAAGGAGGGGGCAGCCCATCCCCCGTTGCGTCTGAGATCAATG  1110

Query  913  TACGGAGCTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCATGAGTCCTGTGACCTCAGCCCACGCGGGGACCTACAGGTG  986
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TACGGAGCTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCATGAGTCCTGTGACCTCAGCCCACGCGGGGACCTACAGGTG  1184

Query  987  CTACGGCTCACGCAGCTCCAACCCCTACCTGCTGTCTCACCCCAGTGAGCCCCTGGAGCTCGTGGTCTCAGGAG  1060
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTACGGCTCACGCAGCTCCAACCCCTACCTGCTGTCTCACCCCAGTGAGCCCCTGGAGCTCGTGGTCTCAGGAG  1258

Query 1061  CAACTGAGACCCTCAATCCAGCACAAAAGAAGTCAGATTCCAAGACTGCCCCACACCTCCAGGATTACACAGTG  1134
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CAACTGAGACCCTCAATCCAGCACAAAAGAAGTCAGATTCCAAGACTGCCCCACACCTCCAGGATTACACAGTG  1332

Query 1135  GAGAATCTCATCCGCATGGGTGTGGCTGGCTTGGTCCTGCTGTTCCTCGGGATTCTGTTATTTGAGGCTCAGCA  1208
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GAGAATCTCATCCGCATGGGTGTGGCTGGCTTGGTCCTGCTGTTCCTCGGGATTCTGTTATTTGAGGCTCAGCA  1406

Query 1209  CAGCCAGAGAAGCCCCCCAAGGTGCAGCCAGGAGGCAAACAGCAGAAAGGACAATGCACCCTTCAGAGTGGTGG  1282
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CAGCCAGAGAAGCCCCCCAAGGTGCAGCCAGGAGGCAAACAGCAGAAAGGACAATGCACCCTTCAGAGTGGTGG  1480

Query 1283  AGCCTTGGGAACAGATC  1299
            |||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGCCTTGGGAACAGATC  1497