Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11746
• Subject: XM_011547130.2
• Aligned Length: 1521
• Identities: 1023
• Gaps: 351

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGACGCCCGCCCTCACAGCCCTGCTCTGCCTTGGGCTGAGTCTGGGCCCCAGGACCCGCGTGCAGGCAGGGCC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CTTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCAGCTGGGGGAGCCCCGTGACCATCTGGTGTC  148

Query    1  -------------------------------------------ATGTCGA-------GGCACATATTAAAAA--  22
                                                       |.|.|.|       ||.|||.|  ||.||  
Sbjct  149  AGGGGAGCCTGGAGGCCCAGGAGTACCAACTGGATAAAGAGGGAAGCCCAGAGCCCTGGGACAGA--AATAACC  220

Query   23  CACTGGAGTCTGAAAACAAGGTCAAACTCTCCATCCCATCCATGATGTGGGAACATGCAGGGCGATATCACTGT  96
            |||||||..|..|.|||||||.||.|.||||||||||||||||||....|.|.|||||||||.||||.|.|||.
Sbjct  221  CACTGGAACCCAAGAACAAGGCCAGATTCTCCATCCCATCCATGACACAGCACCATGCAGGGAGATACCGCTGC  294

Query   97  TACTATCAGAGCCCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGCGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAG---CCTACAGCAG  167
            .|||||.|.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||   .|||||.||.
Sbjct  295  CACTATTACAGCTCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGCGACCCCCTGGAGCTGGTGATGACAGGATTCTACAACAA  368

Query  168  ACCCACCCTGTCCGCCCTGCCAAGCCCTGTGGTAACCTCAGGAGTGAACGTGACCCTCCGGTGTGCCTCACGGC  241
            |||||||||.||.||||||||.|||||||||||..|||||||.|.|||..||||||||||.||||.|||||.|.
Sbjct  369  ACCCACCCTCTCAGCCCTGCCCAGCCCTGTGGTGGCCTCAGGGGGGAATATGACCCTCCGATGTGGCTCACAGA  442

Query  242  TGGGACTGGGCAGGT-TCAC--------TCTGATTGAGGAAGGAGACCACAGGCTCTCCTGGACCCTGAACTCA  306
            .||||         | ||||        ||||||..||||||||||.|||..||||.||.||||||||.|||||
Sbjct  443  AGGGA---------TATCACCATTTTGTTCTGATGAAGGAAGGAGAACACCAGCTCCCCCGGACCCTGGACTCA  507

Query  307  CACCAACACAACCATGGAAAGTTCCAGGCCCTGTTCCCCATGGGCCCCCTGACCTTCAGCAACAGGGGTACATT  380
            ||.||.|.|.||..|||...||||||||||||||||||..||||||||.|||||..||||.|||||.|.|..||
Sbjct  508  CAGCAGCTCCACAGTGGGGGGTTCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGCCCCGTGACCCCCAGCCACAGGTGGAGGTT  581

Query  381  CAGATGCTACGGCTATGAAAACAACACCCCATACGTGTGGTCGGAACCCAGTGACCCCCTGCAGCTACTGGTGT  454
            ||.||||||...||||.|.|..||||||||.|..||||||||..|.|||||||||||||||.||.|.|||...|
Sbjct  582  CACATGCTATTACTATTATACAAACACCCCCTGGGTGTGGTCCCACCCCAGTGACCCCCTGGAGATTCTGCCCT  655

Query  455  CAGGCGTGTCTAGGAAGCCCTCCCTCCTGACCCTGCAGGGCCCTGTCGTGACCCCCGGAGAGAATCTGACCCTC  528
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||.||..|||..|||||||||
Sbjct  656  CAGGCGTGTCTAGGAAGCCCTCCCTCCTGACCCTGCAGGGCCCTGTCCTGGCCCCTGGGCAGAGCCTGACCCTC  729

Query  529  CAGTGTGGCTCTGATGTCGGCTACATCAGATACACTCTGTACAAGGAGGGGG-CCGATGGCCTCCCCCAGCGCC  601
            ||||||||||||||||||||||||..|||||....||||||.|||||||||| .|| ||.|.|||.||||||||
Sbjct  730  CAGTGTGGCTCTGATGTCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGGGAACG-TGACTTCCTCCAGCGCC  802

Query  602  CTGGCCGGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGAGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGC  675
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||.||||||||
Sbjct  803  CTGGCCAGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCCCTCCCACGGGGGC  876

Query  676  CAGTACAGATGCTACGGCGCACACAACGTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGTGACCCCCTGGACATCCTGAT  749
            ||||||||.|||||.||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||
Sbjct  877  CAGTACAGGTGCTATGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGAACATCCTGAT  950

Query  750  CGCAGGACAGATCTCTGACAGACC--CTCCCTCTCAGTGCAGCCGGGCCCCACGGTGACCTCAGGAGAGAAGGT  821
            .|||||||||||||.||||  |||  ||||||.||||..||||||||||||||.|||.|||||||||||||.||
Sbjct  951  GGCAGGACAGATCTATGAC--ACCGTCTCCCTGTCAGCACAGCCGGGCCCCACAGTGGCCTCAGGAGAGAACGT  1022

Query  822  GACCCTGCTGTGTCAGTCATGGGACCCGATGTT-------CACTTTCCTTCTGACCAAGGAGGGGGCAGCCCAT  888
            |||||||||||||||||||.|||       |||       ||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 1023  GACCCTGCTGTGTCAGTCACGGG-------GTTATTTTGACACTTTCCTTCTGACCAAAGAAGGGGCAGCCCAT  1089

Query  889  CCCCCGTTGCGTCTGAGATCAATGTACGGAGCTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCATGAGTCCTGTGACCTC  962
            |||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1090  CCCCCACTGCGTCTGAGATCAATGTACGGAGCTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCATGAGTCCTGTGACCTC  1163

Query  963  AGCCCACGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCACGCAGCTCCAACCCCTACCTGCTGTCTCACCCCAGTGAGC  1036
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1164  AGCCCACGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCACGCAGCTCCAACCCCCACCTGCTGTCTCACCCCAGTGAGC  1237

Query 1037  CCCTGGAGCTCGTGGTCTCAGGAGCAACTGAGACCCTCAATCCAGCACAAAAGAAGTCAGATTCCAAGACTGCC  1110
            |||||||||||.||||||||                                                   |||
Sbjct 1238  CCCTGGAGCTCATGGTCTCA---------------------------------------------------GCC  1260

Query 1111  CCACACCTCCAGGATTACACAGTGGAGAATCTCATCCGCATGGGTGTGGCTGGCTTGGTCCTGCTGTTCCTCGG  1184
            .|||||..|.||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||.||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1261  TCACACGCCAAGGATTACACAGTGGAGAATCTCATCCGCATGGGCATGGCAGGCTTGGTCCTGGTGTTCCTCGG  1334

Query 1185  GATTCTGTTATTTGAGGCTCAGCACAGCCAGAGAAGCCCCCCAAGGTGCAGCCAGGAGGCAAACAGCAGAAAGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| .||||||||.|||||||.|||||               
Sbjct 1335  GATTCTGTTATTTGAGGCTCAGCACAGCCAGAGAA-ACCCCCAAGATGCAGCCGGGAGG---------------  1392

Query 1259  ACAATGCACCCTTCAGAGTGGTGGAGCCTTGGGAACAGATC  1299
                                                     
Sbjct 1393  -----------------------------------------  1392