Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11758
• Subject: NM_001284278.1
• Aligned Length: 834
• Identities: 787
• Gaps: 33

Alignment

Query   1  ATGG------TGCTGATCAAGGAATTCCGTGTGGTTTTGCCATGTTCTGTTCAGGAGTATCAGGTTGGGCAGCT  68
           ||||      ||.||||..||.|.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGGAGATTTGTTGATGGAGAAGTGCCGTGTGGTTTTGCCATGTTCTGTTCAGGAGTATCAGGTTGGGCAGCT  74

Query  69  TTACTCTGTTGCAGAAGCTAGTAAGAATGAGACTGGTGGTGGAGAAGGAATTGAAGTCTTAAAGAATGAACCTT  142
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  TTACTCTGTTGCAGAAGCTAGTAAGAATGAGACTGGTGGTGGAGAAGGAATTGAAGTCTTAAAGAATGAACCTT  148

Query 143  ATGAGAAGGATGGAGAAAAGGGACAGTATACGCACAAAATTTATCACCTAAAGAGCAAAGTGCCTGCATTCGTG  216
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  ATGAGAAGGATGGAGAAAAGGGACAGTATACGCACAAAATTTATCACCTAAAGAGCAAAGTGCCTGCATTCGTG  222

Query 217  AGGATGATTGCTCCCGAGGGCTCCTTGGTGTTTCATGAGAAAGCCTGGAATGCGTACCCCTACTGTAGAACAAT  290
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  AGGATGATTGCTCCCGAGGGCTCCTTGGTGTTTCATGAGAAAGCCTGGAATGCGTACCCCTACTGTAGAACAAT  296

Query 291  TGTAACGAATGAATATATGAAAGATGATTTCTTCATTAAAATCGAAACATGGCACAAACCAGACTTGGGAACAT  364
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  TGTAACGAATGAATATATGAAAGATGATTTCTTCATTAAAATCGAAACATGGCACAAACCAGACTTGGGAACAT  370

Query 365  TAGAAAATGTACATGGTTTAGATCCAAACACATGGAAAACTGTTGAAATTGTCCATATAGATATTGCAGATAGA  438
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  TAGAAAATGTACATGGTTTAGATCCAAACACATGGAAAACTGTTGAAATTGTCCATATAGATATTGCAGATAGA  444

Query 439  AGTCAAGTTGAACCAGCAGACTACAAAGCTGATGAAGACCCAGCATTATTCCAGTCAGTCAAGACCAAGAGAGG  512
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  AGTCAAGTTGAACCAGCAGACTACAAAGCTGATGAAGACCCAGCATTATTCCAGTCAGTCAAGACCAAGAGAGG  518

Query 513  CCCTTTGGGACCCAACTGGAAGAAGGAGCTGGCAAACAGCCCTGACTGTCCCCAGATGTGTGCCTATAAGCTGG  586
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  CCCTTTGGGACCCAACTGGAAGAAGGAGCTGGCAAACAGCCCTGACTGTCCCCAGATGTGTGCCTATAAGCTGG  592

Query 587  TGACCATCAAATTCAAGTGGTGGGGACTGCAAAGCAAAGTAGAAAACTTCATTCAAAAGCAAGAAAAACGGATA  660
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  TGACCATCAAATTCAAGTGGTGGGGACTGCAAAGCAAAGTAGAAAACTTCATTCAAAAGCAAGAAAAACGGATA  666

Query 661  TTTACAAACTTCCATCGCCAGCTTTTTTGTTGGATTGACAAGTGGATCGATCTCACGATGGAAGACATTAGGAG  734
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  TTTACAAACTTCCATCGCCAGCTTTTTTGTTGGATTGACAAGTGGATCGATCTCACGATGGAAGACATTAGGAG  740

Query 735  AATGGAAGACGAGACTCAGAAAGAACTAGAAACATTACGTAATCAAGGTCAAGTGAGGGGAAC------AAGC-  801
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||            ||||||..|      |.|| 
Sbjct 741  AATGGAAGACGAGACTCAGAAAGAACTAGAAACAATGCGTAA------------GAGGGGTTCCGTTCGAGGCA  802

Query 802  -----GCAGCCAGTGATGAG  816
                ||.||   |||||..
Sbjct 803  CGTCGGCTGC---TGATGTC  819