Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11765
• Subject: NM_001284304.1
• Aligned Length: 1494
• Identities: 1274
• Gaps: 210

Alignment

Query    1  ATGGCCAGCGACGGGGCCAGGAAGCAATTCTGGAAGCGCAGCAACAGCAAGCTCCCGGGCAGTTTGCTCAGGTC  74
                                       .|.||     |.|||.|||||..|.| ..|||.||||||||||||||
Sbjct    1  ---------------------------ATGTG-----GGAGCCACAGCCTGAT-GTGGGGAGTTTGCTCAGGTC  41

Query   75  CACGGCCAAGATGCCGACCACACCAGTGAAGGCCAAGAGGGTCAGCACCTTCCAGGAGTTTGAGAGCAATACCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   42  CACGGCCAAGATGCCGACCACACCAGTGAAGGCCAAGAGGGTCAGCACCTTCCAGGAGTTTGAGAGCAATACCA  115

Query  149  GCGATGCCTGGGACGCTGGGGAGGACGACGATGAGCTCCTGGCCATGGCGGCGGAGAGCCTGAACTCCGAGGTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  116  GCGATGCCTGGGACGCTGGGGAGGACGACGATGAGCTCCTGGCCATGGCGGCGGAGAGCCTGAACTCCGAGGTG  189

Query  223  GTCATGGAGACGGCCAACCGTGTGCTGCGTAACCACAGCCAGCGGCAGGGGCGGCCCACGCTGCAGGAGGGGCC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  190  GTCATGGAGACGGCCAACCGTGTGCTGCGTAACCACAGCCAGCGGCAGGGGCGGCCCACGCTGCAGGAGGGGCC  263

Query  297  AGGGCTTCAGCAGAAGCCCAGGCCCGAGGCAGAGCCGCCCTCACCCCCCAGCGGCGACCTCCGGCTGGTGAAGT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  264  AGGGCTTCAGCAGAAGCCCAGGCCCGAGGCAGAGCCGCCCTCACCCCCCAGCGGCGACCTCCGGCTGGTGAAGT  337

Query  371  CGGTCAGTGAGAGCCACACGTCCTGTCCTGCA------------------------------------------  402
            ||||||||||||||||||||||||||||||||                                          
Sbjct  338  CGGTCAGTGAGAGCCACACGTCCTGTCCTGCAGAAAGTGCCAGCGATGCCGCCCCTCTGCAGAGGTCCCAGTCT  411

Query  403  --------------------------------------------------------------------------  402
                                                                                      
Sbjct  412  CTCCCACACTCGGCCACCGTCACGCTGGGTGGCACATCTGACCCCAGCACTCTCAGCAGCTCAGCGCTGAGCGA  485

Query  403  -------------------------------------------------------------GAGGAATTACGGA  415
                                                                         |||||||||||||
Sbjct  486  AAGAGAGGCCTCCCGGCTCGACAAGTTCAAGCAGCTGCTTGCCGGCCCCAACACGGACCTTGAGGAATTACGGA  559

Query  416  GGTTGAGCTGGTCCGGAATCCCTAAGCCAGTGCGTCCAATGACGTGGAAGCTCCTCTCAGGTTACCTTCCCGCC  489
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  560  GGTTGAGCTGGTCCGGAATCCCTAAGCCAGTGCGTCCAATGACGTGGAAGCTCCTCTCAGGTTACCTTCCCGCC  633

Query  490  AATGTAGACCGGAGACCAGCCACTCTCCAGAGAAAACAAAAAGAATATTTTGCATTTATTGAGCACTATTACGA  563
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  634  AATGTAGACCGGAGACCAGCCACTCTCCAGAGAAAACAAAAAGAATATTTTGCATTTATTGAGCACTATTACGA  707

Query  564  TTCTAGGAACGACGAAGTTCACCAGGACACATACAGGCAGATCCACATAGACATCCCTCGCATGAGCCCTGAAG  637
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  708  TTCTAGGAACGACGAAGTTCACCAGGACACATACAGGCAGATCCACATAGACATCCCTCGCATGAGCCCTGAAG  781

Query  638  CGTTGATCCTGCAGCCCAAGGTGACGGAGATTTTTGAAAGGATCTTGTTCATATGGGCGATCCGCCACCCAGCC  711
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  782  CGTTGATCCTGCAGCCCAAGGTGACGGAGATTTTTGAAAGGATCTTGTTCATATGGGCGATCCGCCACCCAGCC  855

Query  712  AGTGGATACGTTCAGGGTATAAATGATCTCGTCACTCCTTTCTTTGTGGTCTTCATTTGTGAATACATAGAGGC  785
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  856  AGTGGATACGTTCAGGGTATAAATGATCTCGTCACTCCTTTCTTTGTGGTCTTCATTTGTGAATACATAGAGGC  929

Query  786  AGAGGAGGTGGACACGGTGGACGTCTCCGGCGTGCCCGCAGAGGTGCTGTGCAACATCGAGGCCGACACCTACT  859
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  930  AGAGGAGGTGGACACGGTGGACGTCTCCGGCGTGCCCGCAGAGGTGCTGTGCAACATCGAGGCCGACACCTACT  1003

Query  860  GGTGCATGAGCAAGCTGCTGGATGGCATTCAGGACAACTACACCTTTGCCCAACCTGGGATTCAAATGAAAGTG  933
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1004  GGTGCATGAGCAAGCTGCTGGATGGCATTCAGGACAACTACACCTTTGCCCAACCTGGGATTCAAATGAAAGTG  1077

Query  934  AAAATGTTAGAAGAACTCGTGAGCCGGATTGATGAGCAAGTGCACCGGCACCTGGACCAACACGAAGTGAGATA  1007
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1078  AAAATGTTAGAAGAACTCGTGAGCCGGATTGATGAGCAAGTGCACCGGCACCTGGACCAACACGAAGTGAGATA  1151

Query 1008  CCTGCAGTTTGCCTTCCGCTGGATGAACAACCTGCTGATGAGGGAGGTGCCCCTGCGTTGTACCATCCGCCTGT  1081
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1152  CCTGCAGTTTGCCTTCCGCTGGATGAACAACCTGCTGATGAGGGAGGTGCCCCTGCGTTGTACCATCCGCCTGT  1225

Query 1082  GGGACACCTACCAGTCTGAACCGGACGGCTTTTCTCATTTCCACTTGTACGTGTGCGCTGCTTTTCTCGTGAGA  1155
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1226  GGGACACCTACCAGTCTGAACCGGACGGCTTTTCTCATTTCCACTTGTACGTGTGCGCTGCTTTTCTCGTGAGA  1299

Query 1156  TGGAGGAAGGAAATACTAGAAGAAAAAGATTTTCAAGAGCTGCTGCTCTTCCTCCAGAACCTGCCCACAGCCCA  1229
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1300  TGGAGGAAGGAAATACTAGAAGAAAAAGATTTTCAAGAGCTGCTGCTCTTCCTCCAGAACCTGCCCACAGCCCA  1373

Query 1230  CTGGGATGATGAGGACATCAGCCTGTTGCTGGCCGAGGCCTACCGCCTCAAGTTTGCTTTTGCCGACGCCCCCA  1303
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1374  CTGGGATGATGAGGACATCAGCCTGTTGCTGGCCGAGGCCTACCGCCTCAAGTTTGCTTTTGCCGACGCCCCCA  1447

Query 1304  ATCACTACAAGAAA  1317
            ||||||||||||||
Sbjct 1448  ATCACTACAAGAAA  1461