Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11765
• Subject: NM_001284305.1
• Aligned Length: 1494
• Identities: 1233
• Gaps: 261

Alignment

Query    1  ATGGCCAGCGACGGGGCCAGGAAGCAATTCTGGAAGCGCAGCAACAGCAAGCTCCCGGGCAGTTTGCTCAGGTC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CACGGCCAAGATGCCGACCACACCAGTGAAGGCCAAGAGGGTCAGCACCTTCCAGGAGTTTGAGAGCAATACCA  148
                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----------ATGCCGACCACACCAGTGAAGGCCAAGAGGGTCAGCACCTTCCAGGAGTTTGAGAGCAATACCA  64

Query  149  GCGATGCCTGGGACGCTGGGGAGGACGACGATGAGCTCCTGGCCATGGCGGCGGAGAGCCTGAACTCCGAGGTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   65  GCGATGCCTGGGACGCTGGGGAGGACGACGATGAGCTCCTGGCCATGGCGGCGGAGAGCCTGAACTCCGAGGTG  138

Query  223  GTCATGGAGACGGCCAACCGTGTGCTGCGTAACCACAGCCAGCGGCAGGGGCGGCCCACGCTGCAGGAGGGGCC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  139  GTCATGGAGACGGCCAACCGTGTGCTGCGTAACCACAGCCAGCGGCAGGGGCGGCCCACGCTGCAGGAGGGGCC  212

Query  297  AGGGCTTCAGCAGAAGCCCAGGCCCGAGGCAGAGCCGCCCTCACCCCCCAGCGGCGACCTCCGGCTGGTGAAGT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  213  AGGGCTTCAGCAGAAGCCCAGGCCCGAGGCAGAGCCGCCCTCACCCCCCAGCGGCGACCTCCGGCTGGTGAAGT  286

Query  371  CGGTCAGTGAGAGCCACACGTCCTGTCCTGCA------------------------------------------  402
            ||||||||||||||||||||||||||||||||                                          
Sbjct  287  CGGTCAGTGAGAGCCACACGTCCTGTCCTGCAGAAAGTGCCAGCGATGCCGCCCCTCTGCAGAGGTCCCAGTCT  360

Query  403  --------------------------------------------------------------------------  402
                                                                                      
Sbjct  361  CTCCCACACTCGGCCACCGTCACGCTGGGTGGCACATCTGACCCCAGCACTCTCAGCAGCTCAGCGCTGAGCGA  434

Query  403  -------------------------------------------------------------GAGGAATTACGGA  415
                                                                         |||||||||||||
Sbjct  435  AAGAGAGGCCTCCCGGCTCGACAAGTTCAAGCAGCTGCTTGCCGGCCCCAACACGGACCTTGAGGAATTACGGA  508

Query  416  GGTTGAGCTGGTCCGGAATCCCTAAGCCAGTGCGTCCAATGACGTGGAAGCTCCTCTCAGGTTACCTTCCCGCC  489
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  509  GGTTGAGCTGGTCCGGAATCCCTAAGCCAGTGCGTCCAATGACGTGGAAGCTCCTCTCAGGTTACCTTCCCGCC  582

Query  490  AATGTAGACCGGAGACCAGCCACTCTCCAGAGAAAACAAAAAGAATATTTTGCATTTATTGAGCACTATTACGA  563
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  583  AATGTAGACCGGAGACCAGCCACTCTCCAGAGAAAACAAAAAGAATATTTTGCATTTATTGAGCACTATTACGA  656

Query  564  TTCTAGGAACGACGAAGTTCACCAGGACACATACAGGCAGATCCACATAGACATCCCTCGCATGAGCCCTGAAG  637
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  657  TTCTAGGAACGACGAAGTTCACCAGGACACATACAGGCAGATCCACATAGACATCCCTCGCATGAGCCCTGAAG  730

Query  638  CGTTGATCCTGCAGCCCAAGGTGACGGAGATTTTTGAAAGGATCTTGTTCATATGGGCGATCCGCCACCCAGCC  711
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  731  CGTTGATCCTGCAGCCCAAGGTGACGGAGATTTTTGAAAGGATCTTGTTCATATGGGCGATCCGCCACCCAGCC  804

Query  712  AGTGGATACGTTCAGGGTATAAATGATCTCGTCACTCCTTTCTTTGTGGTCTTCATTTGTGAATACATAGAGGC  785
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  805  AGTGGATACGTTCAGGGTATAAATGATCTCGTCACTCCTTTCTTTGTGGTCTTCATTTGTGAATACATAGAGGC  878

Query  786  AGAGGAGGTGGACACGGTGGACGTCTCCGGCGTGCCCGCAGAGGTGCTGTGCAACATCGAGGCCGACACCTACT  859
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  879  AGAGGAGGTGGACACGGTGGACGTCTCCGGCGTGCCCGCAGAGGTGCTGTGCAACATCGAGGCCGACACCTACT  952

Query  860  GGTGCATGAGCAAGCTGCTGGATGGCATTCAGGACAACTACACCTTTGCCCAACCTGGGATTCAAATGAAAGTG  933
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  953  GGTGCATGAGCAAGCTGCTGGATGGCATTCAGGACAACTACACCTTTGCCCAACCTGGGATTCAAATGAAAGTG  1026

Query  934  AAAATGTTAGAAGAACTCGTGAGCCGGATTGATGAGCAAGTGCACCGGCACCTGGACCAACACGAAGTGAGATA  1007
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1027  AAAATGTTAGAAGAACTCGTGAGCCGGATTGATGAGCAAGTGCACCGGCACCTGGACCAACACGAAGTGAGATA  1100

Query 1008  CCTGCAGTTTGCCTTCCGCTGGATGAACAACCTGCTGATGAGGGAGGTGCCCCTGCGTTGTACCATCCGCCTGT  1081
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1101  CCTGCAGTTTGCCTTCCGCTGGATGAACAACCTGCTGATGAGGGAGGTGCCCCTGCGTTGTACCATCCGCCTGT  1174

Query 1082  GGGACACCTACCAGTCTGAACCGGACGGCTTTTCTCATTTCCACTTGTACGTGTGCGCTGCTTTTCTCGTGAGA  1155
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1175  GGGACACCTACCAGTCTGAACCGGACGGCTTTTCTCATTTCCACTTGTACGTGTGCGCTGCTTTTCTCGTGAGA  1248

Query 1156  TGGAGGAAGGAAATACTAGAAGAAAAAGATTTTCAAGAGCTGCTGCTCTTCCTCCAGAACCTGCCCACAGCCCA  1229
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1249  TGGAGGAAGGAAATACTAGAAGAAAAAGATTTTCAAGAGCTGCTGCTCTTCCTCCAGAACCTGCCCACAGCCCA  1322

Query 1230  CTGGGATGATGAGGACATCAGCCTGTTGCTGGCCGAGGCCTACCGCCTCAAGTTTGCTTTTGCCGACGCCCCCA  1303
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1323  CTGGGATGATGAGGACATCAGCCTGTTGCTGGCCGAGGCCTACCGCCTCAAGTTTGCTTTTGCCGACGCCCCCA  1396

Query 1304  ATCACTACAAGAAA  1317
            ||||||||||||||
Sbjct 1397  ATCACTACAAGAAA  1410