Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11765
- Subject:
- XM_017028742.2
- Aligned Length:
- 1647
- Identities:
- 1317
- Gaps:
- 330
Alignment
Query 1 ATGGCCAGCGACGGGGCCAGGAAGCAATTCTGGAAGCGCAGCAACAGCAAGCTCCCGGGCAG------------ 62
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCCAGCGACGGGGCCAGGAAGCAATTCTGGAAGCGCAGCAACAGCAAGCTCCCGGGCAGCATCCAGCACGT 74
Query 63 ---------------------------------------------TTTGCTCAGGTCCACGGCCAAGATGCCGA 91
|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GTATGGTGCCCAGCACCCCCCCTTTGATCCACTGTTACATGGCACTTTGCTCAGGTCCACGGCCAAGATGCCGA 148
Query 92 CCACACCAGTGAAGGCCAAGAGGGTCAGCACCTTCCAGGAGTTTGAGAGCAATACCAGCGATGCCTGGGACGCT 165
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCACACCAGTGAAGGCCAAGAGGGTCAGCACCTTCCAGGAGTTTGAGAGCAATACCAGCGATGCCTGGGACGCT 222
Query 166 GGGGAGGACGACGATGAGCTCCTGGCCATGGCGGCGGAGAGCCTGAACTCCGAGGTGGTCATGGAGACGGCCAA 239
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GGGGAGGACGACGATGAGCTCCTGGCCATGGCGGCGGAGAGCCTGAACTCCGAGGTGGTCATGGAGACGGCCAA 296
Query 240 CCGTGTGCTGCGTAACCACAGCCAGCGGCAGGGGCGGCCCACGCTGCAGGAGGGGCCAGGGCTTCAGCAGAAGC 313
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCGTGTGCTGCGTAACCACAGCCAGCGGCAGGGGCGGCCCACGCTGCAGGAGGGGCCAGGGCTTCAGCAGAAGC 370
Query 314 CCAGGCCCGAGGCAGAGCCGCCCTCACCCCCCAGCGGCGACCTCCGGCTGGTGAAGTCGGTCAGTGAGAGCCAC 387
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CCAGGCCCGAGGCAGAGCCGCCCTCACCCCCCAGCGGCGACCTCCGGCTGGTGAAGTCGGTCAGTGAGAGCCAC 444
Query 388 ACGTCCTGTCCTGCA----------------------------------------------------------- 402
|||||||||||||||
Sbjct 445 ACGTCCTGTCCTGCAGAAAGTGCCAGCGATGCCGCCCCTCTGCAGAGGTCCCAGTCTCTCCCACACTCGGCCAC 518
Query 403 -------------------------------------------------------------------------- 402
Sbjct 519 CGTCACGCTGGGTGGCACATCTGACCCCAGCACTCTCAGCAGCTCAGCGCTGAGCGAAAGAGAGGCCTCCCGGC 592
Query 403 --------------------------------------------GAGGAATTACGGAGGTTGAGCTGGTCCGGA 432
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TCGACAAGTTCAAGCAGCTGCTTGCCGGCCCCAACACGGACCTTGAGGAATTACGGAGGTTGAGCTGGTCCGGA 666
Query 433 ATCCCTAAGCCAGTGCGTCCAATGACGTGGAAGCTCCTCTCAGGTTACCTTCCCGCCAATGTAGACCGGAGACC 506
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ATCCCTAAGCCAGTGCGTCCAATGACGTGGAAGCTCCTCTCAGGTTACCTTCCCGCCAATGTAGACCGGAGACC 740
Query 507 AGCCACTCTCCAGAGAAAACAAAAAGAATATTTTGCATTTATTGAGCACTATTACGATTCTAGGAACGACGAAG 580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGCCACTCTCCAGAGAAAACAAAAAGAATATTTTGCATTTATTGAGCACTATTACGATTCTAGGAACGACGAAG 814
Query 581 TTCACCAGGACACATACAGGCAGATCCACATAGACATCCCTCGCATGAGCCCTGAAGCGTTGATCCTGCAGCCC 654
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TTCACCAGGACACATACAGGCAGATCCACATAGACATCCCTCGCATGAGCCCTGAAGCGTTGATCCTGCAGCCC 888
Query 655 AAGGTGACGGAGATTTTTGAAAGGATCTTGTTCATATGGGCGATCCGCCACCCAGCCAGTGGATACGTTCAGGG 728
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AAGGTGACGGAGATTTTTGAAAGGATCTTGTTCATATGGGCGATCCGCCACCCAGCCAGTGGATACGTTCAGGG 962
Query 729 TATAAATGATCTCGTCACTCCTTTCTTTGTGGTCTTCATTTGTGAATACATAGAGGCAGAGGAGGTGGACACGG 802
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TATAAATGATCTCGTCACTCCTTTCTTTGTGGTCTTCATTTGTGAATACATAGAGGCAGAGGAGGTGGACACGG 1036
Query 803 TGGACGTCTCCGGCGTGCCCGCAGAGGTGCTGTGCAACATCGAGGCCGACACCTACTGGTGCATGAGCAAGCTG 876
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TGGACGTCTCCGGCGTGCCCGCAGAGGTGCTGTGCAACATCGAGGCCGACACCTACTGGTGCATGAGCAAGCTG 1110
Query 877 CTGGATGGCATTCAG----------------------------------------------------------- 891
|||||||||||||||
Sbjct 1111 CTGGATGGCATTCAGACTGGTCTTGAACTCCTGGGCTCAAGCGAGCTGCCCATGTTGGCCTCCCAAAGTGCTGG 1184
Query 892 -------------------------------------GACAACTACACCTTTGCCCAACCTGGGATTCAAATGA 928
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GATTACAGATGTGCGCCACCGCGCCCGGCCGCAAAATGACAACTACACCTTTGCCCAACCTGGGATTCAAATGA 1258
Query 929 AAGTGAAAATGTTAGAAGAACTCGTGAGCCGGATTGATGAGCAAGTGCACCGGCACCTGGACCAACACGAAGTG 1002
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AAGTGAAAATGTTAGAAGAACTCGTGAGCCGGATTGATGAGCAAGTGCACCGGCACCTGGACCAACACGAAGTG 1332
Query 1003 AGATACCTGCAGTTTGCCTTCCGCTGGATGAACAACCTGCTGATGAGGGAGGTGCCCCTGCGTTGTACCATCCG 1076
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AGATACCTGCAGTTTGCCTTCCGCTGGATGAACAACCTGCTGATGAGGGAGGTGCCCCTGCGTTGTACCATCCG 1406
Query 1077 CCTGTGGGACACCTACCAGTCTGAACCGGACGGCTTTTCTCATTTCCACTTGTACGTGTGCGCTGCTTTTCTCG 1150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CCTGTGGGACACCTACCAGTCTGAACCGGACGGCTTTTCTCATTTCCACTTGTACGTGTGCGCTGCTTTTCTCG 1480
Query 1151 TGAGATGGAGGAAGGAAATACTAGAAGAAAAAGATTTTCAAGAGCTGCTGCTCTTCCTCCAGAACCTGCCCACA 1224
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TGAGATGGAGGAAGGAAATACTAGAAGAAAAAGATTTTCAAGAGCTGCTGCTCTTCCTCCAGAACCTGCCCACA 1554
Query 1225 GCCCACTGGGATGATGAGGACATCAGCCTGTTGCTGGCCGAGGCCTACCGCCTCAAGTTTGCTTTTGCCGACGC 1298
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GCCCACTGGGATGATGAGGACATCAGCCTGTTGCTGGCCGAGGCCTACCGCCTCAAGTTTGCTTTTGCCGACGC 1628
Query 1299 CCCCAATCACTACAAGAAA 1317
|||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CCCCAATCACTACAAGAAA 1647