Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11798
- Subject:
- XM_006496216.3
- Aligned Length:
- 1530
- Identities:
- 1279
- Gaps:
- 69
Alignment
Query 1 ------------------------------------------------------------ATGGCTGAACTCAA 14
||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCTGGAACACAGGAAACCGGCGCTTCGGCAAGCAAGGCTTATACCCCTAGAAGGAAGATGGCTGAACTCAA 74
Query 15 TACTCATGTGAATGTCAAGGAAAAGATCTATGCAGTTAGATCAGTTGTTCCCAACAAAAGCAATAATGAAATAG 88
.|||||||||||..||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 75 CACTCATGTGAACATCAAAGAGAAGATCTACGCAGTTAGATCAGTTGTTCCGAACAAAAGCAATAATGAAATCG 148
Query 89 TCCTGGTGCTCCAACAGTTTGATTTTAATGTGGATAAAGCCGTGCAAGCCTTTGTGGATGGCAGTGCAATTCAA 162
|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 149 TGCTGGTACTCCAACAGTTTGATTTTAATGTGGATAAAGCCGTACAGGCCTTTGTGGATGGCAGTGCTATTCAA 222
Query 163 GTTCTAAAAGAATGGAATATGACAGGA---AAGAAGAACAATAAAAGAAAAAGAAGCAAGTCCAAGCAGCATCA 233
|||||.|||||||||||.|||||.||| ||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 223 GTTCTTAAAGAATGGAACATGACGGGAAAGAAGAAGAATAATAAAAGGAAGAGAAGCAAATCCAAGCAGCATCA 296
Query 234 AGGCAACAAAGATGCTAAAGACAAGGTGGAGAGGCCTGAGGCAGGGCCCCTGCAGCCGCAGCCACCACAGATTC 307
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||..||||||||||||||.|||.||||||.|.|.|
Sbjct 297 AGGCAACAAAGATGCTAAGGACAAGGTGGAGAGGCCAGAGGTGGGGCCCCTGCAGCCCCAGGCACCACTGGTAC 370
Query 308 AAAACGGCCCCATGAATGGCTGCGAGAAGGACAGCTCGTCCACAGATTCTGCTAACGAAAAACCAGCCCTTATC 381
||||.||.|.|||||||||||||||.|||||||||||.|||.|.||.|||.|.|..|||||||..|||||.|..
Sbjct 371 AAAATGGTCACATGAATGGCTGCGAAAAGGACAGCTCATCCCCTGACTCTACCAGAGAAAAACTGGCCCTCACA 444
Query 382 CCTCGTGAGAAAAAGATCTCGATACTTGAGGAACCTTCAAAGGCACTTCGTGGGGTCACAGGCCCAAATATTGA 455
||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||.|||.|..||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CCACGTGAGAAAAAGATCTCGATACTGGAGGAACCTCCAAGGGCTCAGCGTGGGGTCACAGGCCCAAATATTGA 518
Query 456 GAAATCAGTGAAGGATTTGCAACGCTGCACCGTTTCTCTAACTAGATATCGCGTCATGATTAAGGAAGAAGTGG 529
||||||.|||||||||.||||.||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 519 GAAATCGGTGAAGGATCTGCAGCGCTGCACTGTTTCTCTGACGAGATACCGCGTCATGATCAAGGAAGAAGTGG 592
Query 530 ATAGTTCCGTGAAGAAGATCAAAGCTGCCTTTGCTGAATTACACAACTGCATCATTGACAAAGAAGTTTCATTA 603
|.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||.|.
Sbjct 593 ACAGTTCCGTGAAGAAGATCAAAGCAGCATTTGCTGAGCTACACAACTGCATCATTGACAAAGAAGTTTCACTG 666
Query 604 ATGGCAGAAATGGATAAAGTTAAAGAAGAAGCCATGGAAATCCTGACTGCTCGTCAGAAGAAAGCAGAAGAACT 677
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||
Sbjct 667 ATGGCAGAAATGGACAAAGTTAAAGAAGAAGCCATGGACATCCTGACTGCCCGTCAGAAGAAAGCAGAGGAGCT 740
Query 678 AAAGAGACTCACTGACCTTGCCAGTCAGATGGCAGAGATGCAGCTGGCCGAACTCAGGGCAGAAATTAAGCACT 751
.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 741 GAAGAGACTGACTGACCTAGCCAGTCAGATGGCAGAGATGCAGCTGGCCGAACTCAGAGCTGAAATTAAGCACT 814
Query 752 TTGTCAGCGAGCGTAAATATGACGAGGAGCTCGGGAAAGCTGCCCGGTTTTCCTGTGACATCGAACAGCTGAAG 825
||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.
Sbjct 815 TTGTCAGCGAACGCAAGTATGACGAGGAGCTGGGGAAGGCTGCCCGCTTCTCCTGTGACATTGAACAACTGAAA 888
Query 826 GCCCAAATCATGCTCTGCGGAGAAATTACACATCCAAAGAACAACTATTCCTCAAGAACTCCCTGCAGCTCCCT 899
|||||||||.||.||||.|||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GCCCAAATCCTGATCTGTGGAGAAATTACACATCCAAAGAACAGCTACTCCTCAAGAACTCCCTGCAGCTCCCT 962
Query 900 GCTGCCTCTGCTGAATGCGCACGCAGCAACCTCTGGGAAACAGAGTAACTTTTCCCGAAAATCATCCACTCACA 973
|||||||||||||||..|.||.||.|.|.|.||.|||||||||.|.||.|||.||||.||.||||||..|||||
Sbjct 963 GCTGCCTCTGCTGAACACTCATGCGGTAGCTTCCGGGAAACAGGGGAATTTTGCCCGGAAGTCATCCGGTCACA 1036
Query 974 ATAAGCCCTCTGAAGGCAAAGCGGCAAACCCCAAAATGGTGAGCAGTCTCCCCAGCACCGCCGACCCCTCTCAC 1047
|.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||.|.||..|||.|||.|||||..|.|.||||
Sbjct 1037 ACAAGCCCTCTGAGGGGAAAGCAGCAAACCCCAAAATGGTGAGCGGACTTGCCAACACTGCCGATGCGTGTCAC 1110
Query 1048 CAGACCATGCCGGCCAACA---AGCAGAATGGATCTTCTAACCAAAGACGGAGATTTAATCCACAGTATCATAA 1118
|||||||||||..|.|||| |||||||||||.||||.|.|||||||||.||||||||||||||||||| |
Sbjct 1111 CAGACCATGCCCACTAACAAGCAGCAGAATGGACCTTCCAGCCAAAGACGAAGATTTAATCCACAGTATC---A 1181
Query 1119 CAACAGGCTAAATGGGCCTGCCAAGTCGCAGGGCAGTGGGAATGAAGCCGAGCCACTGGGAAAGGGCAACAGCC 1192
|||||||||||||||.||.||||||||.|||||..||||.||||||||.||.||..|||..|||.|||||||||
Sbjct 1182 CAACAGGCTAAATGGTCCAGCCAAGTCACAGGGTGGTGGTAATGAAGCGGATCCCATGGCGAAGAGCAACAGCC 1255
Query 1193 GCCACGAACACAGAAGACAGCCGCACAACGGCTTCCGGCCCAAAAACAAAGGCGGTGCCAAAAATCAAGAGGCT 1266
||||.|||||||||||||||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct 1256 GCCATGAACACAGAAGACAGCCACATAATGGTTTCCGTCCCAAAAACAAAGGTGGTGCCAAAAACCAAGAGGCC 1329
Query 1267 TCCTTGGGGATGAAGACCCCCGAGGCCCCGGCCCATTCTGAAAAGCCCCGGCGAAGGCAGCACGCTGCAGACAC 1340
.|||||||||..|||.||||.||||||||..|.||||||||||||.||||.|||||||||||.||||||||||.
Sbjct 1330 CCCTTGGGGACAAAGGCCCCAGAGGCCCCCCCACATTCTGAAAAGGCCCGTCGAAGGCAGCATGCTGCAGACAA 1403
Query 1341 CTCGGAGGCCAGGCCCTTCCGGGGTAGTGTCGGTAGGGTTTCACAGTGCAATCTCTGCCCCACGAGAATAGAAG 1414
||..|||||||||||.||||||||||.|||..||||||||||||||||||||||.||.|||.|.||||||||||
Sbjct 1404 CTTAGAGGCCAGGCCTTTCCGGGGTAATGTTAGTAGGGTTTCACAGTGCAATCTTTGTCCCTCTAGAATAGAAG 1477
Query 1415 TTTCCACAGATGCAGCAGTTCTCTCAGTCCCGGCTGTGACGTTGGTGGCC 1464
|||||||.||.||..|.||.|||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1478 TTTCCACGGAGGCCACGGTCCTCTCAGTCCCCGCTGTGACGTTGGTGGCC 1527