Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11798
- Subject:
- XM_011510938.1
- Aligned Length:
- 1764
- Identities:
- 1464
- Gaps:
- 300
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGACCCGTTTTGCCATAGCTCTTCAGAAACCAGGCTGCTTTCAGGAACATTGCTGTGGATTCCCAGGGCCTA 74
Query 1 ----------------ATGGCTGAACTCAATACTCATGTGAATGTCAAGGAAAAGATCTATGCAGTTAGATCAG 58
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TTCCACTAGAAGCAAGATGGCTGAACTCAATACTCATGTGAATGTCAAGGAAAAGATCTATGCAGTTAGATCAG 148
Query 59 TTGTTCCCAACAAAAGCAATAATGAAATAGTCCTGGTGCTCCAACAGTTTGATTTTAATGTGGATAAAGCCGTG 132
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TTGTTCCCAACAAAAGCAATAATGAAATAGTCCTGGTGCTCCAACAGTTTGATTTTAATGTGGATAAAGCCGTG 222
Query 133 CAAGCCTTTGTGGATGGCAGTGCAATTCAAGTTCTAAAAGAATGGAATATGACAGG---AAAGAAGAACAATAA 203
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 223 CAAGCCTTTGTGGATGGCAGTGCAATTCAAGTTCTAAAAGAATGGAATATGACAGGAAAAAAGAAGAACAATAA 296
Query 204 AAGAAAAAGAAGCAAGTCCAAGCAGCATCAAGGCAACAAAGATGCTAAAGACAAGGTGGAGAGGCCTGAGGCAG 277
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AAGAAAAAGAAGCAAGTCCAAGCAGCATCAAGGCAACAAAGATGCTAAAGACAAGGTGGAGAGGCCTGAGGCAG 370
Query 278 GGCCCCTGCAGCCGCAGCCACCACAGATTCAAAACGGCCCCATGAATGGCTGCGAGAAGGACAGCTCGTCCACA 351
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GGCCCCTGCAGCCGCAGCCACCACAGATTCAAAACGGCCCCATGAATGGCTGCGAGAAGGACAGCTCGTCCACA 444
Query 352 GATTCTGCTAACGAAAAACCAGCCCTTATCCCTCGTGAGAAAAAGATCTCGATACTTGAGGAACCTTCAAAGGC 425
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GATTCTGCTAACGAAAAACCAGCCCTTATCCCTCGTGAGAAAAAGATCTCGATACTTGAGGAACCTTCAAAGGC 518
Query 426 ACTTCGTGGGGTCAC----------------------------------------------------------- 440
|||||||||||||||
Sbjct 519 ACTTCGTGGGGTCACAGAAGGCAACAGACTACTGCAACAGAAACTATCCTTAGATGGGAACCCCAAACCTATAC 592
Query 441 -------------------------------------------------------------------------- 440
Sbjct 593 ATGGAACAACAGAGAGGTCAGATGGCCTACAGTGGTCAGCTGAGCAGCCTTGTAACCCAAGCAAGCCTAAGGCA 666
Query 441 -------------------------------------------------------------------------- 440
Sbjct 667 AAAACATCTCCTGTTAAGTCCAATACCCCTGCAGCTCATCTTGAAATAAAGCCAGATGAGTTGGCAAAGAAAAG 740
Query 441 AGGCCCAAATATTGAGAAATCAGTGAAGGATTTGCAACGCTGCACCGTTTCTCTAACTAGATATCGCGTCATGA 514
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGGCCCAAATATTGAGAAATCAGTGAAGGATTTGCAACGCTGCACCGTTTCTCTAACTAGATATCGCGTCATGA 814
Query 515 TTAAGGAAGAAGTGGATAGTTCCGTGAAGAAGATCAAAGCTGCCTTTGCTGAATTACACAACTGCATCATTGAC 588
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TTAAGGAAGAAGTGGATAGTTCCGTGAAGAAGATCAAAGCTGCCTTTGCTGAATTACACAACTGCATCATTGAC 888
Query 589 AAAGAAGTTTCATTAATGGCAGAAATGGATAAAGTTAAAGAAGAAGCCATGGAAATCCTGACTGCTCGTCAGAA 662
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AAAGAAGTTTCATTAATGGCAGAAATGGATAAAGTTAAAGAAGAAGCCATGGAAATCCTGACTGCTCGTCAGAA 962
Query 663 GAAAGCAGAAGAACTAAAGAGACTCACTGACCTTGCCAGTCAGATGGCAGAGATGCAGCTGGCCGAACTCAGGG 736
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GAAAGCAGAAGAACTAAAGAGACTCACTGACCTTGCCAGTCAGATGGCAGAGATGCAGCTGGCCGAACTCAGGG 1036
Query 737 CAGAAATTAAGCACTTTGTCAGCGAGCGTAAATATGACGAGGAGCTCGGGAAAGCTGCCCGGTTTTCCTGTGAC 810
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CAGAAATTAAGCACTTTGTCAGCGAGCGTAAATATGACGAGGAGCTCGGGAAAGCTGCCCGGTTTTCCTGTGAC 1110
Query 811 ATCGAACAGCTGAAGGCCCAAATCATGCTCTGCGGAGAAATTACACATCCAAAGAACAACTATTCCTCAAGAAC 884
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ATCGAACAGCTGAAGGCCCAAATCATGCTCTGCGGAGAAATTACACATCCAAAGAACAACTATTCCTCAAGAAC 1184
Query 885 TCCCTGCAGCTCCCTGCTGCCTCTGCTGAATGCGCACGCAGCAACCTCTGGGAAACAGAGTAACTTTTCCCGAA 958
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TCCCTGCAGCTCCCTGCTGCCTCTGCTGAATGCGCACGCAGCAACCTCTGGGAAACAGAGTAACTTTTCCCGAA 1258
Query 959 AATCATCCACTCACAATAAGCCCTCTGAAGGCAAAGCGGCAAACCCCAAAATGGTGAGCAGTCTCCCCAGCACC 1032
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AATCATCCACTCACAATAAGCCCTCTGAAGGCAAAGCGGCAAACCCCAAAATGGTGAGCAGTCTCCCCAGCACC 1332
Query 1033 GCCGACCCCTCTCACCAGACCATGCCGGCCAACAAGCAGAATGGATCTTCTAACCAAAGACGGAGATTTAATCC 1106
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GCCGACCCCTCTCACCAGACCATGCCGGCCAACAAGCAGAATGGATCTTCTAACCAAAGACGGAGATTTAATCC 1406
Query 1107 ACAGTATCATAACAACAGGCTAAATGGGCCTGCCAAGTCGCAGGGCAGTGGGAATGAAGCCGAGCCACTGGGAA 1180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 ACAGTATCATAACAACAGGCTAAATGGGCCTGCCAAGTCGCAGGGCAGTGGGAATGAAGCCGAGCCACTGGGAA 1480
Query 1181 AGGGCAACAGCCGCCACGAACACAGAAGACAGCCGCACAACGGCTTCCGGCCCAAAAACAAAGGCGGTGCCAAA 1254
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AGGGCAACAGCCGCCACGAACACAGAAGACAGCCGCACAACGGCTTCCGGCCCAAAAACAAAGGCGGTGCCAAA 1554
Query 1255 AATCAAGAGGCTTCCTTGGGGATGAAGACCCCCGAGGCCCCGGCCCATTCTGAAAAGCCCCGGCGAAGGCAGCA 1328
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AATCAAGAGGCTTCCTTGGGGATGAAGACCCCCGAGGCCCCGGCCCATTCTGAAAAGCCCCGGCGAAGGCAGCA 1628
Query 1329 CGCTGCAGACACCTCGGAGGCCAGGCCCTTCCGGGGTAGTGTCGGTAGGGTTTCACAGTGCAATCTCTGCCCCA 1402
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CGCTGCAGACACCTCGGAGGCCAGGCCCTTCCGGGGTAGTGTCGGTAGGGTTTCACAGTGCAATCTCTGCCCCA 1702
Query 1403 CGAGAATAGAAGTTTCCACAGATGCAGCAGTTCTCTCAGTCCCGGCTGTGACGTTGGTGGCC 1464
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CGAGAATAGAAGTTTCCACAGATGCAGCAGTTCTCTCAGTCCCGGCTGTGACGTTGGTGGCC 1764