Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11824
• Subject: XM_011510953.2
• Aligned Length: 1158
• Identities: 998
• Gaps: 159

Alignment

Query    1  ---------------ATGTGGAGGCTCATGTCGAGGTTTAATGCATTCAAAAGGACTAATACCATACTGCACCA  59
                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGGCAGCGCGAGATGTGGAGGCTCATGTCGAGGTTTAATGCATTCAAAAGGACTAATACCATACTGCACCA  74

Query   60  TTTGAGAATGTCCAAGCACACAGATGCAGCAGAAGAGGTGCTATTGGAAAAAAAAGGTTGCGCGGGAGTCATAA  133
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct   75  TTTGAGAATGTCCAAGCACACAGATGCAGCAGAAGAGGTGCTATTGGAAAAAAAAGGTTGCACGGGAGTCATAA  148

Query  134  CACTAAACAGACCAAAGTTCCTCAATGCACTGACTCTTAATATGATTCGGCAGATTTATCCACAGCTAAAGAAG  207
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CACTAAACAGACCAAAGTTCCTCAATGCACTGACTCTTAATATGATTCGGCAGATTTATCCACAGCTAAAGAAG  222

Query  208  TGGGAACAAGATCCTGAAACTTTCCTGATCATTATAAAGGGAGCAGGAGGAAAGGCTTTCTGTGCCGGGGGTGA  281
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TGGGAACAAGATCCTGAAACTTTCCTGATCATTATAAAGGGAGCAGGAGGAAAGGCTTTCTGTGCCGGGGGTGA  296

Query  282  TATCAGAGTGATCTCGGAAGCTGAAAAGGCAAAACAGAAGATAGCTCCAGTTTTCTTCAGAGAAGAATATATGC  355
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TATCAGAGTGATCTCGGAAGCTGAAAAGGCAAAACAGAAGATAGCTCCAGTTTTCTTCAGAGAAGAATATATGC  370

Query  356  TGAATAATGCTGTTGGTTCTTGCCAGAAACCTTATGTTGCACTTATTCATGGAATTACAATGGGTGGGGGAGTT  429
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGAATAATGCTGTTGGTTCTTGCCAGAAACCTTATGTTGCACTTATTCATGGAATTACAATGGGTGGGGGAGTT  444

Query  430  GGTCTCTCAGTCCATGGGCAATTTCGAGTGGCTACAGAAAAGTGTCTTTTTGCTATGCCAGAAACTGCAATAGG  503
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGTCTCTCAGTCCATGGGCAATTTCGAGTGGCTACAGAAAAGTGTCTTTTTGCTATGCCAGAAACTGCAATAGG  518

Query  504  ACTGTTCCCTGATGTGGGTGGAGGTTATTTCTTGCCACGACTCCAAGGAAAACTTGGTTACTTCCTTGCATTAA  577
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ACTGTTCCCTGATGTGGGTGGAGGTTATTTCTTGCCACGACTCCAAGGAAAACTTGGTTACTTCCTTGCATTAA  592

Query  578  CAGGATTCAGACTAAAAGGAAGAGATGTGTACAGAGCAGGAATTGCTACACACTTTGTAGATTCTGAAAAGTTG  651
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAGGATTCAGACTAAAAGGAAGAGATGTGTACAGAGCAGGAATTGCTACACACTTTGTAGATTCTGAAAAGTTG  666

Query  652  GCCATGTTAGAGGAAGATTTGTTAGCCTTGAAATCTCCTTCAAAAGAAAATATTGCATCTGTCTTAGAAAATTA  725
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCCATGTTAGAGGAAGATTTGTTAGCCTTGAAATCTCCTTCAAAAGAAAATATTGCATCTGTCTTAGAAAATTA  740

Query  726  CCATACAGAGTCTAAGATTGATCGAGACAAGTCTTTTATACTTGAGGAACACATGGACAAAATAAACAGTTGTT  799
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCATACAGAGTCTAAGATTGATCGAGACAAGTCTTTTATACTTGAGGAACACATGGACAAAATAAACAGTTGTT  814

Query  800  TTTCAGCCAATACTGTGGAAGAAATTATTGAAAACTTACAGCAAGATGGTTCATCTTTTGCCCTAGAGCAATTG  873
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTTCAGCCAATACTGTGGAAGAAATTATTGAAAACTTACAGCAAGATGGTTCATCTTTTGCCCTAGAGCAATTG  888

Query  874  AAGGTAATTAATAAAATGTCTCCAACATCTCTAAAGATCACACTAAGGCAACTCATGGAGGGGTCTTCAAAGAC  947
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGGTAATTAATAAAATGTCTCCAACATCTCTAAAGATCACACTAAGGCAACTCATGGAGGGGTCTTCAAAGAC  962

Query  948  CTTGCAAGAAGTACTAACTATGGAGTATCGGCTAAGTCAAGCTTGTATG------------TTT----------  999
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||          
Sbjct  963  CTTGCAAGAAGTACTAACTATGGAGTATCGGCTAAGTCAAGCTTGTATGAGAGGTCATGACTTTCATGAAGGCG  1036

Query 1000  --------------------------------------------------------------------------  999
                                                                                      
Sbjct 1037  TTAGAGCTGTTTTAATTGATAAAGACCAGAGTCCAAAATGGAAACCAGCTGATCTAAAAGAAGTTACTGAGGAA  1110

Query 1000  ------------------------------------------------  999
                                                            
Sbjct 1111  GATTTGAATAATCACTTTAAGTCTTTGGGAAGCAGTGATTTGAAATTT  1158