Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11825
- Subject:
- NM_001242333.2
- Aligned Length:
- 1151
- Identities:
- 1019
- Gaps:
- 115
Alignment
Query 1 ------------------------------------------------------ATGGCCCAGCCAGGGTCCGG 20
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Sbjct 1 ATGCGCCGGGGGTTGTGCCGGCGCAGCGCTGAGAATCCCGACGCGGGGCCGGTGATGGCCCAGCCAGGGTCCGG 74
Query 21 CTGCAAAGCGACCACCCGCTGTCTTGAAGGGACCGCGCCGCCCGCCATGGCTCAGTCTGACGCCGAGGCCCTGG 94
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Sbjct 75 CTGCAAAGCGACCACCCGCTGTCTTGAAGGGACCGCGCCGCCCGCCATGGCTCAGTCTGACGCCGAGGCCCTGG 148
Query 95 CAGGAGCTCTGGACAAGGACGAGGGTCAGGCCTCCCCATGTACGCCCAGCACGCCATCTGTCTGCTCACCGCCC 168
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Sbjct 149 CAGGAGCTCTGGACAAGGACGAGGGTCAGGCCTCCCCATGTACGCCCAGCACGCCATCTGTCTGCTCACCGCCC 222
Query 169 TCTGCCGCCTCCTCCGTGCCGTCTGCAGGCAAGAACATCTGCTCCAGCTGCGGCCTCGAGATCCTGGACCGATA 242
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Sbjct 223 TCTGCCGCCTCCTCCGTGCCGTCTGCAGGCAAGAACATCTGCTCCAGCTGCGGCCTCGAGATCCTGGACCGATA 296
Query 243 TCTGCTCAAGGTCAACAACCTCATCTGGCACGTGCGGTGCCTCGAGTGCTCCGTGTGTCGCACGTCGCTGAGGC 316
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Sbjct 297 TCTGCTCAAGGTCAACAACCTCATCTGGCACGTGCGGTGCCTCGAGTGCTCCGTGTGTCGCACGTCGCTGAGGC 370
Query 317 AGCAGAACAGCTGCTACATCAAGAACAAGGAGATCTTCTGCAAGATGGACTACTTCAGCCGATTCGGGACCAAG 390
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Sbjct 371 AGCAGAACAGCTGCTACATCAAGAACAAGGAGATCTTCTGCAAGATGGACTACTTCAGCCGATTCGGGACCAAG 444
Query 391 TGTGCCCGGTGCGGCCGACAGATCTACGCCAGCGACTGGGTGCGGAGAGCTCGCGGCAACGCCTACCACCTGGC 464
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Sbjct 445 TGTGCCCGGTGCGGCCGACAGATCTACGCCAGCGACTGGGTGCGGAGAGCTCGCGGCAACGCCTACCACCTGGC 518
Query 465 CTGCTTCGCCTGCTTCTCGTGCAAGCGCCAGCTGTCCACTGGTGAGGAGTTCGGCCTGGTCGAGGAGAAGGTGC 538
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Sbjct 519 CTGCTTCGCCTGCTTCTCGTGCAAGCGCCAGCTGTCCACTGGTGAGGAGTTCGGCCTGGTCGAGGAGAAGGTGC 592
Query 539 TCTGCCGCATCCACTACGACACCATGATTGAGAACCTCAAGAGGGCCGCCGAGAACGGGAACGGCCTCACGTTG 612
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Sbjct 593 TCTGCCGCATCCACTACGACACCATGATTGAGAACCTCAAGAGGGCCGCCGAGAACGGGAACGGCCTCACGTTG 666
Query 613 GAGGGGGCAGTGCCCTCGGAACAGGACAGTCAACCCAAGCCGGCCAAGCGCGCGCGGACGTCCTTCACCGCGGA 686
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Sbjct 667 GAGGGGGCAGTGCCCTCGGAACAGGACAGTCAACCCAAGCCGGCCAAGCGCGCGCGGACGTCCTTCACCGCGGA 740
Query 687 ACAGCTGCAGGTTATGCAGGCGCAGTTCGCGCAGGACAACAACCCCGACGCTCAGACGCTGCAGAAGCTGGCGG 760
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Sbjct 741 ACAGCTGCAGGTTATGCAGGCGCAGTTCGCGCAGGACAACAACCCCGACGCTCAGACGCTGCAGAAGCTGGCGG 814
Query 761 ACATGACGGGCCTCAGCCGGAGAGTCATCCAGGTGTGGTTTCAAAACTGCCGGGCGCGTCATAAAAAGCACACG 834
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Sbjct 815 ACATGACGGGCCTCAGCCGGAGAGTCATCCAGGTGTGGTTTCAAAACTGCCGGGCGCGTCATAAAAAGCACACG 888
Query 835 CCGCAACACCCAGTGCCGCCCTCGGGGGCGCCCCCGTCCCGCCTTCCCTCCGCCCTGTCCGACGACATCCACTA 908
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Sbjct 889 CCGCAACACCCAGTGCCGCCCTCGGGGGCGCCCCCGTCCCGCCTTCCCTCCGCCCTGTCCGACGACATCCACTA 962
Query 909 CACCCCGTTCAGCAGCCCCGAGCGGGCGCGCATGGTCACCCTGCACGGCTACATTGAGAGTCA----GGTACAG 978
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Sbjct 963 CACCCCGTTCAGCAGCCCCGAGCGGGCGCGCATGGTCACCCTGCACGGCTACATTGAGAGTCATCCTTTTTCAG 1036
Query 979 TGCGGGCAGGT-GCACTGCCGGCTGCCTTACACCGCA-CCCCCCGT--CCACCTCAAAGCCGATATGGATGGGC 1048
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Sbjct 1037 TAC-------TAACGCTGCCGGC--ACTT---CCGCATCTGCCCGTGGGCGCCCCACAGC-----------TGC 1087
Query 1049 CGCTCTCCAACCGGGGTGAGAAGGTCATCCTTTTTCAGTAC 1089
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Sbjct 1088 CCCT---CAGCCGC--------------------------- 1098