Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11825
• Subject: XM_006497744.3
• Aligned Length: 1090
• Identities: 1006
• Gaps: 2

Alignment

Query    1  ATGGCCCAGCCAGGGTCCGGCTGCAAAGCGACCACCCGCTGTCTTGAAGGGACCGCGCCGCCCGCCATGGCTCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCCAGCCAGGGTCCGGCTGCAAAGCGACCACCCGCTGTCTCGAAGGGACCGCTCCGCCTGCCATGGCTCA  74

Query   75  GTCTGACGCCGAGGCCCTGGCAGGAGCTCTGGACAAGGACGAGGGTCAG-GCCTCCCCATGTACGCCCAGCACG  147
            |||.|||||.||||||.|||||||.|||||||||||||||||.||| || |||||||||||||||||||||||.
Sbjct   75  GTCAGACGCAGAGGCCTTGGCAGGCGCTCTGGACAAGGACGAAGGT-AGAGCCTCCCCATGTACGCCCAGCACA  147

Query  148  CCATCTGTCTGCTCACCGCCCTCTGCCGCCTCCTCCGTGCCGTCTGCAGGCAAGAACATCTGCTCCAGCTGCGG  221
            ||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct  148  CCGTCTGTCTGCTCGCCGCCCTCTGCTGCCTCTTCCGTGCCGTCTGCCGGCAAGAATATCTGCTCCAGTTGCGG  221

Query  222  CCTCGAGATCCTGGACCGATATCTGCTCAAGGTCAACAACCTCATCTGGCACGTGCGGTGCCTCGAGTGCTCCG  295
            .||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  222  TCTGGAGATCCTGGACCGGTATCTGCTCAAGGTCAACAACCTCATCTGGCACGTGCGGTGCCTCGAGTGCTCCG  295

Query  296  TGTGTCGCACGTCGCTGAGGCAGCAGAACAGCTGCTACATCAAGAACAAGGAGATCTTCTGCAAGATGGACTAC  369
            ||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  296  TGTGTCGCACATCGCTGAGGCAGCAGAATAGCTGCTACATCAAGAACAAGGAGATCTACTGCAAGATGGACTAC  369

Query  370  TTCAGCCGATTCGGGACCAAGTGTGCCCGGTGCGGCCGACAGATCTACGCCAGCGACTGGGTGCGGAGAGCTCG  443
            |||||||||||.||.||||||||.||||||||||||.||||.|||||.|||||.||||||||||||.|.||.||
Sbjct  370  TTCAGCCGATTTGGAACCAAGTGCGCCCGGTGCGGCAGACAAATCTATGCCAGTGACTGGGTGCGGCGCGCACG  443

Query  444  CGGCAACGCCTACCACCTGGCCTGCTTCGCCTGCTTCTCGTGCAAGCGCCAGCTGTCCACTGGTGAGGAGTTCG  517
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Sbjct  444  CGGCAATGCCTACCACCTGGCATGTTTCGCCTGCTTTTCCTGCAAGCGCCAGCTATCCACCGGTGAGGAATTCG  517

Query  518  GCCTGGTCGAGGAGAAGGTGCTCTGCCGCATCCACTACGACACCATGATTGAGAACCTCAAGAGGGCCGCCGAG  591
            ||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  518  GCCTCGTTGAGGAGAAGGTGCTTTGCCGCATCCATTACGACACCATGATCGAGAACCTCAAGAGGGCCGCCGAG  591

Query  592  AACGGGAACGGCCTCACGTTGGAGGGGGCAGTGCCCTCGGAACAGGACAGTCAACCCAAGCCGGCCAAGCGCGC  665
            |||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct  592  AACGGGAACGGTCTCACGCTGGAGGGGGCAGTGCCCTCGGAACAGGACAGTCAGCCCAAGCCAGCCAAGCGCGC  665

Query  666  GCGGACGTCCTTCACCGCGGAACAGCTGCAGGTTATGCAGGCGCAGTTCGCGCAGGACAACAACCCCGACGCTC  739
            ||||||||||||||||||.||.||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct  666  GCGGACGTCCTTCACCGCAGAGCAATTGCAGGTTATGCAGGCGCAGTTCGCGCAGGACAACAACCCGGACGCGC  739

Query  740  AGACGCTGCAGAAGCTGGCGGACATGACGGGCCTCAGCCGGAGAGTCATCCAGGTGTGGTTTCAAAACTGCCGG  813
            ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  740  AGACGCTGCAGAAGCTAGCGGACATGACGGGCCTCAGTCGCAGGGTCATCCAGGTGTGGTTTCAAAACTGCCGA  813

Query  814  GCGCGTCATAAAAAGCACACGCCGCAACACCCAGTGCCGCCCTCGGGGGCGCCCCCGTCCCGCCTTCCCTCCGC  887
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Sbjct  814  GCGCGTCATAAAAAGCATACACCGCAGCACCCAGTGCCGCCCTCTGGGGCACCCCCGACCCGCCTCCCTTCTGC  887

Query  888  CCTGTCCGACGACATCCACTACACCCCGTTCAGCAGCCCCGAGCGGGCGCGCATGGTCACCCTGCACGGCTACA  961
            ||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  888  CCTGTCCGACGACATCCACTACTCTCCGTTCAGCAGCCCAGAGAGGGCGCGCATGGTCACCTTGCACGGCTACA  961

Query  962  TTGAGAGTCAGGTACAGTGCGGGCAGGTGCACTGCCGGCTGCCTTACACCGCACCCCCCGTCCACCTCAAAGCC  1035
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Sbjct  962  TTGAGAGTCAGGTACAGTGCGGGCAGGTGCACTGCCGACTGCCTTACACCGCGCCCCCTGTCCACCTCAAAGCT  1035

Query 1036  GATATGGATGGGCCGCTCTCCAACCGGGGTGAGAAGGTCATCCTTTTTCAGTAC  1089
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Sbjct 1036  GATTTGGACGGCCCGCTCTCCAGCCGGGGTGAGAAGGTCATCCTTTTTCAGTAC  1089