Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_11828
Subject:
NM_001099634.1
Aligned Length:
2061
Identities:
1466
Gaps:
497

Alignment

Query    1  MLRVIVESASNIPKTKFGKPDPIVSVIFKDEKKKTKKVDNELNPVWNEILEFDLRGIPLDFSSSLGIIVKDFET  74
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|.||||||
Sbjct    1  MLRVIVESATNIPKTKFGKPDPIVSVIFKDEKKKTKKVDNELNPVWNEILEFDLRGIPLDSSSSLVIVVKDFET  74

Query   75  IGQNKLIGTATVALKDLTGDQSRSLPYKLISLLNEKGQDTGATIDLVIGYDPPSAPHPNDLSGPSVPGMGGDGE  148
            ||||||||||||.||||.|||.||||||..||||||||||||||||||||.|||||||||.||.||||||...|
Sbjct   75  IGQNKLIGTATVSLKDLIGDQNRSLPYKQTSLLNEKGQDTGATIDLVIGYTPPSAPHPNDPSGTSVPGMGEEEE  148

Query  149  EDEGDEDRLDNAVRGPGPKGPVGTVSEAQLARRLTKVKNSRRMLSNKPQDFQIRVRVIEGRQLSGNNIRPVVKV  222
            ||.|||||.|..|||||||||.|||||||||||.||.|.||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  149  EDQGDEDRVDGIVRGPGPKGPSGTVSEAQLARRITKGKSSRRMLSNKPQDFQIRVRVIEGRQLCGNNIRPVVKV  222

Query  223  HVCGQTHRTRIKRGNNPFFDELFFYNVNMTPSELMDEIISIRVYNSHSLRADCLMGEFKIDVGFVYDEPGHAVM  296
            |.|||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  HICGQTHRTRIKRGNNPFFDELFFYNVHITPSELMDEIISIRVYNSHSLRADCLMGEFKIDVGFVYDEPGHAVM  296

Query  297  RKWLLLNDPEDTSSGSKGYMKVSMFVLGTGDEPPPERRDRDNDSDDVESNLLLPAGIALRWVTFLLKIYRAEDI  370
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  297  RKWLLLNDPEDTSSGAKGYMKVSMFVLGTGDEPPPEKRDRDNDSDDVESNLLLPAGIALRWVTFMLKIYRAEDI  370

Query  371  PQMDDAFSQTVKEIFGGNADKKNLVDPFVEVSFAGKKVCTNIIEKNANPEWNQVVNLQIKFPSVCEKIKLTIYD  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.||
Sbjct  371  PQMDDAFSQTVKEIFGGNADKKNLVDPFVEVSFAGKKVCTNIIERNANPEWNQVVNLQIKFPSMCEKIKLTVYD  444

Query  445  WDRLTKNDVVGTTYLHLSKIAASGGEVEDFSSSGTGAASYTVNTGETEVGFVPTFGPCYLNLYGSPREYTGFPD  518
            |||||||||||||||.||||||||||||             ..|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  WDRLTKNDVVGTTYLYLSKIAASGGEVE-------------ATTGETEVGFVPTFGPCYLNLYGSPREYTGFPD  505

Query  519  PYDELNTGKGEGVAYRGRILVELATFLEKTPPDKKLEPISNDDLLVVEKYQRRRKYSLSAVFHSATMLQDVGEA  592
            ||||||.||||||||||||.|||.|||||.||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  506  PYDELNSGKGEGVAYRGRIFVELNTFLEKKPPEKKLEPISSDDLLVVEKYQRRRKYSLSAVFHSATMLQDVGEA  579

Query  593  IQFEVSIGNYGNKFDTTCKPLASTTQYSRAVFDGNYYYYLPWAHTKPVVTLTSYWEDISHRLDAVNTLLAMAER  666
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  580  IQFEVSIGNYGNKFDATCKPLASTTQYSRAVFDGNYYYYLPWAHTKPVVTLTSYWEDISHRLDAVNTLLVMAER  653

Query  667  LQTNIEALKSGIQGKIPANQLAELWLKLIDEVIEDTRYTLPLTEGKANVTVLDTQIRKLRSRSLSQIHEAAVRM  740
            ||.||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct  654  LQSNIEAVKSGIQGKIPANQLAEVWLKLIDEVIEDTRYTLPVTEGKANVTVLDTQIRKLRSRFLSQIHEAALRM  727

Query  741  RSEATDVKSTLAEIEDWLDKLMQLTEEPQNSMPDIIIWMIRGEKRLAYARIPAHQVLYSTSGENASGKYCGKTQ  814
            |||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  728  RSEATDVKSTLLEIEEWLDKLMQLTEEPQNSMPDIIIWMIRGEKRLAYARIPAHQVLYSTSGGNASGKYCGKTQ  801

Query  815  TIFLKYPQEKNNGPKVPVELRVNIWLGLSAVEKKFNSFAEGTFTVFAEMYENQALMFGKWGTSGLVGRHKFSDV  888
            ||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  802  TILLKYPQEKTNGPKVPVELRVNIWLGLSAVEKKFNSFAEGTFTVFAEMYENQALVFGKWGTSGLVGRHKFSDV  875

Query  889  TGKIKLKREFFLPPKGWEWEGEWIVDPERSLLTEADAGHTEFTDEVYQNESRYPGGDWKPAEDTYTDANGDKAA  962
            |||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||
Sbjct  876  TGKIKLKREFFLPPKGWEWEGDWVVDPERSLLTEADAGHTEFTDEVYQNENRYPGGEWKQAEDTYTDANGDKAA  949

Query  963  SPSELTCPPGWEWEDDAWSYDINRAVDEKGWEYGITIPPDHKPKSWVAAEKMYHTHRRRRLVRKRKKDLTQTAS  1036
            ||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  950  SPSEMTCPPGWEWEDDAWIYDINRAVDEKGWEYGITIPPDNKPKSWVAAEKMYHTHRRRRLVRKRKKDLTQTAS  1023

Query 1037  STARAMEELQDQEGWEYASLIGWKFHWKQRSSDTFRRRRWRRKMAPSETHGAAAIFKLEGALGADTTEDGDEKS  1110
            |||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1024  STARAMEELEDREGWEYASLIGWKFHWKQRSSDTFRRRRWRRKMAPSETHGAAAIFKLEGALGADTTEDGEEKG  1097

Query 1111  LEKQKHSATTVFGANTPIVSCNFDRVYIYHLRCYVYQARNLLALDKDSFSDPYAHICFLHRSKTTEIIHSTLNP  1184
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||..|||||||||||||||||
Sbjct 1098  PEKQKHSATTVFGANTPIVSCNFDRVYIYHLRCYIYQARNLMALDKDSFSDPYAHVSFLHRSKTTEIIHSTLNP  1171

Query 1185  TWDQTIIFDEVEIYGEPQTVLQNPPKVIMELFDNDQVGK-----------------------------------  1223
            |||||||||||||.|||||||||||.|..||||||||||                                   
Sbjct 1172  TWDQTIIFDEVEIFGEPQTVLQNPPNVTIELFDNDQVGKDEFLGRSICSPLVKLNSETDITPKLLWHPVMNGDK  1245

Query 1224  --------------------------------------------------------------------------  1223
                                                                                      
Sbjct 1246  ACGDVLVTAELILRNKDGSNLPILPSQRAPNLYMVPQGIRPVVQLTAIEILAWGLRNMKNYQMASVTSPSLVVE  1319

Query 1224  --------------------------------------------------------------------------  1223
                                                                                      
Sbjct 1320  CGGERVESVVIKSLKKTPNFPSSVLFMKVFLPKEELYMPPLVIKVIDHRQFGRKPVVGQCTIDHLDRFRCDPYA  1393

Query 1224  --------------------------------------------------------------------------  1223
                                                                                      
Sbjct 1394  GKEDIVPQLKASLMSAPPCREVVIEIEDTKPLLASKLSEKEEEIVDWWSKFYASSGEHEKCGQYIQKGYSKLKI  1467

Query 1224  --------------------------------------------------------------------------  1223
                                                                                      
Sbjct 1468  YDCELEDVADFEGLTDFSDTFKLYRGKSDENEDPSVVGEFKGSFRIYPLPDDPSVPAPPRQFRELPDSVPQECT  1541

Query 1224  --------------------------------------------------------------------------  1223
                                                                                      
Sbjct 1542  VRIYIVQGLQLQPQDNNGLCDPYIKITLGKKVIEDRDHYIPNTLNPVFGRMYELSCYLPQEKDLKISVYDYDTF  1615

Query 1224  --------------------------------------------------------------------------  1223
                                                                                      
Sbjct 1616  TRDEKVGETTIDLENRFLSRFGSHCGIPEQYCVSGVNTWRDQLRPTQLLQNVARFKGFPPPVLSEDGSRIRYGG  1689

Query 1224  -----DEFEANKILHQHLGAPEERLALHILRTQGLVPEHVETRTLHSTFQPNISQGKLQMWVDVFPKSLGPPGP  1292
                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1690  RDYHLDEFEANKILHQHLGAPEERLALHILRTQGLVPEHVETRTLHSTFQPNISQGKLQMWVDVFPKSLGPPGP  1763

Query 1293  PFNITPRKAKKYYLRVIIWNTKDVILDEKSITGEEMSDIYVKGWIPGNEENKQKTDVHYRSLDGEGNFNWRFVF  1366
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1764  PFNITPRKAKKYYLRVIIWNTKDVILDEKSITGEDMSDIYVKGWISGSEENKQKTDVHYRSLDGEGNFNWRFVF  1837

Query 1367  PFDYLPAEQLCIVAKKEHFWSIDQTEFRIPPRLIIQIWDNDKFSLDDYLGFLELDLRHTIIPAKSPEKCRLDMI  1440
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||..||||||..|||.||||
Sbjct 1838  PFDYLPAEQLCIVAKKEHFWSIDQTEFRVPPRLIIQIWDNDKFSLDDYLGFLELDLHRTIIPAKTSEKCSLDMI  1911

Query 1441  PDLKAMNPLKAKTASLFEQKSMKGWWPCYAEKDGARVMAGKVEMTLEILNEKEADERPAGKGRDEPNMNPKLDL  1514
            ||||||.||||||||||||.||||||||||.|||.||||||||||||.|||.|||||||||||.|||||||||.
Sbjct 1912  PDLKAMDPLKAKTASLFEQRSMKGWWPCYADKDGTRVMAGKVEMTLEVLNEREADERPAGKGRSEPNMNPKLDP  1985

Query 1515  PNRPETSFLWFTNPCKTMKFIVWRRFKWVIIGLLFLLILLLFVAVLLYSLPNYLSMKIVKPNV  1577
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1986  PNRPETSFLWFTNPCKTMRFIVWRRFKWVIIGLLLLLILLLFVAVLLYSLPNYLSMKIVRPNA  2048