Protein Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11828
- Subject:
- NM_001099634.1
- Aligned Length:
- 2061
- Identities:
- 1466
- Gaps:
- 497
Alignment
Query 1 MLRVIVESASNIPKTKFGKPDPIVSVIFKDEKKKTKKVDNELNPVWNEILEFDLRGIPLDFSSSLGIIVKDFET 74
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Sbjct 1 MLRVIVESATNIPKTKFGKPDPIVSVIFKDEKKKTKKVDNELNPVWNEILEFDLRGIPLDSSSSLVIVVKDFET 74
Query 75 IGQNKLIGTATVALKDLTGDQSRSLPYKLISLLNEKGQDTGATIDLVIGYDPPSAPHPNDLSGPSVPGMGGDGE 148
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Sbjct 75 IGQNKLIGTATVSLKDLIGDQNRSLPYKQTSLLNEKGQDTGATIDLVIGYTPPSAPHPNDPSGTSVPGMGEEEE 148
Query 149 EDEGDEDRLDNAVRGPGPKGPVGTVSEAQLARRLTKVKNSRRMLSNKPQDFQIRVRVIEGRQLSGNNIRPVVKV 222
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Sbjct 149 EDQGDEDRVDGIVRGPGPKGPSGTVSEAQLARRITKGKSSRRMLSNKPQDFQIRVRVIEGRQLCGNNIRPVVKV 222
Query 223 HVCGQTHRTRIKRGNNPFFDELFFYNVNMTPSELMDEIISIRVYNSHSLRADCLMGEFKIDVGFVYDEPGHAVM 296
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Sbjct 223 HICGQTHRTRIKRGNNPFFDELFFYNVHITPSELMDEIISIRVYNSHSLRADCLMGEFKIDVGFVYDEPGHAVM 296
Query 297 RKWLLLNDPEDTSSGSKGYMKVSMFVLGTGDEPPPERRDRDNDSDDVESNLLLPAGIALRWVTFLLKIYRAEDI 370
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Sbjct 297 RKWLLLNDPEDTSSGAKGYMKVSMFVLGTGDEPPPEKRDRDNDSDDVESNLLLPAGIALRWVTFMLKIYRAEDI 370
Query 371 PQMDDAFSQTVKEIFGGNADKKNLVDPFVEVSFAGKKVCTNIIEKNANPEWNQVVNLQIKFPSVCEKIKLTIYD 444
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Sbjct 371 PQMDDAFSQTVKEIFGGNADKKNLVDPFVEVSFAGKKVCTNIIERNANPEWNQVVNLQIKFPSMCEKIKLTVYD 444
Query 445 WDRLTKNDVVGTTYLHLSKIAASGGEVEDFSSSGTGAASYTVNTGETEVGFVPTFGPCYLNLYGSPREYTGFPD 518
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Sbjct 445 WDRLTKNDVVGTTYLYLSKIAASGGEVE-------------ATTGETEVGFVPTFGPCYLNLYGSPREYTGFPD 505
Query 519 PYDELNTGKGEGVAYRGRILVELATFLEKTPPDKKLEPISNDDLLVVEKYQRRRKYSLSAVFHSATMLQDVGEA 592
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Sbjct 506 PYDELNSGKGEGVAYRGRIFVELNTFLEKKPPEKKLEPISSDDLLVVEKYQRRRKYSLSAVFHSATMLQDVGEA 579
Query 593 IQFEVSIGNYGNKFDTTCKPLASTTQYSRAVFDGNYYYYLPWAHTKPVVTLTSYWEDISHRLDAVNTLLAMAER 666
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Sbjct 580 IQFEVSIGNYGNKFDATCKPLASTTQYSRAVFDGNYYYYLPWAHTKPVVTLTSYWEDISHRLDAVNTLLVMAER 653
Query 667 LQTNIEALKSGIQGKIPANQLAELWLKLIDEVIEDTRYTLPLTEGKANVTVLDTQIRKLRSRSLSQIHEAAVRM 740
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Sbjct 654 LQSNIEAVKSGIQGKIPANQLAEVWLKLIDEVIEDTRYTLPVTEGKANVTVLDTQIRKLRSRFLSQIHEAALRM 727
Query 741 RSEATDVKSTLAEIEDWLDKLMQLTEEPQNSMPDIIIWMIRGEKRLAYARIPAHQVLYSTSGENASGKYCGKTQ 814
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Sbjct 728 RSEATDVKSTLLEIEEWLDKLMQLTEEPQNSMPDIIIWMIRGEKRLAYARIPAHQVLYSTSGGNASGKYCGKTQ 801
Query 815 TIFLKYPQEKNNGPKVPVELRVNIWLGLSAVEKKFNSFAEGTFTVFAEMYENQALMFGKWGTSGLVGRHKFSDV 888
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Sbjct 802 TILLKYPQEKTNGPKVPVELRVNIWLGLSAVEKKFNSFAEGTFTVFAEMYENQALVFGKWGTSGLVGRHKFSDV 875
Query 889 TGKIKLKREFFLPPKGWEWEGEWIVDPERSLLTEADAGHTEFTDEVYQNESRYPGGDWKPAEDTYTDANGDKAA 962
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Sbjct 876 TGKIKLKREFFLPPKGWEWEGDWVVDPERSLLTEADAGHTEFTDEVYQNENRYPGGEWKQAEDTYTDANGDKAA 949
Query 963 SPSELTCPPGWEWEDDAWSYDINRAVDEKGWEYGITIPPDHKPKSWVAAEKMYHTHRRRRLVRKRKKDLTQTAS 1036
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Sbjct 950 SPSEMTCPPGWEWEDDAWIYDINRAVDEKGWEYGITIPPDNKPKSWVAAEKMYHTHRRRRLVRKRKKDLTQTAS 1023
Query 1037 STARAMEELQDQEGWEYASLIGWKFHWKQRSSDTFRRRRWRRKMAPSETHGAAAIFKLEGALGADTTEDGDEKS 1110
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Sbjct 1024 STARAMEELEDREGWEYASLIGWKFHWKQRSSDTFRRRRWRRKMAPSETHGAAAIFKLEGALGADTTEDGEEKG 1097
Query 1111 LEKQKHSATTVFGANTPIVSCNFDRVYIYHLRCYVYQARNLLALDKDSFSDPYAHICFLHRSKTTEIIHSTLNP 1184
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Sbjct 1098 PEKQKHSATTVFGANTPIVSCNFDRVYIYHLRCYIYQARNLMALDKDSFSDPYAHVSFLHRSKTTEIIHSTLNP 1171
Query 1185 TWDQTIIFDEVEIYGEPQTVLQNPPKVIMELFDNDQVGK----------------------------------- 1223
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Sbjct 1172 TWDQTIIFDEVEIFGEPQTVLQNPPNVTIELFDNDQVGKDEFLGRSICSPLVKLNSETDITPKLLWHPVMNGDK 1245
Query 1224 -------------------------------------------------------------------------- 1223
Sbjct 1246 ACGDVLVTAELILRNKDGSNLPILPSQRAPNLYMVPQGIRPVVQLTAIEILAWGLRNMKNYQMASVTSPSLVVE 1319
Query 1224 -------------------------------------------------------------------------- 1223
Sbjct 1320 CGGERVESVVIKSLKKTPNFPSSVLFMKVFLPKEELYMPPLVIKVIDHRQFGRKPVVGQCTIDHLDRFRCDPYA 1393
Query 1224 -------------------------------------------------------------------------- 1223
Sbjct 1394 GKEDIVPQLKASLMSAPPCREVVIEIEDTKPLLASKLSEKEEEIVDWWSKFYASSGEHEKCGQYIQKGYSKLKI 1467
Query 1224 -------------------------------------------------------------------------- 1223
Sbjct 1468 YDCELEDVADFEGLTDFSDTFKLYRGKSDENEDPSVVGEFKGSFRIYPLPDDPSVPAPPRQFRELPDSVPQECT 1541
Query 1224 -------------------------------------------------------------------------- 1223
Sbjct 1542 VRIYIVQGLQLQPQDNNGLCDPYIKITLGKKVIEDRDHYIPNTLNPVFGRMYELSCYLPQEKDLKISVYDYDTF 1615
Query 1224 -------------------------------------------------------------------------- 1223
Sbjct 1616 TRDEKVGETTIDLENRFLSRFGSHCGIPEQYCVSGVNTWRDQLRPTQLLQNVARFKGFPPPVLSEDGSRIRYGG 1689
Query 1224 -----DEFEANKILHQHLGAPEERLALHILRTQGLVPEHVETRTLHSTFQPNISQGKLQMWVDVFPKSLGPPGP 1292
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Sbjct 1690 RDYHLDEFEANKILHQHLGAPEERLALHILRTQGLVPEHVETRTLHSTFQPNISQGKLQMWVDVFPKSLGPPGP 1763
Query 1293 PFNITPRKAKKYYLRVIIWNTKDVILDEKSITGEEMSDIYVKGWIPGNEENKQKTDVHYRSLDGEGNFNWRFVF 1366
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Sbjct 1764 PFNITPRKAKKYYLRVIIWNTKDVILDEKSITGEDMSDIYVKGWISGSEENKQKTDVHYRSLDGEGNFNWRFVF 1837
Query 1367 PFDYLPAEQLCIVAKKEHFWSIDQTEFRIPPRLIIQIWDNDKFSLDDYLGFLELDLRHTIIPAKSPEKCRLDMI 1440
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Sbjct 1838 PFDYLPAEQLCIVAKKEHFWSIDQTEFRVPPRLIIQIWDNDKFSLDDYLGFLELDLHRTIIPAKTSEKCSLDMI 1911
Query 1441 PDLKAMNPLKAKTASLFEQKSMKGWWPCYAEKDGARVMAGKVEMTLEILNEKEADERPAGKGRDEPNMNPKLDL 1514
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Sbjct 1912 PDLKAMDPLKAKTASLFEQRSMKGWWPCYADKDGTRVMAGKVEMTLEVLNEREADERPAGKGRSEPNMNPKLDP 1985
Query 1515 PNRPETSFLWFTNPCKTMKFIVWRRFKWVIIGLLFLLILLLFVAVLLYSLPNYLSMKIVKPNV 1577
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Sbjct 1986 PNRPETSFLWFTNPCKTMRFIVWRRFKWVIIGLLLLLILLLFVAVLLYSLPNYLSMKIVRPNA 2048