Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_11828
Subject:
NM_001302140.1
Aligned Length:
2061
Identities:
1478
Gaps:
484

Alignment

Query    1  MLRVIVESASNIPKTKFGKPDPIVSVIFKDEKKKTKKVDNELNPVWNEILEFDLRGIPLDFSSSLGIIVKDFET  74
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|.||||||
Sbjct    1  MLRVIVESATNIPKTKFGKPDPIVSVIFKDEKKKTKKVDNELNPVWNEILEFDLRGIPLDSSSSLVIVVKDFET  74

Query   75  IGQNKLIGTATVALKDLTGDQSRSLPYKLISLLNEKGQDTGATIDLVIGYDPPSAPHPNDLSGPSVPGMGGDGE  148
            ||||||||||||.||||.|||.||||||..||||||||||||||||||||.|||||||||.||.||||||...|
Sbjct   75  IGQNKLIGTATVSLKDLIGDQNRSLPYKQTSLLNEKGQDTGATIDLVIGYTPPSAPHPNDPSGTSVPGMGEEEE  148

Query  149  EDEGDEDRLDNAVRGPGPKGPVGTVSEAQLARRLTKVKNSRRMLSNKPQDFQIRVRVIEGRQLSGNNIRPVVKV  222
            ||.|||||.|..|||||||||.|||||||||||.||.|.||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  149  EDQGDEDRVDGIVRGPGPKGPSGTVSEAQLARRITKGKSSRRMLSNKPQDFQIRVRVIEGRQLCGNNIRPVVKV  222

Query  223  HVCGQTHRTRIKRGNNPFFDELFFYNVNMTPSELMDEIISIRVYNSHSLRADCLMGEFKIDVGFVYDEPGHAVM  296
            |.|||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  HICGQTHRTRIKRGNNPFFDELFFYNVHITPSELMDEIISIRVYNSHSLRADCLMGEFKIDVGFVYDEPGHAVM  296

Query  297  RKWLLLNDPEDTSSGSKGYMKVSMFVLGTGDEPPPERRDRDNDSDDVESNLLLPAGIALRWVTFLLKIYRAEDI  370
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  297  RKWLLLNDPEDTSSGAKGYMKVSMFVLGTGDEPPPEKRDRDNDSDDVESNLLLPAGIALRWVTFMLKIYRAEDI  370

Query  371  PQMDDAFSQTVKEIFGGNADKKNLVDPFVEVSFAGKKVCTNIIEKNANPEWNQVVNLQIKFPSVCEKIKLTIYD  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.||
Sbjct  371  PQMDDAFSQTVKEIFGGNADKKNLVDPFVEVSFAGKKVCTNIIERNANPEWNQVVNLQIKFPSMCEKIKLTVYD  444

Query  445  WDRLTKNDVVGTTYLHLSKIAASGGEVEDFSSSGTGAASYTVNTGETEVGFVPTFGPCYLNLYGSPREYTGFPD  518
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  WDRLTKNDVVGTTYLYLSKIAASGGEVEDFSSSGAGAASYTATTGETEVGFVPTFGPCYLNLYGSPREYTGFPD  518

Query  519  PYDELNTGKGEGVAYRGRILVELATFLEKTPPDKKLEPISNDDLLVVEKYQRRRKYSLSAVFHSATMLQDVGEA  592
            ||||||.||||||||||||.|||.|||||.||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  PYDELNSGKGEGVAYRGRIFVELNTFLEKKPPEKKLEPISSDDLLVVEKYQRRRKYSLSAVFHSATMLQDVGEA  592

Query  593  IQFEVSIGNYGNKFDTTCKPLASTTQYSRAVFDGNYYYYLPWAHTKPVVTLTSYWEDISHRLDAVNTLLAMAER  666
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  593  IQFEVSIGNYGNKFDATCKPLASTTQYSRAVFDGNYYYYLPWAHTKPVVTLTSYWEDISHRLDAVNTLLVMAER  666

Query  667  LQTNIEALKSGIQGKIPANQLAELWLKLIDEVIEDTRYTLPLTEGKANVTVLDTQIRKLRSRSLSQIHEAAVRM  740
            ||.||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct  667  LQSNIEAVKSGIQGKIPANQLAEVWLKLIDEVIEDTRYTLPVTEGKANVTVLDTQIRKLRSRFLSQIHEAALRM  740

Query  741  RSEATDVKSTLAEIEDWLDKLMQLTEEPQNSMPDIIIWMIRGEKRLAYARIPAHQVLYSTSGENASGKYCGKTQ  814
            |||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  741  RSEATDVKSTLLEIEEWLDKLMQLTEEPQNSMPDIIIWMIRGEKRLAYARIPAHQVLYSTSGGNASGKYCGKTQ  814

Query  815  TIFLKYPQEKNNGPKVPVELRVNIWLGLSAVEKKFNSFAEGTFTVFAEMYENQALMFGKWGTSGLVGRHKFSDV  888
            ||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  815  TILLKYPQEKTNGPKVPVELRVNIWLGLSAVEKKFNSFAEGTFTVFAEMYENQALVFGKWGTSGLVGRHKFSDV  888

Query  889  TGKIKLKREFFLPPKGWEWEGEWIVDPERSLLTEADAGHTEFTDEVYQNESRYPGGDWKPAEDTYTDANGDKAA  962
            |||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||
Sbjct  889  TGKIKLKREFFLPPKGWEWEGDWVVDPERSLLTEADAGHTEFTDEVYQNENRYPGGEWKQAEDTYTDANGDKAA  962

Query  963  SPSELTCPPGWEWEDDAWSYDINRAVDEKGWEYGITIPPDHKPKSWVAAEKMYHTHRRRRLVRKRKKDLTQTAS  1036
            ||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  SPSEMTCPPGWEWEDDAWIYDINRAVDEKGWEYGITIPPDNKPKSWVAAEKMYHTHRRRRLVRKRKKDLTQTAS  1036

Query 1037  STARAMEELQDQEGWEYASLIGWKFHWKQRSSDTFRRRRWRRKMAPSETHGAAAIFKLEGALGADTTEDGDEKS  1110
            |||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1037  STARAMEELEDREGWEYASLIGWKFHWKQRSSDTFRRRRWRRKMAPSETHGAAAIFKLEGALGADTTEDGEEKG  1110

Query 1111  LEKQKHSATTVFGANTPIVSCNFDRVYIYHLRCYVYQARNLLALDKDSFSDPYAHICFLHRSKTTEIIHSTLNP  1184
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||..|||||||||||||||||
Sbjct 1111  PEKQKHSATTVFGANTPIVSCNFDRVYIYHLRCYIYQARNLMALDKDSFSDPYAHVSFLHRSKTTEIIHSTLNP  1184

Query 1185  TWDQTIIFDEVEIYGEPQTVLQNPPKVIMELFDNDQVGK-----------------------------------  1223
            |||||||||||||.|||||||||||.|..||||||||||                                   
Sbjct 1185  TWDQTIIFDEVEIFGEPQTVLQNPPNVTIELFDNDQVGKDEFLGRSICSPLVKLNSETDITPKLLWHPVMNGDK  1258

Query 1224  --------------------------------------------------------------------------  1223
                                                                                      
Sbjct 1259  ACGDVLVTAELILRNKDGSNLPILPSQRAPNLYMVPQGIRPVVQLTAIEILAWGLRNMKNYQMASVTSPSLVVE  1332

Query 1224  --------------------------------------------------------------------------  1223
                                                                                      
Sbjct 1333  CGGERVESVVIKSLKKTPNFPSSVLFMKVFLPKEELYMPPLVIKVIDHRQFGRKPVVGQCTIDHLDRFRCDPYA  1406

Query 1224  --------------------------------------------------------------------------  1223
                                                                                      
Sbjct 1407  GKEDIVPQLKASLMSAPPCREVVIEIEDTKPLLASKLSEKEEEIVDWWSKFYASSGEHEKCGQYIQKGYSKLKI  1480

Query 1224  --------------------------------------------------------------------------  1223
                                                                                      
Sbjct 1481  YDCELEDVADFEGLTDFSDTFKLYRGKSDENEDPSVVGEFKGSFRIYPLPDDPSVPAPPRQFRELPDSVPQECT  1554

Query 1224  --------------------------------------------------------------------------  1223
                                                                                      
Sbjct 1555  VRIYIVQGLQLQPQDNNGLCDPYIKITLGKKVIEDRDHYIPNTLNPVFGRMYELSCYLPQEKDLKISVYDYDTF  1628

Query 1224  --------------------------------------------------------------------------  1223
                                                                                      
Sbjct 1629  TRDEKVGETTIDLENRFLSRFGSHCGIPEQYCVSGVNTWRDQLRPTQLLQNVARFKGFPPPVLSEDGSRIRYGG  1702

Query 1224  -----DEFEANKILHQHLGAPEERLALHILRTQGLVPEHVETRTLHSTFQPNISQGKLQMWVDVFPKSLGPPGP  1292
                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  RDYHLDEFEANKILHQHLGAPEERLALHILRTQGLVPEHVETRTLHSTFQPNISQGKLQMWVDVFPKSLGPPGP  1776

Query 1293  PFNITPRKAKKYYLRVIIWNTKDVILDEKSITGEEMSDIYVKGWIPGNEENKQKTDVHYRSLDGEGNFNWRFVF  1366
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  PFNITPRKAKKYYLRVIIWNTKDVILDEKSITGEDMSDIYVKGWISGSEENKQKTDVHYRSLDGEGNFNWRFVF  1850

Query 1367  PFDYLPAEQLCIVAKKEHFWSIDQTEFRIPPRLIIQIWDNDKFSLDDYLGFLELDLRHTIIPAKSPEKCRLDMI  1440
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||..||||||..|||.||||
Sbjct 1851  PFDYLPAEQLCIVAKKEHFWSIDQTEFRVPPRLIIQIWDNDKFSLDDYLGFLELDLHRTIIPAKTSEKCSLDMI  1924

Query 1441  PDLKAMNPLKAKTASLFEQKSMKGWWPCYAEKDGARVMAGKVEMTLEILNEKEADERPAGKGRDEPNMNPKLDL  1514
            ||||||.||||||||||||.||||||||||.|||.||||||||||||.|||.|||||||||||.|||||||||.
Sbjct 1925  PDLKAMDPLKAKTASLFEQRSMKGWWPCYADKDGTRVMAGKVEMTLEVLNEREADERPAGKGRSEPNMNPKLDP  1998

Query 1515  PNRPETSFLWFTNPCKTMKFIVWRRFKWVIIGLLFLLILLLFVAVLLYSLPNYLSMKIVKPNV  1577
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1999  PNRPETSFLWFTNPCKTMRFIVWRRFKWVIIGLLLLLILLLFVAVLLYSLPNYLSMKIVRPNA  2061