Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_11828
Subject:
NM_133337.3
Aligned Length:
2061
Identities:
1564
Gaps:
497

Alignment

Query    1  MLRVIVESASNIPKTKFGKPDPIVSVIFKDEKKKTKKVDNELNPVWNEILEFDLRGIPLDFSSSLGIIVKDFET  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MLRVIVESASNIPKTKFGKPDPIVSVIFKDEKKKTKKVDNELNPVWNEILEFDLRGIPLDFSSSLGIIVKDFET  74

Query   75  IGQNKLIGTATVALKDLTGDQSRSLPYKLISLLNEKGQDTGATIDLVIGYDPPSAPHPNDLSGPSVPGMGGDGE  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  IGQNKLIGTATVALKDLTGDQSRSLPYKLISLLNEKGQDTGATIDLVIGYDPPSAPHPNDLSGPSVPGMGGDGE  148

Query  149  EDEGDEDRLDNAVRGPGPKGPVGTVSEAQLARRLTKVKNSRRMLSNKPQDFQIRVRVIEGRQLSGNNIRPVVKV  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  EDEGDEDRLDNAVRGPGPKGPVGTVSEAQLARRLTKVKNSRRMLSNKPQDFQIRVRVIEGRQLSGNNIRPVVKV  222

Query  223  HVCGQTHRTRIKRGNNPFFDELFFYNVNMTPSELMDEIISIRVYNSHSLRADCLMGEFKIDVGFVYDEPGHAVM  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  HVCGQTHRTRIKRGNNPFFDELFFYNVNMTPSELMDEIISIRVYNSHSLRADCLMGEFKIDVGFVYDEPGHAVM  296

Query  297  RKWLLLNDPEDTSSGSKGYMKVSMFVLGTGDEPPPERRDRDNDSDDVESNLLLPAGIALRWVTFLLKIYRAEDI  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  RKWLLLNDPEDTSSGSKGYMKVSMFVLGTGDEPPPERRDRDNDSDDVESNLLLPAGIALRWVTFLLKIYRAEDI  370

Query  371  PQMDDAFSQTVKEIFGGNADKKNLVDPFVEVSFAGKKVCTNIIEKNANPEWNQVVNLQIKFPSVCEKIKLTIYD  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  PQMDDAFSQTVKEIFGGNADKKNLVDPFVEVSFAGKKVCTNIIEKNANPEWNQVVNLQIKFPSVCEKIKLTIYD  444

Query  445  WDRLTKNDVVGTTYLHLSKIAASGGEVEDFSSSGTGAASYTVNTGETEVGFVPTFGPCYLNLYGSPREYTGFPD  518
            ||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  WDRLTKNDVVGTTYLHLSKIAASGGEVE-------------VNTGETEVGFVPTFGPCYLNLYGSPREYTGFPD  505

Query  519  PYDELNTGKGEGVAYRGRILVELATFLEKTPPDKKLEPISNDDLLVVEKYQRRRKYSLSAVFHSATMLQDVGEA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  506  PYDELNTGKGEGVAYRGRILVELATFLEKTPPDKKLEPISNDDLLVVEKYQRRRKYSLSAVFHSATMLQDVGEA  579

Query  593  IQFEVSIGNYGNKFDTTCKPLASTTQYSRAVFDGNYYYYLPWAHTKPVVTLTSYWEDISHRLDAVNTLLAMAER  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  580  IQFEVSIGNYGNKFDTTCKPLASTTQYSRAVFDGNYYYYLPWAHTKPVVTLTSYWEDISHRLDAVNTLLAMAER  653

Query  667  LQTNIEALKSGIQGKIPANQLAELWLKLIDEVIEDTRYTLPLTEGKANVTVLDTQIRKLRSRSLSQIHEAAVRM  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  654  LQTNIEALKSGIQGKIPANQLAELWLKLIDEVIEDTRYTLPLTEGKANVTVLDTQIRKLRSRSLSQIHEAAVRM  727

Query  741  RSEATDVKSTLAEIEDWLDKLMQLTEEPQNSMPDIIIWMIRGEKRLAYARIPAHQVLYSTSGENASGKYCGKTQ  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  728  RSEATDVKSTLAEIEDWLDKLMQLTEEPQNSMPDIIIWMIRGEKRLAYARIPAHQVLYSTSGENASGKYCGKTQ  801

Query  815  TIFLKYPQEKNNGPKVPVELRVNIWLGLSAVEKKFNSFAEGTFTVFAEMYENQALMFGKWGTSGLVGRHKFSDV  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  802  TIFLKYPQEKNNGPKVPVELRVNIWLGLSAVEKKFNSFAEGTFTVFAEMYENQALMFGKWGTSGLVGRHKFSDV  875

Query  889  TGKIKLKREFFLPPKGWEWEGEWIVDPERSLLTEADAGHTEFTDEVYQNESRYPGGDWKPAEDTYTDANGDKAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  876  TGKIKLKREFFLPPKGWEWEGEWIVDPERSLLTEADAGHTEFTDEVYQNESRYPGGDWKPAEDTYTDANGDKAA  949

Query  963  SPSELTCPPGWEWEDDAWSYDINRAVDEKGWEYGITIPPDHKPKSWVAAEKMYHTHRRRRLVRKRKKDLTQTAS  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  950  SPSELTCPPGWEWEDDAWSYDINRAVDEKGWEYGITIPPDHKPKSWVAAEKMYHTHRRRRLVRKRKKDLTQTAS  1023

Query 1037  STARAMEELQDQEGWEYASLIGWKFHWKQRSSDTFRRRRWRRKMAPSETHGAAAIFKLEGALGADTTEDGDEKS  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1024  STARAMEELQDQEGWEYASLIGWKFHWKQRSSDTFRRRRWRRKMAPSETHGAAAIFKLEGALGADTTEDGDEKS  1097

Query 1111  LEKQKHSATTVFGANTPIVSCNFDRVYIYHLRCYVYQARNLLALDKDSFSDPYAHICFLHRSKTTEIIHSTLNP  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1098  LEKQKHSATTVFGANTPIVSCNFDRVYIYHLRCYVYQARNLLALDKDSFSDPYAHICFLHRSKTTEIIHSTLNP  1171

Query 1185  TWDQTIIFDEVEIYGEPQTVLQNPPKVIMELFDNDQVGK-----------------------------------  1223
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                   
Sbjct 1172  TWDQTIIFDEVEIYGEPQTVLQNPPKVIMELFDNDQVGKDEFLGRSIFSPVVKLNSEMDITPKLLWHPVMNGDK  1245

Query 1224  --------------------------------------------------------------------------  1223
                                                                                      
Sbjct 1246  ACGDVLVTAELILRGKDGSNLPILPPQRAPNLYMVPQGIRPVVQLTAIEILAWGLRNMKNFQMASITSPSLVVE  1319

Query 1224  --------------------------------------------------------------------------  1223
                                                                                      
Sbjct 1320  CGGERVESVVIKNLKKTPNFPSSVLFMKVFLPKEELYMPPLVIKVIDHRQFGRKPVVGQCTIERLDRFRCDPYA  1393

Query 1224  --------------------------------------------------------------------------  1223
                                                                                      
Sbjct 1394  GKEDIVPQLKASLLSAPPCRDIVIEMEDTKPLLASKLTEKEEEIVDWWSKFYASSGEHEKCGQYIQKGYSKLKI  1467

Query 1224  --------------------------------------------------------------------------  1223
                                                                                      
Sbjct 1468  YNCELENVAEFEGLTDFSDTFKLYRGKSDENEDPSVVGEFKGSFRIYPLPDDPSVPAPPRQFRELPDSVPQECT  1541

Query 1224  --------------------------------------------------------------------------  1223
                                                                                      
Sbjct 1542  VRIYIVRGLELQPQDNNGLCDPYIKITLGKKVIEDRDHYIPNTLNPVFGRMYELSCYLPQEKDLKISVYDYDTF  1615

Query 1224  --------------------------------------------------------------------------  1223
                                                                                      
Sbjct 1616  TRDEKVGETIIDLENRFLSRFGSHCGIPEEYCVSGVNTWRDQLRPTQLLQNVARFKGFPQPILSEDGSRIRYGG  1689

Query 1224  -----DEFEANKILHQHLGAPEERLALHILRTQGLVPEHVETRTLHSTFQPNISQGKLQMWVDVFPKSLGPPGP  1292
                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1690  RDYSLDEFEANKILHQHLGAPEERLALHILRTQGLVPEHVETRTLHSTFQPNISQGKLQMWVDVFPKSLGPPGP  1763

Query 1293  PFNITPRKAKKYYLRVIIWNTKDVILDEKSITGEEMSDIYVKGWIPGNEENKQKTDVHYRSLDGEGNFNWRFVF  1366
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1764  PFNITPRKAKKYYLRVIIWNTKDVILDEKSITGEEMSDIYVKGWIPGNEENKQKTDVHYRSLDGEGNFNWRFVF  1837

Query 1367  PFDYLPAEQLCIVAKKEHFWSIDQTEFRIPPRLIIQIWDNDKFSLDDYLGFLELDLRHTIIPAKSPEKCRLDMI  1440
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1838  PFDYLPAEQLCIVAKKEHFWSIDQTEFRIPPRLIIQIWDNDKFSLDDYLGFLELDLRHTIIPAKSPEKCRLDMI  1911

Query 1441  PDLKAMNPLKAKTASLFEQKSMKGWWPCYAEKDGARVMAGKVEMTLEILNEKEADERPAGKGRDEPNMNPKLDL  1514
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1912  PDLKAMNPLKAKTASLFEQKSMKGWWPCYAEKDGARVMAGKVEMTLEILNEKEADERPAGKGRDEPNMNPKLDL  1985

Query 1515  PNRPETSFLWFTNPCKTMKFIVWRRFKWVIIGLLFLLILLLFVAVLLYSLPNYLSMKIVKPNV  1577
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1986  PNRPETSFLWFTNPCKTMKFIVWRRFKWVIIGLLFLLILLLFVAVLLYSLPNYLSMKIVKPNV  2048