Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11838
• Subject: NM_013861.4
• Aligned Length: 732
• Identities: 636
• Gaps: 6

Alignment

Query   1  ATGGAGCATGCCTTTACCCCGTTGGAGCCCCTGCTTTCCACTGGGAATTTGAAGTACTGCCTTGTAATTCTTAA  74
           ||||||||||||||||||||||||||.||||||||..|.||.|||||.|||||.|||||||||||..|||||||
Sbjct   1  ATGGAGCATGCCTTTACCCCGTTGGAACCCCTGCTACCTACGGGGAACTTGAAATACTGCCTTGTGGTTCTTAA  74

Query  75  TCAGCCTTTGGA--CAACTATTTTCGTCATCTTTGGAACAAAGCTCTTTTAAGAGCCTGTGCCGATGGAGGTGC  146
           ||||||||||||  | ||.| |||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  75  TCAGCCTTTGGATGC-ACGA-TTTCGCCATCTTTGGAAAAAAGCTCTCTTAAGAGCCTGTGCTGATGGGGGTGC  146

Query 147  CAACCGCTTATATGATATCACCGAAGGAGAGAGAGAAAGCTTTTTGCCTGAATTCATCAATGGAGACTTTGATT  220
           |||||.||||||||||.||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||.|||.||||||||||
Sbjct 147  CAACCACTTATATGATCTCACTGAAGGAGAGAGAGAAAGCTTCTTGCCTGAATTCGTCAGTGGGGACTTTGATT  220

Query 221  CTATTAGGCCTGAAGTCAGAGAATACTATGCTACTAAGGGATGTGAGCTCATTTCAACTCCTGATCAAGACCAC  294
           ||||||||||||||||||.|||.|||||..|.|..|||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 221  CTATTAGGCCTGAAGTCAAAGAGTACTACACCAAGAAGGGCTGTGATCTTATTTCAACTCCTGACCAAGACCAC  294

Query 295  ACTGACTTTACTAAGTGCCTTAAAATGCTCCAAAAGAAGATAGAAGAAAAAGACTTAAAGGTTGATGTGATCGT  368
           |||||||||||.|||||.|||.||.|||||||||.|||||||||.|||||.||..|..|||||||.|||||.||
Sbjct 295  ACTGACTTTACCAAGTGTCTTCAAGTGCTCCAAAGGAAGATAGAGGAAAAGGAACTGCAGGTTGACGTGATTGT  368

Query 369  GACACTGGGAGGCCTTGCTGGGCGTTTTGACCAGATTATGGCATCTGTGAATACCTTGTTCCAAGCGACTCACA  442
           ||||||||||||.||.|.|||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||.|.||||||||.|||||||
Sbjct 369  GACACTGGGAGGTCTCGGTGGGCGTTTTGACCAAATCATGGCCTCTGTGAATACCCTTTTCCAAGCCACTCACA  442

Query 443  TCACTCCTTTTCCAATTATAATAATCCAAGAGGAATCGCTGATCTACCTGCTCCAACCAGGAAAGCACAGGTTG  516
           ||||||||.|.||.|||||||||||||||.||||.||.||.||||||||.||||||||.||.|||||||||.|.
Sbjct 443  TCACTCCTGTGCCGATTATAATAATCCAAAAGGACTCTCTCATCTACCTCCTCCAACCCGGGAAGCACAGGCTC  516

Query 517  CATGTAGACACTGGAATGGAGGGTGA-TTGGTGTGGCCTTATTCCTGTTGGACAGCCTTGTAGTCAGGTTACAA  589
           ||||||||||||||||||||.|| || .|||||||||||.||||||||||||||||||||.|..|||||.||.|
Sbjct 517  CATGTAGACACTGGAATGGAAGG-GAGCTGGTGTGGCCTGATTCCTGTTGGACAGCCTTGCAACCAGGTGACGA  589

Query 590  CCACAGGCCTCAAGTGGAACCTCACAAATGATGTGCTTGCTTTTGGAACATTGGTCAGTACTTCCAATACCTAC  663
           |.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||..|||||||||.|||||||||||||.||.||||||
Sbjct 590  CAACAGGCCTGAAATGGAACCTCACAAATGATGTTCTTGGCTTTGGAACACTGGTCAGTACTTCTAACACCTAC  663

Query 664  GACGGGTCTGGTGTTGTGACTGTGGAAACTGACCACCCACTCCTCTGGACCATGGCCATCAAAAGC  729
           ||.|||||.||..||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 664  GATGGGTCCGGCCTTGTCACTGTGGAAACTGACCACCCACTCCTCTGGACCATGGCCATCAAGAGC  729