Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11838
• Subject: XM_006506218.3
• Aligned Length: 801
• Identities: 539
• Gaps: 186

Alignment

Query   1  ATGGAGCATGCCTTTACCCCGTTGGAGCCCCTGCTTTCCACTGGGAATTTGAAGTACTGCCTTGTAATTCTTAA  74
           ||||||||||||||||||||||||||.||||||||..|.||.|||||.|||||.|||||||||||..|||||||
Sbjct   1  ATGGAGCATGCCTTTACCCCGTTGGAACCCCTGCTACCTACGGGGAACTTGAAATACTGCCTTGTGGTTCTTAA  74

Query  75  TCAGCCTTTGGA--CAACTATTTTCGTCATCTTTGGAACAAAGCTCTTTTAAGAGCCTGTGCCGATGGAGGTGC  146
           ||||||||||||  | ||.| |||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  75  TCAGCCTTTGGATGC-ACGA-TTTCGCCATCTTTGGAAAAAAGCTCTCTTAAGAGCCTGTGCTGATGGGGGTGC  146

Query 147  CAACCGCTTATATGATATCACCGAAGGAGAGAGAGAAAGCTTTTTGCCTGAATTCATCAATGGAGACTTTGATT  220
           |||||.||||||||||.||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||.|||.||||||||||
Sbjct 147  CAACCACTTATATGATCTCACTGAAGGAGAGAGAGAAAGCTTCTTGCCTGAATTCGTCAGTGGGGACTTTGATT  220

Query 221  CTATTAGGCCTGAAGTCAGAGAATACTATGCTACTAAGGGATGTGAGCTCATTTCAACTCCTGATCAAGACCAC  294
           ||||||||||||||||||.|||.|||||..|.|..|||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 221  CTATTAGGCCTGAAGTCAAAGAGTACTACACCAAGAAGGGCTGTGATCTTATTTCAACTCCTGACCAAGACCAC  294

Query 295  ACTGACTTTACTAAGTGCCTTAAAATGCTCCAAAAGAAGATAGAAGAAAAAGACTTAAAGGTTGATGTGATCGT  368
           |||||||||||.|||||.|||.||.|||||||||.|||||||||.|||||.||..|..|||||||.|||||.||
Sbjct 295  ACTGACTTTACCAAGTGTCTTCAAGTGCTCCAAAGGAAGATAGAGGAAAAGGAACTGCAGGTTGACGTGATTGT  368

Query 369  GACACTGGGAGGCCTTGCTGGGCGTTTTGACCAGATTATGGCATCTGTGAATACCTTGTTCCAAGCGACTCACA  442
           ||||||||||||.||.|.|||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||.|.||||||||.|||||||
Sbjct 369  GACACTGGGAGGTCTCGGTGGGCGTTTTGACCAAATCATGGCCTCTGTGAATACCCTTTTCCAAGCCACTCACA  442

Query 443  TCACTCCTTTTCCAATTATAATAATCCAAGAGGAATCGCTGATCTACCTGCTCCAACCAGGAAAGCACAGGTTG  516
           ||||||||.|.||.|||||||||||||||.||||.||.||.||||||||.|||||||                 
Sbjct 443  TCACTCCTGTGCCGATTATAATAATCCAAAAGGACTCTCTCATCTACCTCCTCCAAC-----------------  499

Query 517  CATGTAGACACTGGAATGGAGGGTGATTGGTGTGGCCTTATTCCTGTTGGACAGCCTTGTAGTCAGGTTACAAC  590
                                                                                     
Sbjct 500  --------------------------------------------------------------------------  499

Query 591  CACAGGCCTCAAGTGGAACCTCACAAATGATGTGCTTGCTTTTGGAACATTGGTCAGTACTTCCAATACCTACG  664
                                |.||||||||||.||||..|||||||||.|||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 500  ---------------------CCCAAATGATGTTCTTGGCTTTGGAACACTGGTCAGTACTTCTAACACCTACG  552

Query 665  ACGGGTCTGGTGTTGTGACTGTGGAAACTGACCACCCACTCCTCTGGACCATGGCCATCAAAAGC---------  729
           |.|||||.||..||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||         
Sbjct 553  ATGGGTCCGGCCTTGTCACTGTGGAAACTGACCACCCACTCCTCTGGACCATGGCCATCAAGAGCTAACCTACA  626

Query 730  -------------------------------------------------------------  729
                                                                        
Sbjct 627  GTGCGGCATCCATCTTGTGCCTGTGCCTTCCCTTACCTGCCCACTGGTTCGTTGCTCAGCA  687