Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11906
- Subject:
- NM_144851.5
- Aligned Length:
- 1936
- Identities:
- 1666
- Gaps:
- 20
Alignment
Query 1 ATGGATGATATTGCTGATAGGATGAGGATGGATGCTGGAGAAGTGACTTTAGTGAACCACAACTCCGTATTCAA 74
||||||||.|..||||||.||.|||.||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||..||||...||||.
Sbjct 1 ATGGATGACACAGCTGATGGGGTGAAGATGGACGCTGGGGAGGTGACCTTAGTGAACCACGGCTCCACTTTCAG 74
Query 75 AACCCACCTCCTGCCACAAACAGGTTTTCCAGAGGACCAGCTTTCGCTTTCTGACCAGCAGATTTTATCTTCCA 148
||||||||.||.||||||..||||.|||||||||||.||||||..|||||||||||||||||..||..|||.||
Sbjct 75 AACCCACCGCCCGCCACAGTCAGGCTTTCCAGAGGAGCAGCTTCTGCTTTCTGACCAGCAGAGCTTGCCTTTCA 148
Query 149 GGCAAGG-ACATTTGGACCGATCTTTTACATGTTCCACAAGAAGTGCAGCTTATAATCCAAGCTATTACTCAGA 221
||||.|| || |||.||..|||||||.||.|||||.||||||||..||||.|||..||||...|||.|||||||
Sbjct 149 GGCAGGGTAC-TTTAGATGGATCTTTCACGTGTTCTACAAGAAGCCCAGCCTATCGTCCAGATTATCACTCAGA 221
Query 222 TAATCCTTCCTCAGACAGTTTTCTTGGCTCAGGCGATTTAAGAACCTTTGGCCAGAGTGCAAATGGCCAATGGA 295
|||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||..|||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 222 TAACCCTTCCTCAGACAGTTTCCTTGGCTCAGGTGACGTAAGAACCTTTGGTCAAAGTGCAAATGGACAATGGA 295
Query 296 GAAATTCTACCCCATCGTCAAGCTCATCTTTACAAAAATCAAGAAACAGCCGAAGTCTTTACCTCGAAACCCGA 369
|||||||.||.|||.|||||.|||||.|...|||||||.|||||||.|||||||||||||.||||||||||||.
Sbjct 296 GAAATTCCACTCCAGCGTCAGGCTCAGCGCCACAAAAACCAAGAAATAGCCGAAGTCTTTGCCTCGAAACCCGG 369
Query 370 AAGACCTCAAGTGGATTATCAAACAGTTTTGCGGGAAAGTCAAACCATCACTGCCATGTATCTGCATATGAAAA 443
|||||||||||||||||||||||||..||||.|||.|||||.||.||.||||||||..|.|||||.||||||||
Sbjct 370 AAGACCTCAAGTGGATTATCAAACACCTTTGTGGGCAAGTCCAATCACCACTGCCACATGTCTGCGTATGAAAA 443
Query 444 ATCTTTTCCTATTAAACCTGTTCCAAGTCCATCTTGGAGTGGTTCATGTCGTCGAAGTCTCTTGAGCCCCAAGA 517
.||.|||||.|||||.||||..|||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||
Sbjct 444 GTCATTTCCCATTAAGCCTGCCCCAAGTCCATCCTGGAGTGGGTCATGTCGTCGGAGTCTTTTAAGCCCTAAGA 517
Query 518 AAACTCAGAGGCGACATGTTAGTACAGCAGAAGAGACAGTTCAAGAAGAAGA-AAGAGAGGTTTACAGACAGCT 590
|||||||||||||||||.|.||.||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||.|.|||||||||||
Sbjct 518 AAACTCAGAGGCGACATTTCAGCACAGCAGAAGAGACAGTTCAAGAAGAAGAGAAG-GAGATCTACAGACAGCT 590
Query 591 GCTACAGATGGTCACAGGGAAACAGTTTACTATAGCCAAACCCACCACACATTTTCCTTTACACCTGTCTCGAT 664
|||.|||||||||||||||||.|||||...|.||||.||||||||||||||||||||.||||.|||||||||.|
Sbjct 591 GCTGCAGATGGTCACAGGGAAGCAGTTCTGTGTAGCGAAACCCACCACACATTTTCCGTTACGCCTGTCTCGGT 664
Query 665 GTCTTAGTTCCAGTAAAAATACTTTGAAAGACTCACTGTTTAAAAATGGAAACTCTTGTGCATCTCAGATCATT 738
||||||||||||.|||.||..|||||||||||||.|||||.|.|||.||||||||||||||||||||..|||||
Sbjct 665 GTCTTAGTTCCAATAAGAACTCTTTGAAAGACTCGCTGTTGAGAAACGGAAACTCTTGTGCATCTCATGTCATT 738
Query 739 GGCTCTGATACTTCATCATCTGGATCTGCCAGCATTTTAACTAACCAGGAACAGCTGTCCCACAGTGTATATTC 812
||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||...|||||.|||.||||||||||||.|.||||
Sbjct 739 GGTTCTGATACGTCATCCTCTGGATCTGCCAGCATTTTAACTGCACAGGAGCAGTTGTCCCACAGTGCACATTC 812
Query 813 CCTATCTTCTTATACCCCAGATGTTGCATTTGGATCCAAAGATTCTGGTACTCTTCATCATCCCCATCATCACC 886
|||.||.|||..|||||||||||||||.||||||||||||||.|||| ||||.||.|||||||
Sbjct 813 CCTGTCATCTGGTACCCCAGATGTTGCCTTTGGATCCAAAGACTCTG------------ATCCTCACCATCACC 874
Query 887 ACTCTGTTCCACATCAGCCAGATAACTTAGCAGCTTCAAATACACAATCTGAAGGATCAGACTCTGTGATTTTA 960
.|.|||..||.|||||||||.|||.||||.||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 875 TCGCTGCACCTCATCAGCCAAATAGCTTACCAGCATCAAATACACAGTCCGAAGGGTCAGACTCTGTGATTTTA 948
Query 961 CTGAAAGTGAAAGATTCCCAGACTCCAACTCCCAGTTCTACTTTCTTCCAGGCAGAGCTGTGGATCAAAGAATT 1034
||.|||||||||||.||.|||||||||.||.||||..||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 949 CTTAAAGTGAAAGAATCTCAGACTCCAGCTTCCAGCCCTACGTTCTTCCAGGCAGAGCTATGGATCAAAGAATT 1022
Query 1035 AACTAGTGTTTATGGTTCTCGAGCACGAGAAAGATTGCGCCAGATTGAAGAACAGAAGGCATTGGCCTTACAGC 1108
||||||.|||||||..||||||||.||.|||||||||||||.|||||||||.|||||.||||||||..||||||
Sbjct 1023 AACTAGCGTTTATGACTCTCGAGCTCGGGAAAGATTGCGCCGGATTGAAGAGCAGAAAGCATTGGCACTACAGC 1096
Query 1109 TTCAAAACCAGAGATTGCAGGAGCGGGAACATTCAGTACATGATTCAGTAGAACTACATCTTCGTGTACCTCTT 1182
|||||||||||.||.|||||||||.|||||||.||||||.|||.||.|||||.||.||.||||||||.||||||
Sbjct 1097 TTCAAAACCAGCGACTGCAGGAGCAGGAACATGCAGTACTTGACTCCGTAGAGCTTCACCTTCGTGTGCCTCTT 1170
Query 1183 GAAAAGGAGATTCCTGTTACTGTTGTCCAAGAAACACA--AAAAAAAGGTCATAAATTAACTGATAGTGAAGAT 1254
|||||||||||||||||.||.|.||.||||||||| || ||||||| |.||..|..|.|||||.||||||||.
Sbjct 1171 GAAAAGGAGATTCCTGTCACAGCTGCCCAAGAAAC-CAGGAAAAAAA-GCCACCAGCTGACTGACAGTGAAGAC 1242
Query 1255 GAATTTCCTGAAATTACAGAGGAAATGGAGAAAGAAATAAAGAATGTATTTCGTAATGGGAATCAGGATGAAGT 1328
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||
Sbjct 1243 GAATTTCCTGAAATTACAGAGGAAATGGAAAAAGAAATAAAGAATGTATTTCGTAACGGTAACCAGGATGAAGT 1316
Query 1329 TCTCAGTGAAGCATTTCGCCTGACCATTACACGCAAAGATATTCAAACTCTAAACCATCTGAATTGGCTCAATG 1402
.||||||||.|||||.|||.|||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 1317 CCTCAGTGAGGCATTCCGCTTGACCATTACACGCAAAGACATTCAGACTCTAAACCATCTAAACTGGCTCAATG 1390
Query 1403 ATGAGATCATCAATTTCTACATGAATATGCTGATGGAGCGAAGTAAAGAGAAGGGCTTGCCAAGTGTGCATGCA 1476
|||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.
Sbjct 1391 ATGAGATCATCAATTTCTACATGAACATGCTAATGGAACGCAGTAAAGAGAAGGGGTTTCCAAGTGTACATGCG 1464
Query 1477 TTTAATACCTTTTTCTTCACTAAATTAAAAACGGCTGGTTATCAGGCAGTGAAACGTTGGACAAAGAAAGTAGA 1550
|||||||||||.|||||||||||..|||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||
Sbjct 1465 TTTAATACCTTCTTCTTCACTAAGCTAAAAACAGCTGGTTATCAGGCAGTGAAACGCTGGACAAAGAAGGTGGA 1538
Query 1551 TGTATTTTCTGTTGACATTCTTTTGGTGCCCATTCACCTGGGAGTACACTGGTGTCTAGCTGTTGTGGACTTTA 1624
||||||.||.|||||.||||||.||||||||||||||.||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1539 TGTATTCTCCGTTGATATTCTTCTGGTGCCCATTCACTTGGGTGTGCACTGGTGTCTAGCTGTTGTAGACTTTA 1612
Query 1625 GAAAGAAGAATATTACCTATTACGACTCCATGGGTGGGATAAACAATGAAGCCTGCAGAATACTCTTGCAATAC 1698
|||.|||||.|||.|||||.||.||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 1613 GAAGGAAGAGTATCACCTACTATGATTCTATGGGTGGAATAAACAACGAGGCCTGCAGGATCCTCTTGCAATAC 1686
Query 1699 CTAAAGCAAGAAAGCATTGACAAGAAAAGGAAAGAGTTTGACACCAATGGCTGGCAGCTTTTCAGCAAGAAAAG 1772
|||||.||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1687 CTAAAACAAGAAAGTGTTGACAAGAAAAGGAAAGAGTTTGACACCAACGGCTGGCAGCTCTTCAGCAAGAAGAG 1760
Query 1773 CCAGGAGATTCCTCAGCAGATGAATGGAAGTGACTGTGGGATGTTTGCCTGCAAATATGCTGACTGTATTACCA 1846
||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1761 CCAGGAAATCCCACAGCAGATGAATGGGAGTGACTGTGGAATGTTTGCTTGCAAATATGCTGACTGCATTACCA 1834
Query 1847 AAGACAGACCAATCAACTTCACACAGCAACACATGCCATACTTCCGGAAGCGGATGGTCTGGGAGATCCTCCAC 1920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1835 AAGACAGACCAATCAACTTCACACAGCAACACATGCCATATTTCCGAAAGCGAATGGTCTGGGAGATCCTCCAC 1908
Query 1921 CGAAAACTCTTG 1932
||.||.||||||
Sbjct 1909 CGGAAGCTCTTG 1920