Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11906
- Subject:
- XM_017019237.1
- Aligned Length:
- 1932
- Identities:
- 1890
- Gaps:
- 39
Alignment
Query 1 ATGGATGATATTGCTGATAGGATGAGGATGGATGCTGGAGAAGTGACTTTAGTGAACCACAACTCCGTATTCAA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGATGATATTGCTGATAGGATGAGGATGGATGCTGGAGAAGTGACTTTAGTGAACCACAACTCCGTATTCAA 74
Query 75 AACCCACCTCCTGCCACAAACAGGTTTTCCAGAGGACCAGCTTTCGCTTTCTGACCAGCAGATTTTATCTTCCA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AACCCACCTCCTGCCACAAACAGGTTTTCCAGAGGACCAGCTTTCGCTTTCTGACCAGCAGATTTTATCTTCCA 148
Query 149 GGCAAGGACATTTGGACCGATCTTTTACATGTTCCACAAGAAGTGCAGCTTATAATCCAAGCTATTACTCAGAT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GGCAAGGACATTTGGACCGATCTTTTACATGTTCCACAAGAAGTGCAGCTTATAATCCAAGCTATTACTCAGAT 222
Query 223 AATCCTTCCTCAGACAGTTTTCTTGGCTCAGGCGATTTAAGAACCTTTGGCCAGAGTGCAAATGGCCAATGGAG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AATCCTTCCTCAGACAGTTTTCTTGGCTCAGGCGATTTAAGAACCTTTGGCCAGAGTGCAAATGGCCAATGGAG 296
Query 297 AAATTCTACCCCATCGTCAAGCTCATCTTTACAAAAATCAAGAAACAGCCGAAGTCTTTACCTCGAAACCCGAA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AAATTCTACCCCATCGTCAAGCTCATCTTTACAAAAATCAAGAAACAGCCGAAGTCTTTACCTCGAAACCCGAA 370
Query 371 AGACCTCAAGTGGATTATCAAACAGTTTTGCGGGAAAGTCAAACCATCACTGCCATGTATCTGCATATGAAAAA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGACCTCAAGTGGATTATCAAACAGTTTTGCGGGAAAGTCAAACCATCACTGCCATGTATCTGCATATGAAAAA 444
Query 445 TCTTTTCCTATTAAACCTGTTCCAAGTCCATCTTGGAGTGGTTCATGTCGTCGAAGTCTCTTGAGCCCCAAGAA 518
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 445 TCTTTTCCTATTAAACCTGTTCCAAGTCCATCTTGGAGTGGTTCATGTCGTCGAAGTCTTTTGAGCCCCAAGAA 518
Query 519 AACTCAGAGGCGACATGTTAGTACAGCAGAAGAGACAGTTCAAGAAGAAGAAAGAGAGGTTTACAGACAGCTGC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 519 AACTCAGAGGCGACATGTTAGTACAGCAGAAGAGACAGTTCAAGAAGAAGAAAGAGAGATTTACAGACAGCTGC 592
Query 593 TACAGATGGTCACAGGGAAACAGTTTACTATAGCCAAACCCACCACACATTTTCCTTTACACCTGTCTCGATGT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TACAGATGGTCACAGGGAAACAGTTTACTATAGCCAAACCCACCACACATTTTCCTTTACACCTGTCTCGATGT 666
Query 667 CTTAGTTCCAGTAAAAATACTTTGAAAGACTCACTGTTTAAAAATGGAAACTCTTGTGCATCTCAGATCATTGG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CTTAGTTCCAGTAAAAATACTTTGAAAGACTCACTGTTTAAAAATGGAAACTCTTGTGCATCTCAGATCATTGG 740
Query 741 CTCTGATACTTCATCATCTGGATCTGCCAGCATTTTAACTAACCAGGAACAGCTGTCCCACAGTGTATATTCCC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CTCTGATACTTCATCATCTGGATCTGCCAGCATTTTAACTAACCAGGAACAGCTGTCCCACAGTGTATATTCCC 814
Query 815 TATCTTCTTATACCCCAGATGTTGCATTTGGATCCAAAGATTCTGGTACTCTTCATCATCCCCATCATCACCAC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TATCTTCTTATACCCCAGATGTTGCATTTGGATCCAAAGATTCTGGTACTCTTCATCATCCCCATCATCACCAC 888
Query 889 TCTGTTCCACATCAGCCAGATAACTTAGCAGCTTCAAATACACAATCTGAAGGATCAGACTCTGTGATTTTACT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TCTGTTCCACATCAGCCAGATAACTTAGCAGCTTCAAATACACAATCTGAAGGATCAGACTCTGTGATTTTACT 962
Query 963 GAAAGTGAAAGATTCCCAGACTCCAACTCCCAGTTCTACTTTCTTCCAGGCAGAGCTGTGGATCAAAGAATTAA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 963 GAAAGTGAAAGATTCCCAGACTCCAACTCCCAG---------------------------------------AA 997
Query 1037 CTAGTGTTTATGGTTCTCGAGCACGAGAAAGATTGCGCCAGATTGAAGAACAGAAGGCATTGGCCTTACAGCTT 1110
||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 998 CTAGTGTTTATGATTCTCGAGCACGAGAAAGATTGCGCCAGATTGAAGAACAGAAGGCATTGGCCTTACAGCTT 1071
Query 1111 CAAAACCAGAGATTGCAGGAGCGGGAACATTCAGTACATGATTCAGTAGAACTACATCTTCGTGTACCTCTTGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1072 CAAAACCAGAGATTGCAGGAGCGGGAACATTCAGTACATGATTCAGTAGAACTACATCTTCGTGTACCTCTTGA 1145
Query 1185 AAAGGAGATTCCTGTTACTGTTGTCCAAGAAACACAAAAAAAAGGTCATAAATTAACTGATAGTGAAGATGAAT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1146 AAAGGAGATTCCTGTTACTGTTGTCCAAGAAACACAAAAAAAAGGTCATAAATTAACTGATAGTGAAGATGAAT 1219
Query 1259 TTCCTGAAATTACAGAGGAAATGGAGAAAGAAATAAAGAATGTATTTCGTAATGGGAATCAGGATGAAGTTCTC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1220 TTCCTGAAATTACAGAGGAAATGGAGAAAGAAATAAAGAATGTATTTCGTAATGGGAATCAGGATGAAGTTCTC 1293
Query 1333 AGTGAAGCATTTCGCCTGACCATTACACGCAAAGATATTCAAACTCTAAACCATCTGAATTGGCTCAATGATGA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1294 AGTGAAGCATTTCGCCTGACCATTACACGCAAAGATATTCAAACTCTAAACCATCTGAATTGGCTCAATGATGA 1367
Query 1407 GATCATCAATTTCTACATGAATATGCTGATGGAGCGAAGTAAAGAGAAGGGCTTGCCAAGTGTGCATGCATTTA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1368 GATCATCAATTTCTACATGAATATGCTGATGGAGCGAAGTAAAGAGAAGGGCTTGCCAAGTGTGCATGCATTTA 1441
Query 1481 ATACCTTTTTCTTCACTAAATTAAAAACGGCTGGTTATCAGGCAGTGAAACGTTGGACAAAGAAAGTAGATGTA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1442 ATACCTTTTTCTTCACTAAATTAAAAACGGCTGGTTATCAGGCAGTGAAACGTTGGACAAAGAAAGTAGATGTA 1515
Query 1555 TTTTCTGTTGACATTCTTTTGGTGCCCATTCACCTGGGAGTACACTGGTGTCTAGCTGTTGTGGACTTTAGAAA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1516 TTTTCTGTTGACATTCTTTTGGTGCCCATTCACCTGGGAGTACACTGGTGTCTAGCTGTTGTGGACTTTAGAAA 1589
Query 1629 GAAGAATATTACCTATTACGACTCCATGGGTGGGATAAACAATGAAGCCTGCAGAATACTCTTGCAATACCTAA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1590 GAAGAATATTACCTATTACGACTCCATGGGTGGGATAAACAATGAAGCCTGCAGAATACTCTTGCAATACCTAA 1663
Query 1703 AGCAAGAAAGCATTGACAAGAAAAGGAAAGAGTTTGACACCAATGGCTGGCAGCTTTTCAGCAAGAAAAGCCAG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1664 AGCAAGAAAGCATTGACAAGAAAAGGAAAGAGTTTGACACCAATGGCTGGCAGCTTTTCAGCAAGAAAAGCCAG 1737
Query 1777 GAGATTCCTCAGCAGATGAATGGAAGTGACTGTGGGATGTTTGCCTGCAAATATGCTGACTGTATTACCAAAGA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1738 GAGATTCCTCAGCAGATGAATGGAAGTGACTGTGGGATGTTTGCCTGCAAATATGCTGACTGTATTACCAAAGA 1811
Query 1851 CAGACCAATCAACTTCACACAGCAACACATGCCATACTTCCGGAAGCGGATGGTCTGGGAGATCCTCCACCGAA 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1812 CAGACCAATCAACTTCACACAGCAACACATGCCATACTTCCGGAAGCGGATGGTCTGGGAGATCCTCCACCGAA 1885
Query 1925 AACTCTTG 1932
||||||||
Sbjct 1886 AACTCTTG 1893