Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11921
• Subject: NM_001144896.2
• Aligned Length: 1162
• Identities: 1116
• Gaps: 44

Alignment

Query    1  ATG---GCCTC----------AGCCTGCCCAG--GCT-------CTGATTTCACGTCTATCCATTCAGAGGAGG  52
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Sbjct    1  ATGAGTGACTCCAAGGAACCAAGACTG--CAGCAGCTGGGCCTCCTG--------------------GAGGAGG  52

Query   53  AACAGCTGAGAGGCCTTGGATTCCGACAGACTCGAGGATACAAGAGCTTAGCAGTGTCCAAGGTCCCCAGCTCC  126
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Sbjct   53  AACAGCTGAGAGGCCTTGGATTCCGACAGACTCGAGGATACAAGAGCTTAGCAGTGTCCAAGGTCCCCAGCTCC  126

Query  127  ATAAGTCAGGAACAATCCAGGCAAGACGCGATCTACCAGAACCTGACCCAGCTTAAAGCTGCAGTGGGTGAGCT  200
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Sbjct  127  ATAAGTCAGGAACAATCCAGGCAAGACGCGATCTACCAGAACCTGACCCAGCTTAAAGCTGCAGTGGGTGAGCT  200

Query  201  CTCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAG  274
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Sbjct  201  CTCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAG  274

Query  275  AGAAATCTAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAA  348
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Sbjct  275  AGAAATCTAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAA  348

Query  349  TCTAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCTGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAA  422
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Sbjct  349  TCTAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCTGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAA  422

Query  423  GATGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACTCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCAGC  496
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Sbjct  423  GATGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACTCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCAGC  496

Query  497  AGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCAGCAGGAG  570
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Sbjct  497  AGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCAGCAGGAG  570

Query  571  ATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCAGCAGGAGATCTA  644
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Sbjct  571  ATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCAGCAGGAGATCTA  644

Query  645  CCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGAACGCCTGTGCCACCCCTGTCCCTGGGAATGGACATTCTTCC  718
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Sbjct  645  CCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGAACGCCTGTGCCACCCCTGTCCCTGGGAATGGACATTCTTCC  718

Query  719  AAGGAAACTGTTACTTCATGTCTAACTCCCAGCGGAACTGGCACGACTCCATCACCGCCTGCAAAGAAGTGGGG  792
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Sbjct  719  AAGGAAACTGTTACTTCATGTCTAACTCCCAGCGGAACTGGCACGACTCCATCACCGCCTGCAAAGAAGTGGGG  792

Query  793  GCCCAGCTCGTCGTAATCAAAAGTGCTGAGGAGCAGAACTTCCTACAGCTGCAGTCTTCCAGAAGTAACCGCTT  866
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Sbjct  793  GCCCAGCTCGTCGTAATCAAAAGTGCTGAGGAGCAGAACTTCCTACAGCTGCAGTCTTCCAGAAGTAACCGCTT  866

Query  867  CACCTGGATGGGACTTTCAGATCTAAATCAGGAAGGCACGTGGCAATGGGTGGACGGCTCACCTCTGTTGCCCA  940
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Sbjct  867  CACCTGGATGGGACTTTCAGATCTAAATCAGGAAGGCACGTGGCAATGGGTGGACGGCTCACCTCTGTTGCCCA  940

Query  941  GCTTCAAGCAGTATTGGAACAGAGGAGAGCCCAACAACGTTGGGGAGGAAGACTGCGCGGAATTTAGTGGCAAT  1014
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Sbjct  941  GCTTCAAGCAGTATTGGAACAGAGGAGAGCCCAACAACGTTGGGGAGGAAGACTGCGCGGAATTTAGTGGCAAT  1014

Query 1015  GGCTGGAACGACGACAAATGTAATCTTGCCAAATTCTGGATCTGCAAAAAGTCCGCAGCCTCCTGCTCCAGGGA  1088
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Sbjct 1015  GGCTGGAACGACGACAAATGTAATCTTGCCAAATTCTGGATCTGCAAAAAGTCCGCAGCCTCCTGCTCCAGGGA  1088

Query 1089  TGAAGAACAGTTTCTTTCTCCAGCCCCTGCCACCCCAAACCCCCCTCCTGCG  1140
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Sbjct 1089  TGAAGAACAGTTTCTTTCTCCAGCCCCTGCCACCCCAAACCCCCCTCCTGCG  1140