Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11984
- Subject:
- XM_011245642.1
- Aligned Length:
- 1479
- Identities:
- 1144
- Gaps:
- 195
Alignment
Query 1 ATGGCTGACTCAGAAGCACTCCCCTCCCTTGCTGGGGACCCAGTGGCTGTGGAAGCCTTGCTCCGGGCCGTGTT 74
||||||||||||.||.|||||....||||.|.|||||||||.|||||||||||.||||||||||.||.||||||
Sbjct 1 ATGGCTGACTCAAAACCACTCAGGACCCTGGATGGGGACCCCGTGGCTGTGGAGGCCTTGCTCCAGGACGTGTT 74
Query 75 TGGGGTTGTTGTGGATGAGGCCATTCAGAAAGGAACCAGTGTCTCCCAGAAGGTCTGTGAGTGGAAGGAGCCTG 148
||||.|||||||.|||||||||||||.|||.||.|||||||.|||..||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 75 TGGGATTGTTGTAGATGAGGCCATTCTGAAGGGGACCAGTGCCTCTGAGAAGGTCTGCGAATGGAAGGAGCCTG 148
Query 149 AGGAGCTGAAGCAGCTGCTGGATTTGGAGCTGCGGAGCCAGGGCGAGTCACAGAAGCAGATCCTGGAGCGGTGT 222
|.||.||.||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||.|.|.||||||||||||||||.||.
Sbjct 149 AAGAACTCAAGCAGCTGCTGGACTTGGAGCTGCAGAGCCAGGGCGAGTCCCGGGAGCAGATCCTGGAGCGCTGC 222
Query 223 CGGGCTGTGATTCGCTACAGTGTCAAGACTGGTCACCCTCGGTTCTTCAACCAGCTCTTCTCTGGGTTGGATCC 296
|||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 223 CGGACTGTGATTCACTACAGTGTCAAGACTGGTCACCCCCGGTTCTTCAACCAGCTCTTCTCAGGGTTAGATCC 296
Query 297 CCATGCTCTGGCCGGGCGCATTATCACTGAGAGCCTCAACACCAGCCAGTACACATATGAAATCGCCCCCGTGT 370
||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 297 CCATGCTCTGGCTGGGCGCATCATCACGGAGAGCCTCAACACTAGCCAGTACACATATGAGATTGCCCCCGTGT 370
Query 371 TTGTGCTCATGGAAGAGGAGGTGCTGAGGAAACTGCGGGCCCTGGTGGGCTGGAGCTCTGGGGACGGAATCTTC 444
|||||||||||||||||||||||||||.||||||.||.||||||||||||||||.|||||||||.||..|||||
Sbjct 371 TTGTGCTCATGGAAGAGGAGGTGCTGAAGAAACTCCGTGCCCTGGTGGGCTGGAACTCTGGGGATGGGGTCTTC 444
Query 445 TGCCCTGGTGGCTCCATCTCCAACATGTATGCTGTAAATCTGGCCCGCTATCAGCGCTACCCGGATTGCAAGCA 518
||.||||||||||||||||||||||||||.||..|.||.||||||||||.||||||||||||.||.||||||||
Sbjct 445 TGTCCTGGTGGCTCCATCTCCAACATGTACGCCATGAACCTGGCCCGCTTTCAGCGCTACCCAGACTGCAAGCA 518
Query 519 GAGGGGCCTCCGCACACTGCCGCCCCTGGCCCTATTCACATCGAAGGAGTGTCACTACTCCATCCAGAAGGGAG 592
||||||||||||..|.|||||||||.||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||...|||||||
Sbjct 519 GAGGGGCCTCCGGGCCCTGCCGCCCTTGGCTCTCTTCACTTCAAAGGAGTGTCACTACTCCATCACCAAGGGAG 592
Query 593 CTGCGTTTCTGGGACTTGGCACCGACAGTGTCCGAGTGGTCAAGGCTGATGAGAGAGGGAAAATGGTCCCCGAG 666
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||.||||.|||
Sbjct 593 CTGCTTTTCTGGGACTTGGCACCGACAGTGTCCGAGTGGTCAAGGCTGATGAGAGAGGGAGGATGATCCCTGAG 666
Query 667 GATCTGGAGAGGCAGATTGGTATGGCCGAGGCTGAGGGTGCTGTGCCGTTCCTGGTCAGTGCCACCTCTGGCAC 740
||.||||||||||||||...|.||||.|||||||||||..|||||||.||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 667 GACCTGGAGAGGCAGATCATTCTGGCAGAGGCTGAGGGCTCTGTGCCATTTCTGGTCAGTGCCACCTCTGGTAC 740
Query 741 CACTGTGCTAGGGGCCTTTGACCCCCTGGAGGCAATTGCTGATGTGTGCCAGCGTCATGGGCTATGGCTGCATG 814
|||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.||.||.|||.|.||||
Sbjct 741 CACCGTGCTAGGGGCCTTTGACCCCCTGGATGCAATTGCCGATGTTTGCCAGCGACACGGACTGTGGTTCCATG 814
Query 815 TGGATGCTGCCTGGGGTGGGAGCGTCCTGCTGTCACAGACACACAGGCATCTCCTGGATGGGATCCAGAGGGCT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGGATGCTGCCTGGGGTGGGAGCGTCCTGCTGTCTCGGACACACAGGCATCTCCTGGATGGGATCCAGAGGGCT 888
Query 889 GACTCTGTGGCCTGGAATCCCCACAAGCTCCTCGCAGCAGGCCTGCAATGCTCTGCACTTCTTCTCCAGGATAC 962
|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||||.|||.||
Sbjct 889 GACTCTGTGGCCTGGAACCCTCACAAGCTTCTCGCCGCAGGGCTGCAGTGCTCCGCTCTTCTTCTCCGGGACAC 962
Query 963 CTCGAACCTGCTCAAGCGCTGCCATGGGTCCCAGGCCAGCTACCTTTTCCAGCAGGACAAGTTCTACGATGTGG 1036
|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 963 CTCGAACCTGCTCAAGCGCTGCCATGGATCCCAGGCCAGCTACCTCTTCCAGCAAGACAAGTTCTACGATGTGG 1036
Query 1037 CTCTGGACACGGGAGACAAGGTGGTGCAGTGTGGCCGCCGTGTGGACTGTCTGAAGCTGTGGCTCATGTGGAAG 1110
||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1037 CTCTGGACACCGGAGACAAAGTGGTGCAGTGTGGCCGCCGCGTGGACTGTCTGAAGCTATGGCTCATGTGGAAG 1110
Query 1111 GCACAGGGCGATCAAGGGCTGGAGCGGCGCATCGACCAGGCCTTTGTCCTTGCCCGGTACCTGGTGGAGGAAAT 1184
||||||||.|..||.|||.|||||||||||||||||||||||||||..||..|||
Sbjct 1111 GCACAGGGTGGGCAGGGGTTGGAGCGGCGCATCGACCAGGCCTTTGCTCTCACCC------------------- 1165
Query 1185 GAAGAAGCGGGAAGGGTTTGAGCTAGTCATGGAGCCTGAGTTTGTCAATGTGTGTTTCTGGTTCGTACCCCCCA 1258
|||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||.||.||||
Sbjct 1166 ---------------------------------GCCCGAGTTCGTCAACGTGTGCTTCTGGTTTGTGCCTCCCA 1206
Query 1259 GCCTGCGAGGGAAGCAGGAGAGTCCAGATTACCACGAAAGGCTGTCAAAGGTGGCCCCCGTGCTCAAGGAGCGC 1332
||||.||.||||||.|||||||||||||||||..|.||||||||||..||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1207 GCCTTCGGGGGAAGAAGGAGAGTCCAGATTACAGCCAAAGGCTGTCTCAGGTGGCCCCTGTGCTCAAGGAGCGC 1280
Query 1333 ATGGTGAAGGAGGGCTCCATGATGATTGGCTACCAGCCCCACGGGACCCGGGGCAACTTCTTCCGTGTGGTTGT 1406
||||
Sbjct 1281 ATGG---------------------------------------------------------------------- 1284
Query 1407 GGCCAACTCTGCACTGACCTGTGCTGATATGGACTTCCTCCTCAACGAGCTGGAGCGGCTAGGCCAGGACCTG 1479
Sbjct 1285 ------------------------------------------------------------------------- 1284