Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11984
• Subject: XM_017019419.1
• Aligned Length: 1572
• Identities: 1011
• Gaps: 561

Alignment

Query    1  ATGGCTGACTCAGAAGCACTCCCCTCCCTTGCTGGGGACCCAGTGGCTGTGGAAGCCTTGCTCCGGGCCGTGTT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TGGGGTTGTTGTGGATGAGGCCATTCAGAAAGGAACCAGTGTCTCCCAGAAGGTCTGTGAGTGGAAGGAGCCTG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AGGAGCTGAAGCAGCTGCTGGATTTGGAGCTGCGGAGCCAGGGCGAGTCACAGAAGCAGATCCTGGAGCGGTGT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CGGGCTGTGATTCGCTACAGTGTCAAGACTGGTCACCCTCGGTTCTTCAACCAGCTCTTCTCTGGGTTGGATCC  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CCATGCTCTGGCCGGGCGCATTATCACTGAGAGCCTCAACACCAGCCAGTACACATATGAAATCGCCCCCGTGT  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  TTGTGCTCATGGAAGAGGAGGTGCTGAGGAAACTGCGGGCCCTGGTGGGCTGGAGCTCTGGGGACGGAATCTTC  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  TGCCCTGGTGGCTCCATCTCCAACATGTATGCTGTAAATCTGGCCCGCTATCAGCGCTACCCGGATTGCAAGCA  518
                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ------------------------ATGTATGCTGTAAATCTGGCCCGCTATCAGCGCTACCCGGATTGCAAGCA  50

Query  519  GAGGGGCCTCCGCACACTGCCGCCCCTGGCCCTATTCACATCGAAGGAG-------------------------  567
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                         
Sbjct   51  GAGGGGCCTCCGCACACTGCCGCCCCTGGCCCTATTCACATCGAAGGAGGTGGGGAAGAGGCACAGGCCCAACC  124

Query  568  ----------------------------TGTCACTACTCCATCCAGAAGGGAGCTGCGTTTCTGGGACTTGGCA  613
                                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  125  CTGGGCTCCTGATTCTAATCTCCAGCCATGTCACTACTCCATCCAGAAGGGAGCTGCGTTTCTGGGACTTGGCA  198

Query  614  CCGACAGTGTCCGAGTGGTCAAGGCTGATGAGAGAGGGAAAATGGTCCCCGAGGATCTGGAGAGGCAGATTGGT  687
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  199  CCGACAGTGTCCGAGTGGTCAAGGCTGATGAGAGAGGGAAAATGGTCCCCGAGGATCTGGAGAGGCAGATTGGT  272

Query  688  ATGGCCGAGGCTGAG----------------------------------------GGTGCTGTGCCGTTCCTGG  721
            |||||||||||||||                                        |||||||||||||||||||
Sbjct  273  ATGGCCGAGGCTGAGGTTGACTTTTCACTTTTTTGAAACTTTTATTTTGGATTCAGGTGCTGTGCCGTTCCTGG  346

Query  722  TCAGTGCCACCTCTGGCACCACTGTGCTAGGGGCCTTTGACCCCCTGGAGGCAATTGCTGATGTGTGCCAGCGT  795
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  347  TCAGTGCCACCTCTGGCACCACTGTGCTAGGGGCCTTTGACCCCCTGGAGGCAATTGCTGATGTGTGCCAGCGT  420

Query  796  CATGGGCTATGGCTGCATGTGGATGCTGCCTGGGGTGGGAGCGTCCTGCTGTCACAGACACACAGGCATCTCCT  869
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  CATGGGCTATGGCTGCATGTGGATGCTGCCTGGGGTGGGAGCGTCCTGCTGTCACAGACACACAGGCATCTCCT  494

Query  870  GGATGGGATCCAGAGGGCTGACTCTGTGGCCTGGAATCCCCACAAGCTCCTCGCAGCAGGCCTGCAATGCTCTG  943
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  495  GGATGGGATCCAGAGGGCTGACTCTGTGGCCTGGAATCCCCACAAGCTCCTCGCAGCAGGCCTGCAATGCTCTG  568

Query  944  CACTTCTTCTCCAGGATACCTCGAACCTGCTCAAGCGCTGCCATGGGTCCCAGGCCAGCTACCTTTTCCAGCAG  1017
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  569  CACTTCTTCTCCAGGATACCTCGAACCTGCTCAAGCGCTGCCATGGGTCCCAGGCCAGCTACCTTTTCCAGCAG  642

Query 1018  GACAAGTTCTACGATGTGGCTCTGGACACGGGAGACAAGGTGGTGCAGTGTGGCCGCCGTGTGGACTGTCTGAA  1091
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  643  GACAAGTTCTACGATGTGGCTCTGGACACGGGAGACAAGGTGGTGCAGTGTGGCCGCCGTGTGGACTGTCTGAA  716

Query 1092  GCTGTGGCTCATGTGGAAGGCACAGGGCGATCAAGGGCTGGAGCGGCGCATCGACCAGGCCTTTGTCCTTGCCC  1165
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  717  GCTGTGGCTCATGTGGAAGGCACAGGGCGATCAAGGGCTGGAGCGGCGCATCGACCAGGCCTTTGTCCTTGCCC  790

Query 1166  GGTACCTGGTGGAGGAAATGAAGAAGCGGGAAGGGTTTGAGCTAGTCATGGAGCCTGAGTTTGTCAATGTGTGT  1239
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  791  GGTACCTGGTGGAGGAAATGAAGAAGCGGGAAGGGTTTGAGCTAGTCATGGAGCCTGAGTTTGTCAATGTGTGT  864

Query 1240  TTCTGGTTCGTACCCCCCAGCCTGCGAGGGAAGCAGGAGAGTCCAGATTACCACGAAAGGCTGTCAAAGGTGGC  1313
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  865  TTCTGGTTCGTACCCCCCAGCCTGCGAGGGAAGCAGGAGAGTCCAGATTACCACGAAAGGCTGTCAAAGGTGGC  938

Query 1314  CCCCGTGCTCAAGGAGCGCATGGTGAAGGAGGGCTCCATGATGATTGGCTACCAGCCCCACGGGACCCGGGGCA  1387
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  939  CCCCGTGCTCAAGGAGCGCATGGTGAAGGAGGGCTCCATGATGATTGGCTACCAGCCCCACGGGACCCGGGGCA  1012

Query 1388  ACTTCTTCCGTGTGGTTGTGGCCAACTCTGCACTGACCTGTGCTGATATGGACTTCCTCCTCAACGAGCTGGAG  1461
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1013  ACTTCTTCCGTGTGGTTGTGGCCAACTCTGCACTGACCTGTGCTGATATGGACTTCCTCCTCAACGAGCTGGAG  1086

Query 1462  CGGCTAGGCCAGGACCTG  1479
            ||||||||||||||||||
Sbjct 1087  CGGCTAGGCCAGGACCTG  1104