Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11984
- Subject:
- XM_017316613.1
- Aligned Length:
- 1643
- Identities:
- 1188
- Gaps:
- 307
Alignment
Query 1 ATGGCTGACTCAGAAGCACTCCCCTCCCTTGCTGGGGACCCAGTGGCTGTGGAAGCCTTGCTCCGGGCCGTGTT 74
||||||||||||.||.|||||....||||.|.|||||||||.|||||||||||.||||||||||.||.||||||
Sbjct 1 ATGGCTGACTCAAAACCACTCAGGACCCTGGATGGGGACCCCGTGGCTGTGGAGGCCTTGCTCCAGGACGTGTT 74
Query 75 TGGGGTTGTTGTGGATGAGGCCATTCAGAAAGGAACCAGTGTCTCCCAGAAGGTCTGTGAGTGGAAGGAGCCTG 148
||||.|||||||.|||||||||||||.|||.||.|||||||.|||..||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 75 TGGGATTGTTGTAGATGAGGCCATTCTGAAGGGGACCAGTGCCTCTGAGAAGGTCTGCGAATGGAAGGAGCCTG 148
Query 149 AGGAGCTGAAGCAGCTGCTGGATTTGGAGCTGCGGAGCCAGGGCGAGTCACAGAAGCAGATCCTGGAGCGGTGT 222
|.||.||.||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||.|.|.||||||||||||||||.||.
Sbjct 149 AAGAACTCAAGCAGCTGCTGGACTTGGAGCTGCAGAGCCAGGGCGAGTCCCGGGAGCAGATCCTGGAGCGCTGC 222
Query 223 CGGGCTGTGATTCGCTACAGTGTCAAGACTGGTCACCCTCGGTTCTTCAACCAGCTCTTCTCTGGGTTGGATCC 296
|||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 223 CGGACTGTGATTCACTACAGTGTCAAGACTGGTCACCCCCGGTTCTTCAACCAGCTCTTCTCAGGGTTAGATCC 296
Query 297 CCATGCTCTGGCCGGGCGCATTATCACTGAGAGCCTCAACACCAGCCAGTACACATATGAAATCGCCCCCGTGT 370
||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 297 CCATGCTCTGGCTGGGCGCATCATCACGGAGAGCCTCAACACTAGCCAGTACACATATGAGATTGCCCCCGTGT 370
Query 371 TTGTGCTCATGGAAGAGGAGGTGCTGAGGAAACTGCGGGCCCTGGTGGGCTGGAGCTCTGGGGACGGAATCTTC 444
|||||||||||||||||||||||||||.||||||.||.||||||||||||||||.|||||||||.||..|||||
Sbjct 371 TTGTGCTCATGGAAGAGGAGGTGCTGAAGAAACTCCGTGCCCTGGTGGGCTGGAACTCTGGGGATGGGGTCTTC 444
Query 445 TGCCCTGGTGGCTCCATCTCCAACATGTATGCTGTAAATCTGGCCCGCTATCAGCGCTACCCGGATTGCAAGCA 518
||.||||||||||||||||||||||||||.||..|.||.||||||||||.||||||||||||.||.||||||||
Sbjct 445 TGTCCTGGTGGCTCCATCTCCAACATGTACGCCATGAACCTGGCCCGCTTTCAGCGCTACCCAGACTGCAAGCA 518
Query 519 GAGGGGCCTCCGCACACTGCCGCCCCTGGCCCTATTCACATCGAAGGAGTGTCACTACTCCATCCAGAAGGGAG 592
||||||||||||..|.|||||||||.||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||...|||||||
Sbjct 519 GAGGGGCCTCCGGGCCCTGCCGCCCTTGGCTCTCTTCACTTCAAAGGAGTGTCACTACTCCATCACCAAGGGAG 592
Query 593 CTGCGTTTCTGGGACTTGGCACCGACAGTGTCCGAGTGGTCAAGGCTGATGAGAGAGGGAAAATGGTCCCCGAG 666
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||.||||.|||
Sbjct 593 CTGCTTTTCTGGGACTTGGCACCGACAGTGTCCGAGTGGTCAAGGCTGATGAGAGAGGGAGGATGATCCCTGAG 666
Query 667 GATCTGGAGAGGCAGATTGGTATGGCCGAGGCTGAGGGTGCTGTGCCGTTCCTGGTCAGTGCCACCTCTGGCAC 740
||.||||||||||||||...|.||||.|||||||||||..|||||||.||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 667 GACCTGGAGAGGCAGATCATTCTGGCAGAGGCTGAGGGCTCTGTGCCATTTCTGGTCAGTGCCACCTCTGGTAC 740
Query 741 CACTGTGCTAGGGGCCTTTGACCCCCTGGAGGCAATTGCTGATGTGTGCCAGCGTCATGGGCTATGGCTGCATG 814
|||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.||.||.|||.|.||||
Sbjct 741 CACCGTGCTAGGGGCCTTTGACCCCCTGGATGCAATTGCCGATGTTTGCCAGCGACACGGACTGTGGTTCCATG 814
Query 815 TGGATGCTGCCTGGGGTGGGAGCGTCCTGCTGTCACAGACACACAGGCATCTCCTGGATGGGATCCAGAGGGCT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGGATGCTGCCTGGGGTGGGAGCGTCCTGCTGTCTCGGACACACAGGCATCTCCTGGATGGGATCCAGAGGGCT 888
Query 889 GACTCTGTGGCCTGGAATCCCCACAAGCTCCTCGCAGCAGGCCTGCAATGCTCTGCACTTCTTCTCCAGGATAC 962
|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||||.|||.||
Sbjct 889 GACTCTGTGGCCTGGAACCCTCACAAGCTTCTCGCCGCAGGGCTGCAGTGCTCCGCTCTTCTTCTCCGGGACAC 962
Query 963 CTCGAACCTGCTCAAGCGCTGCCATGGGTCCCAGGCCAGCTACCTTTTCCAGCAGGACAAGTTCTACGATGTGG 1036
|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 963 CTCGAACCTGCTCAAGCGCTGCCATGGATCCCAGGCCAGCTACCTCTTCCAGCAAGACAAGTTCTACGATGTGG 1036
Query 1037 CTCTGGACACGGGAGACAAGGTGGTGCAGTGTGGCCGCCGTGTGGACTGTCTGAAGCTGTGGCTCATGTGGAAG 1110
||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1037 CTCTGGACACCGGAGACAAAGTGGTGCAGTGTGGCCGCCGCGTGGACTGTCTGAAGCTATGGCTCATGTGGAAG 1110
Query 1111 GCACAGGGCGATCAAGGGCTGGAGCGGCGCATCGACCAGGCCTTTGTCCTTGCCCGGTACCTGGTGGAGGAAAT 1184
||||||||.|..||.|||.|||||||||||||||||||||||||||..||..||||||||.||||||||||.||
Sbjct 1111 GCACAGGGTGGGCAGGGGTTGGAGCGGCGCATCGACCAGGCCTTTGCTCTCACCCGGTACTTGGTGGAGGAGAT 1184
Query 1185 GAAGAAGCGGGAAGGGTTTGAGCTAGTCATGG------------------------------------------ 1216
.||.|||||||||||.||||||.|.||.||||
Sbjct 1185 TAAAAAGCGGGAAGGATTTGAGTTGGTAATGGAGGTAGGACTCCTGGCTCCTTTGAATGCCTCTCCCAGCCCCC 1258
Query 1217 -------------------------------------------------------------------------- 1216
Sbjct 1259 ACCTTGTTCCAGACATGAAGCCTCATAAAGGACCAGGAGCAAAGACAGGGAAACAACCCCTTCTTTCCTTCCTT 1332
Query 1217 ------------------------------------------------AGCCTGAGTTTGTCAATGTGTGTTTC 1242
||||.|||||.|||||.|||||.|||
Sbjct 1333 CCTCCCTCCCTTCCTTCCCCAACTCATGCCTCCCTCATCCCTCCCCTCAGCCCGAGTTCGTCAACGTGTGCTTC 1406
Query 1243 TGGTTCGTACCCCCCAGCCTGCGAGGGAAGCAGGAGAGTCCAGATTACCACGAAAGGCTGTCAAAGGTGGCCCC 1316
|||||.||.||.||||||||.||.||||||.|||||||||||||||||..|.||||||||||..||||||||||
Sbjct 1407 TGGTTTGTGCCTCCCAGCCTTCGGGGGAAGAAGGAGAGTCCAGATTACAGCCAAAGGCTGTCTCAGGTGGCCCC 1480
Query 1317 CGTGCTCAAGGAGCGCATGGTGAAGGAGGGCTCCATGATGATTGGCTACCAGCCCCACGGGACCCGGGGCAACT 1390
.|||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TGTGCTCAAGGAGCGCATGG------------------------------------------------------ 1500
Query 1391 TCTTCCGTGTGGTTGTGGCCAACTCTGCACTGACCTGTGCTGATATGGACTTCCTCCTCAACGAGCTGGAGCGG 1464
Sbjct 1501 -------------------------------------------------------------------------- 1500
Query 1465 CTAGGCCAGGACCTG 1479
Sbjct 1501 --------------- 1500