Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11984
- Subject:
- XM_024449011.1
- Aligned Length:
- 1860
- Identities:
- 1479
- Gaps:
- 381
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGAGGAACTCTGCCAAAAGGAAAGTTGCTTGGATTTGCCATCTCAGGAATGGAAGAAGGGGGCGGAGACCCT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TTGGGGCTTTTGTGCCCAGTGGGCCGGCCCGAAAAGCTCGCACTTTACAGAGGCGGCAAGACTAGGGTGGAGGA 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 AAGCTCAAGGGCCATCGCTGGGTGCTTCGGTGGCGGGCAGAAACGGGACTGGCAGTGCCCACACGTGTGCGTTC 222
Query 1 ------------------------------------------------------------------ATGGCTGA 8
||||||||
Sbjct 223 TCCCCGTCCGCCCGAAGGAGCTACCTGTGCACCCTGCCTCCGGCTCTCCTGAGCAGAGAGATCCTGATGGCTGA 296
Query 9 CTCAGAAGCACTCCCCTCCCTTGCTGGGGACCCAGTGGCTGTGGAAGCCTTGCTCCGGGCCGTGTTTGGGGTTG 82
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CTCAGAAGCACTCCCCTCCCTTGCTGGGGACCCAGTGGCTGTGGAAGCCTTGCTCCGGGCCGTGTTTGGGGTTG 370
Query 83 TTGTGGATGAGGCCATTCAGAAAGGAACCAGTGTCTCCCAGAAGGTCTGTGAGTGGAAGGAGCCTGAGGAGCTG 156
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TTGTGGATGAGGCCATTCAGAAAGGAACCAGTGTCTCCCAGAAGGTCTGTGAGTGGAAGGAGCCTGAGGAGCTG 444
Query 157 AAGCAGCTGCTGGATTTGGAGCTGCGGAGCCAGGGCGAGTCACAGAAGCAGATCCTGGAGCGGTGTCGGGCTGT 230
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AAGCAGCTGCTGGATTTGGAGCTGCGGAGCCAGGGCGAGTCACAGAAGCAGATCCTGGAGCGGTGTCGGGCTGT 518
Query 231 GATTCGCTACAGTGTCAAGACTGGTCACCCTCGGTTCTTCAACCAGCTCTTCTCTGGGTTGGATCCCCATGCTC 304
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GATTCGCTACAGTGTCAAGACTGGTCACCCTCGGTTCTTCAACCAGCTCTTCTCTGGGTTGGATCCCCATGCTC 592
Query 305 TGGCCGGGCGCATTATCACTGAGAGCCTCAACACCAGCCAGTACACATATGAAATCGCCCCCGTGTTTGTGCTC 378
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGGCCGGGCGCATTATCACTGAGAGCCTCAACACCAGCCAGTACACATATGAAATCGCCCCCGTGTTTGTGCTC 666
Query 379 ATGGAAGAGGAGGTGCTGAGGAAACTGCGGGCCCTGGTGGGCTGGAGCTCTGGGGACGGAATCTTCTGCCCTGG 452
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ATGGAAGAGGAGGTGCTGAGGAAACTGCGGGCCCTGGTGGGCTGGAGCTCTGGGGACGGAATCTTCTGCCCTGG 740
Query 453 TGGCTCCATCTCCAACATGTATGCTGTAAATCTGGCCCGCTATCAGCGCTACCCGGATTGCAAGCAGAGGGGCC 526
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGGCTCCATCTCCAACATGTATGCTGTAAATCTGGCCCGCTATCAGCGCTACCCGGATTGCAAGCAGAGGGGCC 814
Query 527 TCCGCACACTGCCGCCCCTGGCCCTATTCACATCGAAGGAG--------------------------------- 567
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TCCGCACACTGCCGCCCCTGGCCCTATTCACATCGAAGGAGGTGGGGAAGAGGCACAGGCCCAACCCTGGGCTC 888
Query 568 --------------------TGTCACTACTCCATCCAGAAGGGAGCTGCGTTTCTGGGACTTGGCACCGACAGT 621
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTGATTCTAATCTCCAGCCATGTCACTACTCCATCCAGAAGGGAGCTGCGTTTCTGGGACTTGGCACCGACAGT 962
Query 622 GTCCGAGTGGTCAAGGCTGATGAGAGAGGGAAAATGGTCCCCGAGGATCTGGAGAGGCAGATTGGTATGGCCGA 695
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GTCCGAGTGGTCAAGGCTGATGAGAGAGGGAAAATGGTCCCCGAGGATCTGGAGAGGCAGATTGGTATGGCCGA 1036
Query 696 GGCTGAG----------------------------------------GGTGCTGTGCCGTTCCTGGTCAGTGCC 729
||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GGCTGAGGTTGACTTTTCACTTTTTTGAAACTTTTATTTTGGATTCAGGTGCTGTGCCGTTCCTGGTCAGTGCC 1110
Query 730 ACCTCTGGCACCACTGTGCTAGGGGCCTTTGACCCCCTGGAGGCAATTGCTGATGTGTGCCAGCGTCATGGGCT 803
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ACCTCTGGCACCACTGTGCTAGGGGCCTTTGACCCCCTGGAGGCAATTGCTGATGTGTGCCAGCGTCATGGGCT 1184
Query 804 ATGGCTGCATGTGGATGCTGCCTGGGGTGGGAGCGTCCTGCTGTCACAGACACACAGGCATCTCCTGGATGGGA 877
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 ATGGCTGCATGTGGATGCTGCCTGGGGTGGGAGCGTCCTGCTGTCACAGACACACAGGCATCTCCTGGATGGGA 1258
Query 878 TCCAGAGGGCTGACTCTGTGGCCTGGAATCCCCACAAGCTCCTCGCAGCAGGCCTGCAATGCTCTGCACTTCTT 951
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TCCAGAGGGCTGACTCTGTGGCCTGGAATCCCCACAAGCTCCTCGCAGCAGGCCTGCAATGCTCTGCACTTCTT 1332
Query 952 CTCCAGGATACCTCGAACCTGCTCAAGCGCTGCCATGGGTCCCAGGCCAGCTACCTTTTCCAGCAGGACAAGTT 1025
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CTCCAGGATACCTCGAACCTGCTCAAGCGCTGCCATGGGTCCCAGGCCAGCTACCTTTTCCAGCAGGACAAGTT 1406
Query 1026 CTACGATGTGGCTCTGGACACGGGAGACAAGGTGGTGCAGTGTGGCCGCCGTGTGGACTGTCTGAAGCTGTGGC 1099
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CTACGATGTGGCTCTGGACACGGGAGACAAGGTGGTGCAGTGTGGCCGCCGTGTGGACTGTCTGAAGCTGTGGC 1480
Query 1100 TCATGTGGAAGGCACAGGGCGATCAAGGGCTGGAGCGGCGCATCGACCAGGCCTTTGTCCTTGCCCGGTACCTG 1173
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TCATGTGGAAGGCACAGGGCGATCAAGGGCTGGAGCGGCGCATCGACCAGGCCTTTGTCCTTGCCCGGTACCTG 1554
Query 1174 GTGGAGGAAATGAAGAAGCGGGAAGGGTTTGAGCTAGTCATGGAGCCTGAGTTTGTCAATGTGTGTTTCTGGTT 1247
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GTGGAGGAAATGAAGAAGCGGGAAGGGTTTGAGCTAGTCATGGAGCCTGAGTTTGTCAATGTGTGTTTCTGGTT 1628
Query 1248 CGTACCCCCCAGCCTGCGAGGGAAGCAGGAGAGTCCAGATTACCACGAAAGGCTGTCAAAGGTGGCCCCCGTGC 1321
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CGTACCCCCCAGCCTGCGAGGGAAGCAGGAGAGTCCAGATTACCACGAAAGGCTGTCAAAGGTGGCCCCCGTGC 1702
Query 1322 TCAAGGAGCGCATGGTGAAGGAGGGCTCCATGATGATTGGCTACCAGCCCCACGGGACCCGGGGCAACTTCTTC 1395
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TCAAGGAGCGCATGGTGAAGGAGGGCTCCATGATGATTGGCTACCAGCCCCACGGGACCCGGGGCAACTTCTTC 1776
Query 1396 CGTGTGGTTGTGGCCAACTCTGCACTGACCTGTGCTGATATGGACTTCCTCCTCAACGAGCTGGAGCGGCTAGG 1469
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 CGTGTGGTTGTGGCCAACTCTGCACTGACCTGTGCTGATATGGACTTCCTCCTCAACGAGCTGGAGCGGCTAGG 1850
Query 1470 CCAGGACCTG 1479
||||||||||
Sbjct 1851 CCAGGACCTG 1860