Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12028
- Subject:
- NM_001348242.1
- Aligned Length:
- 1017
- Identities:
- 938
- Gaps:
- 78
Alignment
Query 1 ATGGAGTCCAAGGTCTCAGAAGGTGGCCTGAATGTGACCCTCACCATCCGCCTGCTGATGCATGGAAAGGAAGT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGTCCAAGGTCTCAGAAGGTGGCCTGAATGTGACCCTCACCATCCGCCTGCTGATGCATGGAAAGGAAGT 74
Query 75 TGGAAGCATCATCGGGAAGAAAGGAGAAACTGTGAAGAAGATGCGTGAGGAGAGTGGTGCAAGGATCAACATCT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TGGAAGCATCATCGGGAAGAAAGGAGAAACTGTGAAGAAGATGCGTGAGGAGAGTGGTGCAAGGATCAACATCT 148
Query 149 CAGAGGGAAACTGCCCAGAGAGGATTGTGACCATCACAGGCCCCACAGACGCCATCTTCAAGGCCTTTGCCATG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CAGAGGGAAACTGCCCAGAGAGGATTGTGACCATCACAGGCCCCACAGACGCCATCTTCAAGGCCTTTGCCATG 222
Query 223 ATCGCATACAAGTTTGAGGAGGATATCATCAACTCCATGAGCAACAGCCCTGCCACCAGCAAGCCCCCAGTGAC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ATCGCATACAAGTTTGAGGAGGATATCATCAACTCCATGAGCAACAGCCCTGCCACCAGCAAGCCCCCAGTGAC 296
Query 297 GCTGAGGCTGGTGGTGCCTGCCAGCCAGTGCGGGTCCCTGATCGGCAAAGGAGGCTCCAAGATCAAGGAGATCA 370
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GCTGAGGCTGGTGGTGCCTGCCAGCCAGTGTGGGTCCCTGATCGGCAAAGGAGGCTCCAAGATCAAGGAGATCA 370
Query 371 GGGAGTCCACAGGTGCCCAGGTGCAGGTGGCTGGGGACATGCTGCCCAACTCCACGGAGCGAGCGGTGACCATC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GGGAGTCCACAGGTGCCCAGGTGCAGGTGGCTGGGGACATGCTGCCCAACTCCACGGAGCGAGCGGTGACCATC 444
Query 445 TCGGGGACCCCAGATGCCATCATCCAGTGCGTCAAGCAGATCTGTGTGGTCATGCTGG---------------- 502
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TCGGGGACCCCAGATGCCATCATCCAGTGCGTCAAGCAGATCTGTGTGGTCATGCTGGAGTCCCCACCGAAAGG 518
Query 503 -----------------------------------------------------------AGGCCTACACAATCC 517
|||||||||||||||
Sbjct 519 TGCCACCATTCCCTACCGCCCAAAGCCCGCCTCCACCCCTGTCATTTTTGCAGGTGGTCAGGCCTACACAATCC 592
Query 518 AGGGACAGTATGCCATCCCTCACCCGGAT---TTGACCAAGCTCCACCAGTTGGCCATGCAGCAAACCCCCTTT 588
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AGGGACAGTATGCCATCCCTCACCCGGATCAGTTGACCAAGCTCCACCAGTTGGCCATGCAGCAAACCCCCTTT 666
Query 589 CCTCCCCTCGGACAGACCAACCCCGCTTTCCCCGGAGAAAAGCTGCCTTTACACTCCTCCGAAGAAGCTCAAAA 662
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CCTCCCCTCGGACAGACCAACCCCGCTTTCCCCGGAGAAAAGCTGCCTTTACACTCCTCCGAAGAAGCTCAAAA 740
Query 663 TCTGATGGGCCAGTCATCAGGTCTGGACGCCAGCCCACCGGCCAGCACTCATGAGCTCACCATTCCCAATGATC 736
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TCTGATGGGCCAGTCATCAGGTCTGGACGCCAGCCCACCGGCCAGCACTCATGAGCTCACCATTCCCAATGATC 814
Query 737 TAATAGGCTGCATAATTGGACGCCAAGGGACCAAAATCAATGAAATTCGACAGATGTCTGGAGCTCAGATCAAA 810
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TAATAGGCTGCATAATTGGACGCCAAGGGACCAAAATCAATGAAATTCGACAGATGTCTGGAGCTCAGATCAAA 888
Query 811 ATCGCCAACGCCACGGAAGGGTCCTCAGAGCGTCAGATCACCATCACGGGGACCCCGGCCAACATCAGCCTTGC 884
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ATCGCCAACGCCACGGAAGGGTCCTCAGAGCGTCAGATCACCATCACGGGGACCCCGGCCAACATCAGCCTTGC 962
Query 885 CCAGTATCTCATCAACGCCAGGCTGACGTCCGAGGTCACCGGGATGGGCACGCTG 939
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CCAGTATCTCATCAACGCCAGGCTGACGTCCGAGGTCACCGGGATGGGCACGCTG 1017