Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_12044
Subject:
NM_001143821.3
Aligned Length:
1174
Identities:
874
Gaps:
300

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  MAADLNLEWISLPRSWTYGITRGGRVFFINEEAKSTTWLHPVTGEAVVTGHRRQSTDLPTGWEEAYTFEGARYY  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  INHNERKVTCKHPVTGQPSQDNCIFVVNEQTVATMTSEEKKERPISMINEASNYNVTSDYAVHPMSPVGRTSRA  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  SKKVHNFGKRSNSIKRNPNAPVVRRGWLYKQDSTGMKLWKKRWFVLSDLCLFYYRDEKEEGILGSILLPSFQIA  222

Query    1  --------------------MRTYYFCTDTGKEMELWMKAMLDAALVQTEPVKRVDKITSENAPTKETNNIPNH  54
                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  LLTSEDHINRKYAFKAAHPNMRTYYFCTDTGKEMELWMKAMLDAALVQTEPVKRVDKITSENAPTKETNNIPNH  296

Query   55  RVLIKPEIQNNQKNKEMSKIEEKKALEAEKYGFQKDGQDRPLTKINSVKLNSLPSEYESGSACPAQTVHYRPIN  128
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  RVLIKPEIQNNQKNKEMSKIEEKKALEAEKYGFQKDGQDRPLTKINSVKLNSLPSEYESGSACPAQTVHYRPIN  370

Query  129  LSSSENKIVNVSLADLRGGNRPNTGPLYTEADRVIQRTNSMQQLEQWIKIQKGRGHEEETRGVISYQTLPRNMP  202
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  LSSSENKIVNVSLADLRGGNRPNTGPLYTEADRVIQRTNSMQQLEQWIKIQKGRGHEEETRGVISYQTLPRNMP  444

Query  203  SHRAQIMARYPEGYRTLPRNSKTRPESICSVTPSTHDKTLGPGAEEKRRSMRDDTMWQLYEWQQRQFYNKQSTL  276
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  SHRAQIMARYPEGYRTLPRNSKTRPESICSVTPSTHDKTLGPGAEEKRRSMRDDTMWQLYEWQQRQFYNKQSTL  518

Query  277  PRHSTLSSPKTMVNISDQTMHSIPTSPSHGSIAAYQGYSPQRTYRSEVSSPIQRGDVTIDRRHRAHHPKHVYVP  350
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  PRHSTLSSPKTMVNISDQTMHSIPTSPSHGSIAAYQGYSPQRTYRSEVSSPIQRGDVTIDRRHRAHHPKHVYVP  592

Query  351  DRRSVPAGLTLQSVSPQSLQGKT---------------------------------------------------  373
            |||||||||||||||||||||||                                                   
Sbjct  593  DRRSVPAGLTLQSVSPQSLQGKTPEELTLLLIKLRRQQAELSSIREHTLAQLMQLKLEAHSPKNEILSHHLQRN  666

Query  374  -------LSQDEGRGTLYKYRPEEVDIDAKLSRLCEQDKVVHALEEKLQQLHKEKYTLEQALLSASQEIEMHAD  440
                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TIYLDHQLSQDEGRGTLYKYRPEEVDIDAKLSRLCEQDKVVHALEEKLQQLHKEKYTLEQALLSASQEIEMHAD  740

Query  441  NPAAIQTVVLQRDDLQNGLLSTCRELSRATAELERAWREYDKLEYDVTVTRNQMQEQLDHLGEVQTESAGIQRA  514
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  NPAAIQTVVLQRDDLQNGLLSTCRELSRATAELERAWREYDKLEYDVTVTRNQMQEQLDHLGEVQTESAGIQRA  814

Query  515  QIQKELWRIQDVMEGLSKHKQQRGTTEIGMIGSKPFSTVKYKNEGPDYRLYKSEPELTTVAEVDESNGEEKSEP  588
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  QIQKELWRIQDVMEGLSKHKQQRGTTEIGMIGSKPFSTVKYKNEGPDYRLYKSEPELTTVAEVDESNGEEKSEP  888

Query  589  VSEIETSVVKGSHFPVGVVPPRAKSPTPESSTIASYVTLRKTKKMMDLRTERPRSAVEQLCLAESTRPRMTVEE  662
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  VSEIETSVVKGSHFPVGVVPPRAKSPTPESSTIASYVTLRKTKKMMDLRTERPRSAVEQLCLAESTRPRMTVEE  962

Query  663  QMERIRRHQQACLREKKKGLNVIGASDQSPLQSPSNLRDNPFRTTQTRRRDDKELDTAIRENDVKPDHETPATE  736
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  QMERIRRHQQACLREKKKGLNVIGASDQSPLQSPSNLRDNPFRTTQTRRRDDKELDTAIRENDVKPDHETPATE  1036

Query  737  IVQLKETEPQNVDFSKELKKTENISYEMLFEPEPNGVNSVEMMDKERNKDKMPEDVTFSPQDETQTANHKPEEH  810
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  IVQLKETEPQNVDFSKELKKTENISYEMLFEPEPNGVNSVEMMDKERNKDKMPEDVTFSPQDETQTANHKPEEH  1110

Query  811  PEENTKNSVDEQEETVISYESTPEVSRGNQTMAVKSLSPSPESSASPVPSTQPQLTEGSHFMCV  874
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  PEENTKNSVDEQEETVISYESTPEVSRGNQTMAVKSLSPSPESSASPVPSTQPQLTEGSHFMCV  1174