Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12044
- Subject:
- XM_005253400.1
- Aligned Length:
- 3537
- Identities:
- 2622
- Gaps:
- 915
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCGGCGGATCTGAACCTGGAGTGGATCTCCCTGCCCCGGTCCTGGACTTACGGGATCACCAGGGGCGGCCG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 AGTCTTCTTCATCAACGAGGAGGCCAAGAGCACCACCTGGCTGCACCCCGTCACCGGCGAGGCGGTGGTCACCG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 GACACCGGCGGCAGAGCACAGATTTGCCTACTGGCTGGGAAGAAGCATATACTTTTGAAGGTGCAAGATACTAT 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 ATAAACCATAATGAAAGGAAAGTGACCTGCAAACATCCAGTCACAGGACAACCATCACAGGACAATTGTATTTT 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 TGTAGTGAATGAACAGACTGTTGCAACCATGACATCTGAAGAAAAGAAGGAACGGCCAATAAGTATGATAAATG 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 AAGCTTCTAACTATAACGTGACTTCAGATTATGCAGTGCATCCAATGAGCCCTGTAGGCAGAACTTCACGAGCT 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 TCAAAAAAAGTTCATAATTTTGGAAAGAGGTCAAATTCAATTAAAAGGAATCCTAATGCACCGGTTGTCAGACG 518
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 519 AGGTTGGCTTTATAAACAGGACAGTACTGGCATGAAATTGTGGAAGAAACGCTGGTTTGTGCTTTCTGACCTTT 592
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 593 GCCTCTTTTATTATAGAGATGAGAAAGAAGAGGGTATCCTGGGAAGCATACTGTTACCTAGTTTTCAGATAGCT 666
Query 1 ------------------------------------------------------------ATGCGGACCTATTA 14
||||||||||||||
Sbjct 667 TTGCTTACCTCTGAAGATCACATTAATCGCAAATATGCTTTTAAGGCAGCCCATCCAAACATGCGGACCTATTA 740
Query 15 TTTCTGCACTGATACAGGAAAGGAAATGGAGTTGTGGATGAAAGCCATGTTAGATGCTGCCCTAGTACAGACAG 88
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TTTCTGCACTGATACAGGAAAGGAAATGGAGTTGTGGATGAAAGCCATGTTAGATGCTGCCCTAGTACAGACAG 814
Query 89 AACCTGTGAAAAGAGTGGACAAGATTACATCTGAAAATGCACCAACTAAAGAAACCAATAACATTCCCAACCAT 162
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AACCTGTGAAAAGAGTGGACAAGATTACATCTGAAAATGCACCAACTAAAGAAACCAATAACATTCCCAACCAT 888
Query 163 AGAGTGCTAATTAAACCAGAGATCCAAAACAATCAAAAAAACAAGGAAATGAGCAAAATTGAAGAAAAAAAGGC 236
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AGAGTGCTAATTAAACCAGAGATCCAAAACAATCAAAAAAACAAGGAAATGAGCAAAATTGAAGAAAAAAAGGC 962
Query 237 ATTAGAAGCTGAAAAATATGGATTTCAGAAGGATGGTCAAGATAGACCCTTAACAAAAATTAATAGTGTAAAGC 310
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ATTAGAAGCTGAAAAATATGGATTTCAGAAGGATGGTCAAGATAGACCCTTAACAAAAATTAATAGTGTAAAGC 1036
Query 311 TGAATTCTCTGCCATCTGAATATGAGAGTGGGTCAGCATGCCCTGCTCAGACTGTGCACTACAGACCAATCAAC 384
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TGAATTCTCTGCCATCTGAATATGAGAGTGGGTCAGCATGCCCTGCTCAGACTGTGCACTACAGACCAATCAAC 1110
Query 385 TTGAGCAGTTCAGAGAACAAAATAGTCAATGTTAGCCTGGCAGATCTTAGAGGTGGAAATCGCCCCAATACAGG 458
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TTGAGCAGTTCAGAGAACAAAATAGTCAATGTTAGCCTGGCAGATCTTAGAGGTGGAAATCGCCCCAATACAGG 1184
Query 459 GCCCTTATACACAGAGGCCGATCGAGTCATACAGAGAACAAATTCAATGCAGCAGTTGGAACAGTGGATTAAAA 532
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GCCCTTATACACAGAGGCCGATCGAGTCATACAGAGAACAAATTCAATGCAGCAGTTGGAACAGTGGATTAAAA 1258
Query 533 TCCAGAAGGGGAGGGGTCATGAAGAAGAAACCAGGGGAGTAATTTCTTACCAAACATTACCAAGAAATATGCCA 606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TCCAGAAGGGGAGGGGTCATGAAGAAGAAACCAGGGGAGTAATTTCTTACCAAACATTACCAAGAAATATGCCA 1332
Query 607 AGTCACAGAGCCCAGATTATGGCCCGCTACCCTGAAGGTTATAGAACACTCCCAAGAAACAGCAAGACAAGGCC 680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AGTCACAGAGCCCAGATTATGGCCCGCTACCCTGAAGGTTATAGAACACTCCCAAGAAACAGCAAGACAAGGCC 1406
Query 681 TGAAAGTATCTGCAGTGTAACCCCTTCCACTCATGACAAGACATTAGGACCCGGAGCGGAGGAGAAACGGAGGT 754
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGAAAGTATCTGCAGTGTAACCCCTTCCACTCATGACAAGACATTAGGACCCGGAGCGGAGGAGAAACGGAGGT 1480
Query 755 CCATGAGAGATGACACAATGTGGCAGCTCTACGAATGGCAGCAGCGTCAGTTTTATAACAAACAGAGCACCCTC 828
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CCATGAGAGATGACACAATGTGGCAGCTCTACGAATGGCAGCAGCGTCAGTTTTATAACAAACAGAGCACCCTC 1554
Query 829 CCTCGACACAGTACTTTGAGTAGTCCCAAAACCATGGTAAATATTTCTGACCAGACAATGCACTCTATTCCCAC 902
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CCTCGACACAGTACTTTGAGTAGTCCCAAAACCATGGTAAATATTTCTGACCAGACAATGCACTCTATTCCCAC 1628
Query 903 ATCACCTTCCCACGGGTCAATAGCTGCTTATCAGGGATACTCCCCTCAACGAACTTACAGATCGGAAGTGTCTT 976
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 ATCACCTTCCCACGGGTCAATAGCTGCTTATCAGGGATACTCCCCTCAACGAACTTACAGATCGGAAGTGTCTT 1702
Query 977 CACCAATTCAGAGAGGAGATGTGACAATAGACCGCAGACACAGGGCCCATCACCCTAAGCATGTCTATGTGCCT 1050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CACCAATTCAGAGAGGAGATGTGACAATAGACCGCAGACACAGGGCCCATCACCCTAAGCATGTCTATGTGCCT 1776
Query 1051 GACAGAAGGTCAGTGCCAGCTGGCCTGACTTTACAGTCTGTTAGTCCCCAGAGCCTCCAAGGGAAAACGCTGTC 1124
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GACAGAAGGTCAGTGCCAGCTGGCCTGACTTTACAGTCTGTTAGTCCCCAGAGCCTCCAAGGGAAAACGCTGTC 1850
Query 1125 ACAAGATGAAGGTAGAGGCACATTATACAAATACAGACCTGAAGAAGTAGATATTGATGCCAAGTTAAGCCGAT 1198
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 ACAAGATGAAGGTAGAGGCACATTATACAAATACAGACCTGAAGAAGTAGATATTGATGCCAAGTTAAGCCGAT 1924
Query 1199 TATGTGAACAAGATAAAGTGGTGCATGCTCTGGAAGAGAAACTTCAGCAACTCCACAAGGAGAAATACACGCTT 1272
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 TATGTGAACAAGATAAAGTGGTGCATGCTCTGGAAGAGAAACTTCAGCAACTCCACAAGGAGAAATACACGCTT 1998
Query 1273 GAGCAAGCTTTGCTATCAGCCAGCCAAGAGATAGAAATGCATGCAGATAACCCAGCAGCCATTCAGACAGTGGT 1346
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 GAGCAAGCTTTGCTATCAGCCAGCCAAGAGATAGAAATGCATGCAGATAACCCAGCAGCCATTCAGACAGTGGT 2072
Query 1347 GTTACAAAGGGATGATTTACAAAATGGACTGCTTAGTACGTGTCGAGAACTTTCTCGAGCCACTGCCGAATTGG 1420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 GTTACAAAGGGATGATTTACAAAATGGACTGCTTAGTACGTGTCGAGAACTTTCTCGAGCCACTGCCGAATTGG 2146
Query 1421 AACGAGCATGGAGAGAATATGATAAGTTAGAATACGATGTAACTGTTACCAGGAACCAGATGCAAGAGCAGCTG 1494
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 AACGAGCATGGAGAGAATATGATAAGTTAGAATACGATGTAACTGTTACCAGGAACCAGATGCAAGAGCAGCTG 2220
Query 1495 GATCACCTTGGTGAAGTTCAGACGGAATCAGCAGGAATTCAGCGTGCACAGATTCAGAAAGAACTTTGGCGAAT 1568
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 GATCACCTTGGTGAAGTTCAGACGGAATCAGCAGGAATTCAGCGTGCACAGATTCAGAAAGAACTTTGGCGAAT 2294
Query 1569 TCAGGATGTCATGGAAGGGCTGAGTAAACATAAGCAGCAAAGAGGTACTACAGAAATAGGTATGATAGGATCAA 1642
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 TCAGGATGTCATGGAAGGGCTGAGTAAACATAAGCAGCAAAGAGGTACTACAGAAATAGGTATGATAGGATCAA 2368
Query 1643 AGCCTTTCTCAACAGTTAAGTACAAAAATGAG------------------------------------------ 1674
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 AGCCTTTCTCAACAGTTAAGTACAAAAATGAGGAAGAGGAAGTAGTCCCACCTCGTCCTCCACTTCCTCGGTCC 2442
Query 1675 -------------------------------------------------------------------------- 1674
Sbjct 2443 TATGACTTTACAGAGCAGCCTCCCATAATCCCCCCTCTGCCCAGTGATAGCAGCTCCTTGCTCTGTTATAGCAG 2516
Query 1675 -------------------------------------------------------------------------G 1675
|
Sbjct 2517 GGGCCCAGTTCATCTGCCTGAAGAAAAGAAGATGTATCAAGTTCAAGGATATCCAAGAAATGGATCTCACTGTG 2590
Query 1676 GTCCAGATTATAGACTCTACAAGAGTGAACCAGAGTTAACAACAGTGGCAGAAGTTGATGAATCTAATGGAGAA 1749
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 GTCCAGATTATAGACTCTACAAGAGTGAACCAGAGTTAACAACAGTGGCAGAAGTTGATGAATCTAATGGAGAA 2664
Query 1750 GAAAAATCAGAACCTGTTTCAGAGATAGAAACTTCAGTTGTTAAAGGTTCCCACTTTCCTGTTGGAGTAGTCCC 1823
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 GAAAAATCAGAACCTGTTTCAGAGATAGAAACTTCAGTTGTTAAAGGTTCCCACTTTCCTGTTGGAGTAGTCCC 2738
Query 1824 TCCAAGAGCAAAATCACCAACACCCGAATCTTCGACAATAGCTTCCTATGTAACCTTGAGGAAAACTAAGAAGA 1897
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 TCCAAGAGCAAAATCACCAACACCCGAATCTTCGACAATAGCTTCCTATGTAACCTTGAGGAAAACTAAGAAGA 2812
Query 1898 TGATGGATCTAAGAACGGAAAGACCAAGAAGTGCAGTGGAACAGCTCTGTTTGGCTGAAAGTACTCGACCAAGG 1971
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 TGATGGATCTAAGAACGGAAAGACCAAGAAGTGCAGTGGAACAGCTCTGTTTGGCTGAAAGTACTCGACCAAGG 2886
Query 1972 ATGACTGTGGAAGAGCAAATGGAAAGAATAAGAAGACATCAACAAGCGTGCCTGAGGGAGAAGAAAAAAGGGTT 2045
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 ATGACTGTGGAAGAGCAAATGGAAAGAATAAGAAGACATCAACAAGCGTGCCTGAGGGAGAAGAAAAAAGGGTT 2960
Query 2046 AAATGTTATCGGTGCTTCAGACCAGTCACCCTTACAAAGCCCTTCAAATTTAAGGGATAATCCATTTAGGACTA 2119
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 AAATGTTATCGGTGCTTCAGACCAGTCACCCTTACAAAGCCCTTCAAATTTAAGGGATAATCCATTTAGGACTA 3034
Query 2120 CTCAGACTCGAAGGAGGGATGATAAGGAACTGGACACTGCCATTAGAGAAAATGATGTAAAGCCAGACCATGAA 2193
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 CTCAGACTCGAAGGAGGGATGATAAGGAACTGGACACTGCCATTAGAGAAAATGATGTAAAGCCAGACCATGAA 3108
Query 2194 ACTCCTGCAACAGAAATTGTTCAACTAAAAGAAACCGAACCCCAAAATGTGGACTTCAGCAAAGAGTTAAAAAA 2267
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 ACTCCTGCAACAGAAATTGTTCAACTAAAAGAAACCGAACCCCAAAATGTGGACTTCAGCAAAGAGTTAAAAAA 3182
Query 2268 AACTGAAAACATTTCATATGAAATGCTTTTTGAACCTGAGCCAAATGGAGTAAATTCTGTGGAAATGATGGATA 2341
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 AACTGAAAACATTTCATATGAAATGCTTTTTGAACCTGAGCCAAATGGAGTAAATTCTGTGGAAATGATGGATA 3256
Query 2342 AAGAAAGAAACAAAGACAAAATGCCTGAGGATGTTACATTCAGCCCTCAAGATGAAACACAGACCGCAAATCAT 2415
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257 AAGAAAGAAACAAAGACAAAATGCCTGAGGATGTTACATTCAGCCCTCAAGATGAAACACAGACCGCAAATCAT 3330
Query 2416 AAACCAGAAGAGCATCCTGAAGAAAATACAAAGAACAGTGTTGACGAACAGGAAGAAACTGTTATTTCTTACGA 2489
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331 AAACCAGAAGAGCATCCTGAAGAAAATACAAAGAACAGTGTTGACGAACAGGAAGAAACTGTTATTTCTTACGA 3404
Query 2490 ATCAACTCCTGAGGTTTCTAGAGGAAATCAAACAATGGCAGTGAAAAGTCTGTCCCCATCTCCTGAGTCCTCGG 2563
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405 ATCAACTCCTGAGGTTTCTAGAGGAAATCAAACAATGGCAGTGAAAAGTCTGTCCCCATCTCCTGAGTCCTCGG 3478
Query 2564 CATCGCCAGTTCCATCCACTCAGCCGCAGCTCACAGAAGGATCACATTTCATGTGTGTG 2622
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479 CATCGCCAGTTCCATCCACTCAGCCGCAGCTCACAGAAGGATCACATTTCATGTGTGTG 3537
