Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12044
- Subject:
- XM_006506884.2
- Aligned Length:
- 3229
- Identities:
- 2154
- Gaps:
- 674
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGTTGAGTCTGCTCCTGTCGGCATGGGCGCAGCTCATGGAGAGTGACGCTGTTGTTTTCACTCAGGCAGCCCA 74
Query 1 -------ATGCGGACCTATTATTTCTGCACTGATACAGGAAAGGAAATGGAGTTGTGGATGAAAGCCATGTTAG 67
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||.||||||||||.||||||||||
Sbjct 75 CCCAAACATGCGGACCTATTATTTCTGCACCGATACAGGAAAGGAGATGGAGCTGTGGATGAAGGCCATGTTAG 148
Query 68 ATGCTGCCCTAGTACAGACAGAACCTGTGAAAA------------------GAGTGGACAAGATTACATCTGAA 123
|||||||.||.||.||||||||||||||||||| |||||||||||||||||.||||.
Sbjct 149 ATGCTGCTCTGGTGCAGACAGAACCTGTGAAAAGAATTACCTTTAATTTCCGAGTGGACAAGATTACAACTGAC 222
Query 124 AATGCACCAACTAAAGAAACCAATAACATTCCCAACCATAGAGTGCTAATTAAACCAGAGATCCAAAACAATCA 197
|.||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||.|||.|||.||||||||.||||
Sbjct 223 AGTGCATCAACCAAAGAAACCAATAACATTCCCAACCACAGAGTTCTCATTAGACCCGAGGTCCAAAACCATCA 296
Query 198 AAAAAACAAGGAAATGAGCAAAATTGAAGAAAAAAAGGCATTAGAAGCTGAAAAATATGGATTTCAGAAGGATG 271
.||.||.||||||||.|||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||.|||.||||||||||||||.|
Sbjct 297 GAAGAATAAGGAAATCAGCAAAATTGAAGAAAAAAGGGCCTTAGAAGCTGAAAGATACGGATTTCAGAAGGACG 370
Query 272 GTCAAGATAGACCCTTAACAAAAATTAATAGTGTAAAGCTGAATTCTCTGCCATCTGAATATGAGAGTGGGTCA 345
|.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||.||||.||.||||.|||.||||||||.||.|||.||
Sbjct 371 GGCAAGATAGACCATTAACAAAAATTAACAGTGTGAAGTTGAACTCCCTGCTATCAGAATATGAAAGCGGGCCA 444
Query 346 GCATGCCCTGCTCAGACTGTGCACTACAGACCAATCAACTTGAGCAGTTCAGAGAACAAAATAGTCAATGTTAG 419
|..|||||..||||||.|||.|||||||||||.|||||..|||..|||||.||...||||...||.|||||.||
Sbjct 445 GACTGCCCACCTCAGAATGTACACTACAGACCCATCAATGTGAATAGTTCTGACGGCAAAGCGGTGAATGTCAG 518
Query 420 CCTGGCAGATCTTAGAGGTGGAAATCGCCCCAATACAGGGCCCTTATACACAGAGGCCGATCGAGTCATACAGA 493
|.||||||||.|..|.|||||.|.||.|||.|||.||||||||.||..||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 519 CTTGGCAGATGTCCGGGGTGGGAGTCACCCAAATGCAGGGCCCCTAGCCACAGAGGCCGACCGAGTCATTCAGA 592
Query 494 GAACAAATTCAATGCAGCAGTTGGAACAGTGGATTAAAATCCAGAAGGGGAGGGGTCATGAAGAAGAAACCAGG 567
||||.|||||||||||.|||.|.||.||||||||||||.|||||||.||..||||||.|||||||||..||||.
Sbjct 593 GAACGAATTCAATGCAACAGCTAGAGCAGTGGATTAAAGTCCAGAAAGGACGGGGTCTTGAAGAAGAGCCCAGA 666
Query 568 GGAGTAATTTCTTACCAAACATTACCAAGAAATATGCCAAGTCACAGAGCCCAGATTATGGCCCGCTACCCTGA 641
||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||..|||||||||.||||||
Sbjct 667 GGAGTAATTTCTTATCAAACATTGCCAAGAAATATGCCAAGCCACAGAGCCCAGATCCTGGCCCGCTGCCCTGA 740
Query 642 AGGTTATAGAACACTCCCAAGAAACAGCAAGACAAGGCCTGAAAGTATCTGCAGTGTAACCCCTTCCACTCATG 715
||||||..|.||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||.||||...|||||
Sbjct 741 AGGTTACCGGACACTCCCGAGAAACAGCAAGACCAGACCTGAGAGTATCTGCAGCGTAACCTCTTCTGGTCATG 814
Query 716 ACAAGACATTAGGACCCGGAGCGGAGGAGAAACGGAGGTCCATGAGAGATGACACAATGTGGCAGCTCTACGAA 789
|.||||| |||.||.|||||.||.|||||.|||.|.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.
Sbjct 815 AGAAGAC---AGGGCCGGGAGCAGAAGAGAAGCGGCGATCCATGAGAGATGACACCATGTGGCAGCTGTACGAG 885
Query 790 TGGCAGCAGCGTCAGTTTTATAACAAACAGAGCACCCTCCCTCGACACAGTACT--TTGAGTAGTCCCAAAACC 861
|||||||||||.||||||||..||||.|||||||||||||||||.|||.| || .||||.|||||||||.||
Sbjct 886 TGGCAGCAGCGCCAGTTTTACCACAAGCAGAGCACCCTCCCTCGGCACGG--CTGCCTGAGCAGTCCCAAAGCC 957
Query 862 ATGGTAAATATTTCTGACCAGACAATGCACTCTATTCCCACATCACCTTCCCACGGGTCAATAGCTGCTTATCA 935
|||||..|..|.|||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||..|||||||||.||
Sbjct 958 ATGGTGCAGGTGTCTGACCAGACGATGCACTCCATCCCCACGTCACCTTCCCATGGGTCAGCAGCTGCTTACCA 1031
Query 936 GGGATACTCCCCTCAACGAACTTACAGATCGGAAGTGTCTTCACCAATTCAGAGAGGAGATGTGACAATAGACC 1009
|||.|.|||||||||.||.||.|||||.||.||||||.|.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1032 GGGCTTCTCCCCTCAGCGGACGTACAGGTCAGAAGTGACCTCGCCCATCCAGAGAGGAGATGTGACGATAGACC 1105
Query 1010 GCAGACACAGGGCCCATCACCCTAAGCATGTCTATGTGCCTGACAGAAGGTCAGTGCCAGCTGGCCTGACTTTA 1083
||||.||||||.|.|||||||||||||||||||||||..||||||||||||||.|||||||||||.|.||||||
Sbjct 1106 GCAGGCACAGGCCTCATCACCCTAAGCATGTCTATGTAGCTGACAGAAGGTCAATGCCAGCTGGCTTAACTTTA 1179
Query 1084 CAGTCTGTTAGTCCCCAGAGCCTCCAAGGGAAAACG-------------------------------------- 1119
|||.|||||||||||||||||||||||||.|.||||
Sbjct 1180 CAGGCTGTTAGTCCCCAGAGCCTCCAAGGCAGAACGCCAGAGGAGCTCACACTGCTGCTAATAAAGCTGAGACG 1253
Query 1120 -------------------------------------------------------------------------- 1119
Sbjct 1254 GCAGCAGGCAGAGCTGAGTAGTGTCCGGGAGCACACCTTAGCACAGCTCATGCAGCTGAAACTTGAGGCCCACA 1327
Query 1120 -------------------------------------------------------------------------- 1119
Sbjct 1328 GCCCAAAGAATGAGATTCTTTCACATCATCTCCAAAGGAACACCATATATTTGGATCATCAGATGAAAGAAAAT 1401
Query 1120 -------------------------------------------------------------------------- 1119
Sbjct 1402 GAACCTATTATCACCATGGTTCACACAATGATTGAGAACTCGGCGCTAAGACCACAACTGTACCAACAATTCTT 1475
Query 1120 -------------------------------CTGTCACAAGATGAAGGTAGAGGCACATTATACAAATACAGAC 1162
|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1476 AAGACAGAAGAACAAGATAAGTCTCTATTGTCTGTCACAAGATGAATGTAGAGGCACATTATACAAATACAGAC 1549
Query 1163 CTGAAGAAGTAGATATTGATGCCAAGTTAAGCCGATTATGTGAACAAGATAAAGTGGTGCATGCTCTGGAAGAG 1236
|||||||||.||.||||||||||||.||||||.||||.||||||||.|||||||||||.|..||.|||||.|||
Sbjct 1550 CTGAAGAAGCAGGTATTGATGCCAAATTAAGCAGATTGTGTGAACAGGATAAAGTGGTCCGAGCGCTGGAGGAG 1623
Query 1237 AAACTTCAGCAACTCCACAAGGAGAAATACACGCTTGAGCAAGCTTTGCTATCAGCCAGCCAAGAGATAGAAAT 1310
||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1624 AAGCTGCAGCAGCTGCACAAGGAGAAATACACGCTTGAGCAAGCCTTGCTGTCAGCCAGCCAAGAGATAGAGAT 1697
Query 1311 GCATGCAGATAACCCAGCAGCCATTCAGACAGTGGTGTTACAAAGGGATGATTTACAAAATGGACTGCTTAGTA 1384
|.||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||.||.||||||||..|.|||||.||||||||.||.|
Sbjct 1698 GAATGCTGATAACCCAGCTGCCATTCAAACTGTGGTGTTGCAGAGGGATGACCTGCAAAACGGACTGCTGAGCA 1771
Query 1385 CGTGTCGAGAACTTTCTCGAGCCACTGCCGAATTGGAACGAGCATGGAGAGAATATGATAAGTTAGAATACGAT 1458
|||||||.|||||.||.|||||||||||.||..||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||
Sbjct 1772 CGTGTCGGGAACTCTCCCGAGCCACTGCTGAGCTGGAACGAGCCTGGAGAGAATATGACAAGTTGGAATATGAT 1845
Query 1459 GTAACTGTTACCAGGAACCAGATGCAAGAGCAGCTGGATCACCTTGGTGAAGTTCAGACGGAATCAGCAGGAAT 1532
||.||||||||||||.||||||||||.|..|||||.||.|.||||||.|||||.||||..||.||.||||||||
Sbjct 1846 GTGACTGTTACCAGGGACCAGATGCAGGGTCAGCTCGACCGCCTTGGAGAAGTGCAGAGTGAGTCGGCAGGAAT 1919
Query 1533 TCAGCGTGCACAGATTCAGAAAGAACTTTGGCGAATTCAGGATGTCATGGAAGGGCTGAGTAAACATAAGCAGC 1606
|||.||.|||||||||||.||.||.||.|||.|||||||.|||||||||||.|||.||||.|||||.||.||||
Sbjct 1920 TCAACGGGCACAGATTCAAAAGGAGCTCTGGAGAATTCAAGATGTCATGGAGGGGTTGAGCAAACACAAACAGC 1993
Query 1607 AAAGAGGTACTACAGAAA---TAGGTATGATAGGATCAAAGCCTTTCTCAACAGTTAAGTACAA---------- 1667
|||||||..||.|||||| |||||.||..|||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1994 AAAGAGGCTCTTCAGAAACAGTAGGTCTGGCAGGATCAAAGCCTTTCTCATCAGTTAAGTACAAGAGCGAGGAA 2067
Query 1668 -------------------------------------------------------------------------- 1667
Sbjct 2068 GAGGAAGTAGTCCCACCTCGGCCTCCACTTCCTCGGTCTTATGACTTTACAGAGCAGCCTCCCATAATCCCCCC 2141
Query 1668 -------------------------------------------------------------------------- 1667
Sbjct 2142 TCTGCCCAGTGATAGCAGCTCCTTGCTCTGTTATAGCAGGGGCCCCGTGCATCTGCCTGAAGACAAGAAGATTC 2215
Query 1668 ----------------------AAATGAG----------GGTCCAGATTATAGACTCTACAAGAGTGAACCAGA 1709
||||| | |||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 2216 ATCAAGTTCAAGGATATCCAAGAAATG-GATCTCACTGTGGTCCAGATTATAGACTCTACAAGAGTGAGCCAGA 2288
Query 1710 GTTAACAACAGTGGCAGAAGTTGATGAATCTAATGGAGAAGAAAAATCAGAACCTGTTTCAGAGATAGAAACTT 1783
||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||.||||.||.
Sbjct 2289 GTTAACCACAGTGGCAGAAGTCGATGAATCTAACGGAGAAGAAAAGTCAGAGCCAGTTTCTGAGACAGAAGCTC 2362
Query 1784 CAGTTGTTAAAGGTTCCCACTTTCCTGTTGGAGTAGTCCCTCCAAGAGCAAAATCACCAACACCCGAATCTTCG 1857
||||.||||||||||||||.|||||.||.|| |||.||||..|||.||||.|||||.||||||||.||.||.
Sbjct 2363 CAGTCGTTAAAGGTTCCCATTTTCCAGTCGG---AGTTCCTCTGAGAACAAAGTCACCCACACCCGAGTCCTCC 2433
Query 1858 ACAATAGCTTCCTATGTAACCTTGAGGAAAACTAAGAAGATGATGGATCTAAGAACGGAAAGACCAAGAAGTGC 1931
||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2434 ACGATAGCTTCCTATGTGACCTTGAGGAAGACTAAGAAGATGGTGGAGCTAAGAACGGAAAGACCAAGAAGTGC 2507
Query 1932 AGTGGAACAGCTCTGTTTGGCTGAAAGTACTCGACCAAGGATGACTGTGGAAGAGCAAATGGAAAGAATAAGAA 2005
.|||||.|||||.|||.|||||||.|||.|||||||.||.|||||||||||||||||..|.||.||.||.||.|
Sbjct 2508 CGTGGAGCAGCTGTGTCTGGCTGAGAGTGCTCGACCTAGAATGACTGTGGAAGAGCAGCTAGAGAGGATCAGGA 2581
Query 2006 GACATCAACAAGCGTGCCTGAGGGAGAAGAAAAAAGGGTTAAATGTTATCGGTGCTTCAGACCAGTCACCCTTA 2079
||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||.|||.|.|.|||..||||||||||.||
Sbjct 2582 GACACCAGCAGGCCTGCCTGAGGGAGAAGAAGAAGGGGCTGAGTGTCCTCGGTGCTTCCGA------------- 2642
Query 2080 CAAAGCCCTTCAAATTTAAGGGATAATCCATTTAGGACTACTCAGACTCGAAGGAGGGATGA------TAAGGA 2147
|||.|||.|..|.|||||.|.||||.|.|||..|||||||||||.|||||||||||| ||||||
Sbjct 2643 -----CCCGTCAGACGTGAGGGACAGTCCACTCAGGCTTACTCAGACTCTAAGGAGGGATGATAACGTTAAGGA 2711
Query 2148 ACTGGACACTG-CCATTAGAGAAAATGATGTAAAGCCAGACCATGAAACTCCTGCA--ACAGAAATTGT--TCA 2216
.||.|||||.| ||| .||||||||||||||||||||||||.|.||.|||||.||| |||| ||| |||
Sbjct 2712 GCTAGACACCGTCCA-CAGAGAAAATGATGTAAAGCCAGACTACGAGACTCCAGCAGCACAG----TGTGCTCA 2780
Query 2217 ACTAAAAGAAACCGAACCCCAAAATGTGGACTTCAGCAAAGAGTTAAAAAAAACTGAAAACATTTCATATGAAA 2290
.|||.||||..|.||||||||.||||..|||.||.|||.|.||.|||||| .||.|||||
Sbjct 2781 CCTAGAAGACGCTGAACCCCAGAATGCAGACATCGGCAGAAAGCTAAAAA---------------GATCTGAAA 2839
Query 2291 TGCTTTTTGAACCTGAGCCAAATGGAGTAAATTCTGTGGAAATGATGGATAAAGAAAGAAACAAAGACAAAATG 2364
||||||....||||||.|||||||||.|...|||||.||||.|||.|||.||.||||||.|.|||||..|..||
Sbjct 2840 TGCTTTACACACCTGAACCAAATGGAATGGCTTCTGAGGAAGTGACGGAGAAGGAAAGACAGAAAGAGCAGGTG 2913
Query 2365 CCTGAGGATGTTACATTCAGCCCTCAAGATGAAAC-------ACAGACCGCAAATCATAAACCAGAAGAGCATC 2431
|.||..||||...|||.|||||||||.||.||.|| |||||.| ||||.| ..||||..|..|
Sbjct 2914 CATGCCGATGGGTCATGCAGCCCTCAGGAAGAGACGGCCATGACAGAGC----ATCAGA---TGGAAGGCCCCC 2980
Query 2432 CTGAAGAAAATACAAAGAACAGTGTTGACGAACAGGAAGAAACTGTTATTTCTTACGAATCAACTCCTGAGGTT 2505
||||.||| .||.|| |||.||.|.||..|||||||||||.||..|||.|..||..||.||||||||.||
Sbjct 2981 CTGAGGAA---GCAGAG---AGTCTTCATGAGGAGGAAGAAACTCTTGCTTCCTGTGAGCCAGCTCCTGAGATT 3048
Query 2506 TCTAGAGGA-AATCAAACAATGGCAGTGAAAAGTCTGTCCCCATCTCCTGAGTCCT---CGGCATCGCCAGTTC 2575
.|||| ||| ||||||||.| ||||||.||||||||||||.||||||||.|||| ||||| .|||.||
Sbjct 3049 CCTAG-GGAGAATCAAACCA---CAGTGAGAAGTCTGTCCCCGTCTCCTGACTCCTCCACGGCA---GCAGATC 3115
Query 2576 CATCCACTCAGCCGCAGCTCACAGAAGGATCACATTTCATGTGTGTG 2622
|..||||||..||.|||||||..||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 3116 CGCCCACTCCTCCACAGCTCAGGGAAGGATCGCATTTCATGTGTGTG 3162