Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_12044
Subject:
XM_006506884.2
Aligned Length:
3229
Identities:
2154
Gaps:
674

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTTGAGTCTGCTCCTGTCGGCATGGGCGCAGCTCATGGAGAGTGACGCTGTTGTTTTCACTCAGGCAGCCCA  74

Query    1  -------ATGCGGACCTATTATTTCTGCACTGATACAGGAAAGGAAATGGAGTTGTGGATGAAAGCCATGTTAG  67
                   |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||.||||||||||.||||||||||
Sbjct   75  CCCAAACATGCGGACCTATTATTTCTGCACCGATACAGGAAAGGAGATGGAGCTGTGGATGAAGGCCATGTTAG  148

Query   68  ATGCTGCCCTAGTACAGACAGAACCTGTGAAAA------------------GAGTGGACAAGATTACATCTGAA  123
            |||||||.||.||.|||||||||||||||||||                  |||||||||||||||||.||||.
Sbjct  149  ATGCTGCTCTGGTGCAGACAGAACCTGTGAAAAGAATTACCTTTAATTTCCGAGTGGACAAGATTACAACTGAC  222

Query  124  AATGCACCAACTAAAGAAACCAATAACATTCCCAACCATAGAGTGCTAATTAAACCAGAGATCCAAAACAATCA  197
            |.||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||.|||.|||.||||||||.||||
Sbjct  223  AGTGCATCAACCAAAGAAACCAATAACATTCCCAACCACAGAGTTCTCATTAGACCCGAGGTCCAAAACCATCA  296

Query  198  AAAAAACAAGGAAATGAGCAAAATTGAAGAAAAAAAGGCATTAGAAGCTGAAAAATATGGATTTCAGAAGGATG  271
            .||.||.||||||||.|||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||.|||.||||||||||||||.|
Sbjct  297  GAAGAATAAGGAAATCAGCAAAATTGAAGAAAAAAGGGCCTTAGAAGCTGAAAGATACGGATTTCAGAAGGACG  370

Query  272  GTCAAGATAGACCCTTAACAAAAATTAATAGTGTAAAGCTGAATTCTCTGCCATCTGAATATGAGAGTGGGTCA  345
            |.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||.||||.||.||||.|||.||||||||.||.|||.||
Sbjct  371  GGCAAGATAGACCATTAACAAAAATTAACAGTGTGAAGTTGAACTCCCTGCTATCAGAATATGAAAGCGGGCCA  444

Query  346  GCATGCCCTGCTCAGACTGTGCACTACAGACCAATCAACTTGAGCAGTTCAGAGAACAAAATAGTCAATGTTAG  419
            |..|||||..||||||.|||.|||||||||||.|||||..|||..|||||.||...||||...||.|||||.||
Sbjct  445  GACTGCCCACCTCAGAATGTACACTACAGACCCATCAATGTGAATAGTTCTGACGGCAAAGCGGTGAATGTCAG  518

Query  420  CCTGGCAGATCTTAGAGGTGGAAATCGCCCCAATACAGGGCCCTTATACACAGAGGCCGATCGAGTCATACAGA  493
            |.||||||||.|..|.|||||.|.||.|||.|||.||||||||.||..||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct  519  CTTGGCAGATGTCCGGGGTGGGAGTCACCCAAATGCAGGGCCCCTAGCCACAGAGGCCGACCGAGTCATTCAGA  592

Query  494  GAACAAATTCAATGCAGCAGTTGGAACAGTGGATTAAAATCCAGAAGGGGAGGGGTCATGAAGAAGAAACCAGG  567
            ||||.|||||||||||.|||.|.||.||||||||||||.|||||||.||..||||||.|||||||||..||||.
Sbjct  593  GAACGAATTCAATGCAACAGCTAGAGCAGTGGATTAAAGTCCAGAAAGGACGGGGTCTTGAAGAAGAGCCCAGA  666

Query  568  GGAGTAATTTCTTACCAAACATTACCAAGAAATATGCCAAGTCACAGAGCCCAGATTATGGCCCGCTACCCTGA  641
            ||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||..|||||||||.||||||
Sbjct  667  GGAGTAATTTCTTATCAAACATTGCCAAGAAATATGCCAAGCCACAGAGCCCAGATCCTGGCCCGCTGCCCTGA  740

Query  642  AGGTTATAGAACACTCCCAAGAAACAGCAAGACAAGGCCTGAAAGTATCTGCAGTGTAACCCCTTCCACTCATG  715
            ||||||..|.||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||.||||...|||||
Sbjct  741  AGGTTACCGGACACTCCCGAGAAACAGCAAGACCAGACCTGAGAGTATCTGCAGCGTAACCTCTTCTGGTCATG  814

Query  716  ACAAGACATTAGGACCCGGAGCGGAGGAGAAACGGAGGTCCATGAGAGATGACACAATGTGGCAGCTCTACGAA  789
            |.|||||   |||.||.|||||.||.|||||.|||.|.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.
Sbjct  815  AGAAGAC---AGGGCCGGGAGCAGAAGAGAAGCGGCGATCCATGAGAGATGACACCATGTGGCAGCTGTACGAG  885

Query  790  TGGCAGCAGCGTCAGTTTTATAACAAACAGAGCACCCTCCCTCGACACAGTACT--TTGAGTAGTCCCAAAACC  861
            |||||||||||.||||||||..||||.|||||||||||||||||.|||.|  ||  .||||.|||||||||.||
Sbjct  886  TGGCAGCAGCGCCAGTTTTACCACAAGCAGAGCACCCTCCCTCGGCACGG--CTGCCTGAGCAGTCCCAAAGCC  957

Query  862  ATGGTAAATATTTCTGACCAGACAATGCACTCTATTCCCACATCACCTTCCCACGGGTCAATAGCTGCTTATCA  935
            |||||..|..|.|||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||..|||||||||.||
Sbjct  958  ATGGTGCAGGTGTCTGACCAGACGATGCACTCCATCCCCACGTCACCTTCCCATGGGTCAGCAGCTGCTTACCA  1031

Query  936  GGGATACTCCCCTCAACGAACTTACAGATCGGAAGTGTCTTCACCAATTCAGAGAGGAGATGTGACAATAGACC  1009
            |||.|.|||||||||.||.||.|||||.||.||||||.|.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1032  GGGCTTCTCCCCTCAGCGGACGTACAGGTCAGAAGTGACCTCGCCCATCCAGAGAGGAGATGTGACGATAGACC  1105

Query 1010  GCAGACACAGGGCCCATCACCCTAAGCATGTCTATGTGCCTGACAGAAGGTCAGTGCCAGCTGGCCTGACTTTA  1083
            ||||.||||||.|.|||||||||||||||||||||||..||||||||||||||.|||||||||||.|.||||||
Sbjct 1106  GCAGGCACAGGCCTCATCACCCTAAGCATGTCTATGTAGCTGACAGAAGGTCAATGCCAGCTGGCTTAACTTTA  1179

Query 1084  CAGTCTGTTAGTCCCCAGAGCCTCCAAGGGAAAACG--------------------------------------  1119
            |||.|||||||||||||||||||||||||.|.||||                                      
Sbjct 1180  CAGGCTGTTAGTCCCCAGAGCCTCCAAGGCAGAACGCCAGAGGAGCTCACACTGCTGCTAATAAAGCTGAGACG  1253

Query 1120  --------------------------------------------------------------------------  1119
                                                                                      
Sbjct 1254  GCAGCAGGCAGAGCTGAGTAGTGTCCGGGAGCACACCTTAGCACAGCTCATGCAGCTGAAACTTGAGGCCCACA  1327

Query 1120  --------------------------------------------------------------------------  1119
                                                                                      
Sbjct 1328  GCCCAAAGAATGAGATTCTTTCACATCATCTCCAAAGGAACACCATATATTTGGATCATCAGATGAAAGAAAAT  1401

Query 1120  --------------------------------------------------------------------------  1119
                                                                                      
Sbjct 1402  GAACCTATTATCACCATGGTTCACACAATGATTGAGAACTCGGCGCTAAGACCACAACTGTACCAACAATTCTT  1475

Query 1120  -------------------------------CTGTCACAAGATGAAGGTAGAGGCACATTATACAAATACAGAC  1162
                                           |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1476  AAGACAGAAGAACAAGATAAGTCTCTATTGTCTGTCACAAGATGAATGTAGAGGCACATTATACAAATACAGAC  1549

Query 1163  CTGAAGAAGTAGATATTGATGCCAAGTTAAGCCGATTATGTGAACAAGATAAAGTGGTGCATGCTCTGGAAGAG  1236
            |||||||||.||.||||||||||||.||||||.||||.||||||||.|||||||||||.|..||.|||||.|||
Sbjct 1550  CTGAAGAAGCAGGTATTGATGCCAAATTAAGCAGATTGTGTGAACAGGATAAAGTGGTCCGAGCGCTGGAGGAG  1623

Query 1237  AAACTTCAGCAACTCCACAAGGAGAAATACACGCTTGAGCAAGCTTTGCTATCAGCCAGCCAAGAGATAGAAAT  1310
            ||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1624  AAGCTGCAGCAGCTGCACAAGGAGAAATACACGCTTGAGCAAGCCTTGCTGTCAGCCAGCCAAGAGATAGAGAT  1697

Query 1311  GCATGCAGATAACCCAGCAGCCATTCAGACAGTGGTGTTACAAAGGGATGATTTACAAAATGGACTGCTTAGTA  1384
            |.||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||.||.||||||||..|.|||||.||||||||.||.|
Sbjct 1698  GAATGCTGATAACCCAGCTGCCATTCAAACTGTGGTGTTGCAGAGGGATGACCTGCAAAACGGACTGCTGAGCA  1771

Query 1385  CGTGTCGAGAACTTTCTCGAGCCACTGCCGAATTGGAACGAGCATGGAGAGAATATGATAAGTTAGAATACGAT  1458
            |||||||.|||||.||.|||||||||||.||..||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||
Sbjct 1772  CGTGTCGGGAACTCTCCCGAGCCACTGCTGAGCTGGAACGAGCCTGGAGAGAATATGACAAGTTGGAATATGAT  1845

Query 1459  GTAACTGTTACCAGGAACCAGATGCAAGAGCAGCTGGATCACCTTGGTGAAGTTCAGACGGAATCAGCAGGAAT  1532
            ||.||||||||||||.||||||||||.|..|||||.||.|.||||||.|||||.||||..||.||.||||||||
Sbjct 1846  GTGACTGTTACCAGGGACCAGATGCAGGGTCAGCTCGACCGCCTTGGAGAAGTGCAGAGTGAGTCGGCAGGAAT  1919

Query 1533  TCAGCGTGCACAGATTCAGAAAGAACTTTGGCGAATTCAGGATGTCATGGAAGGGCTGAGTAAACATAAGCAGC  1606
            |||.||.|||||||||||.||.||.||.|||.|||||||.|||||||||||.|||.||||.|||||.||.||||
Sbjct 1920  TCAACGGGCACAGATTCAAAAGGAGCTCTGGAGAATTCAAGATGTCATGGAGGGGTTGAGCAAACACAAACAGC  1993

Query 1607  AAAGAGGTACTACAGAAA---TAGGTATGATAGGATCAAAGCCTTTCTCAACAGTTAAGTACAA----------  1667
            |||||||..||.||||||   |||||.||..|||||||||||||||||||.|||||||||||||          
Sbjct 1994  AAAGAGGCTCTTCAGAAACAGTAGGTCTGGCAGGATCAAAGCCTTTCTCATCAGTTAAGTACAAGAGCGAGGAA  2067

Query 1668  --------------------------------------------------------------------------  1667
                                                                                      
Sbjct 2068  GAGGAAGTAGTCCCACCTCGGCCTCCACTTCCTCGGTCTTATGACTTTACAGAGCAGCCTCCCATAATCCCCCC  2141

Query 1668  --------------------------------------------------------------------------  1667
                                                                                      
Sbjct 2142  TCTGCCCAGTGATAGCAGCTCCTTGCTCTGTTATAGCAGGGGCCCCGTGCATCTGCCTGAAGACAAGAAGATTC  2215

Query 1668  ----------------------AAATGAG----------GGTCCAGATTATAGACTCTACAAGAGTGAACCAGA  1709
                                  ||||| |          |||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 2216  ATCAAGTTCAAGGATATCCAAGAAATG-GATCTCACTGTGGTCCAGATTATAGACTCTACAAGAGTGAGCCAGA  2288

Query 1710  GTTAACAACAGTGGCAGAAGTTGATGAATCTAATGGAGAAGAAAAATCAGAACCTGTTTCAGAGATAGAAACTT  1783
            ||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||.||||.||.
Sbjct 2289  GTTAACCACAGTGGCAGAAGTCGATGAATCTAACGGAGAAGAAAAGTCAGAGCCAGTTTCTGAGACAGAAGCTC  2362

Query 1784  CAGTTGTTAAAGGTTCCCACTTTCCTGTTGGAGTAGTCCCTCCAAGAGCAAAATCACCAACACCCGAATCTTCG  1857
            ||||.||||||||||||||.|||||.||.||   |||.||||..|||.||||.|||||.||||||||.||.||.
Sbjct 2363  CAGTCGTTAAAGGTTCCCATTTTCCAGTCGG---AGTTCCTCTGAGAACAAAGTCACCCACACCCGAGTCCTCC  2433

Query 1858  ACAATAGCTTCCTATGTAACCTTGAGGAAAACTAAGAAGATGATGGATCTAAGAACGGAAAGACCAAGAAGTGC  1931
            ||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2434  ACGATAGCTTCCTATGTGACCTTGAGGAAGACTAAGAAGATGGTGGAGCTAAGAACGGAAAGACCAAGAAGTGC  2507

Query 1932  AGTGGAACAGCTCTGTTTGGCTGAAAGTACTCGACCAAGGATGACTGTGGAAGAGCAAATGGAAAGAATAAGAA  2005
            .|||||.|||||.|||.|||||||.|||.|||||||.||.|||||||||||||||||..|.||.||.||.||.|
Sbjct 2508  CGTGGAGCAGCTGTGTCTGGCTGAGAGTGCTCGACCTAGAATGACTGTGGAAGAGCAGCTAGAGAGGATCAGGA  2581

Query 2006  GACATCAACAAGCGTGCCTGAGGGAGAAGAAAAAAGGGTTAAATGTTATCGGTGCTTCAGACCAGTCACCCTTA  2079
            ||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||.|||.|.|.|||..||||||||||.||             
Sbjct 2582  GACACCAGCAGGCCTGCCTGAGGGAGAAGAAGAAGGGGCTGAGTGTCCTCGGTGCTTCCGA-------------  2642

Query 2080  CAAAGCCCTTCAAATTTAAGGGATAATCCATTTAGGACTACTCAGACTCGAAGGAGGGATGA------TAAGGA  2147
                 |||.|||.|..|.|||||.|.||||.|.|||..|||||||||||.||||||||||||      ||||||
Sbjct 2643  -----CCCGTCAGACGTGAGGGACAGTCCACTCAGGCTTACTCAGACTCTAAGGAGGGATGATAACGTTAAGGA  2711

Query 2148  ACTGGACACTG-CCATTAGAGAAAATGATGTAAAGCCAGACCATGAAACTCCTGCA--ACAGAAATTGT--TCA  2216
            .||.|||||.| ||| .||||||||||||||||||||||||.|.||.|||||.|||  ||||    |||  |||
Sbjct 2712  GCTAGACACCGTCCA-CAGAGAAAATGATGTAAAGCCAGACTACGAGACTCCAGCAGCACAG----TGTGCTCA  2780

Query 2217  ACTAAAAGAAACCGAACCCCAAAATGTGGACTTCAGCAAAGAGTTAAAAAAAACTGAAAACATTTCATATGAAA  2290
            .|||.||||..|.||||||||.||||..|||.||.|||.|.||.||||||               .||.|||||
Sbjct 2781  CCTAGAAGACGCTGAACCCCAGAATGCAGACATCGGCAGAAAGCTAAAAA---------------GATCTGAAA  2839

Query 2291  TGCTTTTTGAACCTGAGCCAAATGGAGTAAATTCTGTGGAAATGATGGATAAAGAAAGAAACAAAGACAAAATG  2364
            ||||||....||||||.|||||||||.|...|||||.||||.|||.|||.||.||||||.|.|||||..|..||
Sbjct 2840  TGCTTTACACACCTGAACCAAATGGAATGGCTTCTGAGGAAGTGACGGAGAAGGAAAGACAGAAAGAGCAGGTG  2913

Query 2365  CCTGAGGATGTTACATTCAGCCCTCAAGATGAAAC-------ACAGACCGCAAATCATAAACCAGAAGAGCATC  2431
            |.||..||||...|||.|||||||||.||.||.||       |||||.|    ||||.|   ..||||..|..|
Sbjct 2914  CATGCCGATGGGTCATGCAGCCCTCAGGAAGAGACGGCCATGACAGAGC----ATCAGA---TGGAAGGCCCCC  2980

Query 2432  CTGAAGAAAATACAAAGAACAGTGTTGACGAACAGGAAGAAACTGTTATTTCTTACGAATCAACTCCTGAGGTT  2505
            ||||.|||   .||.||   |||.||.|.||..|||||||||||.||..|||.|..||..||.||||||||.||
Sbjct 2981  CTGAGGAA---GCAGAG---AGTCTTCATGAGGAGGAAGAAACTCTTGCTTCCTGTGAGCCAGCTCCTGAGATT  3048

Query 2506  TCTAGAGGA-AATCAAACAATGGCAGTGAAAAGTCTGTCCCCATCTCCTGAGTCCT---CGGCATCGCCAGTTC  2575
            .|||| ||| ||||||||.|   ||||||.||||||||||||.||||||||.||||   |||||   .|||.||
Sbjct 3049  CCTAG-GGAGAATCAAACCA---CAGTGAGAAGTCTGTCCCCGTCTCCTGACTCCTCCACGGCA---GCAGATC  3115

Query 2576  CATCCACTCAGCCGCAGCTCACAGAAGGATCACATTTCATGTGTGTG  2622
            |..||||||..||.|||||||..||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 3116  CGCCCACTCCTCCACAGCTCAGGGAAGGATCGCATTTCATGTGTGTG  3162