Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_12044
Subject:
XM_006506886.2
Aligned Length:
1056
Identities:
711
Gaps:
198

Alignment

Query    1  -------------------MRTYYFCTDTGKEMELWMKAMLDAALVQTEPVKRVDKITSENAPTKETNNIPNHR  55
                               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||...|.|||||||||||
Sbjct    1  MTAFLDVESAPVGMAAHPNMRTYYFCTDTGKEMELWMKAMLDAALVQTEPVKRVDKITTDSASTKETNNIPNHR  74

Query   56  VLIKPEIQNNQKNKEMSKIEEKKALEAEKYGFQKDGQDRPLTKINSVKLNSLPSEYESGSACPAQTVHYRPINL  129
            |||.||.||.|||||.||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||..||.|.|||||||.
Sbjct   75  VLIRPEVQNHQKNKEISKIEEKRALEAERYGFQKDGQDRPLTKINSVKLNSLLSEYESGPDCPPQNVHYRPINV  148

Query  130  SSSENKIVNVSLADLRGGNRPNTGPLYTEADRVIQRTNSMQQLEQWIKIQKGRGHEEETRGVISYQTLPRNMPS  203
            .||..|.|||||||.|||..||.|||.|||||||||||||||||||||.|||||.|||.|||||||||||||||
Sbjct  149  NSSDGKAVNVSLADVRGGSHPNAGPLATEADRVIQRTNSMQQLEQWIKVQKGRGLEEEPRGVISYQTLPRNMPS  222

Query  204  HRAQIMARYPEGYRTLPRNSKTRPESICSVTPSTHDKTLGPGAEEKRRSMRDDTMWQLYEWQQRQFYNKQSTLP  277
            |||||.||.||||||||||||||||||||||.|.|.|| ||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  223  HRAQILARCPEGYRTLPRNSKTRPESICSVTSSGHEKT-GPGAEEKRRSMRDDTMWQLYEWQQRQFYHKQSTLP  295

Query  278  RHSTLSSPKTMVNISDQTMHSIPTSPSHGSIAAYQGYSPQRTYRSEVSSPIQRGDVTIDRRHRAHHPKHVYVPD  351
            ||..|||||.||..||||||||||||||||.|||||.||||||||||.|||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct  296  RHGCLSSPKAMVQVSDQTMHSIPTSPSHGSAAAYQGFSPQRTYRSEVTSPIQRGDVTIDRRHRPHHPKHVYVAD  369

Query  352  RRSVPAGLTLQSVSPQSLQGKT----------------------------------------------------  373
            |||.|||||||.||||||||.|                                                    
Sbjct  370  RRSMPAGLTLQAVSPQSLQGRTPEELTLLLIKLRRQQAELSSVREHTLAQLMQLKLEAHSPKNEILSHHLQRNT  443

Query  374  ---------------------------------------------LSQDEGRGTLYKYRPEEVDIDAKLSRLCE  402
                                                         |||||.|||||||||||..||||||||||
Sbjct  444  IYLDHQMKENEPIITMVHTMIENSALRPQLYQQFLRQKNKISLYCLSQDECRGTLYKYRPEEAGIDAKLSRLCE  517

Query  403  QDKVVHALEEKLQQLHKEKYTLEQALLSASQEIEMHADNPAAIQTVVLQRDDLQNGLLSTCRELSRATAELERA  476
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  518  QDKVVRALEEKLQQLHKEKYTLEQALLSASQEIEMNADNPAAIQTVVLQRDDLQNGLLSTCRELSRATAELERA  591

Query  477  WREYDKLEYDVTVTRNQMQEQLDHLGEVQTESAGIQRAQIQKELWRIQDVMEGLSKHKQQRGTTE-IGMIGSKP  549
            |||||||||||||||.|||.|||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||..| .|..||||
Sbjct  592  WREYDKLEYDVTVTRDQMQGQLDRLGEVQSESAGIQRAQIQKELWRIQDVMEGLSKHKQQRGSSETVGLAGSKP  665

Query  550  FSTVKYKNE---------------------------------------------------------------GP  560
            ||.||||.|                                                               ||
Sbjct  666  FSSVKYKSEEEEVVPPRPPLPRSYDFTEQPPIIPPLPSDSSSLLCYSRGPVHLPEDKKIHQVQGYPRNGSHCGP  739

Query  561  DYRLYKSEPELTTVAEVDESNGEEKSEPVSEIETSVVKGSHFPVGVVPPRAKSPTPESSTIASYVTLRKTKKMM  634
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|..|||||||||| ||.|.||||||||||||||||||||||.
Sbjct  740  DYRLYKSEPELTTVAEVDESNGEEKSEPVSETEAPVVKGSHFPVG-VPLRTKSPTPESSTIASYVTLRKTKKMV  812

Query  635  DLRTERPRSAVEQLCLAESTRPRMTVEEQMERIRRHQQACLREKKKGLNVIGASDQSPLQSPSNLRDNPFRTTQ  708
            .||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||.|.||||      ||..||.|.|.||
Sbjct  813  ELRTERPRSAVEQLCLAESARPRMTVEEQLERIRRHQQACLREKKKGLSVLGASD------PSDVRDSPLRLTQ  880

Query  709  TRRRDD--KELDTAIRENDVKPDHETPATEIVQLKETEPQNVDFSKELKKTENISYEMLFEPEPNGVNSVEMMD  780
            |.||||  |||||..||||||||.||||.....|...||||.|....||..     |||..|||||..|.|...
Sbjct  881  TLRRDDNVKELDTVHRENDVKPDYETPAAQCAHLEDAEPQNADIGRKLKRS-----EMLYTPEPNGMASEEVTE  949

Query  781  KERNKDKMPEDVTFSPQDETQTANHKPEEHPEENTKNSVDEQEETVISYESTPEVSRGNQTMAVKSLSPSPESS  854
            |||.|.....|...|||.||....|..|..|||  ..|..|.|||..|.|..||..|.||| .|.||||||.||
Sbjct  950  KERQKEQVHADGSCSPQEETAMTEHQMEGPPEE--AESLHEEEETLASCEPAPEIPRENQT-TVRSLSPSPDSS  1020

Query  855  ASPVPSTQPQLTEGSHFMCV  874
            ....|.|.|||.||||||||
Sbjct 1021  TAADPPTPPQLREGSHFMCV  1040