Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12044
• Subject: XM_006506888.2
• Aligned Length: 1043
• Identities: 698
• Gaps: 198

Alignment

Query    1  MRTYYFCTDTGKEMELWMKAMLDAALVQTEPVK------RVDKITSENAPTKETNNIPNHRVLIKPEIQNNQKN  68
                         ||||||||||||||||||||      ||||||...|.||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct    1  -------------MELWMKAMLDAALVQTEPVKRITFNFRVDKITTDSASTKETNNIPNHRVLIRPEVQNHQKN  61

Query   69  KEMSKIEEKKALEAEKYGFQKDGQDRPLTKINSVKLNSLPSEYESGSACPAQTVHYRPINLSSSENKIVNVSLA  142
            ||.||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||..||.|.|||||||..||..|.||||||
Sbjct   62  KEISKIEEKRALEAERYGFQKDGQDRPLTKINSVKLNSLLSEYESGPDCPPQNVHYRPINVNSSDGKAVNVSLA  135

Query  143  DLRGGNRPNTGPLYTEADRVIQRTNSMQQLEQWIKIQKGRGHEEETRGVISYQTLPRNMPSHRAQIMARYPEGY  216
            |.|||..||.|||.|||||||||||||||||||||.|||||.|||.||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct  136  DVRGGSHPNAGPLATEADRVIQRTNSMQQLEQWIKVQKGRGLEEEPRGVISYQTLPRNMPSHRAQILARCPEGY  209

Query  217  RTLPRNSKTRPESICSVTPSTHDKTLGPGAEEKRRSMRDDTMWQLYEWQQRQFYNKQSTLPRHSTLSSPKTMVN  290
            ||||||||||||||||||.|.|.|| ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||..|||||.||.
Sbjct  210  RTLPRNSKTRPESICSVTSSGHEKT-GPGAEEKRRSMRDDTMWQLYEWQQRQFYHKQSTLPRHGCLSSPKAMVQ  282

Query  291  ISDQTMHSIPTSPSHGSIAAYQGYSPQRTYRSEVSSPIQRGDVTIDRRHRAHHPKHVYVPDRRSVPAGLTLQSV  364
            .||||||||||||||||.|||||.||||||||||.|||||||||||||||.||||||||.||||.|||||||.|
Sbjct  283  VSDQTMHSIPTSPSHGSAAAYQGFSPQRTYRSEVTSPIQRGDVTIDRRHRPHHPKHVYVADRRSMPAGLTLQAV  356

Query  365  SPQSLQGKT-----------------------------------------------------------------  373
            |||||||.|                                                                 
Sbjct  357  SPQSLQGRTPEELTLLLIKLRRQQAELSSVREHTLAQLMQLKLEAHSPKNEILSHHLQRNTIYLDHQMKENEPI  430

Query  374  --------------------------------LSQDEGRGTLYKYRPEEVDIDAKLSRLCEQDKVVHALEEKLQ  415
                                            |||||.|||||||||||..|||||||||||||||.|||||||
Sbjct  431  ITMVHTMIENSALRPQLYQQFLRQKNKISLYCLSQDECRGTLYKYRPEEAGIDAKLSRLCEQDKVVRALEEKLQ  504

Query  416  QLHKEKYTLEQALLSASQEIEMHADNPAAIQTVVLQRDDLQNGLLSTCRELSRATAELERAWREYDKLEYDVTV  489
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  505  QLHKEKYTLEQALLSASQEIEMNADNPAAIQTVVLQRDDLQNGLLSTCRELSRATAELERAWREYDKLEYDVTV  578

Query  490  TRNQMQEQLDHLGEVQTESAGIQRAQIQKELWRIQDVMEGLSKHKQQRGTTE-IGMIGSKPFSTVKYKNE----  558
            ||.|||.|||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||..| .|..||||||.||||.|    
Sbjct  579  TRDQMQGQLDRLGEVQSESAGIQRAQIQKELWRIQDVMEGLSKHKQQRGSSETVGLAGSKPFSSVKYKSEEEEV  652

Query  559  -----------------------------------------------------------GPDYRLYKSEPELTT  573
                                                                       |||||||||||||||
Sbjct  653  VPPRPPLPRSYDFTEQPPIIPPLPSDSSSLLCYSRGPVHLPEDKKIHQVQGYPRNGSHCGPDYRLYKSEPELTT  726

Query  574  VAEVDESNGEEKSEPVSEIETSVVKGSHFPVGVVPPRAKSPTPESSTIASYVTLRKTKKMMDLRTERPRSAVEQ  647
            ||||||||||||||||||.|..|||||||||| ||.|.||||||||||||||||||||||..||||||||||||
Sbjct  727  VAEVDESNGEEKSEPVSETEAPVVKGSHFPVG-VPLRTKSPTPESSTIASYVTLRKTKKMVELRTERPRSAVEQ  799

Query  648  LCLAESTRPRMTVEEQMERIRRHQQACLREKKKGLNVIGASDQSPLQSPSNLRDNPFRTTQTRRRDD--KELDT  719
            ||||||.|||||||||.||||||||||||||||||.|.||||      ||..||.|.|.|||.||||  |||||
Sbjct  800  LCLAESARPRMTVEEQLERIRRHQQACLREKKKGLSVLGASD------PSDVRDSPLRLTQTLRRDDNVKELDT  867

Query  720  AIRENDVKPDHETPATEIVQLKETEPQNVDFSKELKKTENISYEMLFEPEPNGVNSVEMMDKERNKDKMPEDVT  793
            ..||||||||.||||.....|...||||.|....||..     |||..|||||..|.|...|||.|.....|..
Sbjct  868  VHRENDVKPDYETPAAQCAHLEDAEPQNADIGRKLKRS-----EMLYTPEPNGMASEEVTEKERQKEQVHADGS  936

Query  794  FSPQDETQTANHKPEEHPEENTKNSVDEQEETVISYESTPEVSRGNQTMAVKSLSPSPESSASPVPSTQPQLTE  867
            .|||.||....|..|..|||  ..|..|.|||..|.|..||..|.||| .|.||||||.||....|.|.|||.|
Sbjct  937  CSPQEETAMTEHQMEGPPEE--AESLHEEEETLASCEPAPEIPRENQT-TVRSLSPSPDSSTAADPPTPPQLRE  1007

Query  868  GSHFMCV  874
            |||||||
Sbjct 1008  GSHFMCV  1014