Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12044
- Subject:
- XM_006506889.2
- Aligned Length:
- 3130
- Identities:
- 2117
- Gaps:
- 614
Alignment
Query 1 ATGCGGACCTATTATTTCTGCACTGATACAGGAAAGGAAATGGAGTTGTGGATGAAAGCCATGTTAGATGCTGC 74
||||||.||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1 ---------------------------------------ATGGAGCTGTGGATGAAGGCCATGTTAGATGCTGC 35
Query 75 CCTAGTACAGACAGAACCTGTGAAAAGAGTGGACAAGATTACATCTGAAAATGCACCAACTAAAGAAACCAATA 148
.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|.||||.||||.|||||||||||||
Sbjct 36 TCTGGTGCAGACAGAACCTGTGAAAAGAGTGGACAAGATTACAACTGACAGTGCATCAACCAAAGAAACCAATA 109
Query 149 ACATTCCCAACCATAGAGTGCTAATTAAACCAGAGATCCAAAACAATCAAAAAAACAAGGAAATGAGCAAAATT 222
|||||||||||||.|||||.||.||||.|||.|||.||||||||.||||.||.||.||||||||.|||||||||
Sbjct 110 ACATTCCCAACCACAGAGTTCTCATTAGACCCGAGGTCCAAAACCATCAGAAGAATAAGGAAATCAGCAAAATT 183
Query 223 GAAGAAAAAAAGGCATTAGAAGCTGAAAAATATGGATTTCAGAAGGATGGTCAAGATAGACCCTTAACAAAAAT 296
||||||||||.|||.|||||||||||||.|||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 184 GAAGAAAAAAGGGCCTTAGAAGCTGAAAGATACGGATTTCAGAAGGACGGGCAAGATAGACCATTAACAAAAAT 257
Query 297 TAATAGTGTAAAGCTGAATTCTCTGCCATCTGAATATGAGAGTGGGTCAGCATGCCCTGCTCAGACTGTGCACT 370
|||.|||||.|||.||||.||.||||.|||.||||||||.||.|||.|||..|||||..||||||.|||.||||
Sbjct 258 TAACAGTGTGAAGTTGAACTCCCTGCTATCAGAATATGAAAGCGGGCCAGACTGCCCACCTCAGAATGTACACT 331
Query 371 ACAGACCAATCAACTTGAGCAGTTCAGAGAACAAAATAGTCAATGTTAGCCTGGCAGATCTTAGAGGTGGAAAT 444
|||||||.|||||..|||..|||||.||...||||...||.|||||.|||.||||||||.|..|.|||||.|.|
Sbjct 332 ACAGACCCATCAATGTGAATAGTTCTGACGGCAAAGCGGTGAATGTCAGCTTGGCAGATGTCCGGGGTGGGAGT 405
Query 445 CGCCCCAATACAGGGCCCTTATACACAGAGGCCGATCGAGTCATACAGAGAACAAATTCAATGCAGCAGTTGGA 518
|.|||.|||.||||||||.||..||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.|||.|.||
Sbjct 406 CACCCAAATGCAGGGCCCCTAGCCACAGAGGCCGACCGAGTCATTCAGAGAACGAATTCAATGCAACAGCTAGA 479
Query 519 ACAGTGGATTAAAATCCAGAAGGGGAGGGGTCATGAAGAAGAAACCAGGGGAGTAATTTCTTACCAAACATTAC 592
.||||||||||||.|||||||.||..||||||.|||||||||..||||.||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 480 GCAGTGGATTAAAGTCCAGAAAGGACGGGGTCTTGAAGAAGAGCCCAGAGGAGTAATTTCTTATCAAACATTGC 553
Query 593 CAAGAAATATGCCAAGTCACAGAGCCCAGATTATGGCCCGCTACCCTGAAGGTTATAGAACACTCCCAAGAAAC 666
||||||||||||||||.||||||||||||||..|||||||||.||||||||||||..|.||||||||.||||||
Sbjct 554 CAAGAAATATGCCAAGCCACAGAGCCCAGATCCTGGCCCGCTGCCCTGAAGGTTACCGGACACTCCCGAGAAAC 627
Query 667 AGCAAGACAAGGCCTGAAAGTATCTGCAGTGTAACCCCTTCCACTCATGACAAGACATTAGGACCCGGAGCGGA 740
||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||.||||...||||||.||||| |||.||.|||||.||
Sbjct 628 AGCAAGACCAGACCTGAGAGTATCTGCAGCGTAACCTCTTCTGGTCATGAGAAGAC---AGGGCCGGGAGCAGA 698
Query 741 GGAGAAACGGAGGTCCATGAGAGATGACACAATGTGGCAGCTCTACGAATGGCAGCAGCGTCAGTTTTATAACA 814
.|||||.|||.|.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||..|||
Sbjct 699 AGAGAAGCGGCGATCCATGAGAGATGACACCATGTGGCAGCTGTACGAGTGGCAGCAGCGCCAGTTTTACCACA 772
Query 815 AACAGAGCACCCTCCCTCGACACAGTACT--TTGAGTAGTCCCAAAACCATGGTAAATATTTCTGACCAGACAA 886
|.|||||||||||||||||.|||.| || .||||.|||||||||.|||||||..|..|.|||||||||||.|
Sbjct 773 AGCAGAGCACCCTCCCTCGGCACGG--CTGCCTGAGCAGTCCCAAAGCCATGGTGCAGGTGTCTGACCAGACGA 844
Query 887 TGCACTCTATTCCCACATCACCTTCCCACGGGTCAATAGCTGCTTATCAGGGATACTCCCCTCAACGAACTTAC 960
|||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||..|||||||||.|||||.|.|||||||||.||.||.|||
Sbjct 845 TGCACTCCATCCCCACGTCACCTTCCCATGGGTCAGCAGCTGCTTACCAGGGCTTCTCCCCTCAGCGGACGTAC 918
Query 961 AGATCGGAAGTGTCTTCACCAATTCAGAGAGGAGATGTGACAATAGACCGCAGACACAGGGCCCATCACCCTAA 1034
||.||.||||||.|.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||.|.|||||||||||
Sbjct 919 AGGTCAGAAGTGACCTCGCCCATCCAGAGAGGAGATGTGACGATAGACCGCAGGCACAGGCCTCATCACCCTAA 992
Query 1035 GCATGTCTATGTGCCTGACAGAAGGTCAGTGCCAGCTGGCCTGACTTTACAGTCTGTTAGTCCCCAGAGCCTCC 1108
||||||||||||..||||||||||||||.|||||||||||.|.|||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 993 GCATGTCTATGTAGCTGACAGAAGGTCAATGCCAGCTGGCTTAACTTTACAGGCTGTTAGTCCCCAGAGCCTCC 1066
Query 1109 AAGGGAAAACG--------------------------------------------------------------- 1119
||||.|.||||
Sbjct 1067 AAGGCAGAACGCCAGAGGAGCTCACACTGCTGCTAATAAAGCTGAGACGGCAGCAGGCAGAGCTGAGTAGTGTC 1140
Query 1120 -------------------------------------------------------------------------- 1119
Sbjct 1141 CGGGAGCACACCTTAGCACAGCTCATGCAGCTGAAACTTGAGGCCCACAGCCCAAAGAATGAGATTCTTTCACA 1214
Query 1120 -------------------------------------------------------------------------- 1119
Sbjct 1215 TCATCTCCAAAGGAACACCATATATTTGGATCATCAGATGAAAGAAAATGAACCTATTATCACCATGGTTCACA 1288
Query 1120 -------------------------------------------------------------------------- 1119
Sbjct 1289 CAATGATTGAGAACTCGGCGCTAAGACCACAACTGTACCAACAATTCTTAAGACAGAAGAACAAGATAAGTCTC 1362
Query 1120 ------CTGTCACAAGATGAAGGTAGAGGCACATTATACAAATACAGACCTGAAGAAGTAGATATTGATGCCAA 1187
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 1363 TATTGTCTGTCACAAGATGAATGTAGAGGCACATTATACAAATACAGACCTGAAGAAGCAGGTATTGATGCCAA 1436
Query 1188 GTTAAGCCGATTATGTGAACAAGATAAAGTGGTGCATGCTCTGGAAGAGAAACTTCAGCAACTCCACAAGGAGA 1261
.||||||.||||.||||||||.|||||||||||.|..||.|||||.|||||.||.|||||.||.||||||||||
Sbjct 1437 ATTAAGCAGATTGTGTGAACAGGATAAAGTGGTCCGAGCGCTGGAGGAGAAGCTGCAGCAGCTGCACAAGGAGA 1510
Query 1262 AATACACGCTTGAGCAAGCTTTGCTATCAGCCAGCCAAGAGATAGAAATGCATGCAGATAACCCAGCAGCCATT 1335
|||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||.||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1511 AATACACGCTTGAGCAAGCCTTGCTGTCAGCCAGCCAAGAGATAGAGATGAATGCTGATAACCCAGCTGCCATT 1584
Query 1336 CAGACAGTGGTGTTACAAAGGGATGATTTACAAAATGGACTGCTTAGTACGTGTCGAGAACTTTCTCGAGCCAC 1409
||.||.||||||||.||.||||||||..|.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||||||
Sbjct 1585 CAAACTGTGGTGTTGCAGAGGGATGACCTGCAAAACGGACTGCTGAGCACGTGTCGGGAACTCTCCCGAGCCAC 1658
Query 1410 TGCCGAATTGGAACGAGCATGGAGAGAATATGATAAGTTAGAATACGATGTAACTGTTACCAGGAACCAGATGC 1483
|||.||..||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1659 TGCTGAGCTGGAACGAGCCTGGAGAGAATATGACAAGTTGGAATATGATGTGACTGTTACCAGGGACCAGATGC 1732
Query 1484 AAGAGCAGCTGGATCACCTTGGTGAAGTTCAGACGGAATCAGCAGGAATTCAGCGTGCACAGATTCAGAAAGAA 1557
|.|..|||||.||.|.||||||.|||||.||||..||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||.
Sbjct 1733 AGGGTCAGCTCGACCGCCTTGGAGAAGTGCAGAGTGAGTCGGCAGGAATTCAACGGGCACAGATTCAAAAGGAG 1806
Query 1558 CTTTGGCGAATTCAGGATGTCATGGAAGGGCTGAGTAAACATAAGCAGCAAAGAGGTACTACAGAAA---TAGG 1628
||.|||.|||||||.|||||||||||.|||.||||.|||||.||.|||||||||||..||.|||||| ||||
Sbjct 1807 CTCTGGAGAATTCAAGATGTCATGGAGGGGTTGAGCAAACACAAACAGCAAAGAGGCTCTTCAGAAACAGTAGG 1880
Query 1629 TATGATAGGATCAAAGCCTTTCTCAACAGTTAAGTACAA----------------------------------- 1667
|.||..|||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1881 TCTGGCAGGATCAAAGCCTTTCTCATCAGTTAAGTACAAGAGCGAGGAAGAGGAAGTAGTCCCACCTCGGCCTC 1954
Query 1668 -------------------------------------------------------------------------- 1667
Sbjct 1955 CACTTCCTCGGTCTTATGACTTTACAGAGCAGCCTCCCATAATCCCCCCTCTGCCCAGTGATAGCAGCTCCTTG 2028
Query 1668 -----------------------------------------------------------------------AAA 1670
|||
Sbjct 2029 CTCTGTTATAGCAGGGGCCCCGTGCATCTGCCTGAAGACAAGAAGATTCATCAAGTTCAAGGATATCCAAGAAA 2102
Query 1671 TGAG----------GGTCCAGATTATAGACTCTACAAGAGTGAACCAGAGTTAACAACAGTGGCAGAAGTTGAT 1734
|| | |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 2103 TG-GATCTCACTGTGGTCCAGATTATAGACTCTACAAGAGTGAGCCAGAGTTAACCACAGTGGCAGAAGTCGAT 2175
Query 1735 GAATCTAATGGAGAAGAAAAATCAGAACCTGTTTCAGAGATAGAAACTTCAGTTGTTAAAGGTTCCCACTTTCC 1808
||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||.||||.||.||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 2176 GAATCTAACGGAGAAGAAAAGTCAGAGCCAGTTTCTGAGACAGAAGCTCCAGTCGTTAAAGGTTCCCATTTTCC 2249
Query 1809 TGTTGGAGTAGTCCCTCCAAGAGCAAAATCACCAACACCCGAATCTTCGACAATAGCTTCCTATGTAACCTTGA 1882
.||.|| |||.||||..|||.||||.|||||.||||||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 2250 AGTCGG---AGTTCCTCTGAGAACAAAGTCACCCACACCCGAGTCCTCCACGATAGCTTCCTATGTGACCTTGA 2320
Query 1883 GGAAAACTAAGAAGATGATGGATCTAAGAACGGAAAGACCAAGAAGTGCAGTGGAACAGCTCTGTTTGGCTGAA 1956
||||.||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||.|||||||.
Sbjct 2321 GGAAGACTAAGAAGATGGTGGAGCTAAGAACGGAAAGACCAAGAAGTGCCGTGGAGCAGCTGTGTCTGGCTGAG 2394
Query 1957 AGTACTCGACCAAGGATGACTGTGGAAGAGCAAATGGAAAGAATAAGAAGACATCAACAAGCGTGCCTGAGGGA 2030
|||.|||||||.||.|||||||||||||||||..|.||.||.||.||.|||||.||.||.||.|||||||||||
Sbjct 2395 AGTGCTCGACCTAGAATGACTGTGGAAGAGCAGCTAGAGAGGATCAGGAGACACCAGCAGGCCTGCCTGAGGGA 2468
Query 2031 GAAGAAAAAAGGGTTAAATGTTATCGGTGCTTCAGACCAGTCACCCTTACAAAGCCCTTCAAATTTAAGGGATA 2104
||||||.||.|||.|.|.|||..||||||||||.|| |||.|||.|..|.|||||.|
Sbjct 2469 GAAGAAGAAGGGGCTGAGTGTCCTCGGTGCTTCCGA------------------CCCGTCAGACGTGAGGGACA 2524
Query 2105 ATCCATTTAGGACTACTCAGACTCGAAGGAGGGATGA------TAAGGAACTGGACACTG-CCATTAGAGAAAA 2171
.||||.|.|||..|||||||||||.|||||||||||| ||||||.||.|||||.| ||| .||||||||
Sbjct 2525 GTCCACTCAGGCTTACTCAGACTCTAAGGAGGGATGATAACGTTAAGGAGCTAGACACCGTCCA-CAGAGAAAA 2597
Query 2172 TGATGTAAAGCCAGACCATGAAACTCCTGCA--ACAGAAATTGT--TCAACTAAAAGAAACCGAACCCCAAAAT 2241
||||||||||||||||.|.||.|||||.||| |||| ||| |||.|||.||||..|.||||||||.|||
Sbjct 2598 TGATGTAAAGCCAGACTACGAGACTCCAGCAGCACAG----TGTGCTCACCTAGAAGACGCTGAACCCCAGAAT 2667
Query 2242 GTGGACTTCAGCAAAGAGTTAAAAAAAACTGAAAACATTTCATATGAAATGCTTTTTGAACCTGAGCCAAATGG 2315
|..|||.||.|||.|.||.|||||| .||.|||||||||||....||||||.||||||||
Sbjct 2668 GCAGACATCGGCAGAAAGCTAAAAA---------------GATCTGAAATGCTTTACACACCTGAACCAAATGG 2726
Query 2316 AGTAAATTCTGTGGAAATGATGGATAAAGAAAGAAACAAAGACAAAATGCCTGAGGATGTTACATTCAGCCCTC 2389
|.|...|||||.||||.|||.|||.||.||||||.|.|||||..|..|||.||..||||...|||.||||||||
Sbjct 2727 AATGGCTTCTGAGGAAGTGACGGAGAAGGAAAGACAGAAAGAGCAGGTGCATGCCGATGGGTCATGCAGCCCTC 2800
Query 2390 AAGATGAAAC-------ACAGACCGCAAATCATAAACCAGAAGAGCATCCTGAAGAAAATACAAAGAACAGTGT 2456
|.||.||.|| |||||.| ||||.| ..||||..|..|||||.||| .||.|| |||.|
Sbjct 2801 AGGAAGAGACGGCCATGACAGAGC----ATCAGA---TGGAAGGCCCCCCTGAGGAA---GCAGAG---AGTCT 2861
Query 2457 TGACGAACAGGAAGAAACTGTTATTTCTTACGAATCAACTCCTGAGGTTTCTAGAGGA-AATCAAACAATGGCA 2529
|.|.||..|||||||||||.||..|||.|..||..||.||||||||.||.|||| ||| ||||||||.| ||
Sbjct 2862 TCATGAGGAGGAAGAAACTCTTGCTTCCTGTGAGCCAGCTCCTGAGATTCCTAG-GGAGAATCAAACCA---CA 2931
Query 2530 GTGAAAAGTCTGTCCCCATCTCCTGAGTCCT---CGGCATCGCCAGTTCCATCCACTCAGCCGCAGCTCACAGA 2600
||||.||||||||||||.||||||||.|||| ||||| .|||.|||..||||||..||.|||||||..||
Sbjct 2932 GTGAGAAGTCTGTCCCCGTCTCCTGACTCCTCCACGGCA---GCAGATCCGCCCACTCCTCCACAGCTCAGGGA 3002
Query 2601 AGGATCACATTTCATGTGTGTG 2622
||||||.|||||||||||||||
Sbjct 3003 AGGATCGCATTTCATGTGTGTG 3024