Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12044
- Subject:
- XM_011520714.1
- Aligned Length:
- 3792
- Identities:
- 2622
- Gaps:
- 1170
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCGGCGGATCTGAACCTGGAGTGGATCTCCCTGCCCCGGTCCTGGACTTACGGGATCACCAGGGGCGGCCG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 AGTCTTCTTCATCAACGAGGAGGCCAAGAGCACCACCTGGCTGCACCCCGTCACCGGCGAGGCGGTGGTCACCG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 GACACCGGCGGCAGAGCACAGATTTGCCTACTGGCTGGGAAGAAGCATATACTTTTGAAGGTGCAAGATACTAT 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 ATAAACCATAATGAAAGGAAAGTGACCTGCAAACATCCAGTCACAGGACAACCATCACAGGACAATTGTATTTT 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 TGTAGTGAATGAACAGACTGTTGCAACCATGACATCTGAAGAAAAGAAGGAACGGCCAATAAGTATGATAAATG 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 AAGCTTCTAACTATAACGTGACTTCAGATTATGCAGTGCATCCAATGAGCCCTGTAGGCAGAACTTCACGAGCT 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 TCAAAAAAAGTTCATAATTTTGGAAAGAGGTCAAATTCAATTAAAAGGAATCCTAATGCACCGGTTGTCAGACG 518
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 519 AGGTTGGCTTTATAAACAGGACAGTACTGGCATGAAATTGTGGAAGAAACGCTGGTTTGTGCTTTCTGACCTTT 592
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 593 GCCTCTTTTATTATAGAGATGAGAAAGAAGAGGGTATCCTGGGAAGCATACTGTTACCTAGTTTTCAGATAGCT 666
Query 1 ------------------------------------------------------------ATGCGGACCTATTA 14
||||||||||||||
Sbjct 667 TTGCTTACCTCTGAAGATCACATTAATCGCAAATATGCTTTTAAGGCAGCCCATCCAAACATGCGGACCTATTA 740
Query 15 TTTCTGCACTGATACAGGAAAGGAAATGGAGTTGTGGATGAAAGCCATGTTAGATGCTGCCCTAGTACAGACAG 88
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TTTCTGCACTGATACAGGAAAGGAAATGGAGTTGTGGATGAAAGCCATGTTAGATGCTGCCCTAGTACAGACAG 814
Query 89 AACCTGTGAAAAGAGTGGACAAGATTACATCTGAAAATGCACCAACTAAAGAAACCAATAACATTCCCAACCAT 162
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AACCTGTGAAAAGAGTGGACAAGATTACATCTGAAAATGCACCAACTAAAGAAACCAATAACATTCCCAACCAT 888
Query 163 AGAGTGCTAATTAAACCAGAGATCCAAAACAATCAAAAAAACAAGGAAATGAGCAAAATTGAAGAAAAAAAGGC 236
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AGAGTGCTAATTAAACCAGAGATCCAAAACAATCAAAAAAACAAGGAAATGAGCAAAATTGAAGAAAAAAAGGC 962
Query 237 ATTAGAAGCTGAAAAATATGGATTTCAGAAGGATGGTCAAGATAGACCCTTAACAAAAATTAATAGTGTAAAGC 310
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ATTAGAAGCTGAAAAATATGGATTTCAGAAGGATGGTCAAGATAGACCCTTAACAAAAATTAATAGTGTAAAGC 1036
Query 311 TGAATTCTCTGCCATCTGAATATGAGAGTGGGTCAGCATGCCCTGCTCAGACTGTGCACTACAGACCAATCAAC 384
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TGAATTCTCTGCCATCTGAATATGAGAGTGGGTCAGCATGCCCTGCTCAGACTGTGCACTACAGACCAATCAAC 1110
Query 385 TTGAGCAGTTCAGAGAACAAAATAGTCAATGTTAGCCTGGCAGATCTTAGAGGTGGAAATCGCCCCAATACAGG 458
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TTGAGCAGTTCAGAGAACAAAATAGTCAATGTTAGCCTGGCAGATCTTAGAGGTGGAAATCGCCCCAATACAGG 1184
Query 459 GCCCTTATACACAGAGGCCGATCGAGTCATACAGAGAACAAATTCAATGCAGCAGTTGGAACAGTGGATTAAAA 532
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GCCCTTATACACAGAGGCCGATCGAGTCATACAGAGAACAAATTCAATGCAGCAGTTGGAACAGTGGATTAAAA 1258
Query 533 TCCAGAAGGGGAGGGGTCATGAAGAAGAAACCAGGGGAGTAATTTCTTACCAAACATTACCAAGAAATATGCCA 606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TCCAGAAGGGGAGGGGTCATGAAGAAGAAACCAGGGGAGTAATTTCTTACCAAACATTACCAAGAAATATGCCA 1332
Query 607 AGTCACAGAGCCCAGATTATGGCCCGCTACCCTGAAGGTTATAGAACACTCCCAAGAAACAGCAAGACAAGGCC 680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AGTCACAGAGCCCAGATTATGGCCCGCTACCCTGAAGGTTATAGAACACTCCCAAGAAACAGCAAGACAAGGCC 1406
Query 681 TGAAAGTATCTGCAGTGTAACCCCTTCCACTCATGACAAGACATTAGGACCCGGAGCGGAGGAGAAACGGAGGT 754
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGAAAGTATCTGCAGTGTAACCCCTTCCACTCATGACAAGACATTAGGACCCGGAGCGGAGGAGAAACGGAGGT 1480
Query 755 CCATGAGAGATGACACAATGTGGCAGCTCTACGAATGGCAGCAGCGTCAGTTTTATAACAAACAGAGCACCCTC 828
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CCATGAGAGATGACACAATGTGGCAGCTCTACGAATGGCAGCAGCGTCAGTTTTATAACAAACAGAGCACCCTC 1554
Query 829 CCTCGACACAGTACTTTGAGTAGTCCCAAAACCATGGTAAATATTTCTGACCAGACAATGCACTCTATTCCCAC 902
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CCTCGACACAGTACTTTGAGTAGTCCCAAAACCATGGTAAATATTTCTGACCAGACAATGCACTCTATTCCCAC 1628
Query 903 ATCACCTTCCCACGGGTCAATAGCTGCTTATCAGGGATACTCCCCTCAACGAACTTACAGATCGGAAGTGTCTT 976
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 ATCACCTTCCCACGGGTCAATAGCTGCTTATCAGGGATACTCCCCTCAACGAACTTACAGATCGGAAGTGTCTT 1702
Query 977 CACCAATTCAGAGAGGAGATGTGACAATAGACCGCAGACACAGGGCCCATCACCCTAAGCATGTCTATGTGCCT 1050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CACCAATTCAGAGAGGAGATGTGACAATAGACCGCAGACACAGGGCCCATCACCCTAAGCATGTCTATGTGCCT 1776
Query 1051 GACAGAAGGTCAGTGCCAGCTGGCCTGACTTTACAGTCTGTTAGTCCCCAGAGCCTCCAAGGGAAAACG----- 1119
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GACAGAAGGTCAGTGCCAGCTGGCCTGACTTTACAGTCTGTTAGTCCCCAGAGCCTCCAAGGGAAAACGCCAGA 1850
Query 1120 -------------------------------------------------------------------------- 1119
Sbjct 1851 GGAGCTTACGCTGCTGCTAATAAAGCTGAGACGGCAGCAAGCCGAACTGAGTAGTATCCGGGAGCATACGTTAG 1924
Query 1120 -------------------------------------------------------------------------- 1119
Sbjct 1925 CACAGCTCATGCAGCTAAAGCTTGAGGCCCACAGCCCAAAGAATGAAATTCTTTCACATCATCTCCAAAGGAAC 1998
Query 1120 -------------------------------------------------------------------------- 1119
Sbjct 1999 ACCATATATTTGGATCATCAGATGAAAGAAAATGAACCTATTATCACCATGGTTCACACAATGATTGAGAACTC 2072
Query 1120 ----------------------------CTGTCACAAGATGAAGGTAGAGGCACATTATACAAATACAGACCTG 1165
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 GGCGCTAAGACCCCAACTGTACCAGCAACTGTCACAAGATGAAGGTAGAGGCACATTATACAAATACAGACCTG 2146
Query 1166 AAGAAGTAGATATTGATGCCAAGTTAAGCCGATTATGTGAACAAGATAAAGTGGTGCATGCTCTGGAAGAGAAA 1239
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 AAGAAGTAGATATTGATGCCAAGTTAAGCCGATTATGTGAACAAGATAAAGTGGTGCATGCTCTGGAAGAGAAA 2220
Query 1240 CTTCAGCAACTCCACAAGGAGAAATACACGCTTGAGCAAGCTTTGCTATCAGCCAGCCAAGAGATAGAAATGCA 1313
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CTTCAGCAACTCCACAAGGAGAAATACACGCTTGAGCAAGCTTTGCTATCAGCCAGCCAAGAGATAGAAATGCA 2294
Query 1314 TGCAGATAACCCAGCAGCCATTCAGACAGTGGTGTTACAAAGGGATGATTTACAAAATGGACTGCTTAGTACGT 1387
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 TGCAGATAACCCAGCAGCCATTCAGACAGTGGTGTTACAAAGGGATGATTTACAAAATGGACTGCTTAGTACGT 2368
Query 1388 GTCGAGAACTTTCTCGAGCCACTGCCGAATTGGAACGAGCATGGAGAGAATATGATAAGTTAGAATACGATGTA 1461
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 GTCGAGAACTTTCTCGAGCCACTGCCGAATTGGAACGAGCATGGAGAGAATATGATAAGTTAGAATACGATGTA 2442
Query 1462 ACTGTTACCAGGAACCAGATGCAAGAGCAGCTGGATCACCTTGGTGAAGTTCAGACGGAATCAGCAGGAATTCA 1535
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 ACTGTTACCAGGAACCAGATGCAAGAGCAGCTGGATCACCTTGGTGAAGTTCAGACGGAATCAGCAGGAATTCA 2516
Query 1536 GCGTGCACAGATTCAGAAAGAACTTTGGCGAATTCAGGATGTCATGGAAGGGCTGAGTAAACATAAGCAGCAAA 1609
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 GCGTGCACAGATTCAGAAAGAACTTTGGCGAATTCAGGATGTCATGGAAGGGCTGAGTAAACATAAGCAGCAAA 2590
Query 1610 GAGGTACTACAGAAATAGGTATGATAGGATCAAAGCCTTTCTCAACAGTTAAGTACAAAAATGAG--------- 1674
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 GAGGTACTACAGAAATAGGTATGATAGGATCAAAGCCTTTCTCAACAGTTAAGTACAAAAATGAGGAAGAGGAA 2664
Query 1675 -------------------------------------------------------------------------- 1674
Sbjct 2665 GTAGTCCCACCTCGTCCTCCACTTCCTCGGTCCTATGACTTTACAGAGCAGCCTCCCATAATCCCCCCTCTGCC 2738
Query 1675 -------------------------------------------------------------------------- 1674
Sbjct 2739 CAGTGATAGCAGCTCCTTGCTCTGTTATAGCAGGGGCCCAGTTCATCTGCCTGAAGAAAAGAAGATGTATCAAG 2812
Query 1675 --------------------------------GGTCCAGATTATAGACTCTACAAGAGTGAACCAGAGTTAACA 1716
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 TTCAAGGATATCCAAGAAATGGATCTCACTGTGGTCCAGATTATAGACTCTACAAGAGTGAACCAGAGTTAACA 2886
Query 1717 ACAGTGGCAGAAGTTGATGAATCTAATGGAGAAGAAAAATCAGAACCTGTTTCAGAGATAGAAACTTCAGTTGT 1790
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 ACAGTGGCAGAAGTTGATGAATCTAATGGAGAAGAAAAATCAGAACCTGTTTCAGAGATAGAAACTTCAGTTGT 2960
Query 1791 TAAAGGTTCCCACTTTCCTGTTGGAGTAGTCCCTCCAAGAGCAAAATCACCAACACCCGAATCTTCGACAATAG 1864
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 TAAAGGTTCCCACTTTCCTGTTGGAGTAGTCCCTCCAAGAGCAAAATCACCAACACCCGAATCTTCGACAATAG 3034
Query 1865 CTTCCTATGTAACCTTGAGGAAAACTAAGAAGATGATGGATCTAAGAACGGAAAGACCAAGAAGTGCAGTGGAA 1938
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 CTTCCTATGTAACCTTGAGGAAAACTAAGAAGATGATGGATCTAAGAACGGAAAGACCAAGAAGTGCAGTGGAA 3108
Query 1939 CAGCTCTGTTTGGCTGAAAGTACTCGACCAAGGATGACTGTGGAAGAGCAAATGGAAAGAATAAGAAGACATCA 2012
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 CAGCTCTGTTTGGCTGAAAGTACTCGACCAAGGATGACTGTGGAAGAGCAAATGGAAAGAATAAGAAGACATCA 3182
Query 2013 ACAAGCGTGCCTGAGGGAGAAGAAAAAAGGGTTAAATGTTATCGGTGCTTCAGACCAGTCACCCTTACAAAGCC 2086
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 ACAAGCGTGCCTGAGGGAGAAGAAAAAAGGGTTAAATGTTATCGGTGCTTCAGACCAGTCACCCTTACAAAGCC 3256
Query 2087 CTTCAAATTTAAGGGATAATCCATTTAGGACTACTCAGACTCGAAGGAGGGATGATAAGGAACTGGACACTGCC 2160
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257 CTTCAAATTTAAGGGATAATCCATTTAGGACTACTCAGACTCGAAGGAGGGATGATAAGGAACTGGACACTGCC 3330
Query 2161 ATTAGAGAAAATGATGTAAAGCCAGACCATGAAACTCCTGCAACAGAAATTGTTCAACTAAAAGAAACCGAACC 2234
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331 ATTAGAGAAAATGATGTAAAGCCAGACCATGAAACTCCTGCAACAGAAATTGTTCAACTAAAAGAAACCGAACC 3404
Query 2235 CCAAAATGTGGACTTCAGCAAAGAGTTAAAAAAAACTGAAAACATTTCATATGAAATGCTTTTTGAACCTGAGC 2308
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405 CCAAAATGTGGACTTCAGCAAAGAGTTAAAAAAAACTGAAAACATTTCATATGAAATGCTTTTTGAACCTGAGC 3478
Query 2309 CAAATGGAGTAAATTCTGTGGAAATGATGGATAAAGAAAGAAACAAAGACAAAATGCCTGAGGATGTTACATTC 2382
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479 CAAATGGAGTAAATTCTGTGGAAATGATGGATAAAGAAAGAAACAAAGACAAAATGCCTGAGGATGTTACATTC 3552
Query 2383 AGCCCTCAAGATGAAACACAGACCGCAAATCATAAACCAGAAGAGCATCCTGAAGAAAATACAAAGAACAGTGT 2456
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3553 AGCCCTCAAGATGAAACACAGACCGCAAATCATAAACCAGAAGAGCATCCTGAAGAAAATACAAAGAACAGTGT 3626
Query 2457 TGACGAACAGGAAGAAACTGTTATTTCTTACGAATCAACTCCTGAGGTTTCTAGAGGAAATCAAACAATGGCAG 2530
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3627 TGACGAACAGGAAGAAACTGTTATTTCTTACGAATCAACTCCTGAGGTTTCTAGAGGAAATCAAACAATGGCAG 3700
Query 2531 TGAAAAGTCTGTCCCCATCTCCTGAGTCCTCGGCATCGCCAGTTCCATCCACTCAGCCGCAGCTCACAGAAGGA 2604
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3701 TGAAAAGTCTGTCCCCATCTCCTGAGTCCTCGGCATCGCCAGTTCCATCCACTCAGCCGCAGCTCACAGAAGGA 3774
Query 2605 TCACATTTCATGTGTGTG 2622
||||||||||||||||||
Sbjct 3775 TCACATTTCATGTGTGTG 3792
