Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12044
- Subject:
- XM_011520715.1
- Aligned Length:
- 3711
- Identities:
- 2622
- Gaps:
- 1089
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCGGCGGATCTGAACCTGGAGTGGATCTCCCTGCCCCGGTCCTGGACTTACGGGATCACCAGGGGCGGCCG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 AGTCTTCTTCATCAACGAGGAGGCCAAGAGCACCACCTGGCTGCACCCCGTCACCGGCGAGGCGGTGGTCACCG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 GACACCGGCGGCAGAGCACAGATTTGCCTACTGGCTGGGAAGAAGCATATACTTTTGAAGGTGCAAGATACTAT 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 ATAAACCATAATGAAAGGAAAGTGACCTGCAAACATCCAGTCACAGGACAACCATCACAGGACAATTGTATTTT 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 TGTAGTGAATGAACAGACTGTTGCAACCATGACATCTGAAGAAAAGAAGGAACGGCCAATAAGTATGATAAATG 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 AAGCTTCTAACTATAACGTGACTTCAGATTATGCAGTGCATCCAATGAGCCCTGTAGGCAGAACTTCACGAGCT 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 TCAAAAAAAGTTCATAATTTTGGAAAGAGGTCAAATTCAATTAAAAGGAATCCTAATGCACCGGTTGTCAGACG 518
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 519 AGGTTGGCTTTATAAACAGGACAGTACTGGCATGAAATTGTGGAAGAAACGCTGGTTTGTGCTTTCTGACCTTT 592
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 593 GCCTCTTTTATTATAGAGATGAGAAAGAAGAGGGTATCCTGGGAAGCATACTGTTACCTAGTTTTCAGATAGCT 666
Query 1 ------------------------------------------------------------ATGCGGACCTATTA 14
||||||||||||||
Sbjct 667 TTGCTTACCTCTGAAGATCACATTAATCGCAAATATGCTTTTAAGGCAGCCCATCCAAACATGCGGACCTATTA 740
Query 15 TTTCTGCACTGATACAGGAAAGGAAATGGAGTTGTGGATGAAAGCCATGTTAGATGCTGCCCTAGTACAGACAG 88
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TTTCTGCACTGATACAGGAAAGGAAATGGAGTTGTGGATGAAAGCCATGTTAGATGCTGCCCTAGTACAGACAG 814
Query 89 AACCTGTGAAAAGAGTGGACAAGATTACATCTGAAAATGCACCAACTAAAGAAACCAATAACATTCCCAACCAT 162
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AACCTGTGAAAAGAGTGGACAAGATTACATCTGAAAATGCACCAACTAAAGAAACCAATAACATTCCCAACCAT 888
Query 163 AGAGTGCTAATTAAACCAGAGATCCAAAACAATCAAAAAAACAAGGAAATGAGCAAAATTGAAGAAAAAAAGGC 236
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AGAGTGCTAATTAAACCAGAGATCCAAAACAATCAAAAAAACAAGGAAATGAGCAAAATTGAAGAAAAAAAGGC 962
Query 237 ATTAGAAGCTGAAAAATATGGATTTCAGAAGGATGGTCAAGATAGACCCTTAACAAAAATTAATAGTGTAAAGC 310
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ATTAGAAGCTGAAAAATATGGATTTCAGAAGGATGGTCAAGATAGACCCTTAACAAAAATTAATAGTGTAAAGC 1036
Query 311 TGAATTCTCTGCCATCTGAATATGAGAGTGGGTCAGCATGCCCTGCTCAGACTGTGCACTACAGACCAATCAAC 384
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TGAATTCTCTGCCATCTGAATATGAGAGTGGGTCAGCATGCCCTGCTCAGACTGTGCACTACAGACCAATCAAC 1110
Query 385 TTGAGCAGTTCAGAGAACAAAATAGTCAATGTTAGCCTGGCAGATCTTAGAGGTGGAAATCGCCCCAATACAGG 458
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TTGAGCAGTTCAGAGAACAAAATAGTCAATGTTAGCCTGGCAGATCTTAGAGGTGGAAATCGCCCCAATACAGG 1184
Query 459 GCCCTTATACACAGAGGCCGATCGAGTCATACAGAGAACAAATTCAATGCAGCAGTTGGAACAGTGGATTAAAA 532
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GCCCTTATACACAGAGGCCGATCGAGTCATACAGAGAACAAATTCAATGCAGCAGTTGGAACAGTGGATTAAAA 1258
Query 533 TCCAGAAGGGGAGGGGTCATGAAGAAGAAACCAGGGGAGTAATTTCTTACCAAACATTACCAAGAAATATGCCA 606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TCCAGAAGGGGAGGGGTCATGAAGAAGAAACCAGGGGAGTAATTTCTTACCAAACATTACCAAGAAATATGCCA 1332
Query 607 AGTCACAGAGCCCAGATTATGGCCCGCTACCCTGAAGGTTATAGAACACTCCCAAGAAACAGCAAGACAAGGCC 680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AGTCACAGAGCCCAGATTATGGCCCGCTACCCTGAAGGTTATAGAACACTCCCAAGAAACAGCAAGACAAGGCC 1406
Query 681 TGAAAGTATCTGCAGTGTAACCCCTTCCACTCATGACAAGACATTAGGACCCGGAGCGGAGGAGAAACGGAGGT 754
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGAAAGTATCTGCAGTGTAACCCCTTCCACTCATGACAAGACATTAGGACCCGGAGCGGAGGAGAAACGGAGGT 1480
Query 755 CCATGAGAGATGACACAATGTGGCAGCTCTACGAATGGCAGCAGCGTCAGTTTTATAACAAACAGAGCACCCTC 828
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CCATGAGAGATGACACAATGTGGCAGCTCTACGAATGGCAGCAGCGTCAGTTTTATAACAAACAGAGCACCCTC 1554
Query 829 CCTCGACACAGTACTTTGAGTAGTCCCAAAACCATGGTAAATATTTCTGACCAGACAATGCACTCTATTCCCAC 902
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CCTCGACACAGTACTTTGAGTAGTCCCAAAACCATGGTAAATATTTCTGACCAGACAATGCACTCTATTCCCAC 1628
Query 903 ATCACCTTCCCACGGGTCAATAGCTGCTTATCAGGGATACTCCCCTCAACGAACTTACAGATCGGAAGTGTCTT 976
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 ATCACCTTCCCACGGGTCAATAGCTGCTTATCAGGGATACTCCCCTCAACGAACTTACAGATCGGAAGTGTCTT 1702
Query 977 CACCAATTCAGAGAGGAGATGTGACAATAGACCGCAGACACAGGGCCCATCACCCTAAGCATGTCTATGTGCCT 1050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CACCAATTCAGAGAGGAGATGTGACAATAGACCGCAGACACAGGGCCCATCACCCTAAGCATGTCTATGTGCCT 1776
Query 1051 GACAGAAGGTCAGTGCCAGCTGGCCTGACTTTACAGTCTGTTAGTCCCCAGAGCCTCCAAGGGAAAAC------ 1118
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GACAGAAGGTCAGTGCCAGCTGGCCTGACTTTACAGTCTGTTAGTCCCCAGAGCCTCCAAGGGAAAACGCCAGA 1850
Query 1119 -------------------------------------------------------------------------- 1118
Sbjct 1851 GGAGCTTACGCTGCTGCTAATAAAGCTGAGACGGCAGCAAGCCGAACTGAGTAGTATCCGGGAGCATACGTTAG 1924
Query 1119 -------------------------------------------------------------------------- 1118
Sbjct 1925 CACAGCTCATGCAGCTAAAGCTTGAGGCCCACAGCCCAAAGAATGAAATTCTTTCACATCATCTCCAAAGGAAC 1998
Query 1119 --------------------GCTGTCACAAGATGAAGGTAGAGGCACATTATACAAATACAGACCTGAAGAAGT 1172
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 ACCATATATTTGGATCATCAGCTGTCACAAGATGAAGGTAGAGGCACATTATACAAATACAGACCTGAAGAAGT 2072
Query 1173 AGATATTGATGCCAAGTTAAGCCGATTATGTGAACAAGATAAAGTGGTGCATGCTCTGGAAGAGAAACTTCAGC 1246
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 AGATATTGATGCCAAGTTAAGCCGATTATGTGAACAAGATAAAGTGGTGCATGCTCTGGAAGAGAAACTTCAGC 2146
Query 1247 AACTCCACAAGGAGAAATACACGCTTGAGCAAGCTTTGCTATCAGCCAGCCAAGAGATAGAAATGCATGCAGAT 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 AACTCCACAAGGAGAAATACACGCTTGAGCAAGCTTTGCTATCAGCCAGCCAAGAGATAGAAATGCATGCAGAT 2220
Query 1321 AACCCAGCAGCCATTCAGACAGTGGTGTTACAAAGGGATGATTTACAAAATGGACTGCTTAGTACGTGTCGAGA 1394
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 AACCCAGCAGCCATTCAGACAGTGGTGTTACAAAGGGATGATTTACAAAATGGACTGCTTAGTACGTGTCGAGA 2294
Query 1395 ACTTTCTCGAGCCACTGCCGAATTGGAACGAGCATGGAGAGAATATGATAAGTTAGAATACGATGTAACTGTTA 1468
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 ACTTTCTCGAGCCACTGCCGAATTGGAACGAGCATGGAGAGAATATGATAAGTTAGAATACGATGTAACTGTTA 2368
Query 1469 CCAGGAACCAGATGCAAGAGCAGCTGGATCACCTTGGTGAAGTTCAGACGGAATCAGCAGGAATTCAGCGTGCA 1542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 CCAGGAACCAGATGCAAGAGCAGCTGGATCACCTTGGTGAAGTTCAGACGGAATCAGCAGGAATTCAGCGTGCA 2442
Query 1543 CAGATTCAGAAAGAACTTTGGCGAATTCAGGATGTCATGGAAGGGCTGAGTAAACATAAGCAGCAAAGAGGTAC 1616
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 CAGATTCAGAAAGAACTTTGGCGAATTCAGGATGTCATGGAAGGGCTGAGTAAACATAAGCAGCAAAGAGGTAC 2516
Query 1617 TACAGAAATAGGTATGATAGGATCAAAGCCTTTCTCAACAGTTAAGTACAAAAATGAG---------------- 1674
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 TACAGAAATAGGTATGATAGGATCAAAGCCTTTCTCAACAGTTAAGTACAAAAATGAGGAAGAGGAAGTAGTCC 2590
Query 1675 -------------------------------------------------------------------------- 1674
Sbjct 2591 CACCTCGTCCTCCACTTCCTCGGTCCTATGACTTTACAGAGCAGCCTCCCATAATCCCCCCTCTGCCCAGTGAT 2664
Query 1675 -------------------------------------------------------------------------- 1674
Sbjct 2665 AGCAGCTCCTTGCTCTGTTATAGCAGGGGCCCAGTTCATCTGCCTGAAGAAAAGAAGATGTATCAAGTTCAAGG 2738
Query 1675 -------------------------GGTCCAGATTATAGACTCTACAAGAGTGAACCAGAGTTAACAACAGTGG 1723
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 ATATCCAAGAAATGGATCTCACTGTGGTCCAGATTATAGACTCTACAAGAGTGAACCAGAGTTAACAACAGTGG 2812
Query 1724 CAGAAGTTGATGAATCTAATGGAGAAGAAAAATCAGAACCTGTTTCAGAGATAGAAACTTCAGTTGTTAAAGGT 1797
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 CAGAAGTTGATGAATCTAATGGAGAAGAAAAATCAGAACCTGTTTCAGAGATAGAAACTTCAGTTGTTAAAGGT 2886
Query 1798 TCCCACTTTCCTGTTGGAGTAGTCCCTCCAAGAGCAAAATCACCAACACCCGAATCTTCGACAATAGCTTCCTA 1871
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 TCCCACTTTCCTGTTGGAGTAGTCCCTCCAAGAGCAAAATCACCAACACCCGAATCTTCGACAATAGCTTCCTA 2960
Query 1872 TGTAACCTTGAGGAAAACTAAGAAGATGATGGATCTAAGAACGGAAAGACCAAGAAGTGCAGTGGAACAGCTCT 1945
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 TGTAACCTTGAGGAAAACTAAGAAGATGATGGATCTAAGAACGGAAAGACCAAGAAGTGCAGTGGAACAGCTCT 3034
Query 1946 GTTTGGCTGAAAGTACTCGACCAAGGATGACTGTGGAAGAGCAAATGGAAAGAATAAGAAGACATCAACAAGCG 2019
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 GTTTGGCTGAAAGTACTCGACCAAGGATGACTGTGGAAGAGCAAATGGAAAGAATAAGAAGACATCAACAAGCG 3108
Query 2020 TGCCTGAGGGAGAAGAAAAAAGGGTTAAATGTTATCGGTGCTTCAGACCAGTCACCCTTACAAAGCCCTTCAAA 2093
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 TGCCTGAGGGAGAAGAAAAAAGGGTTAAATGTTATCGGTGCTTCAGACCAGTCACCCTTACAAAGCCCTTCAAA 3182
Query 2094 TTTAAGGGATAATCCATTTAGGACTACTCAGACTCGAAGGAGGGATGATAAGGAACTGGACACTGCCATTAGAG 2167
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 TTTAAGGGATAATCCATTTAGGACTACTCAGACTCGAAGGAGGGATGATAAGGAACTGGACACTGCCATTAGAG 3256
Query 2168 AAAATGATGTAAAGCCAGACCATGAAACTCCTGCAACAGAAATTGTTCAACTAAAAGAAACCGAACCCCAAAAT 2241
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257 AAAATGATGTAAAGCCAGACCATGAAACTCCTGCAACAGAAATTGTTCAACTAAAAGAAACCGAACCCCAAAAT 3330
Query 2242 GTGGACTTCAGCAAAGAGTTAAAAAAAACTGAAAACATTTCATATGAAATGCTTTTTGAACCTGAGCCAAATGG 2315
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331 GTGGACTTCAGCAAAGAGTTAAAAAAAACTGAAAACATTTCATATGAAATGCTTTTTGAACCTGAGCCAAATGG 3404
Query 2316 AGTAAATTCTGTGGAAATGATGGATAAAGAAAGAAACAAAGACAAAATGCCTGAGGATGTTACATTCAGCCCTC 2389
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405 AGTAAATTCTGTGGAAATGATGGATAAAGAAAGAAACAAAGACAAAATGCCTGAGGATGTTACATTCAGCCCTC 3478
Query 2390 AAGATGAAACACAGACCGCAAATCATAAACCAGAAGAGCATCCTGAAGAAAATACAAAGAACAGTGTTGACGAA 2463
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479 AAGATGAAACACAGACCGCAAATCATAAACCAGAAGAGCATCCTGAAGAAAATACAAAGAACAGTGTTGACGAA 3552
Query 2464 CAGGAAGAAACTGTTATTTCTTACGAATCAACTCCTGAGGTTTCTAGAGGAAATCAAACAATGGCAGTGAAAAG 2537
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3553 CAGGAAGAAACTGTTATTTCTTACGAATCAACTCCTGAGGTTTCTAGAGGAAATCAAACAATGGCAGTGAAAAG 3626
Query 2538 TCTGTCCCCATCTCCTGAGTCCTCGGCATCGCCAGTTCCATCCACTCAGCCGCAGCTCACAGAAGGATCACATT 2611
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3627 TCTGTCCCCATCTCCTGAGTCCTCGGCATCGCCAGTTCCATCCACTCAGCCGCAGCTCACAGAAGGATCACATT 3700
Query 2612 TCATGTGTGTG 2622
|||||||||||
Sbjct 3701 TCATGTGTGTG 3711
