Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12044
- Subject:
- XM_017019497.1
- Aligned Length:
- 3504
- Identities:
- 2622
- Gaps:
- 882
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGACATCTGAAGAAAAGAAGGAACGGCCAATAAGTATGATAAATGAAGCTTCTAACTATAACGTGACTTCAGA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TTATGCAGTGCATCCAATGAGCCCTGTAGGCAGAACTTCACGAGCTTCAAAAAAAGTTCATAATTTTGGAAAGA 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 GGTCAAATTCAATTAAAAGGAATCCTAATGCACCGGTTGTCAGACGAGGTTGGCTTTATAAACAGGACAGTACT 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 GGCATGAAATTGTGGAAGAAACGCTGGTTTGTGCTTTCTGACCTTTGCCTCTTTTATTATAGAGATGAGAAAGA 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 AGAGGGTATCCTGGGAAGCATACTGTTACCTAGTTTTCAGATAGCTTTGCTTACCTCTGAAGATCACATTAATC 370
Query 1 --------------------------------ATGCGGACCTATTATTTCTGCACTGATACAGGAAAGGAAATG 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GCAAATATGCTTTTAAGGCAGCCCATCCAAACATGCGGACCTATTATTTCTGCACTGATACAGGAAAGGAAATG 444
Query 43 GAGTTGTGGATGAAAGCCATGTTAGATGCTGCCCTAGTACAGACAGAACCTGTGAAAAGAGTGGACAAGATTAC 116
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GAGTTGTGGATGAAAGCCATGTTAGATGCTGCCCTAGTACAGACAGAACCTGTGAAAAGAGTGGACAAGATTAC 518
Query 117 ATCTGAAAATGCACCAACTAAAGAAACCAATAACATTCCCAACCATAGAGTGCTAATTAAACCAGAGATCCAAA 190
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 ATCTGAAAATGCACCAACTAAAGAAACCAATAACATTCCCAACCATAGAGTGCTAATTAAACCAGAGATCCAAA 592
Query 191 ACAATCAAAAAAACAAGGAAATGAGCAAAATTGAAGAAAAAAAGGCATTAGAAGCTGAAAAATATGGATTTCAG 264
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACAATCAAAAAAACAAGGAAATGAGCAAAATTGAAGAAAAAAAGGCATTAGAAGCTGAAAAATATGGATTTCAG 666
Query 265 AAGGATGGTCAAGATAGACCCTTAACAAAAATTAATAGTGTAAAGCTGAATTCTCTGCCATCTGAATATGAGAG 338
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AAGGATGGTCAAGATAGACCCTTAACAAAAATTAATAGTGTAAAGCTGAATTCTCTGCCATCTGAATATGAGAG 740
Query 339 TGGGTCAGCATGCCCTGCTCAGACTGTGCACTACAGACCAATCAACTTGAGCAGTTCAGAGAACAAAATAGTCA 412
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGGGTCAGCATGCCCTGCTCAGACTGTGCACTACAGACCAATCAACTTGAGCAGTTCAGAGAACAAAATAGTCA 814
Query 413 ATGTTAGCCTGGCAGATCTTAGAGGTGGAAATCGCCCCAATACAGGGCCCTTATACACAGAGGCCGATCGAGTC 486
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ATGTTAGCCTGGCAGATCTTAGAGGTGGAAATCGCCCCAATACAGGGCCCTTATACACAGAGGCCGATCGAGTC 888
Query 487 ATACAGAGAACAAATTCAATGCAGCAGTTGGAACAGTGGATTAAAATCCAGAAGGGGAGGGGTCATGAAGAAGA 560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ATACAGAGAACAAATTCAATGCAGCAGTTGGAACAGTGGATTAAAATCCAGAAGGGGAGGGGTCATGAAGAAGA 962
Query 561 AACCAGGGGAGTAATTTCTTACCAAACATTACCAAGAAATATGCCAAGTCACAGAGCCCAGATTATGGCCCGCT 634
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AACCAGGGGAGTAATTTCTTACCAAACATTACCAAGAAATATGCCAAGTCACAGAGCCCAGATTATGGCCCGCT 1036
Query 635 ACCCTGAAGGTTATAGAACACTCCCAAGAAACAGCAAGACAAGGCCTGAAAGTATCTGCAGTGTAACCCCTTCC 708
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ACCCTGAAGGTTATAGAACACTCCCAAGAAACAGCAAGACAAGGCCTGAAAGTATCTGCAGTGTAACCCCTTCC 1110
Query 709 ACTCATGACAAGACATTAGGACCCGGAGCGGAGGAGAAACGGAGGTCCATGAGAGATGACACAATGTGGCAGCT 782
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ACTCATGACAAGACATTAGGACCCGGAGCGGAGGAGAAACGGAGGTCCATGAGAGATGACACAATGTGGCAGCT 1184
Query 783 CTACGAATGGCAGCAGCGTCAGTTTTATAACAAACAGAGCACCCTCCCTCGACACAGTACTTTGAGTAGTCCCA 856
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CTACGAATGGCAGCAGCGTCAGTTTTATAACAAACAGAGCACCCTCCCTCGACACAGTACTTTGAGTAGTCCCA 1258
Query 857 AAACCATGGTAAATATTTCTGACCAGACAATGCACTCTATTCCCACATCACCTTCCCACGGGTCAATAGCTGCT 930
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AAACCATGGTAAATATTTCTGACCAGACAATGCACTCTATTCCCACATCACCTTCCCACGGGTCAATAGCTGCT 1332
Query 931 TATCAGGGATACTCCCCTCAACGAACTTACAGATCGGAAGTGTCTTCACCAATTCAGAGAGGAGATGTGACAAT 1004
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TATCAGGGATACTCCCCTCAACGAACTTACAGATCGGAAGTGTCTTCACCAATTCAGAGAGGAGATGTGACAAT 1406
Query 1005 AGACCGCAGACACAGGGCCCATCACCCTAAGCATGTCTATGTGCCTGACAGAAGGTCAGTGCCAGCTGGCCTGA 1078
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 AGACCGCAGACACAGGGCCCATCACCCTAAGCATGTCTATGTGCCTGACAGAAGGTCAGTGCCAGCTGGCCTGA 1480
Query 1079 CTTTACAGTCTGTTAGTCCCCAGAGCCTCCAAGGGAAAACG--------------------------------- 1119
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CTTTACAGTCTGTTAGTCCCCAGAGCCTCCAAGGGAAAACGCCAGAGGAGCTTACGCTGCTGCTAATAAAGCTG 1554
Query 1120 -------------------------------------------------------------------------- 1119
Sbjct 1555 AGACGGCAGCAAGCCGAACTGAGTAGTATCCGGGAGCATACGTTAGCACAGCTCATGCAGCTAAAGCTTGAGGC 1628
Query 1120 -------------------------------------------------------------------------- 1119
Sbjct 1629 CCACAGCCCAAAGAATGAAATTCTTTCACATCATCTCCAAAGGAACACCATATATTTGGATCATCAGATGAAAG 1702
Query 1120 -------------------------------------------------------------------------- 1119
Sbjct 1703 AAAATGAACCTATTATCACCATGGTTCACACAATGATTGAGAACTCGGCGCTAAGACCCCAACTGTACCAGCAA 1776
Query 1120 ------------------------------------CTGTCACAAGATGAAGGTAGAGGCACATTATACAAATA 1157
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 TTCTTAAGACAGAAGAGCAAGATAAGTCTATATTGTCTGTCACAAGATGAAGGTAGAGGCACATTATACAAATA 1850
Query 1158 CAGACCTGAAGAAGTAGATATTGATGCCAAGTTAAGCCGATTATGTGAACAAGATAAAGTGGTGCATGCTCTGG 1231
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CAGACCTGAAGAAGTAGATATTGATGCCAAGTTAAGCCGATTATGTGAACAAGATAAAGTGGTGCATGCTCTGG 1924
Query 1232 AAGAGAAACTTCAGCAACTCCACAAGGAGAAATACACGCTTGAGCAAGCTTTGCTATCAGCCAGCCAAGAGATA 1305
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 AAGAGAAACTTCAGCAACTCCACAAGGAGAAATACACGCTTGAGCAAGCTTTGCTATCAGCCAGCCAAGAGATA 1998
Query 1306 GAAATGCATGCAGATAACCCAGCAGCCATTCAGACAGTGGTGTTACAAAGGGATGATTTACAAAATGGACTGCT 1379
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 GAAATGCATGCAGATAACCCAGCAGCCATTCAGACAGTGGTGTTACAAAGGGATGATTTACAAAATGGACTGCT 2072
Query 1380 TAGTACGTGTCGAGAACTTTCTCGAGCCACTGCCGAATTGGAACGAGCATGGAGAGAATATGATAAGTTAGAAT 1453
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 TAGTACGTGTCGAGAACTTTCTCGAGCCACTGCCGAATTGGAACGAGCATGGAGAGAATATGATAAGTTAGAAT 2146
Query 1454 ACGATGTAACTGTTACCAGGAACCAGATGCAAGAGCAGCTGGATCACCTTGGTGAAGTTCAGACGGAATCAGCA 1527
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 ACGATGTAACTGTTACCAGGAACCAGATGCAAGAGCAGCTGGATCACCTTGGTGAAGTTCAGACGGAATCAGCA 2220
Query 1528 GGAATTCAGCGTGCACAGATTCAGAAAGAACTTTGGCGAATTCAGGATGTCATGGAAGGGCTGAGTAAACATAA 1601
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 GGAATTCAGCGTGCACAGATTCAGAAAGAACTTTGGCGAATTCAGGATGTCATGGAAGGGCTGAGTAAACATAA 2294
Query 1602 GCAGCAAAGAGGTACTACAGAAATAGGTATGATAGGATCAAAGCCTTTCTCAACAGTTAAGTACAAAAATGAG- 1674
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 GCAGCAAAGAGGTACTACAGAAATAGGTATGATAGGATCAAAGCCTTTCTCAACAGTTAAGTACAAAAATGAGG 2368
Query 1675 -------------------------------------------------------------------------- 1674
Sbjct 2369 AAGAGGAAGTAGTCCCACCTCGTCCTCCACTTCCTCGGTCCTATGACTTTACAGAGCAGCCTCCCATAATCCCC 2442
Query 1675 -------------------------------------------------------------------------- 1674
Sbjct 2443 CCTCTGCCCAGTGATAGCAGCTCCTTGCTCTGTTATAGCAGGGGCCCAGTTCATCTGCCTGAAGAAAAGAAGAT 2516
Query 1675 ----------------------------------------GGTCCAGATTATAGACTCTACAAGAGTGAACCAG 1708
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 GTATCAAGTTCAAGGATATCCAAGAAATGGATCTCACTGTGGTCCAGATTATAGACTCTACAAGAGTGAACCAG 2590
Query 1709 AGTTAACAACAGTGGCAGAAGTTGATGAATCTAATGGAGAAGAAAAATCAGAACCTGTTTCAGAGATAGAAACT 1782
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 AGTTAACAACAGTGGCAGAAGTTGATGAATCTAATGGAGAAGAAAAATCAGAACCTGTTTCAGAGATAGAAACT 2664
Query 1783 TCAGTTGTTAAAGGTTCCCACTTTCCTGTTGGAGTAGTCCCTCCAAGAGCAAAATCACCAACACCCGAATCTTC 1856
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 TCAGTTGTTAAAGGTTCCCACTTTCCTGTTGGAGTAGTCCCTCCAAGAGCAAAATCACCAACACCCGAATCTTC 2738
Query 1857 GACAATAGCTTCCTATGTAACCTTGAGGAAAACTAAGAAGATGATGGATCTAAGAACGGAAAGACCAAGAAGTG 1930
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 GACAATAGCTTCCTATGTAACCTTGAGGAAAACTAAGAAGATGATGGATCTAAGAACGGAAAGACCAAGAAGTG 2812
Query 1931 CAGTGGAACAGCTCTGTTTGGCTGAAAGTACTCGACCAAGGATGACTGTGGAAGAGCAAATGGAAAGAATAAGA 2004
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 CAGTGGAACAGCTCTGTTTGGCTGAAAGTACTCGACCAAGGATGACTGTGGAAGAGCAAATGGAAAGAATAAGA 2886
Query 2005 AGACATCAACAAGCGTGCCTGAGGGAGAAGAAAAAAGGGTTAAATGTTATCGGTGCTTCAGACCAGTCACCCTT 2078
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 AGACATCAACAAGCGTGCCTGAGGGAGAAGAAAAAAGGGTTAAATGTTATCGGTGCTTCAGACCAGTCACCCTT 2960
Query 2079 ACAAAGCCCTTCAAATTTAAGGGATAATCCATTTAGGACTACTCAGACTCGAAGGAGGGATGATAAGGAACTGG 2152
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 ACAAAGCCCTTCAAATTTAAGGGATAATCCATTTAGGACTACTCAGACTCGAAGGAGGGATGATAAGGAACTGG 3034
Query 2153 ACACTGCCATTAGAGAAAATGATGTAAAGCCAGACCATGAAACTCCTGCAACAGAAATTGTTCAACTAAAAGAA 2226
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 ACACTGCCATTAGAGAAAATGATGTAAAGCCAGACCATGAAACTCCTGCAACAGAAATTGTTCAACTAAAAGAA 3108
Query 2227 ACCGAACCCCAAAATGTGGACTTCAGCAAAGAGTTAAAAAAAACTGAAAACATTTCATATGAAATGCTTTTTGA 2300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 ACCGAACCCCAAAATGTGGACTTCAGCAAAGAGTTAAAAAAAACTGAAAACATTTCATATGAAATGCTTTTTGA 3182
Query 2301 ACCTGAGCCAAATGGAGTAAATTCTGTGGAAATGATGGATAAAGAAAGAAACAAAGACAAAATGCCTGAGGATG 2374
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 ACCTGAGCCAAATGGAGTAAATTCTGTGGAAATGATGGATAAAGAAAGAAACAAAGACAAAATGCCTGAGGATG 3256
Query 2375 TTACATTCAGCCCTCAAGATGAAACACAGACCGCAAATCATAAACCAGAAGAGCATCCTGAAGAAAATACAAAG 2448
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257 TTACATTCAGCCCTCAAGATGAAACACAGACCGCAAATCATAAACCAGAAGAGCATCCTGAAGAAAATACAAAG 3330
Query 2449 AACAGTGTTGACGAACAGGAAGAAACTGTTATTTCTTACGAATCAACTCCTGAGGTTTCTAGAGGAAATCAAAC 2522
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331 AACAGTGTTGACGAACAGGAAGAAACTGTTATTTCTTACGAATCAACTCCTGAGGTTTCTAGAGGAAATCAAAC 3404
Query 2523 AATGGCAGTGAAAAGTCTGTCCCCATCTCCTGAGTCCTCGGCATCGCCAGTTCCATCCACTCAGCCGCAGCTCA 2596
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405 AATGGCAGTGAAAAGTCTGTCCCCATCTCCTGAGTCCTCGGCATCGCCAGTTCCATCCACTCAGCCGCAGCTCA 3478
Query 2597 CAGAAGGATCACATTTCATGTGTGTG 2622
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479 CAGAAGGATCACATTTCATGTGTGTG 3504