Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12044
• Subject: XM_017019498.1
• Aligned Length: 3279
• Identities: 2622
• Gaps: 657

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGACATCTGAAGAAAAGAAGGAACGGCCAATAAGTATGATAAATGAAGCTTCTAACTATAACGTGACTTCAGA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TTATGCAGTGCATCCAATGAGCCCTGTAGGCAGAACTTCACGAGCTTCAAAAAAAGTTCATAATTTTGGAAAGA  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  GGTCAAATTCAATTAAAAGGAATCCTAATGCACCGGTTGTCAGACGAGGTTGGCTTTATAAACAGGACAGTACT  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  GGCATGAAATTGTGGAAGAAACGCTGGTTTGTGCTTTCTGACCTTTGCCTCTTTTATTATAGAGATGAGAAAGA  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  AGAGGGTATCCTGGGAAGCATACTGTTACCTAGTTTTCAGATAGCTTTGCTTACCTCTGAAGATCACATTAATC  370

Query    1  --------------------------------ATGCGGACCTATTATTTCTGCACTGATACAGGAAAGGAAATG  42
                                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCAAATATGCTTTTAAGGCAGCCCATCCAAACATGCGGACCTATTATTTCTGCACTGATACAGGAAAGGAAATG  444

Query   43  GAGTTGTGGATGAAAGCCATGTTAGATGCTGCCCTAGTACAGACAGAACCTGTGAAAAGAGTGGACAAGATTAC  116
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAGTTGTGGATGAAAGCCATGTTAGATGCTGCCCTAGTACAGACAGAACCTGTGAAAAGAGTGGACAAGATTAC  518

Query  117  ATCTGAAAATGCACCAACTAAAGAAACCAATAACATTCCCAACCATAGAGTGCTAATTAAACCAGAGATCCAAA  190
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ATCTGAAAATGCACCAACTAAAGAAACCAATAACATTCCCAACCATAGAGTGCTAATTAAACCAGAGATCCAAA  592

Query  191  ACAATCAAAAAAACAAGGAAATGAGCAAAATTGAAGAAAAAAAGGCATTAGAAGCTGAAAAATATGGATTTCAG  264
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACAATCAAAAAAACAAGGAAATGAGCAAAATTGAAGAAAAAAAGGCATTAGAAGCTGAAAAATATGGATTTCAG  666

Query  265  AAGGATGGTCAAGATAGACCCTTAACAAAAATTAATAGTGTAAAGCTGAATTCTCTGCCATCTGAATATGAGAG  338
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGGATGGTCAAGATAGACCCTTAACAAAAATTAATAGTGTAAAGCTGAATTCTCTGCCATCTGAATATGAGAG  740

Query  339  TGGGTCAGCATGCCCTGCTCAGACTGTGCACTACAGACCAATCAACTTGAGCAGTTCAGAGAACAAAATAGTCA  412
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGGGTCAGCATGCCCTGCTCAGACTGTGCACTACAGACCAATCAACTTGAGCAGTTCAGAGAACAAAATAGTCA  814

Query  413  ATGTTAGCCTGGCAGATCTTAGAGGTGGAAATCGCCCCAATACAGGGCCCTTATACACAGAGGCCGATCGAGTC  486
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATGTTAGCCTGGCAGATCTTAGAGGTGGAAATCGCCCCAATACAGGGCCCTTATACACAGAGGCCGATCGAGTC  888

Query  487  ATACAGAGAACAAATTCAATGCAGCAGTTGGAACAGTGGATTAAAATCCAGAAGGGGAGGGGTCATGAAGAAGA  560
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATACAGAGAACAAATTCAATGCAGCAGTTGGAACAGTGGATTAAAATCCAGAAGGGGAGGGGTCATGAAGAAGA  962

Query  561  AACCAGGGGAGTAATTTCTTACCAAACATTACCAAGAAATATGCCAAGTCACAGAGCCCAGATTATGGCCCGCT  634
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AACCAGGGGAGTAATTTCTTACCAAACATTACCAAGAAATATGCCAAGTCACAGAGCCCAGATTATGGCCCGCT  1036

Query  635  ACCCTGAAGGTTATAGAACACTCCCAAGAAACAGCAAGACAAGGCCTGAAAGTATCTGCAGTGTAACCCCTTCC  708
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACCCTGAAGGTTATAGAACACTCCCAAGAAACAGCAAGACAAGGCCTGAAAGTATCTGCAGTGTAACCCCTTCC  1110

Query  709  ACTCATGACAAGACATTAGGACCCGGAGCGGAGGAGAAACGGAGGTCCATGAGAGATGACACAATGTGGCAGCT  782
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACTCATGACAAGACATTAGGACCCGGAGCGGAGGAGAAACGGAGGTCCATGAGAGATGACACAATGTGGCAGCT  1184

Query  783  CTACGAATGGCAGCAGCGTCAGTTTTATAACAAACAGAGCACCCTCCCTCGACACAGTACTTTGAGTAGTCCCA  856
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTACGAATGGCAGCAGCGTCAGTTTTATAACAAACAGAGCACCCTCCCTCGACACAGTACTTTGAGTAGTCCCA  1258

Query  857  AAACCATGGTAAATATTTCTGACCAGACAATGCACTCTATTCCCACATCACCTTCCCACGGGTCAATAGCTGCT  930
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AAACCATGGTAAATATTTCTGACCAGACAATGCACTCTATTCCCACATCACCTTCCCACGGGTCAATAGCTGCT  1332

Query  931  TATCAGGGATACTCCCCTCAACGAACTTACAGATCGGAAGTGTCTTCACCAATTCAGAGAGGAGATGTGACAAT  1004
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TATCAGGGATACTCCCCTCAACGAACTTACAGATCGGAAGTGTCTTCACCAATTCAGAGAGGAGATGTGACAAT  1406

Query 1005  AGACCGCAGACACAGGGCCCATCACCCTAAGCATGTCTATGTGCCTGACAGAAGGTCAGTGCCAGCTGGCCTGA  1078
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGACCGCAGACACAGGGCCCATCACCCTAAGCATGTCTATGTGCCTGACAGAAGGTCAGTGCCAGCTGGCCTGA  1480

Query 1079  CTTTACAGTCTGTTAGTCCCCAGAGCCTCCAAGGGAAAACG---------------------------------  1119
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                 
Sbjct 1481  CTTTACAGTCTGTTAGTCCCCAGAGCCTCCAAGGGAAAACGCCAGAGGAGCTTACGCTGCTGCTAATAAAGCTG  1554

Query 1120  --------------------------------------------------------------------------  1119
                                                                                      
Sbjct 1555  AGACGGCAGCAAGCCGAACTGAGTAGTATCCGGGAGCATACGTTAGCACAGCTCATGCAGCTAAAGCTTGAGGC  1628

Query 1120  --------------------------------------------------------------------------  1119
                                                                                      
Sbjct 1629  CCACAGCCCAAAGAATGAAATTCTTTCACATCATCTCCAAAGGAACACCATATATTTGGATCATCAGATGAAAG  1702

Query 1120  --------------------------------------------------------------------------  1119
                                                                                      
Sbjct 1703  AAAATGAACCTATTATCACCATGGTTCACACAATGATTGAGAACTCGGCGCTAAGACCCCAACTGTACCAGCAA  1776

Query 1120  CTGTCACAAGATGAAGGTAGAGGCACATTATACAAATACAGACCTGAAGAAGTAGATATTGATGCCAAGTTAAG  1193
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CTGTCACAAGATGAAGGTAGAGGCACATTATACAAATACAGACCTGAAGAAGTAGATATTGATGCCAAGTTAAG  1850

Query 1194  CCGATTATGTGAACAAGATAAAGTGGTGCATGCTCTGGAAGAGAAACTTCAGCAACTCCACAAGGAGAAATACA  1267
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CCGATTATGTGAACAAGATAAAGTGGTGCATGCTCTGGAAGAGAAACTTCAGCAACTCCACAAGGAGAAATACA  1924

Query 1268  CGCTTGAGCAAGCTTTGCTATCAGCCAGCCAAGAGATAGAAATGCATGCAGATAACCCAGCAGCCATTCAGACA  1341
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CGCTTGAGCAAGCTTTGCTATCAGCCAGCCAAGAGATAGAAATGCATGCAGATAACCCAGCAGCCATTCAGACA  1998

Query 1342  GTGGTGTTACAAAGGGATGATTTACAAAATGGACTGCTTAGTACGTGTCGAGAACTTTCTCGAGCCACTGCCGA  1415
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GTGGTGTTACAAAGGGATGATTTACAAAATGGACTGCTTAGTACGTGTCGAGAACTTTCTCGAGCCACTGCCGA  2072

Query 1416  ATTGGAACGAGCATGGAGAGAATATGATAAGTTAGAATACGATGTAACTGTTACCAGGAACCAGATGCAAGAGC  1489
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  ATTGGAACGAGCATGGAGAGAATATGATAAGTTAGAATACGATGTAACTGTTACCAGGAACCAGATGCAAGAGC  2146

Query 1490  AGCTGGATCACCTTGGTGAAGTTCAGACGGAATCAGCAGGAATTCAGCGTGCACAGATTCAGAAAGAACTTTGG  1563
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  AGCTGGATCACCTTGGTGAAGTTCAGACGGAATCAGCAGGAATTCAGCGTGCACAGATTCAGAAAGAACTTTGG  2220

Query 1564  CGAATTCAGGATGTCATGGAAGGGCTGAGTAAACATAAGCAGCAAAGAGGTACTACAGAAATAGGTATGATAGG  1637
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CGAATTCAGGATGTCATGGAAGGGCTGAGTAAACATAAGCAGCAAAGAGGTACTACAGAAATAGGTATGATAGG  2294

Query 1638  ATCAAAGCCTTTCTCAACAGTTAAGTACAAAAATGAGGGTCCAGATTATAGACTCTACAAGAGTGAACCAGAGT  1711
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  ATCAAAGCCTTTCTCAACAGTTAAGTACAAAAATGAGGGTCCAGATTATAGACTCTACAAGAGTGAACCAGAGT  2368

Query 1712  TAACAACAGTGGCAGAAGTTGATGAATCTAATGGAGAAGAAAAATCAGAACCTGTTTCAGAGATAGAAACTTCA  1785
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  TAACAACAGTGGCAGAAGTTGATGAATCTAATGGAGAAGAAAAATCAGAACCTGTTTCAGAGATAGAAACTTCA  2442

Query 1786  GTTGTTAAAGGTTCCCACTTTCCTGTTGGAGTAGTCCCTCCAAGAGCAAAATCACCAACACCCGAATCTTCGAC  1859
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  GTTGTTAAAGGTTCCCACTTTCCTGTTGGAGTAGTCCCTCCAAGAGCAAAATCACCAACACCCGAATCTTCGAC  2516

Query 1860  AATAGCTTCCTATGTAACCTTGAGGAAAACTAAGAAGATGATGGATCTAAGAACGGAAAGACCAAGAAGTGCAG  1933
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  AATAGCTTCCTATGTAACCTTGAGGAAAACTAAGAAGATGATGGATCTAAGAACGGAAAGACCAAGAAGTGCAG  2590

Query 1934  TGGAACAGCTCTGTTTGGCTGAAAGTACTCGACCAAGGATGACTGTGGAAGAGCAAATGGAAAGAATAAGAAGA  2007
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  TGGAACAGCTCTGTTTGGCTGAAAGTACTCGACCAAGGATGACTGTGGAAGAGCAAATGGAAAGAATAAGAAGA  2664

Query 2008  CATCAACAAGCGTGCCTGAGGGAGAAGAAAAAAGGGTTAAATGTTATCGGTGCTTCAGACCAGTCACCCTTACA  2081
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  CATCAACAAGCGTGCCTGAGGGAGAAGAAAAAAGGGTTAAATGTTATCGGTGCTTCAGACCAGTCACCCTTACA  2738

Query 2082  AAGCCCTTCAAATTTAAGGGATAATCCATTTAGGACTACTCAGACTCGAAGGAGGGATGATAAGGAACTGGACA  2155
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  AAGCCCTTCAAATTTAAGGGATAATCCATTTAGGACTACTCAGACTCGAAGGAGGGATGATAAGGAACTGGACA  2812

Query 2156  CTGCCATTAGAGAAAATGATGTAAAGCCAGACCATGAAACTCCTGCAACAGAAATTGTTCAACTAAAAGAAACC  2229
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  CTGCCATTAGAGAAAATGATGTAAAGCCAGACCATGAAACTCCTGCAACAGAAATTGTTCAACTAAAAGAAACC  2886

Query 2230  GAACCCCAAAATGTGGACTTCAGCAAAGAGTTAAAAAAAACTGAAAACATTTCATATGAAATGCTTTTTGAACC  2303
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  GAACCCCAAAATGTGGACTTCAGCAAAGAGTTAAAAAAAACTGAAAACATTTCATATGAAATGCTTTTTGAACC  2960

Query 2304  TGAGCCAAATGGAGTAAATTCTGTGGAAATGATGGATAAAGAAAGAAACAAAGACAAAATGCCTGAGGATGTTA  2377
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  TGAGCCAAATGGAGTAAATTCTGTGGAAATGATGGATAAAGAAAGAAACAAAGACAAAATGCCTGAGGATGTTA  3034

Query 2378  CATTCAGCCCTCAAGATGAAACACAGACCGCAAATCATAAACCAGAAGAGCATCCTGAAGAAAATACAAAGAAC  2451
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  CATTCAGCCCTCAAGATGAAACACAGACCGCAAATCATAAACCAGAAGAGCATCCTGAAGAAAATACAAAGAAC  3108

Query 2452  AGTGTTGACGAACAGGAAGAAACTGTTATTTCTTACGAATCAACTCCTGAGGTTTCTAGAGGAAATCAAACAAT  2525
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109  AGTGTTGACGAACAGGAAGAAACTGTTATTTCTTACGAATCAACTCCTGAGGTTTCTAGAGGAAATCAAACAAT  3182

Query 2526  GGCAGTGAAAAGTCTGTCCCCATCTCCTGAGTCCTCGGCATCGCCAGTTCCATCCACTCAGCCGCAGCTCACAG  2599
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183  GGCAGTGAAAAGTCTGTCCCCATCTCCTGAGTCCTCGGCATCGCCAGTTCCATCCACTCAGCCGCAGCTCACAG  3256

Query 2600  AAGGATCACATTTCATGTGTGTG  2622
            |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257  AAGGATCACATTTCATGTGTGTG  3279