Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12045
• Subject: NM_019015.2
• Aligned Length: 2322
• Identities: 1972
• Gaps: 330

Alignment

Query    1  ATGCGACTGAGCTCCCTGTTGGCTCTGCTGCGGCCAGCGCTTCCCCTCATCTTAGGGCTGTCTCTGGGGTGCAG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCGACTGAGCTCCCTGTTGGCTCTGCTGCGGCCAGCGCTTCCCCTCATCTTAGGGCTGTCTCTGGGGTGCAG  74

Query   75  CCTGAGCCTCCTGCGGGTTTCCTGGATCCAGGGGGAGGGAGAAGATCCCTGTGTCGAGGCTGTAGGGGAGCGAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTGAGCCTCCTGCGGGTTTCCTGGATCCAGGGGGAGGGAGAAGATCCCTGTGTCGAGGCTGTAGGGGAGCGAG  148

Query  149  GAGGGCCACAGAATCCAGATTCGAGAGCTCGGCTAGACCAAAGTGATGAAGACTTCAAACCCCGGATTGTCCCC  222
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GAGGGCCACAGAATCCAGATTCCAGAGCTCGGCTAGACCAAAGTGATGAAGACTTCAAACCCCGGATTGTCCCC  222

Query  223  TACTACAGGGACCCCAACAAGCCCTACAAGAAGGTGCTCAGGACTCGGTACATCCAGACAGAGCTGGGCTCCCG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TACTACAGGGACCCCAACAAGCCCTACAAGAAGGTGCTCAGGACTCGGTACATCCAGACAGAGCTGGGCTCCCG  296

Query  297  TGAGCGGTTGCTGGTGGCTGTCCTGACCTCCCGAGCTACACTGTCCACTTTGGCCGTGGCTGTGAACCGTACGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGAGCGGTTGCTGGTGGCTGTCCTGACCTCCCGAGCTACACTGTCCACTTTGGCCGTGGCTGTGAACCGTACGG  370

Query  371  TGGCCCATCACTTCCCTCGGTTACTCTACTTCACTGGGCAGCGGGGGGCCCGGGCTCCAGCAGGGATGCAGGTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGGCCCATCACTTCCCTCGGTTACTCTACTTCACTGGGCAGCGGGGGGCCCGGGCTCCAGCAGGGATGCAGGTG  444

Query  445  GTGTCTCATGGGGATGAGCGGCCCGCCTGGCTCATGTCAGAGACCCTGCGCCACCTTCACACACACTTTGGGGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTGTCTCATGGGGATGAGCGGCCCGCCTGGCTCATGTCAGAGACCCTGCGCCACCTTCACACACACTTTGGGGC  518

Query  519  CGACTACGACTGGTTCTTCATCATGCAGGATGACACATATGTGCAGGCCCCCCGCCTGGCAGCCCTTGCTGGCC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CGACTACGACTGGTTCTTCATCATGCAGGATGACACATATGTGCAGGCCCCCCGCCTGGCAGCCCTTGCTGGCC  592

Query  593  ACCTCAGCATCAACCAAGACCTGTACTTAGGCCGGGCAGAGGAGTTCATTGGCGCAGGCGAGCAGGCCCGGTAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACCTCAGCATCAACCAAGACCTGTACTTAGGCCGGGCAGAGGAGTTCATTGGCGCAGGCGAGCAGGCCCGGTAC  666

Query  667  TGTCATGGGGGCTTTGGCTACCTGTTGTCACGGAGTCTCCTGCTTCGTCTGCGGCCACATCTGGATGGCTGCCG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TGTCATGGGGGCTTTGGCTACCTGTTGTCACGGAGTCTCCTGCTTCGTCTGCGGCCACATCTGGATGGCTGCCG  740

Query  741  AGGAGACATTCTCAGTGCCCGTCCTGACGAGTGGCTTGGACGCTGCCTCATTGACTCTCTGGGCGTCGGCTGTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGGAGACATTCTCAGTGCCCGTCCTGACGAGTGGCTTGGACGCTGCCTCATTGACTCTCTGGGCGTCGGCTGTG  814

Query  815  TCTCACAGCACCAGGGGCAGCAGTATCGCTCATTTGAACTGGCCAAAAATAGGGACCCTGAGAAGGAAGGGAGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCTCACAGCACCAGGGGCAGCAGTATCGCTCATTTGAACTGGCCAAAAATAGGGACCCTGAGAAGGAAGGGAGC  888

Query  889  TCGGCTTTCCTGAGTGCCTTCGCCGTGCACCCTGTCTCCGAAGGTACCCTCATGTACCGGCTCCACAAACGCTT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCGGCTTTCCTGAGTGCCTTCGCCGTGCACCCTGTCTCCGAAGGTACCCTCATGTACCGGCTCCACAAACGCTT  962

Query  963  CAGCGCTCTGGAGTTGGAGCGGGCTTACAGTGAAATAGAACAACTGCAGGCTCAGATCCGGAACCTGACCGTGC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAGCGCTCTGGAGTTGGAGCGGGCTTACAGTGAAATAGAACAACTGCAGGCTCAGATCCGGAACCTGACCGTGC  1036

Query 1037  TGACCCCCGAAGGGGAGGCAGGGCTGAGCTGGCCCGTTGGGCTCCCTGCTCCTTTCACACCACACTCTCGCTTT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGACCCCCGAAGGGGAGGCAGGGCTGAGCTGGCCCGTTGGGCTCCCTGCTCCTTTCACACCACACTCTCGCTTT  1110

Query 1111  GAGGTGCTGGGCTGGGACTACTTCACAGAGCAGCACACCTTCTCCTGTGCAGATGGGGCTCCCAAGTGCCCACT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAGGTGCTGGGCTGGGACTACTTCACAGAGCAGCACACCTTCTCCTGTGCAGATGGGGCTCCCAAGTGCCCACT  1184

Query 1185  ACAGGGGGCTAGCAGGGCGGACGTGGGTGATGCGTTGGAGACTGCCCTGGAGCAGCTCAATCGGCGCTATCAGC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ACAGGGGGCTAGCAGGGCGGACGTGGGTGATGCGTTGGAGACTGCCCTGGAGCAGCTCAATCGGCGCTATCAGC  1258

Query 1259  CCCGCCTGCGCTTCCAGAAGCAGCGACTGCTCAACGGCTATCGGCGCTTCGACCCAGCACGGGGCATGGAGTAC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCCGCCTGCGCTTCCAGAAGCAGCGACTGCTCAACGGCTATCGGCGCTTCGACCCAGCACGGGGCATGGAGTAC  1332

Query 1333  ACCCTGGACCTGCTGTTGGAATGTGTGACACAGCGTGGGCACCGGCGGGCCCTGGCTCGCAGGGTCAGCCTGCT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ACCCTGGACCTGCTGTTGGAATGTGTGACACAGCGTGGGCACCGGCGGGCCCTGGCTCGCAGGGTCAGCCTGCT  1406

Query 1407  GCGGCCACTGAGCCGGGTGGAAATCCTACCTATGCCCTATGTCACTGAGGCCACCCGAGTGCAGCTGGTGCTGC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GCGGCCACTGAGCCGGGTGGAAATCCTACCTATGCCCTATGTCACTGAGGCCACCCGAGTGCAGCTGGTGCTGC  1480

Query 1481  CACTCCTGGTGGCTGAAGCTGCTGCAGCCCCGGCTTTCCTCGAGGCGTTTGCAGCCAATGTCCTGGAGCCACGA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CACTCCTGGTGGCTGAAGCTGCTGCAGCCCCGGCTTTCCTCGAGGCCTTTGCAGCCAATGTCCTGGAGCCACGA  1554

Query 1555  GAACATGCATTGCTCACCCTGTTGCTGGTCTACGGGCCACGAGAAGGTGGCCGTGGAGCTCCAGACCCATTTCT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GAACATGCATTGCTCACCCTGTTGCTGGTCTACGGGCCACGAGAAGGTGGCCGTGGAGCTCCAGACCCATTTCT  1628

Query 1629  TGGGGTGAAGGCTGCAGCAGCGGAGTTAGAGCGACGGTACCCTGGGACGAGGCTGGCCTGGCTCGCTGTGCGAG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TGGGGTGAAGGCTGCAGCAGCGGAGTTAGAGCGACGGTACCCTGGGACGAGGCTGGCCTGGCTCGCTGTGCGAG  1702

Query 1703  CAGAGGCCCCTTCCCAGGTGCGACTCATGGACGTGGTCTCGAAGAAGCACCCTGTGGACACTCTCTTCTTCCTT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CAGAGGCCCCTTCCCAGGTGCGACTCATGGACGTGGTCTCGAAGAAGCACCCTGTGGACACTCTCTTCTTCCTT  1776

Query 1777  ACCACCGTGTGGACAAGGCCTGGGCCCGAAGTCCTCAACCGCTGTCGCATGAATGCCATCTCTGGCTGGCAGGC  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  ACCACCGTGTGGACAAGGCCTGGGCCCGAAGTCCTCAACCGCTGTCGCATGAATGCCATCTCTGGCTGGCAGGC  1850

Query 1851  CTTCTTTCCAGTCCATTTCCAGGAGTTCAATCCTGCCCTGTCACCACAGAGATCACC-----------------  1907
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 
Sbjct 1851  CTTCTTTCCAGTCCATTTCCAGGAGTTCAATCCTGCCCTGTCACCACAGAGATCACCCCCAGGGCCCCCGGGGG  1924

Query 1908  ----CCCTAACC----------------TCATTACCTTTCC------------------------TTTG-----  1932
                ||||.|||                |..|.|||..|||                        ||||     
Sbjct 1925  CTGGCCCTGACCCCCCCTCCCCTCCTGGTGCTGACCCCTCCCGGGGGGCTCCTATAGGGGGGAGATTTGACCGG  1998

Query 1933  ------TCT------------------------------------GCCTCAGCCC--CAGGAAG----------  1952
                  |||                                    |||..|||||  |.||.||          
Sbjct 1999  CAGGCTTCTGCGGAGGGCTGCTTCTACAACGCTGACTACCTGGCGGCCCGAGCCCGGCTGGCAGGTGAACTGGC  2072

Query 1953  -GGCAAGGCAAGATGGTGGACAG--ATAGA-------GAATTGTTGCTGTATTTTT------------------  1998
             |||.||| |||| ||.||| ||  .|.||       ||   |.||.||.||.|||                  
Sbjct 2073  AGGCCAGG-AAGA-GGAGGA-AGCCCTGGAGGGGCTGGA---GGTGATGGATGTTTTCCTCCGGTTCTCAGGGC  2140

Query 1999  --------------------------------------------------------------------------  1998
                                                                                      
Sbjct 2141  TCCACCTCTTTCGGGCCGTAGAGCCAGGGCTGGTGCAGAAGTTCTCCCTGCGAGACTGCAGCCCACGGCTCAGT  2214

Query 1999  --------------------------------------------------------------------------  1998
                                                                                      
Sbjct 2215  GAAGAACTCTACCACCGCTGCCGCCTCAGCAACCTGGAGGGGCTAGGGGGCCGTGCCCAGCTGGCTATGGCTCT  2288

Query 1999  ----------------------------  1998
                                        
Sbjct 2289  CTTTGAGCAGGAGCAGGCCAATAGCACT  2316