Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12046
• Subject: XM_006724268.3
• Aligned Length: 1470
• Identities: 1248
• Gaps: 222

Alignment

Query    1  ATGATGACCAAGATTAAAACAGTGCTCAAAAGTCGTGGCCGCCCACCTACAGAGCCGCTGCCCGACGGGTGGAT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CATGACATTCCATAACTCTGGAGTCCCGGTGTACCTACACAGAGAGTCTCGGGTGGTCACCTGGTCCAGGCCAT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ACTTCTTGGGAACGGGAAGCATACGGAAACACGACCCTCCTCTGAGTAGCATCCCTTGTCTGCATTATAAGAAA  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  ATGAAGGACAACGAGGAACGGGAGCAAAGCAGTGACCTCACCCCTAGTGGGGATGTGTCCCCCGTCAAGCCCCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAGGACAACGAGGAACGGGAGCAAAGCAGTGACCTCACCCCTAGTGGGGATGTGTCCCCCGTCAAGCCCCT  74

Query  297  GAGCCGATCTGCAGAGCTGGAGTTTCCCCTGGATGAGCCTGACTCTATGGGTGCTGACCCGGGGCCCCCGGACG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAGCCGATCTGCAGAGCTGGAGTTTCCCCTGGATGAGCCTGACTCTATGGGTGCTGACCCGGGGCCCCCGGACG  148

Query  371  AGAAAGACCCACTAGGGGCTGAGGCAGCCCCTGGGGCCCTGGGGCAGGTGAAGGCCAAAGTCGAGGTGTGCAAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGAAAGACCCACTAGGGGCTGAGGCAGCCCCTGGGGCCCTGGGGCAGGTGAAGGCCAAAGTCGAGGTGTGCAAA  222

Query  445  GATGAATCCGTTGATCTCGAGGAATTTCGAAGCTACCTGGAGAAGCGTTTTGACTTTGAGCAAGTTACTGTGAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GATGAATCCGTTGATCTCGAGGAATTTCGAAGCTACCTGGAGAAGCGTTTTGACTTTGAGCAAGTTACTGTGAA  296

Query  519  AAAATTCAGGACTTGGGCTGAGCGGCGGCAATTCAATCGGGAAATGAAGCGGAAGCAGGCGGAGTCCGAGAGGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAAATTCAGGACTTGGGCTGAGCGGCGGCAATTCAATCGGGAAATGAAGCGGAAGCAGGCGGAGTCCGAGAGGC  370

Query  593  CCATCTTGCCAGCCAATCAGAAGCTCATTACTTTATCAGTGCAAGATGCACCCACAAAGAAAGAGTTTGTTATT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCATCTTGCCAGCCAATCAGAAGCTCATTACTTTATCAGTGCAAGATGCACCCACAAAGAAAGAGTTTGTTATT  444

Query  667  AACCCCAACGGGAAATCCGAGGTCTGCATCCTGCACGAGTACATGCAGCGTGTCCTCAAGGTCCGCCCTGTCTA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AACCCCAACGGGAAATCCGAGGTCTGCATCCTGCACGAGTACATGCAGCGTGTCCTCAAGGTCCGCCCTGTCTA  518

Query  741  TAATTTCTTTGAATGTGAGAACCCAAGTGAGCCTTTTGGTGCCTCGGTGACCATTGATGGTGTGACTTACGGAT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TAATTTCTTTGAATGTGAGAACCCAAGTGAGCCTTTTGGTGCCTCGGTGACCATTGATGGTGTGACTTACGGAT  592

Query  815  CTGGAACTGCAAGCAGCAAAAAACTTGCGAAGAATAAAGCTGCCCGAGCTACACTGGAAATCCTCATCCCTGAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTGGAACTGCAAGCAGCAAAAAACTTGCGAAGAATAAAGCTGCCCGAGCTACACTGGAAATCCTCATCCCTGAC  666

Query  889  TTTGTTAAACAGACCTCTGAAGAGAAGCCCAAAGACAGTGAAGAACTCGAGTATTTTAACCACATCAGCATCGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTTGTTAAACAGACCTCTGAAGAGAAGCCCAAAGACAGTGAAGAACTCGAGTATTTTAACCACATCAGCATCGA  740

Query  963  GGACTCGCGGGTCTACGAGCTGACCAGCAAGGCTGGGCTGTTGTCTCCATATCAGATCCTCCACGAGTGCCTTA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGACTCGCGGGTCTACGAGCTGACCAGCAAGGCTGGGCTGTTGTCTCCATATCAGATCCTCCACGAGTGCCTTA  814

Query 1037  AAAGAAACCATGGGATGGGTGACACGTCTATCAAGTTTGAAGTGGTTCCTGGGAAAAACCAGAAGAGTGAATAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAAGAAACCATGGGATGGGTGACACGTCTATCAAGTTTGAAGTGGTTCCTGGGAAAAACCAGAAGAGTGAATAC  888

Query 1111  GTCATGGCGTGTGGCAAGCACACAGTGCGCGGGTGGTGTAAGAACAAGAGAGTTGGAAAGCAGTTAGCCTCACA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTCATGGCGTGTGGCAAGCACACAGTGCGCGGGTGGTGTAAGAACAAGAGAGTTGGAAAGCAGTTAGCCTCACA  962

Query 1185  GAAGATCCTTCAGCTGCTGCACCCACATGTCAAGAACTGGGGGTCTTTACTGCGCATGTATGGCCGTGAGAGCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GAAGATCCTTCAGCTGCTGCACCCACATGTCAAGAACTGGGGGTCTTTACTGCGCATGTATGGCCGTGAGAGCA  1036

Query 1259  GCAAGATGGTCAAGCAGGAGACATCGGACAAGAGTGTGATTGAGCTGCAGCAGTATGCCAAGAAGAACAAGCCC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCAAGATGGTCAAGCAGGAGACATCGGACAAGAGTGTGATTGAGCTGCAGCAGTATGCCAAGAAGAACAAGCCC  1110

Query 1333  AACCTGCACATCCTCAGCAAGCTCCAAGAGGAGATGAAGAGGCTAGCTGAGGAAAGGGAGGAGACTCGAAAGAA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AACCTGCACATCCTCAGCAAGCTCCAAGAGGAGATGAAGAGGCTAGCTGAGGAAAGGGAGGAGACTCGAAAGAA  1184

Query 1407  GCCCAAGATGTCCATTGTGGCGTCCGCCCAGCCTGGCGGTGAGCCCCTGTGCACCGTGGACGTG  1470
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCCCAAGATGTCCATTGTGGCGTCCGCCCAGCCTGGCGGTGAGCCCCTGTGCACCGTGGACGTG  1248