Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12052
• Subject: NM_001184965.2
• Aligned Length: 913
• Identities: 614
• Gaps: 298

Alignment

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct   1  MASESDTEEFYDAPEDVHLGGGYPVGSPGKVGLSTFKETENTAYKVGNESPVQELKQDVSKKIIESIIEESQKV  74

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct  75  LQLEDDSLDSKGKELSDQATASPIVARTDLSNIPGLLAIDQVLPEESQKAESQNTFEETELELKKCFPSDETCE  148

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct 149  KPVDETTKLTQTSSTEQLNVLETETEVLNKEAVEVKGGGDVLEPVSSDSLSTKDFAAVEEVAPAKPPRHLTPEP  222

Query   1  --------------------------------------------------------------------MASESA  6
                                                                               |||||.
Sbjct 223  DIVASTKKPVPARPPPPTNFPPPRPPPPSRPAPPPRKRKSELEFETLKTPDIDVPKENITSDSLLTASMASEST  296

Query   7  VKDSQPSLDLASATSGDKIVTAQENGKAPDGQTVAGEVMGPQRPRSNSGRELTDEEILASVMIKNLDTGEEIPL  80
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  VKDSQPSLDLASATSGDKIVTAQENGKAPDGQTVAGEVMGPQRPRSNSGRELTDEEILASVMIKNLDTGEEIPL  370

Query  81  SLAEEKLPTGINPLTLHIMRRTKEYVSNDAAQSDDEEKLQSQPTDTDGGRLKQKTTQLKKFLGKSVKRAKHLAE  154
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  SLAEEKLPTGINPLTLHIMRRTKEYVSNDAAQSDDEEKLQSQPTDTDGGRLKQKTTQLKKFLGKSVKRAKHLAE  444

Query 155  EYGERAINKVKSVRDEVFHTDQDDPSSSDDEGMPYTRPVKFKAAHGFKGPYDFDQIKVVQDLSGEHMGAVWTMK  228
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  EYGERAINKVKSVRDEVFHTDQDDPSSSDDEGMPYTRPVKFKAAHGFKGPYDFDQIKVVQDLSGEHMGAVWTMK  518

Query 229  FSHCGRLLASAGQDNVVRIWALKNAFDYFNNMRMKYNTEGRVSPSPSQESLSSSKSDTDTGVCSGTDEDPDDKN  302
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  FSHCGRLLASAGQDNVVRIWALKNAFDYFNNMRMKYNTEGRVSPSPSQESLSSSKSDTDTGVCSGTDEDPDDKN  592

Query 303  APFRQRPFCKYKGHTADLLDLSWSKNYFLLSSSMDKTVRLWHISRRECLCCFQHIDFVTAIAFHPRDDRYFLSG  376
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  APFRQRPFCKYKGHTADLLDLSWSKNYFLLSSSMDKTVRLWHISRRECLCCFQHIDFVTAIAFHPRDDRYFLSG  666

Query 377  SLDGKLRLWNIPDKKVALWNEVDGQTKLITAANFCQNGKYAVIGTYDGRCIFYDTEHLKYHTQIHVRSTRGRNK  450
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  SLDGKLRLWNIPDKKVALWNEVDGQTKLITAANFCQNGKYAVIGTYDGRCIFYDTEHLKYHTQIHVRSTRGRNK  740

Query 451  VGRKITGIEPLPGENKILVTSNDSRIRLYDLRDLSLSMKYKGYVNSSSQIKASFSHDFTYLVSGSEDKYVYIWS  524
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||
Sbjct 741  VGRKITGIEPLPGENKILVTSNDSRIRLYDLRDLSLSMKYKGYVNSSSQIKASF--------SGSEDKYVYIWS  806

Query 525  TYHDLSKFTSVRRDRNDFWEGIKAHNAVVTSAIFAPNPSLMLSLDVQSEKSEGNEKSEDAEVLDATPSGIMKTD  598
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 807  TYHDLSKFTSVRRDRNDFWEGIKAHNAVVTSAIFAPNPSLMLSLDVQSEKSEGNEKSEDAEVLDATPSGIMKTD  880

Query 599  NTEVLLSADFTGAIKVFVNKRKNVS  623
           |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 881  NTEVLLSADFTGAIKVFVNKRKNVS  905