Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12070
• Subject: NM_001369447.1
• Aligned Length: 1197
• Identities: 1097
• Gaps: 99

Alignment

Query    1  ATGGCGGCTGCTGCTGCACGCTGGAACCATGTGTGGGTCGGCACCGAGACTGGGATCTTGAAAGGGGTAAATCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGCTGCTGCTGCACGCTGGAACCATGTGTGGGTCGGCACCGAGACTGGGATCTTGAAAGGGGTAAATCT  74

Query   75  TCAGCGAAAACAGGCGGCGAACTTCACGGCCGGAGGACAGCCGCGGCGCGAGGAGGCAGTGAGCGCCCTGTGTT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCAGCGAAAACAGGCGGCGAACTTCACGGCCGGAGGACAGCCGCGGCGCGAGGAGGCAGTGAGCGCCCTGTGTT  148

Query  149  GGGGCACCGGCGGCGAGACCCAGATGCTGGTGGGCTGCGCGGACAGGACGGTGAAGCACTTCAGCACCGAGGAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGGGCACCGGCGGCGAGACCCAGATGCTGGTGGGCTGCGCGGACAGGACGGTGAAGCACTTCAGCACCGAGGAT  222

Query  223  GGCATATTCCAGGGTCAGAGACACTGCCCGGGCGGGGAGGGCATGTTCCGTGGCCTCGCCCAGGCCGACGGCAC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGCATATTCCAGGGTCAGAGACACTGCCCGGGCGGGGAGGGCATGTTCCGTGGCCTCGCCCAGGCCGACGGCAC  296

Query  297  CCTCATCACATGTGTGGATTCTGGGATTCTCAGAGTCTGGCATGACAAGGACAAGGACACATCCTCTGACCCA-  369
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  297  CCTCATCACATGTGTGGATTCTGGGATTCTCAGAGTCTGGCATGACAAGGACAAGGACACATCCTCTGACCCAG  370

Query  370  -----------------------------------------CTCCTGGAACTGAGAGTGGGCCCTGGGGTGTGT  402
                                                     |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGAGGCTCCCCTGCCCTGATGGTTGGGGGAGGTGGGCTGGGCTCCTGGAACTGAGAGTGGGCCCTGGGGTGTGT  444

Query  403  AGGATGCGCCAAGACCCAGCACACCCCCATGTGGTTGCCACAGGTGGGAAAGAGAATGCTTTGAAGATATGGGA  476
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGGATGCGCCAAGACCCAGCACACCCCCATGTGGTTGCCACAGGTGGGAAAGAGAATGCTTTGAAGATATGGGA  518

Query  477  CCTGCAGGGCTCTGAGGAACCTGTTTTCAGGGCCAAGAACGTGCGGAATGACTGGCTGGACTTGCGGGTTCCCA  550
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCTGCAGGGCTCTGAGGAACCTGTGTTCAGGGCCAAGAACGTGCGGAATGACTGGCTGGACTTGCGGGTTCCCA  592

Query  551  TCTGGGACCAGGACATACAGTTTCTCCCAGGATCACAGAAGCTTGTCACCTGCACAGGGTACCACCAGGTCCGT  624
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCTGGGACCAGGACATACAGTTTCTCCCAGGATCACAGAAGCTTGTCACCTGCACAGGGTACCACCAGGTCCGT  666

Query  625  GTTTATGATCCAGCATCCCCCCAGCGCCGGCCAGTCCTAGAGACCACCTATGGAGAGTACCCACTAACAGCCAT  698
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTTTATGATCCAGCATCCCCCCAGCGCCGGCCAGTCCTAGAGACCACCTATGGAGAGTACCCACTAACAGCCAT  740

Query  699  GACCCTCACTCCGGGAGGCAACTCAGTGATTGTGGGAAACACTCATGGGCAGCTGGCAGAAATTGACCTTCGGC  772
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GACCCTCACTCCGGGAGGCAACTCAGTGATTGTGGGAAACACTCATGGGCAGCTGGCAGAAATTGACCTTCGGC  814

Query  773  AAGGGCGTCTACTGGGCTGTCTGAAGGGGCTGGCAGGCAGTGTGCGTGGGTTGCAGTGCCACCCTTCAAAGCCT  846
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAGGGCGTCTACTGGGCTGTCTGAAGGGGCTGGCAGGCAGTGTGCGTGGGTTGCAGTGCCACCCTTCAAAGCCT  888

Query  847  CTACTAGCCTCCTGTGGCTTGGACAGAGTCTTGAGGATACACAGGATCCAGAATCCACGGGGTCTGGAGCATA-  919
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  889  CTACTAGCCTCCTGTGGCTTGGACAGAGTCTTGAGGATACACAGGATCCAGAATCCACGGGGTCTGGAGCATAA  962

Query  920  --------------------------------------------------------AGGATGAGCCCCAAGAGC  937
                                                                    ||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGTTTATCTCAAGTCTCAATTGAACTGCCTCCTCTTGTCAGGCAGGGACAACTGGGAGGATGAGCCCCAAGAGC  1036

Query  938  CTCAAGAACCCAACAAGGTGCCCCTAGAAGACACAGAGACAGATGAACTTTGGGCATCCTTGGAGGCAGCTGCC  1011
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTCAAGAACCCAACAAGGTGCCCCTAGAAGACACAGAGACAGATGAACTTTGGGCATCCTTGGAGGCAGCTGCC  1110

Query 1012  AAGCGGAAGCTCTCGGGTTTGGAGCAGCCCCAAGGAGCTCTCCAAACGAGACGGAGAAAGAAGAAGCGGCCTGG  1085
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAGCGGAAGCTCTCGGGTTTGGAGCAGCCCCAAGGAGCTCTCCAAACGAGACGGAGAAAGAAGAAGCGGCCTGG  1184

Query 1086  GTCCACCAGCCCC  1098
            |||||||||||||
Sbjct 1185  GTCCACCAGCCCC  1197